Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q12069

Protein Details
Accession Q12069    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
46-77QNEVEREREIQKKKKIKRTQSKKSPDLINKSTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
56-68QKKKKIKRTQSKK
Subcellular Location(s) mito 15, mito_nucl 12.833, nucl 9.5, cyto_mito 9.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR006224  PsdUridine_synth_RluA-like_CS  
IPR006225  PsdUridine_synth_RluC/D  
IPR006145  PsdUridine_synth_RsuA/RluA  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005739  C:mitochondrion  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0106029  F:tRNA pseudouridine synthase activity  
GO:0000455  P:enzyme-directed rRNA pseudouridine synthesis  
GO:0031119  P:tRNA pseudouridine synthesis  
KEGG sce:YDL036C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00849  PseudoU_synth_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01129  PSI_RLU  
PS50889  S4  
CDD cd02557  PseudoU_synth_ScRIB2  
Amino Acid Sequences MQRNNRLRNLFTVPVIMARQLKRNALSAGLAFAGNATSNEFDEHLQNEVEREREIQKKKKIKRTQSKKSPDLINKSTFQSRTIGSKKEKHRQLDPEYEIVIDGPLRKIKPYHFTYRTFCKERWRDKKLVDVFISEFRDRESEYYKRTIENGDVHINDETADLSTVIRNGDLITHQVHRHEPPVTSRPIKVIFEDDNIMVIDKPSGIPVHPTGRYRFNTITKMLQNNLGFVVNPCNRLDRLTSGLMFLAKTPKGADNIGDQLKAREVTKEYVAKVVGEFPETEVIVEKPLKLIEPRLALNAVCQMDEKGAKHAKTVFNRISYDGKTSIVKCKPLTGRSHQIRVHLQYLGHPIANDPIYSNDEVWGNNLGKGGQADFDIVITKLDEIGKRKPAKSWFHSNGGYGEVLRQEKCSICESDLYTDPGPNDLDLWLHAYLYESTETEEGTEKKKWCYKTEYPEWALRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.32
3 0.3
4 0.3
5 0.29
6 0.36
7 0.37
8 0.42
9 0.41
10 0.44
11 0.41
12 0.36
13 0.36
14 0.28
15 0.25
16 0.21
17 0.18
18 0.13
19 0.12
20 0.1
21 0.08
22 0.08
23 0.08
24 0.09
25 0.09
26 0.11
27 0.12
28 0.13
29 0.15
30 0.16
31 0.16
32 0.16
33 0.15
34 0.17
35 0.18
36 0.18
37 0.16
38 0.19
39 0.23
40 0.32
41 0.41
42 0.48
43 0.56
44 0.65
45 0.74
46 0.82
47 0.86
48 0.88
49 0.9
50 0.92
51 0.93
52 0.93
53 0.94
54 0.91
55 0.88
56 0.86
57 0.84
58 0.82
59 0.77
60 0.72
61 0.64
62 0.61
63 0.6
64 0.51
65 0.44
66 0.37
67 0.33
68 0.37
69 0.39
70 0.43
71 0.43
72 0.51
73 0.59
74 0.66
75 0.72
76 0.69
77 0.72
78 0.74
79 0.74
80 0.75
81 0.69
82 0.62
83 0.54
84 0.48
85 0.4
86 0.3
87 0.23
88 0.14
89 0.11
90 0.11
91 0.15
92 0.15
93 0.17
94 0.2
95 0.25
96 0.33
97 0.38
98 0.45
99 0.47
100 0.52
101 0.56
102 0.63
103 0.67
104 0.63
105 0.59
106 0.59
107 0.63
108 0.68
109 0.73
110 0.71
111 0.69
112 0.67
113 0.75
114 0.7
115 0.68
116 0.58
117 0.5
118 0.45
119 0.44
120 0.46
121 0.36
122 0.29
123 0.23
124 0.23
125 0.2
126 0.21
127 0.21
128 0.21
129 0.25
130 0.3
131 0.31
132 0.3
133 0.31
134 0.3
135 0.29
136 0.28
137 0.28
138 0.27
139 0.26
140 0.27
141 0.25
142 0.23
143 0.19
144 0.15
145 0.11
146 0.07
147 0.07
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.07
152 0.07
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.06
157 0.07
158 0.08
159 0.09
160 0.12
161 0.13
162 0.15
163 0.18
164 0.18
165 0.21
166 0.21
167 0.2
168 0.23
169 0.28
170 0.32
171 0.32
172 0.31
173 0.32
174 0.33
175 0.32
176 0.27
177 0.26
178 0.22
179 0.21
180 0.22
181 0.18
182 0.15
183 0.14
184 0.14
185 0.09
186 0.08
187 0.06
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.06
192 0.05
193 0.08
194 0.1
195 0.15
196 0.18
197 0.2
198 0.22
199 0.29
200 0.3
201 0.32
202 0.34
203 0.33
204 0.34
205 0.34
206 0.36
207 0.33
208 0.34
209 0.3
210 0.31
211 0.27
212 0.24
213 0.23
214 0.17
215 0.14
216 0.12
217 0.19
218 0.15
219 0.17
220 0.16
221 0.18
222 0.18
223 0.19
224 0.2
225 0.14
226 0.16
227 0.16
228 0.16
229 0.15
230 0.15
231 0.14
232 0.12
233 0.11
234 0.11
235 0.1
236 0.1
237 0.11
238 0.12
239 0.14
240 0.14
241 0.14
242 0.13
243 0.18
244 0.18
245 0.18
246 0.16
247 0.15
248 0.16
249 0.16
250 0.14
251 0.12
252 0.13
253 0.14
254 0.19
255 0.22
256 0.21
257 0.22
258 0.22
259 0.19
260 0.18
261 0.19
262 0.14
263 0.12
264 0.11
265 0.1
266 0.11
267 0.11
268 0.11
269 0.09
270 0.08
271 0.1
272 0.11
273 0.1
274 0.09
275 0.09
276 0.11
277 0.11
278 0.13
279 0.14
280 0.16
281 0.17
282 0.18
283 0.19
284 0.17
285 0.17
286 0.2
287 0.16
288 0.14
289 0.13
290 0.12
291 0.13
292 0.16
293 0.16
294 0.18
295 0.23
296 0.23
297 0.25
298 0.31
299 0.36
300 0.39
301 0.46
302 0.43
303 0.42
304 0.44
305 0.44
306 0.43
307 0.37
308 0.36
309 0.28
310 0.26
311 0.25
312 0.26
313 0.32
314 0.31
315 0.34
316 0.31
317 0.38
318 0.42
319 0.45
320 0.5
321 0.49
322 0.55
323 0.57
324 0.65
325 0.59
326 0.59
327 0.59
328 0.56
329 0.51
330 0.43
331 0.37
332 0.32
333 0.36
334 0.32
335 0.26
336 0.22
337 0.19
338 0.21
339 0.22
340 0.18
341 0.13
342 0.14
343 0.17
344 0.18
345 0.17
346 0.15
347 0.15
348 0.15
349 0.16
350 0.19
351 0.16
352 0.16
353 0.16
354 0.15
355 0.15
356 0.15
357 0.14
358 0.1
359 0.09
360 0.09
361 0.09
362 0.09
363 0.09
364 0.08
365 0.08
366 0.08
367 0.08
368 0.09
369 0.12
370 0.16
371 0.19
372 0.25
373 0.34
374 0.41
375 0.42
376 0.47
377 0.53
378 0.59
379 0.62
380 0.66
381 0.63
382 0.64
383 0.64
384 0.59
385 0.52
386 0.44
387 0.37
388 0.27
389 0.23
390 0.21
391 0.22
392 0.21
393 0.21
394 0.22
395 0.24
396 0.26
397 0.28
398 0.26
399 0.24
400 0.28
401 0.29
402 0.31
403 0.31
404 0.34
405 0.3
406 0.3
407 0.28
408 0.26
409 0.24
410 0.19
411 0.17
412 0.13
413 0.13
414 0.11
415 0.14
416 0.12
417 0.11
418 0.11
419 0.12
420 0.13
421 0.14
422 0.15
423 0.12
424 0.14
425 0.14
426 0.14
427 0.13
428 0.18
429 0.19
430 0.22
431 0.28
432 0.29
433 0.38
434 0.45
435 0.49
436 0.51
437 0.58
438 0.63
439 0.67
440 0.74
441 0.75
442 0.74