Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P25582

Protein Details
Accession P25582    Localization Confidence High Confidence Score 22.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
231-251SKIYNPEKKVRKRQGYEEGDNHydrophilic
360-385QEKQRLNVKRERRRKNEMKQKELQRMBasic
588-608DISKLNKKRKHEEMHQKQDEABasic
738-757EAKARKRMRAVARLEKIKKKBasic
774-799EEISRLMRKVTKKPKTKPKVTLVVASHydrophilic
822-841VMKNEQRALRRIAKKHHKKKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
368-375KRERRRKN
720-759AIKEKIKAMNARPIKKVAEAKARKRMRAVARLEKIKKKAG
777-841SRLMRKVTKKPKTKPKVTLVVASGRNKGLAGRPKGVKGKYKMVDGVMKNEQRALRRIAKKHHKKK
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 12, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002877  RNA_MeTrfase_FtsJ_dom  
IPR015507  rRNA-MeTfrase_E  
IPR012920  rRNA_MeTfrase_SPB1-like_C  
IPR024576  rRNA_MeTfrase_Spb1_DUF3381  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
IPR028589  SPB1-like  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0016435  F:rRNA (guanine) methyltransferase activity  
GO:0070039  F:rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase activity  
GO:0008650  F:rRNA (uridine-2'-O-)-methyltransferase activity  
GO:0000466  P:maturation of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0031167  P:rRNA methylation  
KEGG sce:YCL054W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF11861  DUF3381  
PF01728  FtsJ  
PF07780  Spb1_C  
Amino Acid Sequences MGKTQKKNSKGRLDRYYYLAKEKGYRARSSFKIIQINEKYGHFLEKSKVVIDLCAAPGSWCQVASKLCPVNSLIIGVDIVPMKPMPNVITFQSDITTEDCRSKLRGYMKTWKADTVLHDGAPNVGLGWVQDAFTQSQLTLQALKLAVENLVVNGTFVTKIFRSKDYNKLIWVFQQLFEKVEATKPPASRNVSAEIFVVCKGFKAPKRLDPRLLDPKEVFEELPDGQQNMESKIYNPEKKVRKRQGYEEGDNLLYHETSILDFVRTEDPISMLGEMNKFTIDENDHEWKILKKLKQTTDEFRSCIEDLKVLGKKDFKMILRWRKIAREILGIEVKDDAKTEIEVVPLTEEEQIEKDLQGLQEKQRLNVKRERRRKNEMKQKELQRMQMNMITPTDIGIEAASLGKESLFNLKTAEKTGILNDLAKGKKRMIFTDDELAKDNDIYIDENIMIKDKDSAADADDLESELNAMYSDYKTRRSERDAKFRAKQARGGDNEEEWTGFNEGSLEKKEEEGKDYIEDNDDEGVEGDSDDDEAITNLISKLKGQEGDHKLSSKARMIFNDPIFNNVEPDLPVNTVNDGIMSSESVGDISKLNKKRKHEEMHQKQDEADSSDESSSDDSDFEIVANDNASEEFDSDYDSEEEKNQTKKEKHSRDIDIATVEAMTLAHQLALGQKNKHDLVDEGFNRYTFRDTENLPDWFLEDEKEHSKINKPITKEAAMAIKEKIKAMNARPIKKVAEAKARKRMRAVARLEKIKKKAGLINDDSDKTEKDKAEEISRLMRKVTKKPKTKPKVTLVVASGRNKGLAGRPKGVKGKYKMVDGVMKNEQRALRRIAKKHHKKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.79
2 0.76
3 0.75
4 0.67
5 0.65
6 0.59
7 0.52
