FuNGI

Q02792

Protein Details

Accession

Q02792

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
103-122	GVAPRAKMNQQRARRFRSAR	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
402-410	KKEAFERRK

Subcellular Location(s)

nucl 16.5, mito_nucl 12, mito 6.5, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4
Gene Ontology	GO:0090730 C:Las1 complex GO:0005739 C:mitochondrion GO:0005634 C:nucleus GO:0110103 C:RNA polymerase II termination complex GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003729 F:mRNA binding GO:0003723 F:RNA binding GO:0019843 F:rRNA binding GO:0000448 P:cleavage in ITS2 between 5.8S rRNA and LSU-rRNA of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0006397 P:mRNA processing GO:0034244 P:negative regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0071028 P:nuclear mRNA surveillance GO:0071035 P:nuclear polyadenylation-dependent rRNA catabolic process GO:0000956 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process GO:1904595 P:positive regulation of termination of RNA polymerase II transcription GO:0006364 P:rRNA processing GO:0043144 P:sno(s)RNA processing GO:0030847 P:termination of RNA polymerase II transcription, exosome-dependent GO:0030846 P:termination of RNA polymerase II transcription, poly(A)-coupled
KEGG	sce:YOR048C -
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGVPSFFRWLSRKYPKIISPVLEEQPQIVDGVILPLDYSASNPNGELDNLYLDMNGIVHPCSHPENKPPPETEDEMLLAVFEYTNRVLNMARPRKVLVMAVDGVAPRAKMNQQRARRFRSARDAQIENEAREEIMRQREEVGEIIDDAVRNKKTWDSNAITPGTPFMDKLAAALRYWTAFKLATDPGWKNLQVIISDATVPGEGEHKIMNFIRSQRADPEYNPNTTHCIYGLDADLIFLGLATHEPHFKILREDVFAQDNRKRNNLKDTINMTEEEKQFLQKQNSEQPFLWLHINVLREYLSAELWVPGLPFTFDLERAIDDWVFMCFFCGNDFLPHLPCLDVRENSIDILLDIWKVVLPKLKTYMTCDGVLNLPSVETLLQHLGSREGDIFKTRHIQEARKKEAFERRKAQKNMSKGQDRHPTVATEQLQMYDTQGNLAKGSWNLTTSDMVRLKKELMLANEGNEEAIAKVKQQSDKNNELMKDISKEEIDDAVSKANKTNFNLAEVMKQKIINKKHRLEKDNEEEEIAKDSKKVKTEKAESECDLDAEIKDEIVADVNDRENSETTEVSRDSPVHSTVNVSEGPKNGVFDTDEFVKLFEPGYHERYYTAKFHVTPQDIEQLRKDMVKCYIEGVAWVLMYYYQGCASWNWFYPYHYAPLATDFHGFSHLEIKFEEGTPFLPYEQLMSVLPAASGHALPKIFRSLMSEPDSEIIDFYPEEFPIDMNGKKMSWQGIALLPFIDQDRLLTAVRAQYPLLSDAERARNIRGEPVLLISNKNANYERFSKKLYSKENNNNNVVVKFQHFKSGLSGIVSKDVEGFELNGKIVCPIQGGSLPNLSTTLILKMSYRLIPLPSRNKSIILNGFIPSEPVLTAYDLDSIMYKYNNQNYSRRWNFGNDLKQNIVPVGPKGITQYKPRTGGYRAFFYFAELSRNNVQPAHNYGRNSYNSQPGFNNSRYDGGNNNYRQNSNYRNNNYSGNRNSGQYSGNSYSRNNKQSRYDNSRANRR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.62
2	0.64
3	0.68
4	0.69
5	0.62
6	0.59
7	0.59
8	0.57
9	0.52
10	0.46
11	0.38
12	0.34
13	0.3
14	0.23
15	0.15
16	0.11
17	0.08
18	0.1
19	0.09
20	0.07
21	0.07
22	0.06
23	0.07
24	0.07
25	0.09
26	0.11
27	0.13
28	0.14
29	0.14
30	0.16
31	0.16
32	0.17
33	0.17
34	0.13
35	0.14
36	0.14
37	0.14
38	0.12
39	0.11
40	0.1
41	0.1
42	0.09
43	0.08
44	0.08
45	0.09
46	0.1
47	0.13
48	0.19
49	0.24
50	0.27
51	0.36
52	0.46
53	0.52
54	0.58
55	0.58
56	0.58
57	0.59
58	0.59
59	0.51
60	0.43
61	0.37
62	0.31
63	0.27
64	0.21
65	0.15
66	0.1
67	0.09
68	0.06
69	0.08
70	0.09
71	0.12
72	0.12
73	0.13
74	0.13
75	0.2
76	0.31
77	0.37
78	0.4
79	0.4
80	0.42
81	0.44
82	0.45
83	0.42
84	0.33
85	0.3
86	0.26
87	0.25
88	0.24
89	0.21
90	0.2
91	0.18
92	0.15
93	0.1
94	0.13
95	0.19
96	0.26
97	0.36
98	0.45
99	0.54
100	0.65
101	0.74
102	0.79
103	0.82
104	0.8
105	0.77
106	0.78
107	0.77
108	0.75
109	0.73
110	0.67
111	0.58
112	0.63
113	0.59
114	0.49
115	0.42
116	0.33
117	0.26
118	0.24
119	0.24
120	0.2
121	0.24
122	0.25
123	0.24
124	0.26
125	0.27
126	0.28
127	0.27
128	0.22
129	0.15
130	0.14
131	0.14
132	0.13
133	0.12
134	0.12
135	0.18
136	0.17
137	0.17
138	0.19
139	0.24
140	0.29
141	0.33
142	0.4
143	0.4
144	0.44
145	0.5
146	0.51
147	0.45
148	0.39
149	0.36
150	0.3
151	0.24
152	0.19
153	0.13
154	0.13
155	0.12
156	0.13
157	0.17
158	0.15
159	0.15
160	0.16
161	0.16
162	0.16
163	0.17
164	0.16
165	0.13
166	0.13
167	0.13
168	0.16
169	0.17
170	0.19
171	0.25
172	0.26
173	0.27
174	0.31
175	0.31
176	0.27
177	0.28
178	0.27
179	0.2
180	0.21
181	0.19
182	0.15
183	0.15
184	0.14
185	0.12
186	0.1
187	0.09
188	0.08
189	0.08
190	0.08
191	0.08
192	0.1
193	0.09
194	0.13
195	0.14
196	0.16
197	0.18
198	0.21
199	0.28
200	0.3
201	0.31
202	0.33
203	0.37
204	0.38
205	0.37
206	0.44
207	0.39
208	0.4
209	0.4
210	0.35
211	0.35
212	0.33
213	0.31
214	0.21
215	0.19
216	0.16
217	0.17
218	0.16
219	0.12
220	0.11
221	0.1
222	0.1
223	0.08
224	0.07
225	0.05
226	0.04
227	0.03
228	0.04
229	0.05
230	0.06
231	0.08
232	0.09
233	0.12
234	0.14
235	0.15
236	0.18
237	0.21
238	0.23
239	0.25
240	0.26
241	0.26
242	0.3
243	0.31
244	0.33
245	0.34
246	0.39
247	0.38
248	0.44
249	0.46
250	0.44
251	0.52
252	0.54
253	0.52
254	0.53
255	0.55
256	0.51
257	0.49
258	0.46
259	0.38
260	0.38
261	0.34
262	0.3
263	0.25
264	0.24
265	0.27
266	0.33
267	0.35
268	0.32
269	0.37
270	0.44
271	0.47
272	0.48
273	0.44
274	0.41
275	0.37
276	0.35
277	0.31
278	0.21
279	0.19
280	0.18
281	0.19
282	0.15
283	0.15
284	0.13
285	0.11
286	0.12
287	0.11
288	0.08
289	0.07
290	0.07
291	0.07
292	0.07
293	0.07
294	0.07
295	0.06
296	0.06
297	0.06
298	0.06
299	0.08
300	0.09
301	0.09
302	0.1
303	0.1
304	0.11
305	0.11
306	0.12
307	0.1
308	0.09
309	0.09
310	0.08
311	0.08
312	0.07
313	0.07
314	0.06
315	0.06
316	0.07
317	0.08
318	0.08
319	0.09
320	0.11
321	0.11
322	0.13
323	0.13
324	0.13
325	0.12
326	0.12
327	0.16
328	0.18
329	0.17
330	0.17
331	0.2
332	0.2
333	0.19
334	0.19
335	0.14
336	0.1
337	0.1
338	0.09
339	0.05
340	0.05
341	0.05
342	0.06
343	0.06
344	0.07
345	0.11
346	0.12
347	0.14
348	0.19
349	0.21
350	0.21
351	0.27
352	0.32
353	0.29
354	0.3
355	0.28
356	0.25
357	0.24
358	0.23
359	0.18
360	0.12
361	0.09
362	0.07
363	0.07
364	0.06
365	0.05
366	0.06
367	0.06
368	0.07
369	0.07
370	0.08
371	0.09
372	0.09
373	0.1
374	0.09
375	0.1
376	0.1
377	0.13
378	0.13
379	0.13
380	0.2
381	0.2
382	0.26
383	0.28
384	0.36
385	0.41
386	0.51
387	0.57
388	0.53
389	0.53
390	0.52
391	0.6
392	0.6
393	0.59
394	0.59
395	0.6
396	0.67
397	0.69
398	0.72
399	0.67
400	0.67
401	0.67
402	0.66
403	0.66
404	0.58
405	0.63
406	0.64
407	0.61
408	0.55
409	0.49
410	0.42
411	0.33
412	0.38
413	0.31
414	0.23
415	0.21
416	0.19
417	0.18
418	0.17
419	0.17
420	0.11
421	0.1
422	0.09
423	0.11
424	0.11
425	0.1
426	0.1
427	0.1
428	0.09
429	0.11
430	0.1
431	0.09
432	0.1
433	0.11
434	0.12
435	0.12
436	0.18
437	0.2
438	0.21
439	0.21
440	0.21
441	0.2
442	0.2
443	0.23
444	0.19
445	0.16
446	0.21
447	0.2
448	0.2
449	0.2
450	0.18
451	0.15
452	0.12
453	0.1
454	0.05
455	0.06
456	0.05
457	0.06
458	0.1
459	0.13
460	0.18
461	0.22
462	0.3
463	0.36
464	0.41
465	0.45
466	0.45
467	0.42
468	0.38
469	0.35
470	0.29
471	0.24
472	0.19
473	0.15
474	0.12
475	0.12
476	0.11
477	0.11
478	0.1
479	0.08
480	0.08
481	0.1
482	0.11
483	0.11
484	0.12
485	0.16
486	0.18
487	0.18
488	0.24
489	0.22
490	0.23
491	0.25
492	0.23
493	0.24
494	0.24
495	0.24
496	0.19
497	0.2
498	0.21
499	0.27
500	0.35
501	0.39
502	0.46
503	0.52
504	0.59
505	0.65
506	0.67
507	0.65
508	0.65
509	0.64
510	0.59
511	0.52
512	0.45
513	0.38
514	0.33
515	0.31
516	0.23
517	0.14
518	0.13
519	0.17
520	0.19
521	0.24
522	0.26
523	0.28
524	0.35
525	0.42
526	0.47
527	0.49
528	0.5
529	0.45
530	0.45
531	0.4
532	0.32
533	0.26
534	0.18
535	0.13
536	0.1
537	0.09
538	0.06
539	0.06
540	0.06
541	0.05
542	0.05
543	0.05
544	0.04
545	0.06
546	0.07
547	0.07
548	0.08
549	0.09
550	0.08
551	0.1
552	0.11
553	0.1
554	0.1
555	0.12
556	0.12
557	0.13
558	0.13
559	0.13
560	0.13
561	0.14
562	0.16
563	0.13
564	0.13
565	0.13
566	0.12
567	0.14
568	0.14
569	0.14
570	0.13
571	0.13
572	0.16
573	0.15
574	0.16
575	0.13
576	0.13
577	0.12
578	0.11
579	0.13
580	0.12
581	0.12
582	0.11
583	0.12
584	0.11
585	0.1
586	0.1
587	0.08
588	0.11
589	0.14
590	0.18
591	0.19
592	0.19
593	0.2
594	0.22
595	0.24
596	0.22
597	0.21
598	0.2
599	0.2
600	0.25
601	0.31
602	0.31
603	0.29
604	0.29
605	0.34
606	0.32
607	0.33
608	0.3
609	0.25
610	0.23
611	0.25
612	0.23
613	0.18
614	0.22
615	0.22
616	0.21
617	0.2
618	0.2
619	0.17
620	0.17
621	0.15
622	0.1
623	0.09
624	0.08
625	0.06
626	0.05
627	0.05
628	0.06
629	0.05
630	0.05
631	0.05
632	0.06
633	0.07
634	0.09
635	0.11
636	0.13
637	0.16
638	0.16
639	0.17
640	0.2
641	0.21
642	0.21
643	0.19
644	0.18
645	0.15
646	0.18
647	0.18
648	0.16
649	0.16
650	0.13
651	0.13
652	0.15
653	0.15
654	0.12
655	0.17
656	0.16
657	0.16
658	0.15
659	0.17
660	0.16
661	0.17
662	0.17
663	0.1
664	0.11
665	0.11
666	0.12
667	0.1
668	0.09
669	0.08
670	0.09
671	0.09
672	0.09
673	0.08
674	0.08
675	0.08
676	0.08
677	0.08
678	0.06
679	0.06
680	0.06
681	0.06
682	0.06
683	0.08
684	0.08
685	0.09
686	0.1
687	0.13
688	0.13
689	0.13
690	0.19
691	0.18
692	0.24
693	0.28
694	0.27
695	0.24
696	0.25
697	0.26
698	0.19
699	0.18
700	0.11
701	0.08
702	0.08
703	0.09
704	0.09
705	0.08
706	0.09
707	0.09
708	0.09
709	0.1
710	0.14
711	0.13
712	0.14
713	0.15
714	0.14
715	0.16
716	0.18
717	0.18
718	0.15
719	0.15
720	0.15
721	0.18
722	0.19
723	0.17
724	0.15
725	0.13
726	0.12
727	0.13
728	0.11
729	0.07
730	0.07
731	0.07
732	0.09
733	0.1
734	0.09
735	0.1
736	0.14
737	0.16
738	0.17
739	0.16
740	0.15
741	0.16
742	0.17
743	0.17
744	0.13
745	0.13
746	0.18
747	0.23
748	0.26
749	0.25
750	0.25
751	0.28
752	0.28
753	0.31
754	0.27
755	0.22
756	0.19
757	0.21
758	0.23
759	0.2
760	0.2
761	0.17
762	0.22
763	0.21
764	0.24
765	0.24
766	0.22
767	0.26
768	0.33
769	0.36
770	0.34
771	0.37
772	0.4
773	0.43
774	0.5
775	0.55
776	0.57
777	0.62
778	0.7
779	0.76
780	0.77
781	0.74
782	0.68
783	0.61
784	0.52
785	0.43
786	0.35
787	0.28
788	0.25
789	0.23
790	0.28
791	0.26
792	0.27
793	0.29
794	0.29
795	0.27
796	0.25
797	0.26
798	0.19
799	0.23
800	0.23
801	0.19
802	0.18
803	0.16
804	0.15
805	0.13
806	0.14
807	0.11
808	0.12
809	0.12
810	0.11
811	0.11
812	0.12
813	0.12
814	0.11
815	0.09
816	0.08
817	0.1
818	0.13
819	0.15
820	0.16
821	0.19
822	0.18
823	0.17
824	0.17
825	0.16
826	0.13
827	0.13
828	0.13
829	0.11
830	0.11
831	0.12
832	0.13
833	0.16
834	0.17
835	0.18
836	0.18
837	0.21
838	0.26
839	0.34
840	0.42
841	0.44
842	0.48
843	0.48
844	0.48
845	0.46
846	0.48
847	0.45
848	0.4
849	0.37
850	0.32
851	0.33
852	0.3
853	0.29
854	0.22
855	0.16
856	0.12
857	0.11
858	0.11
859	0.1
860	0.11
861	0.1
862	0.11
863	0.11
864	0.11
865	0.11
866	0.1
867	0.12
868	0.12
869	0.15
870	0.2
871	0.28
872	0.35
873	0.38
874	0.45
875	0.49
876	0.59
877	0.62
878	0.59
879	0.53
880	0.52
881	0.55
882	0.57
883	0.61
884	0.55
885	0.55
886	0.54
887	0.52
888	0.47
889	0.41
890	0.34
891	0.26
892	0.22
893	0.21
894	0.18
895	0.18
896	0.23
897	0.29
898	0.32
899	0.39
900	0.47
901	0.49
902	0.54
903	0.55
904	0.55
905	0.53
906	0.57
907	0.53
908	0.52
909	0.46
910	0.43
911	0.41
912	0.39
913	0.38
914	0.31
915	0.33
916	0.25
917	0.29
918	0.32
919	0.35
920	0.33
921	0.32
922	0.33
923	0.3
924	0.38
925	0.42
926	0.4
927	0.39
928	0.41
929	0.46
930	0.49
931	0.5
932	0.46
933	0.47
934	0.44
935	0.45
936	0.45
937	0.44
938	0.46
939	0.43
940	0.44
941	0.37
942	0.39
943	0.37
944	0.37
945	0.35
946	0.35
947	0.41
948	0.41
949	0.47
950	0.48
951	0.48
952	0.48
953	0.5
954	0.54
955	0.54
956	0.6
957	0.6
958	0.6
959	0.62
960	0.68
961	0.66
962	0.66
963	0.62
964	0.59
965	0.54
966	0.51
967	0.5
968	0.44
969	0.41
970	0.34
971	0.36
972	0.33
973	0.36
974	0.37
975	0.38
976	0.45
977	0.52
978	0.59
979	0.57
980	0.57
981	0.62
982	0.69
983	0.76
984	0.76
985	0.75
986	0.75

Q02792

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer