FuNGI

P40028

Protein Details

Accession

P40028

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
56-77	DISARSRSRSRSPTRSPRDSDI	Hydrophilic
548-577	TQQLIQKEKEKKGKKSNKSRLPQKNNLDEF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
555-569	EKEKKGKKSNKSRLP

Subcellular Location(s)

nucl 22.5, cyto_nucl 12.5, cyto 1.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR036279 5-3_exonuclease_C_sf IPR029060 PIN-like_dom_sf IPR006086 XPG-I_dom IPR006084 XPG/Rad2 IPR006085 XPG_DNA_repair_N IPR037316 Yen1_H3TH
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005634 C:nucleus GO:0017108 F:5'-flap endonuclease activity GO:0008821 F:crossover junction DNA endonuclease activity GO:0000400 F:four-way junction DNA binding GO:0000287 F:magnesium ion binding GO:0042803 F:protein homodimerization activity GO:0006974 P:DNA damage response GO:0006281 P:DNA repair GO:0031297 P:replication fork processing
KEGG	sce:YER041W -
Pfam	View protein in Pfam PF00867 XPG_I
CDD	cd09906 H3TH_YEN1 cd09870 PIN_YEN1

Amino Acid Sequences

MGVSQIWEFLKPYLQDSRIPLRKFVIDFNKSQKRAPRIAIDAYGWLFECGFIQNIDISARSRSRSRSPTRSPRDSDIDSSQEYYGSRSYTTTGKAVINFISRLKELLSLNVEFLLVFDGVMKPSFKRKFNHEQNATTCDDEKEYYSSWEQHVKNHEVYGNCKGLLAPSDPEFISLVRKLLDLMNISYVIACGEGEAQCVWLQVSGAVDFILSNDSDTLVFGGEKILKNYSKFYDDFGPSSITSHSPSRHHDSKESFVTVIDLPKINKVAGKKFDRLSLLFFSVLLGADYNRGVKGLGKNKSLQLAQCEDPNFSMEFYDIFKDFNLEDLTSESLRKSRYRLFQKRLYLYCKDHSVELFGRNYPVLLNQGSFEGWPSTVAIMHYFHPIVQPYFDEEVLSDKYINMAGNGHYRNLNFNELKYFLQSLNLPQISSFDKWFHDSMHEMFLLREFLSIDESDNIGKGNMRITEEKIMNIDGGKFQIPCFKIRYTTFLPNIPISSQSPLKRSNSPSRSKSPTRRQMDIMEHPNSLWLPKYLIPQSHPLVIQYYETQQLIQKEKEKKGKKSNKSRLPQKNNLDEFLRKHTSPIKSIGKVGESRKEILEPVRKRLFVDTDEDTSLEEIPAPTRLTTVDEHSDNDDDSLIFVDEITNSQSVLDSSPGKRIRDLTQDEQVDVWKDVIEISPIKKSRTTNAEKNPPESGLKSRSSITINARLQGTKMLPPNLTAPRLEREHSSVLDQLVTDAQDTVDRFVACDSDSSSTIE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.31
2	0.34
3	0.4
4	0.49
5	0.52
6	0.53
7	0.52
8	0.48
9	0.51
10	0.49
11	0.51
12	0.51
13	0.47
14	0.51
15	0.59
16	0.65
17	0.61
18	0.64
19	0.64
20	0.62
21	0.64
22	0.64
23	0.62
24	0.58
25	0.6
26	0.58
27	0.5
28	0.46
29	0.39
30	0.34
31	0.26
32	0.2
33	0.16
34	0.13
35	0.12
36	0.1
37	0.1
38	0.09
39	0.1
40	0.1
41	0.11
42	0.12
43	0.12
44	0.12
45	0.17
46	0.2
47	0.23
48	0.27
49	0.32
50	0.41
51	0.5
52	0.58
53	0.63
54	0.7
55	0.78
56	0.83
57	0.87
58	0.83
59	0.8
60	0.78
61	0.72
62	0.66
63	0.61
64	0.56
65	0.48
66	0.44
67	0.37
68	0.31
69	0.27
70	0.24
71	0.21
72	0.17
73	0.16
74	0.14
75	0.16
76	0.19
77	0.21
78	0.21
79	0.22
80	0.23
81	0.24
82	0.25
83	0.26
84	0.26
85	0.25
86	0.25
87	0.25
88	0.23
89	0.22
90	0.21
91	0.23
92	0.2
93	0.23
94	0.25
95	0.22
96	0.23
97	0.22
98	0.21
99	0.16
100	0.15
101	0.12
102	0.07
103	0.06
104	0.07
105	0.08
106	0.09
107	0.1
108	0.11
109	0.11
110	0.21
111	0.29
112	0.33
113	0.37
114	0.45
115	0.55
116	0.65
117	0.74
118	0.71
119	0.72
120	0.7