8 0.5
9 0.54
10 0.57
11 0.54
12 0.57
13 0.55
14 0.59
15 0.6
16 0.62
17 0.61
18 0.6
19 0.63
20 0.58
21 0.63
22 0.6
23 0.62
24 0.56
25 0.49
26 0.46
27 0.38
28 0.41
29 0.32
30 0.31
31 0.3
32 0.32
33 0.32
34 0.29
35 0.31
36 0.27
37 0.26
38 0.24
39 0.23
40 0.2
41 0.18
42 0.18
43 0.15
44 0.16
45 0.18
46 0.16
47 0.13
48 0.13
49 0.17
50 0.2
51 0.22
52 0.3
53 0.32
54 0.31
55 0.33
56 0.33
57 0.33
58 0.3
59 0.28
60 0.19
61 0.15
62 0.15
63 0.13
64 0.14
65 0.1
66 0.1
67 0.1
68 0.1
69 0.1
70 0.1
71 0.12
72 0.13
73 0.15
74 0.17
75 0.18
76 0.23
77 0.23
78 0.23
79 0.22
80 0.2
81 0.18
82 0.19
83 0.2
84 0.16
85 0.2
86 0.21
87 0.22
88 0.24
89 0.25
90 0.29
91 0.35
92 0.41
93 0.45
94 0.54
95 0.59
96 0.64
97 0.64
98 0.6
99 0.53
100 0.48
101 0.44
102 0.42
103 0.37
104 0.29
105 0.28
106 0.26
107 0.25
108 0.22
109 0.18
110 0.09
111 0.07
112 0.06
113 0.06
114 0.07
115 0.07
116 0.07
117 0.08
118 0.1
119 0.1
120 0.12
121 0.12
122 0.1
123 0.11
124 0.12
125 0.12
126 0.13
127 0.12
128 0.15
129 0.15
130 0.15
131 0.14
132 0.13
133 0.12
134 0.11
135 0.11
136 0.08
137 0.08
138 0.08
139 0.07
140 0.07
141 0.07
142 0.07
143 0.07
144 0.1
145 0.1
146 0.16
147 0.19
148 0.24
149 0.31
150 0.36
151 0.46
152 0.51
153 0.53
154 0.52
155 0.52
156 0.48
157 0.45
158 0.46
159 0.38
160 0.32
161 0.35
162 0.31
163 0.3
164 0.29
165 0.26
166 0.2
167 0.22
168 0.22
169 0.21
170 0.26
171 0.26
172 0.29
173 0.36
174 0.4
175 0.4
176 0.4
177 0.41
178 0.36
179 0.35
180 0.32
181 0.25
182 0.21
183 0.18
184 0.16
185 0.1
186 0.09
187 0.11
188 0.18
189 0.21
190 0.3
191 0.34
192 0.42
193 0.53
194 0.58
195 0.64
196 0.61
197 0.66
198 0.68
199 0.65
200 0.61
201 0.51
202 0.48
203 0.44
204 0.4
205 0.31
206 0.2
207 0.21
208 0.17
209 0.2
210 0.17
211 0.14
212 0.13
213 0.15
214 0.15
215 0.15
216 0.17
217 0.14
218 0.14
219 0.23
220 0.31
221 0.33
222 0.36
223 0.43
224 0.51
225 0.6
226 0.7
227 0.72
228 0.74
229 0.75
230 0.8
231 0.82
232 0.8
233 0.75
234 0.67
235 0.59
236 0.5
237 0.44
238 0.36
239 0.26
240 0.17
241 0.12
242 0.09
243 0.06
244 0.06
245 0.07
246 0.07
247 0.07
248 0.07
249 0.09
250 0.11
251 0.11
252 0.11
253 0.1
254 0.1
255 0.11
256 0.11
257 0.1
258 0.09
259 0.1
260 0.11
261 0.11
262 0.1
263 0.09
264 0.09
265 0.08
266 0.1
267 0.11
268 0.12
269 0.16
270 0.21
271 0.21
272 0.21
273 0.22
274 0.21
275 0.26
276 0.31
277 0.29
278 0.32
279 0.4
280 0.46
281 0.53
282 0.57
283 0.58
284 0.61
285 0.61
286 0.54
287 0.47
288 0.44
289 0.36
290 0.33
291 0.26
292 0.18
293 0.16
294 0.22
295 0.24
296 0.21
297 0.23
298 0.24
299 0.24
300 0.27
301 0.31
302 0.25
303 0.31
304 0.4
305 0.48
306 0.51
307 0.56
308 0.54
309 0.54
310 0.57
311 0.53
312 0.45
313 0.4
314 0.34
315 0.33
316 0.34
317 0.29
318 0.25
319 0.21
320 0.19
321 0.14
322 0.13
323 0.1
324 0.07
325 0.08
326 0.09
327 0.08
328 0.08
329 0.08
330 0.08
331 0.08
332 0.07
333 0.08
334 0.08
335 0.07
336 0.07
337 0.08
338 0.09
339 0.08
340 0.08
341 0.08
342 0.09
343 0.09
344 0.12
345 0.14
346 0.15
347 0.22
348 0.22
349 0.24
350 0.3
351 0.34
352 0.36
353 0.41
354 0.49
355 0.53
356 0.63
357 0.71
358 0.72
359 0.78
360 0.83
361 0.85
362 0.86
363 0.85
364 0.83
365 0.81
366 0.81
367 0.8
368 0.73
369 0.69
370 0.62
371 0.55
372 0.49
373 0.43
374 0.36
375 0.27
376 0.23
377 0.17
378 0.13
379 0.11
380 0.09
381 0.06
382 0.06
383 0.04
384 0.04
385 0.04
386 0.04
387 0.04
388 0.03
389 0.03
390 0.03
391 0.04
392 0.04
393 0.1
394 0.1
395 0.1
396 0.12
397 0.13
398 0.14
399 0.15
400 0.16
401 0.11
402 0.11
403 0.11
404 0.12
405 0.12
406 0.11
407 0.11
408 0.15
409 0.16
410 0.18
411 0.19
412 0.18
413 0.22
414 0.23
415 0.24
416 0.22
417 0.24
418 0.24
419 0.31
420 0.29
421 0.26
422 0.27
423 0.25
424 0.22
425 0.18
426 0.16
427 0.08
428 0.07
429 0.07
430 0.05
431 0.06
432 0.06
433 0.07
434 0.07
435 0.08
436 0.07
437 0.06
438 0.07
439 0.07
440 0.07
441 0.07
442 0.08
443 0.08
444 0.09
445 0.09
446 0.08
447 0.08
448 0.08
449 0.07
450 0.06
451 0.05
452 0.03
453 0.04
454 0.03
455 0.03
456 0.04
457 0.05
458 0.09
459 0.11
460 0.16
461 0.2
462 0.24
463 0.28
464 0.35
465 0.45
466 0.49
467 0.58
468 0.6
469 0.64
470 0.65
471 0.68
472 0.69
473 0.61
474 0.59
475 0.53
476 0.54
477 0.5
478 0.5
479 0.44
480 0.36
481 0.35
482 0.29
483 0.24
484 0.16
485 0.14
486 0.1
487 0.08
488 0.07
489 0.07
490 0.07
491 0.09
492 0.11
493 0.11
494 0.11
495 0.12
496 0.17
497 0.17
498 0.2
499 0.19
500 0.19
501 0.19
502 0.19
503 0.18
504 0.16
505 0.15
506 0.12
507 0.11
508 0.1
509 0.08
510 0.08
511 0.07
512 0.06
513 0.05
514 0.05
515 0.04
516 0.04
517 0.04
518 0.04
519 0.03
520 0.03
521 0.04
522 0.03
523 0.04
524 0.04
525 0.06
526 0.06
527 0.07
528 0.09
529 0.11
530 0.15
531 0.15
532 0.25
533 0.29
534 0.34
535 0.36
536 0.35
537 0.34
538 0.34
539 0.35
540 0.31
541 0.3
542 0.28
543 0.29
544 0.33
545 0.39
546 0.38
547 0.42
548 0.36
549 0.34
550 0.34
551 0.31
552 0.27
553 0.2
554 0.19
555 0.12
556 0.14
557 0.12
558 0.1
559 0.11
560 0.1
561 0.1
562 0.1
563 0.09
564 0.08
565 0.06
566 0.06
567 0.06
568 0.06
569 0.05
570 0.05
571 0.05
572 0.05
573 0.05
574 0.05
575 0.06
576 0.1
577 0.18
578 0.25
579 0.34
580 0.39
581 0.46
582 0.54
583 0.63
584 0.68
585 0.71
586 0.75
587 0.77
588 0.83
589 0.81
590 0.73
591 0.64
592 0.57
593 0.48
594 0.4
595 0.3
596 0.2
597 0.18
598 0.17
599 0.16
600 0.15
601 0.13
602 0.11
603 0.1
604 0.08
605 0.07
606 0.07
607 0.07
608 0.07
609 0.07
610 0.07
611 0.06
612 0.07
613 0.06
614 0.06
615 0.06
616 0.07
617 0.06
618 0.06
619 0.07
620 0.06
621 0.08
622 0.08
623 0.1
624 0.11
625 0.11
626 0.12
627 0.13
628 0.18
629 0.21
630 0.26
631 0.27
632 0.35
633 0.4
634 0.49
635 0.58
636 0.64
637 0.67
638 0.7
639 0.73
640 0.71
641 0.68
642 0.6
643 0.5
644 0.4
645 0.32
646 0.23
647 0.17
648 0.1
649 0.07
650 0.06
651 0.05
652 0.05
653 0.05
654 0.05
655 0.05
656 0.11
657 0.18
658 0.22
659 0.23
660 0.25
661 0.31
662 0.32
663 0.32
664 0.28
665 0.23
666 0.22
667 0.3
668 0.3
669 0.3
670 0.3
671 0.29
672 0.29
673 0.28
674 0.27
675 0.18
676 0.2
677 0.19
678 0.19
679 0.26
680 0.31
681 0.31
682 0.29
683 0.28
684 0.26
685 0.23
686 0.22
687 0.17
688 0.13
689 0.16
690 0.18
691 0.21
692 0.22
693 0.23
694 0.3
695 0.35
696 0.43
697 0.44
698 0.45
699 0.5
700 0.54
701 0.54
702 0.48
703 0.44
704 0.41
705 0.38
706 0.36
707 0.31
708 0.3
709 0.29
710 0.29
711 0.29
712 0.27
713 0.32
714 0.35
715 0.42
716 0.46
717 0.5
718 0.53
719 0.55
720 0.52
721 0.53
722 0.55
723 0.53
724 0.55
725 0.59
726 0.65
727 0.7
728 0.75
729 0.71
730 0.69
731 0.7
732 0.68
733 0.68
734 0.68
735 0.68
736 0.7
737 0.77
738 0.8
739 0.8
740 0.76
741 0.74
742 0.69
743 0.64
744 0.61
745 0.59
746 0.6
747 0.57
748 0.58
749 0.57
750 0.54
751 0.51
752 0.48
753 0.41
754 0.35
755 0.36
756 0.3
757 0.28
758 0.32
759 0.34
760 0.39
761 0.41
762 0.41
763 0.44
764 0.47
765 0.45
766 0.43
767 0.45
768 0.45
769 0.52
770 0.59
771 0.6
772 0.66
773 0.75
774 0.83
775 0.88
776 0.91
777 0.9
778 0.89
779 0.89
780 0.83
781 0.79
782 0.72
783 0.7
784 0.67
785 0.61
786 0.55
787 0.45
788 0.42
789 0.35
790 0.33
791 0.33
792 0.35
793 0.38
794 0.42
795 0.46
796 0.53
797 0.61
798 0.65
799 0.66
800 0.63
801 0.67
802 0.63
803 0.65
804 0.61
805 0.58
806 0.6
807 0.53
808 0.53
809 0.53
810 0.51
811 0.46
812 0.48
813 0.47
814 0.44
815 0.47
816 0.47
817 0.48
818 0.54
819 0.61
820 0.67
821 0.74