Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0A1THH6

Protein Details
Accession A0A0A1THH6    Localization Confidence High Confidence Score 20.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
37-61QLYNDSVRGQKRKRQANQTDDKVEDHydrophilic
80-109QESAKKPQRAASPPRKPTKRLPEDECRQIFHydrophilic
117-148TILSKDQELKKPKKSSKKKQKKAVAEEDTKNDHydrophilic
630-650NVGKADRKKLRERGVESRRSGBasic
652-674KAKITSKSGYERRKENNRRGAIEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
84-99KKPQRAASPPRKPTKR
125-138LKKPKKSSKKKQKK
633-680KADRKKLRERGVESRRSGSKAKITSKSGYERRKENNRRGAIEGSKRRK
Subcellular Location(s) nucl 11.5, cyto_nucl 10, mito 8, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR044764  DDX52/Rok1_DEADc  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014013  Helic_SF1/SF2_ATP-bd_DinG/Rad3  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0030490  P:maturation of SSU-rRNA  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF00271  Helicase_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51193  HELICASE_ATP_BIND_2  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd17957  DEADc_DDX52  
cd18787  SF2_C_DEAD  
Amino Acid Sequences MDILKILSRGTKKTNTASTSATATGDLPSSGAKVNPQLYNDSVRGQKRKRQANQTDDKVEDELPEVNFFPAPDATSAREQESAKKPQRAASPPRKPTKRLPEDECRQIFRSHRLKLTILSKDQELKKPKKSSKKKQKKAVAEEDTKNDSKAQLFPQPLESFADLRNTYGISRRVAENLIAQGYRVPTEVQLGCLPLLLRPELALPDTDGLDNGINFLAVAPTGSGKTVSFLIPAINKIMRRRALEKSEGSRELEAIIVAPTRELSHQIVNEGLKLLQGTGIKIVGMKKTTNISVEQQEIAEDSSDEGSDDEDEESADEGKPKRTQKVRPATQTDILVTTPRLLINFLTSGPSGTQRVLPGVRDLILDEADVLLDPLFREHTLSIWTACTNTDLRVSLWSATMGSNIETMINEKLEGRAEALGLPVKPLLRLVVGLKDTAVPNIIHKLVYTASEQGKLLALRQLLHPSRADDSGPPLRPPFLVFTQTIDRATALHEELKYDIPLEAGGPSRIAALHSGLAESARAAIMRKFRAGDIWVLITTDVLARGVDFAGVNGVVNYDVPGSSAVYVHRAGRTGRAGRQGGIAVTFYTKEDIPFVKTVANVIAVSEKQAGKTGDEATVQKWLLDALPNVGKADRKKLRERGVESRRSGSKAKITSKSGYERRKENNRRGAIEGSKRRKQAEADGSGDEDGDEWGGIDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.57
3 0.56
4 0.54
5 0.49
6 0.45
7 0.4
8 0.33
9 0.25
10 0.22
11 0.19
12 0.17
13 0.14
14 0.11
15 0.1
16 0.11
17 0.11
18 0.12
19 0.13
20 0.19
21 0.25
22 0.28
23 0.29
24 0.32
25 0.34
26 0.39
27 0.37
28 0.36
29 0.38
30 0.43
31 0.51
32 0.54
33 0.59
34 0.63
35 0.72
36 0.76
37 0.8
38 0.82
39 0.83
40 0.86
41 0.87
42 0.84
43 0.75
44 0.67
45 0.58
46 0.49
47 0.39
48 0.3
49 0.25
50 0.19
51 0.19
52 0.18
53 0.16
54 0.16
55 0.15
56 0.16
57 0.13
58 0.14
59 0.14
60 0.15
61 0.18
62 0.23
63 0.25
64 0.25
65 0.29
66 0.28
67 0.35
68 0.41
69 0.49
70 0.51
71 0.57
72 0.57
73 0.58
74 0.66
75 0.66
76 0.69
77 0.7
78 0.72
79 0.75
80 0.84
81 0.84
82 0.8
83 0.82
84 0.82
85 0.82
86 0.79
87 0.78
88 0.78
89 0.79
90 0.83
91 0.78
92 0.71
93 0.63