121	0.71
122	0.64
123	0.55
124	0.46
125	0.36
126	0.31
127	0.24
128	0.22
129	0.2
130	0.19
131	0.21
132	0.22
133	0.24
134	0.25
135	0.32
136	0.31
137	0.34
138	0.4
139	0.42
140	0.4
141	0.4
142	0.41
143	0.35
144	0.38
145	0.39
146	0.34
147	0.29
148	0.27
149	0.24
150	0.22
151	0.22
152	0.21
153	0.16
154	0.15
155	0.18
156	0.18
157	0.19
158	0.18
159	0.15
160	0.17
161	0.16
162	0.15
163	0.13
164	0.13
165	0.13
166	0.14
167	0.17
168	0.14
169	0.14
170	0.15
171	0.15
172	0.14
173	0.13
174	0.12
175	0.09
176	0.07
177	0.06
178	0.04
179	0.06
180	0.06
181	0.07
182	0.07
183	0.08
184	0.08
185	0.09
186	0.09
187	0.07
188	0.07
189	0.06
190	0.07
191	0.07
192	0.06
193	0.06
194	0.06
195	0.05
196	0.06
197	0.06
198	0.05
199	0.05
200	0.05
201	0.06
202	0.06
203	0.06
204	0.06
205	0.05
206	0.05
207	0.05
208	0.07
209	0.11
210	0.12
211	0.13
212	0.18
213	0.19
214	0.21
215	0.25
216	0.25
217	0.25
218	0.25
219	0.26
220	0.29
221	0.29
222	0.28
223	0.26
224	0.26
225	0.21
226	0.22
227	0.21
228	0.15
229	0.16
230	0.18
231	0.2
232	0.21
233	0.27
234	0.34
235	0.4
236	0.41
237	0.45
238	0.46
239	0.48
240	0.49
241	0.45
242	0.36
243	0.29
244	0.29
245	0.24
246	0.21
247	0.17
248	0.15
249	0.14
250	0.16
251	0.17
252	0.15
253	0.16
254	0.18
255	0.24
256	0.3
257	0.35
258	0.38
259	0.38
260	0.42
261	0.43
262	0.4
263	0.36
264	0.3
265	0.27
266	0.22
267	0.2
268	0.16
269	0.13
270	0.12
271	0.09
272	0.06
273	0.05
274	0.06
275	0.06
276	0.06
277	0.06
278	0.06
279	0.06
280	0.1
281	0.17
282	0.24
283	0.29
284	0.31
285	0.33
286	0.34
287	0.38
288	0.36
289	0.3
290	0.26
291	0.25
292	0.23
293	0.25
294	0.24
295	0.21
296	0.2
297	0.2
298	0.16
299	0.12
300	0.11
301	0.08
302	0.08
303	0.08
304	0.09
305	0.08
306	0.08
307	0.08
308	0.09
309	0.09
310	0.1
311	0.1
312	0.09
313	0.09
314	0.1
315	0.12
316	0.11
317	0.11
318	0.09
319	0.11
320	0.13
321	0.14
322	0.17
323	0.22
324	0.31
325	0.42
326	0.51
327	0.56
328	0.61
329	0.67
330	0.7
331	0.68
332	0.65
333	0.59
334	0.53
335	0.49
336	0.45
337	0.38
338	0.32
339	0.28
340	0.26
341	0.23
342	0.22
343	0.21
344	0.17
345	0.17
346	0.16
347	0.16
348	0.11
349	0.1
350	0.09
351	0.08
352	0.08
353	0.08
354	0.08
355	0.08
356	0.08
357	0.08
358	0.06
359	0.06
360	0.06
361	0.06
362	0.05
363	0.06
364	0.06
365	0.06
366	0.07
367	0.08
368	0.09
369	0.09
370	0.09
371	0.09
372	0.1
373	0.09
374	0.09
375	0.08
376	0.1
377	0.12
378	0.12
379	0.1
380	0.09
381	0.12
382	0.12
383	0.12
384	0.09
385	0.07
386	0.08
387	0.09
388	0.09
389	0.07
390	0.07
391	0.07
392	0.13
393	0.14
394	0.14
395	0.15
396	0.15
397	0.18
398	0.19
399	0.24
400	0.19
401	0.19
402	0.2
403	0.2
404	0.2
405	0.18
406	0.18
407	0.12
408	0.13
409	0.13
410	0.13
411	0.18
412	0.17
413	0.16
414	0.15
415	0.16
416	0.18
417	0.18
418	0.18
419	0.13
420	0.14
421	0.16
422	0.17
423	0.16
424	0.15
425	0.16
426	0.16
427	0.17
428	0.16
429	0.13
430	0.13
431	0.13
432	0.12
433	0.1
