Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P38141

Protein Details
Accession P38141    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MVNSKRQQRSKKVASSSKVPHydrophilic
25-50RTFTGCWACRFKKRRCDENRPICSLCHydrophilic
81-106SLQARKSKSKPLCQKISKSRFKQMTHHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21, mito_nucl 12.833, cyto_nucl 11.833, mito 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036864  Zn2-C6_fun-type_DNA-bd_sf  
IPR001138  Zn2Cys6_DnaBD  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0000978  F:RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0090180  P:positive regulation of thiamine biosynthetic process  
GO:0045944  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0009228  P:thiamine biosynthetic process  
KEGG sce:YBR240C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00172  Zn_clus  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00463  ZN2_CY6_FUNGAL_1  
PS50048  ZN2_CY6_FUNGAL_2  
CDD cd00067  GAL4  
Amino Acid Sequences MVNSKRQQRSKKVASSSKVPPTKGRTFTGCWACRFKKRRCDENRPICSLCAKHGDNCSYDIRLMWLEENIYKVRKHSLISSLQARKSKSKPLCQKISKSRFKQMTHFRQLSPPTSDCEDSVHEASKETTLPNDNTFTISVRRLKIYNNAVASVFGSMTNRDYTQKRIDKKLDELLNMVENDISVVNLNCSKHGPYSVFRANPAAVTSALTDQLPSPGHSMSSAEETTTAALSSPPEDSTSLIDIIQGKIFGILWFNCYGNMILNRQEYTTWFINKMRNSLTTEFIRFLGKIIDDPDINMASCLFKECIARWSCVDWQSIAITMLVIIHGYTCPNLTKLLRVWFLQQKLLRFSMYPLVNFIINNTQDLDVLYHCNGLLGNADLFEDPYQDELTSELHVLVTERLVNSWKDTILQQLCSCQDTTLSCSQLRYWQLQLKCNQQFYKDVYAMQD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.8
3 0.78
4 0.78
5 0.74
6 0.67
7 0.65
8 0.64
9 0.68
10 0.66
11 0.62
12 0.58
13 0.56
14 0.63
15 0.65
16 0.62
17 0.58
18 0.62
19 0.63
20 0.67
21 0.72
22 0.72
23 0.72
24 0.77
25 0.82
26 0.83
27 0.88
28 0.89
29 0.9
30 0.89
31 0.86
32 0.78
33 0.69
34 0.65
35 0.56
36 0.49
37 0.47
38 0.41
39 0.39
40 0.44
41 0.46
42 0.42
43 0.44
44 0.42
45 0.35
46 0.33
47 0.27
48 0.23
49 0.2
50 0.19
51 0.17
52 0.15
53 0.15
54 0.16
55 0.19
56 0.2
57 0.21
58 0.21
59 0.21
60 0.27
61 0.27
62 0.28
63 0.3
64 0.34
65 0.37
66 0.42
67 0.5
68 0.51
69 0.53
70 0.56
71 0.55
72 0.55
73 0.54
74 0.58
75 0.57
76 0.61
77 0.66
78 0.71
79 0.78
80 0.78
81 0.84
82 0.85
83 0.87
84 0.87
85 0.82
86 0.82
87 0.8
88 0.76
89 0.75
90 0.75
91 0.75
92 0.75
93 0.73
94 0.65
95 0.63
96 0.64
97 0.59
98 0.54
99 0.45
100 0.38
101 0.38
102 0.37
103 0.3
104 0.28
105 0.26
106 0.23
107 0.24
108 0.23
109 0.19
110 0.19
111 0.2
112 0.19
113 0.17
114 0.13
115 0.15
116 0.17
117 0.18
118 0.2
119 0.21
120 0.2
121 0.21
122 0.21
123 0.2
124 0.18
125 0.21
126 0.24
127 0.24
128 0.25
129 0.25
130 0.27
131 0.33
132 0.36
133 0.36
134 0.32
135 0.32
136 0.29
137 0.28
138 0.26
139 0.19
140 0.13
141 0.08
142 0.08
143 0.07
144 0.09
145 0.1
146 0.11
147 0.14
148 0.16
149 0.2
150 0.29
151 0.36
152 0.4
153 0.46
154 0.51
155 0.51
156 0.54
157 0.57
158 0.5
159 0.44
160 0.4
161 0.33
162 0.3
163 0.26
164 0.21
165 0.13
166 0.1
167 0.09
168 0.08
169 0.07
170 0.04
171 0.04
172 0.05
173 0.08
174 0.09
175 0.09
176 0.1
177 0.11
178 0.11
179 0.14
180 0.15
181 0.14
182 0.21
183 0.26
184 0.25
185 0.25
186 0.26
187 0.24
188 0.22
189 0.21
190 0.15
191 0.09
192 0.09
193 0.09
194 0.08
195 0.09
196 0.08
197 0.08
198 0.07
199 0.09
200 0.09
201 0.09
202 0.1
203 0.09
204 0.09
205 0.09
206 0.1
207 0.08
208 0.11
209 0.1
210 0.08
211 0.09
212 0.09
213 0.09
214 0.08
215 0.07
216 0.04
217 0.04
218 0.05
219 0.05
220 0.06
221 0.06
222 0.07
223 0.07
224 0.08
225 0.09
226 0.1
227 0.09
228 0.09
229 0.1
230 0.1
231 0.1
232 0.1
233 0.08
234 0.07
235 0.06
236 0.07
237 0.06
238 0.07
239 0.06
240 0.08
241 0.09
242 0.09
243 0.09
244 0.1
245 0.1
246 0.1
247 0.12
248 0.12
249 0.14
250 0.15
251 0.16
252 0.15
253 0.16
254 0.14
255 0.18
256 0.2
257 0.18
258 0.19
259 0.22
260 0.27
261 0.28
262 0.3
263 0.27
264 0.27
265 0.3
266 0.3
267 0.31
268 0.29
269 0.29
270 0.26
271 0.25
272 0.23
273 0.18
274 0.17
275 0.14
276 0.11
277 0.11
278 0.12
279 0.13
280 0.11
281 0.12
282 0.13
283 0.12
284 0.12
285 0.1
286 0.09
287 0.08
288 0.08
289 0.1
290 0.08
291 0.09
292 0.11
293 0.12
294 0.2
295 0.22
296 0.23
297 0.22
298 0.25
299 0.28
300 0.29
301 0.29
302 0.22
303 0.21
304 0.2
305 0.19
306 0.16
307 0.12
308 0.08
309 0.07
310 0.07
311 0.05
312 0.05
313 0.04
314 0.04
315 0.04
316 0.05
317 0.05
318 0.06
319 0.07
320 0.08
321 0.12
322 0.12
323 0.16
324 0.2
325 0.26
326 0.27
327 0.27
328 0.33
329 0.36
330 0.38
331 0.41
332 0.4
333 0.37
334 0.39
335 0.4
336 0.35
337 0.28
338 0.28
339 0.29
340 0.29
341 0.25
342 0.23
343 0.22
344 0.22
345 0.21
346 0.21
347 0.2
348 0.18
349 0.19
350 0.18
351 0.17
352 0.17
353 0.18
354 0.17
355 0.11
356 0.14
357 0.13
358 0.12
359 0.11
360 0.12
361 0.11
362 0.1
363 0.1
364 0.09
365 0.09
366 0.08
367 0.09
368 0.09
369 0.1
370 0.1
371 0.1
372 0.08
373 0.1
374 0.1
375 0.1
376 0.1
377 0.09
378 0.11
379 0.11
380 0.11
381 0.09
382 0.09
383 0.09
384 0.1
385 0.1
386 0.1
387 0.11
388 0.11
389 0.12
390 0.15
391 0.16
392 0.19
393 0.2
394 0.19
395 0.19
396 0.19
397 0.28
398 0.28
399 0.32
400 0.29
401 0.32
402 0.34
403 0.34
404 0.34
405 0.25
406 0.24
407 0.22
408 0.27
409 0.27
410 0.29
411 0.28
412 0.29
413 0.31
414 0.35
415 0.37
416 0.36
417 0.37
418 0.41
419 0.45
420 0.51
421 0.56
422 0.59
423 0.63
424 0.67
425 0.63
426 0.58
427 0.59
428 0.57
429 0.6
430 0.51