Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0A1TN39

Protein Details
Accession A0A0A1TN39    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MARRRMKKRTHMGANNPEPNAHydrophilic
362-405AEVKELEKRWQQRRQEKDARKREQKANVERKKAEKEARKGRGKABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
369-405KRWQQRRQEKDARKREQKANVERKKAEKEARKGRGKA
Subcellular Location(s) nucl 15, mito 9, cyto_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR045112  PPAN-like  
Gene Ontology GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MARRRMKKRTHMGANNPEPNAPAHASAKDPKSMVIRIGAGEVGSSISQLATDVRRVMEPGTASRLRERRANRLRDYVVMCGPLGVTHLVLFSRSESGNTNMRLALTPRGPTMHFRVDKYSLCKDVQRVQKHPKGMGKEFLTAPLLVMNNMSSPDADSNSAVPKHLESLATTVFRSLFPPINPQATPLKSIRRVVLINREQEEDGTFILNFRHYAITTKLAGVSKQLRRINAAEKLVTTKTSRHGQMPNLGKLQDISDYMIGGEGGDGYMTDATSGSEADTDAEVEVVDNAPRKVMSTKARLAAELNAASAGPEEATTEENVERRAVKLVELGPRMRLRLTKVEEGMCGGKIMWHEYVKKTNAEVKELEKRWQQRRQEKDARKREQKANVERKKAEKEARKGRGKAGEDEEDDDDEDMEDYSDYEDYNHVAASRKKEDEEEEDEEWEDEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.9
2 0.87
3 0.77
4 0.67
5 0.57
6 0.49
7 0.43
8 0.34
9 0.28
10 0.24
11 0.24
12 0.29
13 0.35
14 0.37
15 0.36
16 0.34
17 0.34
18 0.36
19 0.37
20 0.34
21 0.3
22 0.29
23 0.25
24 0.26
25 0.22
26 0.17
27 0.14
28 0.12
29 0.09
30 0.08
31 0.07
32 0.06
33 0.05
34 0.05
35 0.06
36 0.09
37 0.1
38 0.13
39 0.14
40 0.15
41 0.16
42 0.17
43 0.18
44 0.18
45 0.18
46 0.19
47 0.25
48 0.26
49 0.27
50 0.35
51 0.4
52 0.39
53 0.45
54 0.47
55 0.51
56 0.58
57 0.66
58 0.63
59 0.66
60 0.66
61 0.65
62 0.62
63 0.55
64 0.47
65 0.39
66 0.33
67 0.25
68 0.22
69 0.15
70 0.14
71 0.1
72 0.08
73 0.07
74 0.08
75 0.07
76 0.08
77 0.09
78 0.08
79 0.11
80 0.11
81 0.12
82 0.14
83 0.18
84 0.24
85 0.25
86 0.25
87 0.22
88 0.23
89 0.23
90 0.22
91 0.24
92 0.2
93 0.21
94 0.2
95 0.22
96 0.22
97 0.25
98 0.29
99 0.33
100 0.34
101 0.34
102 0.39
103 0.41
104 0.44
105 0.46
106 0.45
107 0.39
108 0.38
109 0.39
110 0.38
111 0.42
112 0.47
113 0.49
114 0.52
115 0.57
116 0.61
117 0.62
118 0.64
119 0.61
120 0.59
121 0.55
122 0.54
123 0.47
124 0.45
125 0.41
126 0.37
127 0.33
128 0.25
129 0.22
130 0.17
131 0.15
132 0.11
133 0.11
134 0.09
135 0.08
136 0.09
137 0.09
138 0.06
139 0.07
140 0.08
141 0.09
142 0.1
143 0.1
144 0.1
145 0.14
146 0.14
147 0.14
148 0.13
149 0.12
150 0.13
151 0.14
152 0.13
153 0.1
154 0.13
155 0.15
156 0.15
157 0.15
158 0.13
159 0.13
160 0.12
161 0.13
162 0.13
163 0.14
