Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P38344

Protein Details
Accession P38344    Localization Confidence High Confidence Score 16.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
63-91KSAEKEKPVTKKELKRREKQALLEKKKKLBasic
363-383WQTERFDKKRLDKRSAKFVNNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
66-90EKEKPVTKKELKRREKQALLEKKKK
Subcellular Location(s) nucl 26, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003604  Matrin/U1-like-C_Znf_C2H2  
IPR041661  ZN622/Rei1/Reh1_Znf-C2H2  
IPR040025  Znf622/Rei1/Reh1  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0007117  P:budding cell bud growth  
GO:0000278  P:mitotic cell cycle  
GO:0006913  P:nucleocytoplasmic transport  
GO:0042273  P:ribosomal large subunit biogenesis  
KEGG sce:YBR267W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12756  zf-C2H2_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
Amino Acid Sequences MSSSGVYTCNSCVLTFDSSDEQRAHMKSDWHRYNLKRRVAQLPPISFETFDSKVSAAAASTSKSAEKEKPVTKKELKRREKQALLEKKKKLLEIARANMLENMQKSQEGNTPDLSKLSLQENEENKEKEEPKKEEPEQLTEEEMAERVMQEKLRNRVDIPLEQCLFCEHNKHFKDVEENLEHMFRTHGFYIPEQKYLVDKIGLVKYMSEKIGLGNICIVCNYQGRTLTAVRQHMLAKRHCKIPYESEDERLEISEFYDFTSSYANFNSNTTPDNEDDWEDVGSDEAGSDDEDLPQEYLYNDGIELHLPTGIKVGHRSLQRYYKQDLKPEVILTEGQGTLVAAETRSFLPAFDKKGVQTQQRVWQTERFDKKRLDKRSAKFVNNQPHYRDQLLQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.2
3 0.22
4 0.24
5 0.25
6 0.29
7 0.28
8 0.26
9 0.29
10 0.3
11 0.31
12 0.28
13 0.35
14 0.4
15 0.5
16 0.55
17 0.55
18 0.62
19 0.67
20 0.74
21 0.75
22 0.76
23 0.72
24 0.7
25 0.73
26 0.71
27 0.72
28 0.7
29 0.65
30 0.6
31 0.58
32 0.53
33 0.44
34 0.4
35 0.36
36 0.29
37 0.25
38 0.23
39 0.19
40 0.18
41 0.18
42 0.16
43 0.1
44 0.11
45 0.11
46 0.11
47 0.12
48 0.12
49 0.14
50 0.15
51 0.2
52 0.23
53 0.3
54 0.37
55 0.44
56 0.53
57 0.56
58 0.64
59 0.69
60 0.74
61 0.77
62 0.8
63 0.81
64 0.81
65 0.86
66 0.86
67 0.84
68 0.82
69 0.82
70 0.82
71 0.83
72 0.83
73 0.77
74 0.74
75 0.7
76 0.63
77 0.59
78 0.55
79 0.54
80 0.54
81 0.54
82 0.53
83 0.5
84 0.49
85 0.43
86 0.38
87 0.31
88 0.23
89 0.2
90 0.15
91 0.15
92 0.15
93 0.17
94 0.2
95 0.2
96 0.21
97 0.22
98 0.23
99 0.23
100 0.23
101 0.21
102 0.17
103 0.16
104 0.18
105 0.18
106 0.18
107 0.25
108 0.28
109 0.31
110 0.36
111 0.34
112 0.32
113 0.36
114 0.38
115 0.38
116 0.44
117 0.46
118 0.47
119 0.55
120 0.56
121 0.57
122 0.55
123 0.53
124 0.47
125 0.43
126 0.37
127 0.29
128 0.27
129 0.19
130 0.16
131 0.11
132 0.08
133 0.07
134 0.07
135 0.08
136 0.09
137 0.13
138 0.19
139 0.26
140 0.3
141 0.31
142 0.3
143 0.34
144 0.35
145 0.36
146 0.33
147 0.32
148 0.3
149 0.28
150 0.28
151 0.25
152 0.23
153 0.18
154 0.21
155 0.17
156 0.26
157 0.27
158 0.3
159 0.29
160 0.28
161 0.34
162 0.3
163 0.34
164 0.27
165 0.26
166 0.24
167 0.24
168 0.22
169 0.17
170 0.15
171 0.09
172 0.1
173 0.1
174 0.11
175 0.12
176 0.13
177 0.22
178 0.23
179 0.24
180 0.21
181 0.21
182 0.2
183 0.19
184 0.19
185 0.1
186 0.09
187 0.11
188 0.12
189 0.13
190 0.11
191 0.11
192 0.12
193 0.13
194 0.13
195 0.1
196 0.09
197 0.09
198 0.12
199 0.12
200 0.1
201 0.11
202 0.11
203 0.11
204 0.11
205 0.11
206 0.08
207 0.1
208 0.12
209 0.11
210 0.12
211 0.13
212 0.16
213 0.17
214 0.19
215 0.22
216 0.22
217 0.21
218 0.21
219 0.24
220 0.25
221 0.31
222 0.34
223 0.37
224 0.38
225 0.45
226 0.44
227 0.45
228 0.44
229 0.46
230 0.46
231 0.47
232 0.44
233 0.42
234 0.42
235 0.38
236 0.35
237 0.28
238 0.21
239 0.13
240 0.13
241 0.09
242 0.08
243 0.08
244 0.08
245 0.08
246 0.07
247 0.11
248 0.11
249 0.11
250 0.12
251 0.12
252 0.12
253 0.13
254 0.15
255 0.12
256 0.13
257 0.15
258 0.17
259 0.17
260 0.18
261 0.19
262 0.18
263 0.18
264 0.18
265 0.15
266 0.12
267 0.11
268 0.09
269 0.08
270 0.06
271 0.05
272 0.04
273 0.04
274 0.04
275 0.06
276 0.06
277 0.07
278 0.07
279 0.08
280 0.08
281 0.08
282 0.08
283 0.07
284 0.08
285 0.08
286 0.08
287 0.07
288 0.07
289 0.08
290 0.08
291 0.08
292 0.07
293 0.08
294 0.08
295 0.08
296 0.1
297 0.11
298 0.12
299 0.14
300 0.17
301 0.21
302 0.25
303 0.28
304 0.33
305 0.41
306 0.47
307 0.49
308 0.51
309 0.56
310 0.56
311 0.61
312 0.6
313 0.55
314 0.51
315 0.48
316 0.43
317 0.35
318 0.31
319 0.23
320 0.2
321 0.16
322 0.12
323 0.11
324 0.1
325 0.08
326 0.09
327 0.09
328 0.06
329 0.06
330 0.08
331 0.09
332 0.11
333 0.11
334 0.1
335 0.16
336 0.21
337 0.26
338 0.28
339 0.31
340 0.3
341 0.39
342 0.46
343 0.47
344 0.5
345 0.52
346 0.57
347 0.63
348 0.66
349 0.6
350 0.59
351 0.6
352 0.62
353 0.66
354 0.63
355 0.61
356 0.66
357 0.73
358 0.76
359 0.78
360 0.78
361 0.77
362 0.78
363 0.82
364 0.83
365 0.79
366 0.79
367 0.79
368 0.8
369 0.79
370 0.78
371 0.74
372 0.72
373 0.71