Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P25443

Protein Details
Accession P25443    Localization Confidence Low Confidence Score 9.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-34RGGFGGRNRGRPNRRGPRNTEEKGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
11-28RGGFGGRNRGRPNRRGPR
Subcellular Location(s) cyto 11.5, cyto_nucl 9, mito 7, nucl 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000851  Ribosomal_S5  
IPR005324  Ribosomal_S5_C  
IPR020568  Ribosomal_S5_D2-typ_fold  
IPR014721  Ribosomal_S5_D2-typ_fold_subgr  
IPR005711  Ribosomal_S5_euk/arc  
IPR013810  Ribosomal_S5_N  
IPR018192  Ribosomal_S5_N_CS  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005829  C:cytosol  
GO:0022627  C:cytosolic small ribosomal subunit  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005654  C:nucleoplasm  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0070181  F:small ribosomal subunit rRNA binding  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0002181  P:cytoplasmic translation  
GO:0045903  P:positive regulation of translational fidelity  
GO:0006407  P:rRNA export from nucleus  
GO:0006364  P:rRNA processing  
GO:0006412  P:translation  
KEGG sce:YGL123W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00333  Ribosomal_S5  
PF03719  Ribosomal_S5_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00585  RIBOSOMAL_S5  
PS50881  S5_DSRBD  
Amino Acid Sequences MSAPEAQQQKRGGFGGRNRGRPNRRGPRNTEEKGWVPVTKLGRLVKAGKITTIEEIFLHSLPVKEFQIIDTLLPGLQDEVMNIKPVQKQTRAGQRTRFKAVVVVGDSNGHVGLGIKTAKEVAGAIRAGIIIAKLSVIPIRRGYWGTNLGQPHSLATKTTGKCGSVTVRLIPAPRGSGIVASPAVKKLLQLAGVEDVYTQSNGKTRTLENTLKAAFVAIGNTYGFLTPNLWAEQPLPVSPLDIYSDEASAQKKRF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.48
3 0.51
4 0.58
5 0.62
6 0.7
7 0.74
8 0.75
9 0.79
10 0.78
11 0.82
12 0.82
13 0.83
14 0.82
15 0.84
16 0.79
17 0.74
18 0.69
19 0.61
20 0.58
21 0.53
22 0.44
23 0.36
24 0.38
25 0.36
26 0.32
27 0.35
28 0.32
29 0.31
30 0.34
31 0.35
32 0.34
33 0.37
34 0.35
35 0.3
36 0.3
37 0.29
38 0.29
39 0.26
40 0.22
41 0.15
42 0.17
43 0.17
44 0.14
45 0.14
46 0.11
47 0.11
48 0.12
49 0.15
50 0.13
51 0.13
52 0.13
53 0.12
54 0.15
55 0.14
56 0.13
57 0.11
58 0.1
59 0.09
60 0.09
61 0.09
62 0.05
63 0.06
64 0.06
65 0.05
66 0.08
67 0.08
68 0.1
69 0.1
70 0.13
71 0.16
72 0.21
73 0.26
74 0.27
75 0.31
76 0.36
77 0.47
78 0.49
79 0.5
80 0.55
81 0.57
82 0.59
83 0.6
84 0.54
85 0.43
86 0.4
87 0.37
88 0.31
89 0.25
90 0.2
91 0.15
92 0.15
93 0.15
94 0.12
95 0.11
96 0.07
97 0.05
98 0.05
99 0.04
100 0.06
101 0.07
102 0.06
103 0.06
104 0.07
105 0.07
106 0.06
107 0.06
108 0.05
109 0.07
110 0.07
111 0.07
112 0.06
113 0.06
114 0.06
115 0.06
116 0.05
117 0.03
118 0.03
119 0.03
120 0.03
121 0.03
122 0.05
123 0.06
124 0.08
125 0.1
126 0.11
127 0.13
128 0.14
129 0.15
130 0.18
131 0.21
132 0.21
133 0.23
134 0.22
135 0.22
136 0.21
137 0.2
138 0.17
139 0.15
140 0.13
141 0.1
142 0.13
143 0.2
144 0.2
145 0.24
146 0.25
147 0.24
148 0.24
149 0.26
150 0.25
151 0.21
152 0.22
153 0.19
154 0.2
155 0.21
156 0.21
157 0.2
158 0.18
159 0.15
160 0.14
161 0.14
162 0.12
163 0.12
164 0.11
165 0.11
166 0.11
167 0.11
168 0.12
169 0.12
170 0.13
171 0.12
172 0.12
173 0.13
174 0.14
175 0.15
176 0.15
177 0.15
178 0.17
179 0.17
180 0.17
181 0.13
182 0.12
183 0.11
184 0.11
185 0.1
186 0.08
187 0.12
188 0.14
189 0.16
190 0.18
191 0.19
192 0.24
193 0.31
194 0.35
195 0.34
196 0.38
197 0.37
198 0.34
199 0.32
200 0.26
201 0.19
202 0.15
203 0.13
204 0.07
205 0.08
206 0.08
207 0.09
208 0.09
209 0.09
210 0.09
211 0.08
212 0.09
213 0.09
214 0.12
215 0.13
216 0.13
217 0.14
218 0.15
219 0.18
220 0.19
221 0.18
222 0.17
223 0.15
224 0.16
225 0.15
226 0.16
227 0.15
228 0.14
229 0.16
230 0.16
231 0.17
232 0.16
233 0.19
234 0.21