Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P36124

Protein Details
Accession P36124    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
219-244TDQDNTNHRDKRRKRNPSNNSIDSKNHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR044435  Set3/4_SET  
IPR001214  SET_dom  
IPR046341  SET_dom_sf  
IPR019786  Zinc_finger_PHD-type_CS  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR001965  Znf_PHD  
IPR019787  Znf_PHD-finger  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0070210  C:Rpd3L-Expanded complex  
GO:0034967  C:Set3 complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0035064  F:methylated histone binding  
GO:0009267  P:cellular response to starvation  
GO:0006325  P:chromatin organization  
GO:0006974  P:DNA damage response  
GO:0016575  P:histone deacetylation  
GO:0051321  P:meiotic cell cycle  
GO:0045835  P:negative regulation of meiotic nuclear division  
GO:0006479  P:protein methylation  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
KEGG sce:YKR029C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00628  PHD  
PF00856  SET  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50280  SET  
PS01359  ZF_PHD_1  
PS50016  ZF_PHD_2  
CDD cd15550  PHD_MLL5  
cd19183  SET_SpSET3-like  
Amino Acid Sequences MSVPNSKEQSLLDDASTLLLFSKGKKRAEEASKIGSKTDTIEHDESHEREKKGAIEMAAAALATASTVSLPLKKATEQSAAEAATSTAAKEETENQPQKQPQWPVPDSYIVDPDAGIITCICDLNDDDGFTIQCDHCNRWQHAICYGIKDIGMAPDDYLCNSCDPREVDINLARKIQQERINVKTVEPSSSNNSASNKNNGRDRASSTTISDVGDSFSTDQDNTNHRDKRRKRNPSNNSIDSKNESASVNSSDGLTSMPKKKEHFLSAKDAYGAIYLPLKDNVFKSDLIEPFLNKHMDDNWVIQYPHKTFKSVSIEVKPYADIAYSRTYPGFTKLGVYLKKDCIKGDFIQEILGELDFYKNYLTDPRNHYRIWGTAKRRVIFHSHWPIYIDARLSGNSTRYLRRSCQPNVELVTIKLQDTDNRNDKSSGRKSSRIKFVLRALRDISEDEELYIKWQWDSKHPILKLIKGMTIDSLDDLERYGLINSVETILSNGECGCGNNSKDCYLLKVKRYAQSLYKSVKSRGKMNNRYKLNEILNQYNCKKRREPPILHRLEEKAQNTIERAPILLNNFYRQKFLNRNNGPKIPQKNTIDSTNNPDDIAKPFKFALFAQHSSNISVPKKNETSEKPLIITKSTDYDESHITNIEELPIPVLLPINKTSRQTANDVEESQSKNEHKLSRTPSLSNFNKELSKEAQHSQAKTKEIMTEASVNSRRESTPESIMHLSDFSSSQLHSKKKLSFADYRKKLLK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.2
3 0.19
4 0.14
5 0.09
6 0.1
7 0.11
8 0.16
9 0.25
10 0.31
11 0.36
12 0.39
13 0.43
14 0.51
15 0.59
16 0.62
17 0.59
18 0.61
19 0.63
20 0.6
21 0.57
22 0.48
23 0.4
24 0.34
25 0.33
26 0.28
27 0.29
28 0.31
29 0.3
30 0.34
31 0.39
32 0.39
33 0.42
34 0.45
35 0.39
36 0.38
37 0.41
38 0.39
39 0.38
40 0.39
41 0.31
42 0.26
43 0.25
44 0.24
45 0.21
46 0.18
47 0.12
48 0.08
49 0.07
50 0.04
51 0.04
52 0.03
53 0.03
54 0.04
55 0.06
56 0.09
57 0.11
58 0.14
59 0.17
60 0.19
61 0.23
62 0.27
63 0.33
64 0.31
65 0.32
66 0.34
67 0.31
68 0.29
69 0.26
70 0.21
71 0.16
72 0.15
73 0.11
74 0.08
75 0.08
76 0.09
77 0.1
78 0.16
79 0.21
80 0.32
81 0.38
82 0.39
83 0.46
84 0.5
85 0.53
86 0.56
87 0.56
88 0.52
89 0.56
90 0.56
91 0.53
92 0.52
93 0.52
94 0.46
95 0.42
96 0.38
97 0.28
98 0.26
99 0.21
100 0.19
101 0.14
102 0.12
103 0.1
104 0.07
105 0.07
106 0.08
107 0.08
108 0.07
109 0.07
110 0.09
111 0.12
112 0.13
113 0.13
114 0.12
115 0.13
116 0.14
117 0.12
118 0.15
119 0.11
120 0.16
121 0.18
122 0.22
123 0.27
124 0.36
125 0.38
126 0.44
127 0.48
128 0.45
129 0.47
130 0.49
131 0.44
132 0.39
133 0.38
134 0.29
135 0.25
136 0.23
137 0.19
138 0.16
139 0.16
140 0.12
141 0.11
142 0.12
143 0.12
144 0.13
145 0.13
146 0.11
147 0.12
148 0.13
149 0.13
150 0.16
151 0.18
152 0.21
153 0.25
154 0.25
155 0.28
156 0.33
157 0.37
158 0.34
159 0.34
160 0.32
161 0.32
162 0.35
163 0.36
164 0.38
165 0.41
166 0.45
167 0.49
168 0.54
169 0.49
170 0.46
171 0.46
172 0.4
173 0.35
174 0.3
175 0.29
176 0.28
177 0.32
178 0.33
179 0.29
180 0.31
181 0.33
182 0.35
183 0.41
184 0.41
185 0.42
186 0.47
187 0.47
188 0.49
189 0.46
190 0.48
191 0.46
192 0.43
193 0.4
194 0.35
195 0.34
196 0.3
197 0.28
198 0.22
199 0.16
200 0.13
201 0.11
202 0.11
203 0.09
204 0.09
205 0.09
206 0.09
207 0.11
208 0.13
209 0.17
210 0.21
211 0.29
212 0.34
213 0.39
214 0.49
215 0.57
216 0.65
217 0.72
218 0.78
219 0.81
220 0.86
221 0.91
222 0.91
223 0.92
224 0.87
225 0.81
226 0.72
227 0.64
228 0.57
229 0.48
230 0.38
231 0.3
232 0.23
233 0.2
234 0.19
235 0.18
236 0.15
237 0.13
238 0.13
239 0.11
240 0.1
241 0.1
242 0.1
243 0.13
244 0.19
245 0.23
246 0.26
247 0.29
248 0.34
249 0.38
250 0.44
251 0.46
252 0.43
253 0.48
254 0.47
255 0.46
256 0.41
257 0.36
258 0.28
259 0.21
260 0.17
261 0.09
262 0.09
263 0.08
264 0.09
265 0.1
266 0.11
267 0.12
268 0.12
269 0.14
270 0.14
271 0.14
272 0.15
273 0.19
274 0.2
275 0.21
276 0.21
277 0.19
278 0.19
279 0.23
280 0.21
281 0.15
282 0.16
283 0.14
284 0.16
285 0.17
286 0.17
287 0.16
288 0.18
289 0.18
290 0.19
291 0.22
292 0.22
293 0.28
294 0.26
295 0.25
296 0.23
297 0.31
298 0.37
299 0.36
300 0.38
301 0.36
302 0.38
303 0.37
304 0.37
305 0.29
306 0.22
307 0.18
308 0.14
309 0.09
310 0.09
311 0.12
312 0.12
313 0.12
314 0.12
315 0.13
316 0.13
317 0.16
318 0.15
319 0.11
320 0.12
321 0.14
322 0.2
323 0.21
324 0.23
325 0.24
326 0.28
327 0.33
328 0.32
329 0.3
330 0.27
331 0.29
332 0.27
333 0.28
334 0.23
335 0.18
336 0.18
337 0.17
338 0.15
339 0.11
340 0.1
341 0.06
342 0.05
343 0.05
344 0.04
345 0.05
346 0.04
347 0.04
348 0.05
349 0.11
350 0.13
351 0.18
352 0.26
353 0.31
354 0.34
355 0.34
356 0.35
357 0.31
358 0.34
359 0.35
360 0.36
361 0.36
362 0.39
363 0.44
364 0.44
365 0.43
366 0.41
367 0.39
368 0.34
369 0.38
370 0.42
371 0.38
372 0.37
373 0.37
374 0.35
375 0.3
376 0.28
377 0.2
378 0.11
379 0.11
380 0.1
381 0.11
382 0.11
383 0.11
384 0.13
385 0.15
386 0.17
387 0.2
388 0.23
389 0.25
390 0.3
391 0.36
392 0.36
393 0.42
394 0.4
395 0.4
396 0.4
397 0.39
398 0.34
399 0.27
400 0.27
401 0.2
402 0.18
403 0.16
404 0.13
405 0.15
406 0.19
407 0.25
408 0.29
409 0.3
410 0.32
411 0.32
412 0.33
413 0.38
414 0.42
415 0.44
416 0.41
417 0.48
418 0.53
419 0.59
420 0.67
421 0.63
422 0.58
423 0.53
424 0.56
425 0.56
426 0.51
427 0.46
428 0.38
429 0.34
430 0.32
431 0.28
432 0.22
433 0.16
434 0.15
435 0.12
436 0.11
437 0.1
438 0.11
439 0.11
440 0.1
441 0.08
442 0.11
443 0.12
444 0.18
445 0.26
446 0.3
447 0.36
448 0.36
449 0.43
450 0.43
451 0.44
452 0.42
453 0.35
454 0.32
455 0.26
456 0.26
457 0.19
458 0.17
459 0.15
460 0.1
461 0.1
462 0.08
463 0.07
464 0.07
465 0.06
466 0.05
467 0.06
468 0.06
469 0.06
470 0.06
471 0.06
472 0.06
473 0.07
474 0.07
475 0.07
476 0.07
477 0.06
478 0.06
479 0.06
480 0.06
481 0.05
482 0.06
483 0.06
484 0.08
485 0.12
486 0.13
487 0.17
488 0.19
489 0.19
490 0.2
491 0.2
492 0.23
493 0.27
494 0.32
495 0.33
496 0.4
497 0.44
498 0.47
499 0.51
500 0.49
501 0.47
502 0.47
503 0.49
504 0.46
505 0.47
506 0.46
507 0.49
508 0.51
509 0.47
510 0.51
511 0.53
512 0.6
513 0.64
514 0.71
515 0.74
516 0.73
517 0.74
518 0.69
519 0.66
520 0.59
521 0.54
522 0.48
523 0.47
524 0.46
525 0.49
526 0.5
527 0.52
528 0.52
529 0.52
530 0.54
531 0.53
532 0.6
533 0.63
534 0.69
535 0.7
536 0.77
537 0.77
538 0.73
539 0.69
540 0.62
541 0.57
542 0.54
543 0.44
544 0.37
545 0.33
546 0.32
547 0.31
548 0.29
549 0.26
550 0.19
551 0.19
552 0.15
553 0.17
554 0.18
555 0.21
556 0.2
557 0.23
558 0.29
559 0.29
560 0.3
561 0.3
562 0.35
563 0.4
564 0.47
565 0.53
566 0.55
567 0.64
568 0.69
569 0.73
570 0.7
571 0.68
572 0.69
573 0.63
574 0.64
575 0.59
576 0.59
577 0.57
578 0.59
579 0.56
580 0.5
581 0.52
582 0.48
583 0.44
584 0.37
585 0.34
586 0.29
587 0.28
588 0.33
589 0.25
590 0.23
591 0.23
592 0.23
593 0.24
594 0.23
595 0.28
596 0.27
597 0.29
598 0.3
599 0.34
600 0.35
601 0.34
602 0.37
603 0.34
604 0.3
605 0.33
606 0.32
607 0.35
608 0.38
609 0.38
610 0.44
611 0.43
612 0.49
613 0.51
614 0.52
615 0.46
616 0.47
617 0.46
618 0.4
619 0.36
620 0.29
621 0.26
622 0.25
623 0.26
624 0.23
625 0.24
626 0.25
627 0.25
628 0.24
629 0.21
630 0.19
631 0.18
632 0.17
633 0.16
634 0.14
635 0.12
636 0.12
637 0.11
638 0.1
639 0.09
640 0.12
641 0.11
642 0.13
643 0.17
644 0.21
645 0.25
646 0.28
647 0.32
648 0.36
649 0.38
650 0.4
651 0.42
652 0.43
653 0.44
654 0.43
655 0.41
656 0.41
657 0.4
658 0.37
659 0.38
660 0.32
661 0.33
662 0.38
663 0.42
664 0.4
665 0.46
666 0.51
667 0.54
668 0.57
669 0.56
670 0.55
671 0.59
672 0.62
673 0.59
674 0.55
675 0.5
676 0.5
677 0.47
678 0.45
679 0.4
680 0.41
681 0.38
682 0.39
683 0.45
684 0.46
685 0.49
686 0.53
687 0.53
688 0.5
689 0.48
690 0.47
691 0.41
692 0.37
693 0.36
694 0.31
695 0.31
696 0.28
697 0.36
698 0.39
699 0.37
700 0.37
701 0.38
702 0.35
703 0.33
704 0.38
705 0.33
706 0.35
707 0.36
708 0.4
709 0.39
710 0.38
711 0.35
712 0.3
713 0.25
714 0.19
715 0.18
716 0.14
717 0.13
718 0.13
719 0.2
720 0.27
721 0.32
722 0.36
723 0.43
724 0.48
725 0.54
726 0.61
727 0.61
728 0.63
729 0.68
730 0.73
731 0.73