94 0.6
95 0.56
96 0.56
97 0.57
98 0.53
99 0.53
100 0.52
101 0.51
102 0.53
103 0.56
104 0.54
105 0.49
106 0.45
107 0.43
108 0.47
109 0.5
110 0.52
111 0.54
112 0.54
113 0.6
114 0.68
115 0.74
116 0.77
117 0.83
118 0.86
119 0.88
120 0.91
121 0.92
122 0.92
123 0.93
124 0.93
125 0.92
126 0.91
127 0.89
128 0.86
129 0.8
130 0.75
131 0.71
132 0.61
133 0.52
134 0.42
135 0.34
136 0.28
137 0.28
138 0.26
139 0.27
140 0.28
141 0.29
142 0.35
143 0.33
144 0.32
145 0.31
146 0.28
147 0.23
148 0.22
149 0.27
150 0.2
151 0.2
152 0.2
153 0.17
154 0.17
155 0.21
156 0.23
157 0.19
158 0.21
159 0.22
160 0.23
161 0.23
162 0.23
163 0.2
164 0.19
165 0.19
166 0.17
167 0.16
168 0.16
169 0.16
170 0.15
171 0.13
172 0.11
173 0.09
174 0.15
175 0.15
176 0.15
177 0.16
178 0.16
179 0.15
180 0.15
181 0.15
182 0.1
183 0.12
184 0.1
185 0.09
186 0.09
187 0.1
188 0.1
189 0.1
190 0.09
191 0.08
192 0.09
193 0.1
194 0.09
195 0.08
196 0.08
197 0.08
198 0.08
199 0.08
200 0.06
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.03
208 0.04
209 0.05
210 0.05
211 0.06
212 0.06
213 0.07
214 0.08
215 0.08
216 0.08
217 0.08
218 0.1
219 0.11
220 0.12
221 0.13
222 0.15
223 0.17
224 0.2
225 0.27
226 0.29
227 0.32
228 0.36
229 0.4
230 0.43
231 0.47
232 0.49
233 0.48
234 0.49
235 0.47
236 0.45
237 0.38
238 0.32
239 0.26
240 0.21
241 0.15
242 0.09
243 0.08
244 0.06
245 0.06
246 0.05
247 0.05
248 0.06
249 0.07
250 0.09
251 0.1
252 0.13
253 0.14
254 0.14
255 0.16
256 0.16
257 0.16
258 0.14
259 0.12
260 0.09
261 0.08
262 0.08
263 0.08
264 0.08
265 0.08
266 0.08
267 0.08
268 0.08
269 0.1
270 0.11
271 0.11
272 0.12
273 0.12
274 0.13
275 0.15
276 0.17
277 0.17
278 0.17
279 0.18
280 0.19
281 0.2
282 0.19
283 0.16
284 0.15
285 0.14
286 0.12
287 0.09
288 0.06
289 0.05
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.05
294 0.05
295 0.05
296 0.05
297 0.05
298 0.05
299 0.05
300 0.05
301 0.05
302 0.06
303 0.06
304 0.09
305 0.1
306 0.13
307 0.19
308 0.22
309 0.29
310 0.35
311 0.43
312 0.5
313 0.6
314 0.64
315 0.66
316 0.69
317 0.65
318 0.61
319 0.54
320 0.44
321 0.34
322 0.27
323 0.2
324 0.14
325 0.11
326 0.09
327 0.08
328 0.08
329 0.07
330 0.07
331 0.07
332 0.08
333 0.07
334 0.08
335 0.08
336 0.08
337 0.08
338 0.09
339 0.09
340 0.09
341 0.1
342 0.09
343 0.11
344 0.11
345 0.11
346 0.11
347 0.11
348 0.11
349 0.09
350 0.09
351 0.08
352 0.07
353 0.07
354 0.05
355 0.05
356 0.04
357 0.04
358 0.04
359 0.03
360 0.03
361 0.03
362 0.03
363 0.04
364 0.04
365 0.06
366 0.06
367 0.06
368 0.08
369 0.09
370 0.09
371 0.09
372 0.09
373 0.09
374 0.09
375 0.1
376 0.09
377 0.09
378 0.1
379 0.1
380 0.1
381 0.12
382 0.12
383 0.11
384 0.11
385 0.1
386 0.09
387 0.08
388 0.09
389 0.07
390 0.07
391 0.06
392 0.06
393 0.06
394 0.06
395 0.07
396 0.07
397 0.07
398 0.07
399 0.07
400 0.08
401 0.08
402 0.08
403 0.08
404 0.07
405 0.08
406 0.07
407 0.08
408 0.09
409 0.08
410 0.09
411 0.09
412 0.09
413 0.08
414 0.08
415 0.08
416 0.06
417 0.08
418 0.08
419 0.12
420 0.12
421 0.12
422 0.12
423 0.13
424 0.13
425 0.12
426 0.13
427 0.09
428 0.09
429 0.13
430 0.13
431 0.11
432 0.11
433 0.12
434 0.11
435 0.12
436 0.12
437 0.14
438 0.15
439 0.16
440 0.16
441 0.15
442 0.17
443 0.15
444 0.15
445 0.14
446 0.13
447 0.12
448 0.14
449 0.22
450 0.21
451 0.23
452 0.23
453 0.22
454 0.23
455 0.24
456 0.23
457 0.16
458 0.21
459 0.26
460 0.27
461 0.27
462 0.25
463 0.25
464 0.25
465 0.25
466 0.23
467 0.19
468 0.2
469 0.19
470 0.22
471 0.25
472 0.27
473 0.25
474 0.21
475 0.18
476 0.15
477 0.16
478 0.15
479 0.12
480 0.14
481 0.13
482 0.14
483 0.15
484 0.16
485 0.15
486 0.14
487 0.12
488 0.09
489 0.09
490 0.08
491 0.08
492 0.08
493 0.09
494 0.08
495 0.08
496 0.08
497 0.08
498 0.08
499 0.08
500 0.08
501 0.09
502 0.09
503 0.09
504 0.09
505 0.08
506 0.08
507 0.07
508 0.06
509 0.05
510 0.05
511 0.06
512 0.1
513 0.16
514 0.18
515 0.21
516 0.21
517 0.21
518 0.24
519 0.24
520 0.24
521 0.2
522 0.19
523 0.17
524 0.16
525 0.16
526 0.12
527 0.11
528 0.09
529 0.07
530 0.05
531 0.05
532 0.05
533 0.06
534 0.06
535 0.06
536 0.06
537 0.05
538 0.06
539 0.06
540 0.06
541 0.05
542 0.06
543 0.05
544 0.05
545 0.06
546 0.05
547 0.05
548 0.06
549 0.06
550 0.07
551 0.07
552 0.08
553 0.09
554 0.11
555 0.13
556 0.15
557 0.15
558 0.17
559 0.17
560 0.22
561 0.29
562 0.32
563 0.35
564 0.41
565 0.41
566 0.4
567 0.42
568 0.37
569 0.3
570 0.26
571 0.21
572 0.13
573 0.13
574 0.13
575 0.11
576 0.12
577 0.12
578 0.11
579 0.14
580 0.15
581 0.18
582 0.19
583 0.19
584 0.19
585 0.19
586 0.2
587 0.18
588 0.18
589 0.13
590 0.13
591 0.16
592 0.13
593 0.16
594 0.19
595 0.19
596 0.17
597 0.22
598 0.22
599 0.2
600 0.23
601 0.23
602 0.21
603 0.24
604 0.24
605 0.21
606 0.26
607 0.24
608 0.21
609 0.19
610 0.17
611 0.15
612 0.18
613 0.17
614 0.17
615 0.2
616 0.21
617 0.22
618 0.23
619 0.27
620 0.27
621 0.37
622 0.4
623 0.44
624 0.53
625 0.62
626 0.7
627 0.75
628 0.79
629 0.79
630 0.81
631 0.83
632 0.77
633 0.75
634 0.7
635 0.65
636 0.61
637 0.57
638 0.55
639 0.55
640 0.59
641 0.59
642 0.6
643 0.61
644 0.64
645 0.68
646 0.68
647 0.69
648 0.67
649 0.69
650 0.73
651 0.79
652 0.83
653 0.83
654 0.84
655 0.82
656 0.8
657 0.76
658 0.74
659 0.71
660 0.71
661 0.72
662 0.71
663 0.7
664 0.7
665 0.69
666 0.66
667 0.61
668 0.61
669 0.61
670 0.58
671 0.54
672 0.51
673 0.5
674 0.45
675 0.4
676 0.29
677 0.19
678 0.13
679 0.09
680 0.07