164 0.13
165 0.2
166 0.21
167 0.24
168 0.24
169 0.25
170 0.28
171 0.26
172 0.29
173 0.26
174 0.3
175 0.31
176 0.33
177 0.31
178 0.29
179 0.29
180 0.29
181 0.37
182 0.35
183 0.35
184 0.35
185 0.35
186 0.31
187 0.3
188 0.28
189 0.18
190 0.13
191 0.09
192 0.08
193 0.07
194 0.07
195 0.07
196 0.07
197 0.07
198 0.08
199 0.07
200 0.1
201 0.11
202 0.14
203 0.14
204 0.14
205 0.15
206 0.14
207 0.14
208 0.16
209 0.22
210 0.22
211 0.29
212 0.31
213 0.29
214 0.32
215 0.34
216 0.36
217 0.33
218 0.32
219 0.24
220 0.23
221 0.25
222 0.23
223 0.22
224 0.18
225 0.15
226 0.18
227 0.23
228 0.24
229 0.26
230 0.29
231 0.3
232 0.37
233 0.41
234 0.4
235 0.36
236 0.34
237 0.29
238 0.26
239 0.24
240 0.18
241 0.12
242 0.1
243 0.08
244 0.08
245 0.08
246 0.07
247 0.06
248 0.05
249 0.04
250 0.03
251 0.03
252 0.02
253 0.02
254 0.03
255 0.03
256 0.03
257 0.03
258 0.03
259 0.04
260 0.04
261 0.04
262 0.04
263 0.04
264 0.04
265 0.05
266 0.05
267 0.05
268 0.05
269 0.05
270 0.05
271 0.04
272 0.05
273 0.04
274 0.05
275 0.07
276 0.07
277 0.08
278 0.08
279 0.09
280 0.1
281 0.17
282 0.22
283 0.27
284 0.31
285 0.36
286 0.37
287 0.36
288 0.36
289 0.32
290 0.29
291 0.22
292 0.18
293 0.13
294 0.12
295 0.11
296 0.1
297 0.08
298 0.04
299 0.04
300 0.04
301 0.05
302 0.06
303 0.07
304 0.08
305 0.1
306 0.11
307 0.12
308 0.13
309 0.13
310 0.13
311 0.17
312 0.15
313 0.14
314 0.18
315 0.21
316 0.27
317 0.29
318 0.29
319 0.31
320 0.32
321 0.33
322 0.3
323 0.29
324 0.27
325 0.32
326 0.37
327 0.38
328 0.39
329 0.4
330 0.38
331 0.38
332 0.35
333 0.25
334 0.2
335 0.14
336 0.13
337 0.12
338 0.15
339 0.16
340 0.18
341 0.22
342 0.26
343 0.34
344 0.35
345 0.36
346 0.36
347 0.39
348 0.38
349 0.39
350 0.37
351 0.36
352 0.43
353 0.43
354 0.46
355 0.47
356 0.53
357 0.59
358 0.65
359 0.69
360 0.69
361 0.76
362 0.81
363 0.84
364 0.86
365 0.87
366 0.89
367 0.89
368 0.9
369 0.89
370 0.88
371 0.87
372 0.86
373 0.87
374 0.87
375 0.86
376 0.85
377 0.82
378 0.81
379 0.79
380 0.77
381 0.76
382 0.74
383 0.76
384 0.77
385 0.82
386 0.83
387 0.78
388 0.77
389 0.77
390 0.71
391 0.68
392 0.64
393 0.6
394 0.53
395 0.53
396 0.47
397 0.39
398 0.36
399 0.29
400 0.22
401 0.15
402 0.13
403 0.1
404 0.08
405 0.07
406 0.07
407 0.08
408 0.08
409 0.07
410 0.08
411 0.09
412 0.1
413 0.1
414 0.11
415 0.11
416 0.17
417 0.23
418 0.3
419 0.36
420 0.39
421 0.4
422 0.43
423 0.47
424 0.48
425 0.5
426 0.48
427 0.42
428 0.4
429 0.39