434	0.09
435	0.07
436	0.07
437	0.08
438	0.08
439	0.08
440	0.08
441	0.09
442	0.08
443	0.08
444	0.08
445	0.06
446	0.07
447	0.07
448	0.08
449	0.09
450	0.12
451	0.14
452	0.16
453	0.22
454	0.22
455	0.22
456	0.2
457	0.19
458	0.16
459	0.15
460	0.13
461	0.08
462	0.09
463	0.1
464	0.09
465	0.09
466	0.15
467	0.16
468	0.18
469	0.21
470	0.21
471	0.25
472	0.26
473	0.32
474	0.31
475	0.37
476	0.37
477	0.37
478	0.38
479	0.34
480	0.33
481	0.28
482	0.24
483	0.18
484	0.19
485	0.22
486	0.22
487	0.25
488	0.29
489	0.32
490	0.37
491	0.42
492	0.5
493	0.53
494	0.59
495	0.61
496	0.63
497	0.68
498	0.71
499	0.74
500	0.74
501	0.76
502	0.73
503	0.71
504	0.67
505	0.65
506	0.64
507	0.61
508	0.58
509	0.5
510	0.44
511	0.4
512	0.38
513	0.31
514	0.25
515	0.17
516	0.11
517	0.11
518	0.14
519	0.19
520	0.21
521	0.24
522	0.26
523	0.31
524	0.32
525	0.32
526	0.3
527	0.25
528	0.24
529	0.22
530	0.21
531	0.16
532	0.16
533	0.16
534	0.16
535	0.16
536	0.16
537	0.21
538	0.24
539	0.27
540	0.33
541	0.39
542	0.47
543	0.56
544	0.62
545	0.67
546	0.73
547	0.8
548	0.82
549	0.85
550	0.88
551	0.89
552	0.9
553	0.91
554	0.91
555	0.9
556	0.9
557	0.87
558	0.87
559	0.79
560	0.72
561	0.65
562	0.58
563	0.52
564	0.5
565	0.46
566	0.35
567	0.36
568	0.41
569	0.41
570	0.4
571	0.45
572	0.45
573	0.42
574	0.45
575	0.44
576	0.41
577	0.43
578	0.44
579	0.43
580	0.38
581	0.38
582	0.36
583	0.34
584	0.32
585	0.34
586	0.4
587	0.36
588	0.42
589	0.46
590	0.45
591	0.46
592	0.48
593	0.45
594	0.37
595	0.39
596	0.34
597	0.31
598	0.31
599	0.3
600	0.25
601	0.21
602	0.2
603	0.14
604	0.11
605	0.08
606	0.09
607	0.11
608	0.12
609	0.11
610	0.11
611	0.12
612	0.14
613	0.16
614	0.19
615	0.22
616	0.22
617	0.24
618	0.26
619	0.27
620	0.24
621	0.22
622	0.18
623	0.13
624	0.12
625	0.11
626	0.09
627	0.07
628	0.07
629	0.07
630	0.07
631	0.08
632	0.1
633	0.09
634	0.08
635	0.08
636	0.09
637	0.09
638	0.1
639	0.12
640	0.15
641	0.16
642	0.26
643	0.31
644	0.32
645	0.34
646	0.37
647	0.4
648	0.45
649	0.51
650	0.48
651	0.51
652	0.51
653	0.49
654	0.46
655	0.42
656	0.35
657	0.28
658	0.22
659	0.14
660	0.12
661	0.13
662	0.13
663	0.14
664	0.15
665	0.16
666	0.25
667	0.27
668	0.3
669	0.34
670	0.36
671	0.41
672	0.48
673	0.55
674	0.56
675	0.64
676	0.72
677	0.71
678	0.72
679	0.67
680	0.59
681	0.54
682	0.48
683	0.45
684	0.41
685	0.4
686	0.38
687	0.37
688	0.38
689	0.37
690	0.4
691	0.39
692	0.43
693	0.42
694	0.44
695	0.45
696	0.41
697	0.39
698	0.39
699	0.34
700	0.3
701	0.34
702	0.35
703	0.33
704	0.35
705	0.41
706	0.41
707	0.41
708	0.37
709	0.35
710	0.37
711	0.4
712	0.41
713	0.37
714	0.37
715	0.39
716	0.39
717	0.38
718	0.34
719	0.31
720	0.3
721	0.26
722	0.21
723	0.18
724	0.17
725	0.14
726	0.11
727	0.11
728	0.13
729	0.14
730	0.16
731	0.18
732	0.17
733	0.17
734	0.18
735	0.19
736	0.15
737	0.16
738	0.16
739	0.16

P40028

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer