FuNGI

P53333

Protein Details

Accession

P53333

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
539-577	RSPFTVETRKRARSRTPPRGSRNHRNRSRTPPARRQRHR	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
547-577	RKRARSRTPPRGSRNHRNRSRTPPARRQRHR

Subcellular Location(s)

nucl 23, plas 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR016024 ARM-type_fold IPR003891 Initiation_fac_eIF4g_MI IPR003890 MIF4G-like_typ-3
Gene Ontology	GO:0071013 C:catalytic step 2 spliceosome GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005684 C:U2-type spliceosomal complex GO:0003723 F:RNA binding GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
KEGG	sce:YGR278W -
Pfam	View protein in Pfam PF02847 MA3
PROSITE	View protein in PROSITE PS51366 MI

Amino Acid Sequences

MSTATIQDEDIKFQRENWEMIRSHVSPIISNLTMDNLQESHRDLFQVNILIGRNIICKNVVDFTLNKQNGRLIPALSALIALLNSDIPDIGETLAKELMLMFVQQFNRKDYVSCGNILQCLSILFLYDVIHEIVILQILLLLLEKNSLRLVIAVMKICGWKLALVSKKTHDMIWEKLRYILQTQELSSTLRESLETLFEIRQKDYKSGSQGLFILDPTSYTVHTHSYIVSDEDEANKELGNFEKCENFNELTMAFDTLRQKLLINNTSDTNEGSNSQLQIYDMTSTNDVEFKKKIYLVLKSSLSGDEAAHKLLKLKIANNLKKSVVDIIIKSSLQESTFSKFYSILSERMITFHRSWQTAYNETFEQNYTQDIEDYETDQLRILGKFWGHLISYEFLPMDCLKIIKLTEEESCPQGRIFIKFLFQELVNELGLDELQLRLNSSKLDGMFPLEGDAEHIRYSINFFTAIGLGLLTEDMRSRLTIIQEVEDAEEEEKKLREEEELEKLRKKARESQPTQGPKIHESRLFLQKDTRENSRSRSPFTVETRKRARSRTPPRGSRNHRNRSRTPPARRQRHR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.38
2	0.35
3	0.38
4	0.36
5	0.41
6	0.37
7	0.41
8	0.45
9	0.38
10	0.37
11	0.36
12	0.33
13	0.26
14	0.29
15	0.31
16	0.24
17	0.23
18	0.21
19	0.21
20	0.21
21	0.2
22	0.19
23	0.14
24	0.15
25	0.16
26	0.19
27	0.18
28	0.19
29	0.2
30	0.18
31	0.19
32	0.22
33	0.22
34	0.19
35	0.2
36	0.2
37	0.18
38	0.18
39	0.18
40	0.19
41	0.17
42	0.18
43	0.16
44	0.16
45	0.18
46	0.2
47	0.2
48	0.19
49	0.19
50	0.25
51	0.34
52	0.36
53	0.34
54	0.33
55	0.37
56	0.36
57	0.39
58	0.34
59	0.24
60	0.23
61	0.24
62	0.23
63	0.17
64	0.15
65	0.1
66	0.08
67	0.07
68	0.06
69	0.05
70	0.05
71	0.05
72	0.05
73	0.05
74	0.05
75	0.06
76	0.06
77	0.06
78	0.08
79	0.08
80	0.1
81	0.1
82	0.1
83	0.09
84	0.09
85	0.09
86	0.07
87	0.08
88	0.07
89	0.12
90	0.15
91	0.21
92	0.23
93	0.25
94	0.28
95	0.28
96	0.28
97	0.27
98	0.32
99	0.29
100	0.28
101	0.27
102	0.26
103	0.28
104	0.27
105	0.22
106	0.15
107	0.12
108	0.12
109	0.09
110	0.08
111	0.06
112	0.07
113	0.07
114	0.07
115	0.08
116	0.08
117	0.08
118	0.07
119	0.06
120	0.06
121	0.06
122	0.05
123	0.03
124	0.04
125	0.04
126	0.04
127	0.04
128	0.04
129	0.04
130	0.06
131	0.06
132	0.07
133	0.07
134	0.08
135	0.07
136	0.08
137	0.09
138	0.11
139	0.14
140	0.14
141	0.14
142	0.15
143	0.15
144	0.15
145	0.14
146	0.1
147	0.08
148	0.09
149	0.15
150	0.21
151	0.23
152	0.27
153	0.29
154	0.33
155	0.34
156	0.33
157	0.31
158	0.29
159	0.33
160	0.39
161	0.4
162	0.35
163	0.37
164	0.38
165	0.34
166	0.32
167	0.28
168	0.23
169	0.22
170	0.22
171	0.2
172	0.2
173	0.2
174	0.18
175	0.16
176	0.12
177	0.1
178	0.1
179	0.09
180	0.1
181	0.1
182	0.1
183	0.11
184	0.12
185	0.15
186	0.16
187	0.17
188	0.2
189	0.2
190	0.22
191	0.24
192	0.26
193	0.28
194	0.32
195	0.31
196	0.29
197	0.28
198	0.26
199	0.23
200	0.2
201	0.15
202	0.09
203	0.09
204	0.08
205	0.08
206	0.08
207	0.08
208	0.09
209	0.1
210	0.12
211	0.12
212	0.11
213	0.11
214	0.11
215	0.11
216	0.11
217	0.1
218	0.1
219	0.1
220	0.12
221	0.11
222	0.11
223	0.1
224	0.09
225	0.09
226	0.11
227	0.12
228	0.12
229	0.12
230	0.17
231	0.18
232	0.2
233	0.23
234	0.2
235	0.19
236	0.18
237	0.17
238	0.13
239	0.13
240	0.12
241	0.08
242	0.1
243	0.12
244	0.12
245	0.13
246	0.12
247	0.12
248	0.14
249	0.2
250	0.22
251	0.22
252	0.22
253	0.22
254	0.23
255	0.23
256	0.21
257	0.15
258	0.11
259	0.1
260	0.1
261	0.1
262	0.1
263	0.09
264	0.09
265	0.08
266	0.09
267	0.08
268	0.08
269	0.08
270	0.08
271	0.09
272	0.09
273	0.09
274	0.11
275	0.11
276	0.12
277	0.12
278	0.12
279	0.14
280	0.14
281	0.17
282	0.18
283	0.22
284	0.23
285	0.27
286	0.26
287	0.25
288	0.25
289	0.22
290	0.19
291	0.15
292	0.12
293	0.1
294	0.1
295	0.11
296	0.1
297	0.1
298	0.11
299	0.12
300	0.16
301	0.15
302	0.16
303	0.23
304	0.33
305	0.39
306	0.39
307	0.41
308	0.38
309	0.36
310	0.35
311	0.3
312	0.23
313	0.19
314	0.16
315	0.16
316	0.17
317	0.17
318	0.16
319	0.14
320	0.12
321	0.11
322	0.12
323	0.11
324	0.13
325	0.14
326	0.14
327	0.14
328	0.14
329	0.14
330	0.18
331	0.19
332	0.17
333	0.17
334	0.18
335	0.18
336	0.19
337	0.2
338	0.17
339	0.16
340	0.2
341	0.22
342	0.22
343	0.23
344	0.27
345	0.3
346	0.31
347	0.31
348	0.29
349	0.27
350	0.26
351	0.26
352	0.2
353	0.17
354	0.13
355	0.13
356	0.11
357	0.11
358	0.1
359	0.1
360	0.11
361	0.1
362	0.12
363	0.13
364	0.11
365	0.11
366	0.11
367	0.12
368	0.11
369	0.11
370	0.1
371	0.11
372	0.11
373	0.11
374	0.12
375	0.13
376	0.11
377	0.12
378	0.13
379	0.12
380	0.12
381	0.13
382	0.12
383	0.1
384	0.12
385	0.11
386	0.1
387	0.09
388	0.09
389	0.08
390	0.1
391	0.11
392	0.11
393	0.12
394	0.13
395	0.15
396	0.18
397	0.19
398	0.2
399	0.21
400	0.2
401	0.18
402	0.21
403	0.21
404	0.2
405	0.22
406	0.2
407	0.23
408	0.23
409	0.24
410	0.21
411	0.19
412	0.18
413	0.16
414	0.17
415	0.13
416	0.12
417	0.11
418	0.09
419	0.09
420	0.07
421	0.06
422	0.05
423	0.06
424	0.06
425	0.08
426	0.09
427	0.1
428	0.1
429	0.11
430	0.14
431	0.13
432	0.15
433	0.13
434	0.16
435	0.16
436	0.15
437	0.15
438	0.11
439	0.1
440	0.12
441	0.13
442	0.11
443	0.11
444	0.11
445	0.1
446	0.1
447	0.13
448	0.11
449	0.11
450	0.1
451	0.1
452	0.11
453	0.12
454	0.12
455	0.09
456	0.07
457	0.06
458	0.06
459	0.06
460	0.05
461	0.05
462	0.05
463	0.06
464	0.07
465	0.07
466	0.09
467	0.12
468	0.14
469	0.18
470	0.19
471	0.19
472	0.19
473	0.2
474	0.19
475	0.17
476	0.16
477	0.13
478	0.13
479	0.12
480	0.15
481	0.15
482	0.15
483	0.16
484	0.15
485	0.17
486	0.2
487	0.25
488	0.32
489	0.39
490	0.43
491	0.47
492	0.5
493	0.54
494	0.54
495	0.54
496	0.55
497	0.57
498	0.64
499	0.65
500	0.71
501	0.75
502	0.78
503	0.77
504	0.72
505	0.65
506	0.6
507	0.6
508	0.56
509	0.49
510	0.46
511	0.49
512	0.54
513	0.52
514	0.48
515	0.49
516	0.48
517	0.53
518	0.53
519	0.54
520	0.5
521	0.51
522	0.56
523	0.59
524	0.58
525	0.56
526	0.56
527	0.54
528	0.56
529	0.62
530	0.66
531	0.63
532	0.67
533	0.71
534	0.75
535	0.77
536	0.76
537	0.77
538	0.77
539	0.81
540	0.83
541	0.84
542	0.85
543	0.88
544	0.92
545	0.91
546	0.91
547	0.91
548	0.91
549	0.9
550	0.89
551	0.88
552	0.87
553	0.89
554	0.88
555	0.88
556	0.87
557	0.89

P53333

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer