Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P38333

Protein Details
Accession P38333    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-44MARASSTKARKQRHDPLLKDLDAAQGTLKKINKKKLAQNDAANHHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 15, mito 8, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007955  Bystin  
Gene Ontology GO:0030686  C:90S preribosome  
GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0030688  C:preribosome, small subunit precursor  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0030515  F:snoRNA binding  
GO:0000447  P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0030490  P:maturation of SSU-rRNA  
GO:0016973  P:poly(A)+ mRNA export from nucleus  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG sce:YBR247C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05291  Bystin  
Amino Acid Sequences MARASSTKARKQRHDPLLKDLDAAQGTLKKINKKKLAQNDAANHDAANEEDGYIDSKASRKILQLAKEQQDEIEGEELAESERNKQFEARFTTMSYDDEDEDEDEDEEAFGEDISDFEPEGDYKEEEEIVEIDEEDAAMFEQYFKKSDDFNSLSGSYNLADKIMASIREKESQVEDMQDDEPLANEQNTSRGNISSGLKSGEGVALPEKVIKAYTTVGSILKTWTHGKLPKLFKVIPSLRNWQDVIYVTNPEEWSPHVVYEATKLFVSNLTAKESQKFINLILLERFRDNIETSEDHSLNYHIYRAVKKSLYKPSAFFKGFLFPLVETGCNVREATIAGSVLAKVSVPALHSSAALSYLLRLPFSPPTTVFIKILLDKKYALPYQTVDDCVYYFMRFRILDDGSNGEDATRVLPVIWHKAFLTFAQRYKNDITQDQRDFLLETVRQRGHKDIGPEIRRELLAGASREFVDPQEANDDLMIDVN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.85
2 0.8
3 0.81
4 0.8
5 0.71
6 0.62
7 0.53
8 0.48
9 0.37
10 0.34
11 0.27
12 0.23
13 0.24
14 0.28
15 0.32
16 0.36
17 0.44
18 0.53
19 0.6
20 0.64
21 0.73
22 0.78
23 0.82
24 0.81
25 0.82
26 0.8
27 0.76
28 0.69
29 0.6
30 0.48
31 0.39
32 0.31
33 0.23
34 0.17
35 0.11
36 0.08
37 0.08
38 0.09
39 0.11
40 0.1
41 0.11
42 0.1
43 0.13
44 0.17
45 0.19
46 0.21
47 0.22
48 0.3
49 0.36
50 0.41
51 0.47
52 0.53
53 0.57
54 0.57
55 0.55
56 0.46
57 0.42
58 0.36
59 0.29
60 0.21
61 0.14
62 0.11
63 0.11
64 0.11
65 0.09
66 0.11
67 0.1
68 0.15
69 0.19
70 0.2
71 0.21
72 0.25
73 0.27
74 0.33
75 0.41
76 0.39
77 0.37
78 0.37
79 0.39
80 0.36
81 0.34
82 0.29
83 0.22
84 0.18
85 0.17
86 0.17
87 0.14
88 0.14
89 0.13
90 0.11
91 0.1
92 0.09
93 0.08
94 0.07
95 0.07
96 0.06
97 0.05
98 0.05
99 0.04
100 0.05
101 0.05
102 0.05
103 0.05
104 0.05
105 0.06
106 0.06
107 0.08
108 0.1
109 0.1
110 0.1
111 0.11
112 0.12
113 0.11
114 0.12
115 0.1
116 0.09
117 0.08
118 0.08
119 0.07
120 0.06
121 0.06
122 0.05
123 0.05
124 0.04
125 0.04
126 0.04
127 0.05
128 0.08
129 0.1
130 0.11
131 0.13
132 0.14
133 0.16
134 0.18
135 0.26
136 0.25
137 0.25
138 0.27
139 0.27
140 0.27
141 0.25
142 0.24
143 0.16
144 0.14
145 0.13
146 0.1
147 0.08
148 0.07
149 0.09
150 0.1
151 0.12
152 0.12
153 0.17
154 0.19
155 0.23
156 0.24
157 0.23
158 0.23
159 0.23
160 0.22
161 0.2
162 0.17
163 0.15
164 0.15
165 0.14
166 0.12
167 0.09
168 0.09
169 0.08
170 0.08
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.1
175 0.11
176 0.12
177 0.12
178 0.12
179 0.13
180 0.16
181 0.18
182 0.14
183 0.15
184 0.14
185 0.13
186 0.13
187 0.13
188 0.1
189 0.08
190 0.08
191 0.08
192 0.07
193 0.07
194 0.08
195 0.07
196 0.07
197 0.07
198 0.06
199 0.07
200 0.08
201 0.08
202 0.08
203 0.09
204 0.1
205 0.1
206 0.1
207 0.1
208 0.09
209 0.11
210 0.12
211 0.12
212 0.16
213 0.19
214 0.22
215 0.3
216 0.34
217 0.36
218 0.4
219 0.39
220 0.36
221 0.41
222 0.43
223 0.4
224 0.39
225 0.42
226 0.38
227 0.4
228 0.39
229 0.3
230 0.26
231 0.22
232 0.2
233 0.14
234 0.14
235 0.12
236 0.13
237 0.13
238 0.11
239 0.11
240 0.1
241 0.12
242 0.12
243 0.11
244 0.1
245 0.1
246 0.1
247 0.13
248 0.13
249 0.1
250 0.1
251 0.1
252 0.1
253 0.1
254 0.12
255 0.12
256 0.12
257 0.16
258 0.18
259 0.19
260 0.21
261 0.22
262 0.21
263 0.19
264 0.19
265 0.15
266 0.16
267 0.16
268 0.15
269 0.17
270 0.17
271 0.16
272 0.15
273 0.16
274 0.12
275 0.14
276 0.13
277 0.12
278 0.14
279 0.14
280 0.17
281 0.21
282 0.21
283 0.2
284 0.19
285 0.18
286 0.16
287 0.15
288 0.13
289 0.1
290 0.13
291 0.16
292 0.19
293 0.23
294 0.25
295 0.29
296 0.36
297 0.44
298 0.47
299 0.46
300 0.45
301 0.46
302 0.51
303 0.47
304 0.41
305 0.32
306 0.31
307 0.29
308 0.28
309 0.24
310 0.15
311 0.16
312 0.16
313 0.15
314 0.11
315 0.12
316 0.12
317 0.12
318 0.12
319 0.1
320 0.09
321 0.1
322 0.1
323 0.1
324 0.09
325 0.08
326 0.08
327 0.08
328 0.08
329 0.07
330 0.06
331 0.04
332 0.05
333 0.06
334 0.07
335 0.08
336 0.09
337 0.09
338 0.1
339 0.1
340 0.09
341 0.09
342 0.08
343 0.07
344 0.07
345 0.11
346 0.11
347 0.11
348 0.11
349 0.13
350 0.18
351 0.2
352 0.22
353 0.19
354 0.22
355 0.24
356 0.26
357 0.24
358 0.2
359 0.21
360 0.23
361 0.27
362 0.27
363 0.26
364 0.25
365 0.27
366 0.32
367 0.32
368 0.28
369 0.25
370 0.24
371 0.28
372 0.29
373 0.28
374 0.23
375 0.21
376 0.2
377 0.2
378 0.19
379 0.15
380 0.14
381 0.12
382 0.17
383 0.16
384 0.17
385 0.21
386 0.22
387 0.23
388 0.23
389 0.26
390 0.22
391 0.23
392 0.21
393 0.15
394 0.13
395 0.12
396 0.11
397 0.08
398 0.07
399 0.06
400 0.09
401 0.13
402 0.21
403 0.21
404 0.22
405 0.22
406 0.23
407 0.25
408 0.24
409 0.3
410 0.26
411 0.3
412 0.37
413 0.38
414 0.41
415 0.45
416 0.48
417 0.44
418 0.46
419 0.5
420 0.5
421 0.53
422 0.51
423 0.46
424 0.42
425 0.38
426 0.31
427 0.31
428 0.25
429 0.25
430 0.31
431 0.35
432 0.36
433 0.38
434 0.43
435 0.42
436 0.42
437 0.42
438 0.43
439 0.5
440 0.52
441 0.52
442 0.49
443 0.47
444 0.44
445 0.4
446 0.32
447 0.26
448 0.28
449 0.27
450 0.25
451 0.24
452 0.25
453 0.25
454 0.25
455 0.2
456 0.21
457 0.19
458 0.19
459 0.22
460 0.21
461 0.21
462 0.21
463 0.2