FuNGI

P53166

Protein Details

Accession

P53166

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
41-73	ASVPTGSSNKNRKQKAKGKKGNKKNDPDQAFNF	Hydrophilic
541-561	SKTKSWAKALPKIIKKHQRLS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
49-64	NKNRKQKAKGKKGNKK

Subcellular Location(s)

mito 23, nucl 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011545 DEAD/DEAH_box_helicase_dom IPR014001 Helicase_ATP-bd IPR001650 Helicase_C IPR027417 P-loop_NTPase
Gene Ontology	GO:0005759 C:mitochondrial matrix GO:0005739 C:mitochondrion GO:0005730 C:nucleolus GO:0005524 F:ATP binding GO:0016887 F:ATP hydrolysis activity GO:1990400 F:mitochondrial ribosomal large subunit rRNA binding GO:0003724 F:RNA helicase activity GO:0000463 P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:1902775 P:mitochondrial large ribosomal subunit assembly GO:0016070 P:RNA metabolic process
KEGG	sce:YGL064C -
Pfam	View protein in Pfam PF00270 DEAD PF00271 Helicase_C
PROSITE	View protein in PROSITE PS51192 HELICASE_ATP_BIND_1 PS51194 HELICASE_CTER
CDD	cd17965 DEADc_MRH4 cd18787 SF2_C_DEAD

Amino Acid Sequences

MSLFFKPVISPQWSFPVLLKIGVRSYAGGPRTKHKGNSPLASVPTGSSNKNRKQKAKGKKGNKKNDPDQAFNFGEYGGLKKDVEMNMDSTNKLIQKISNFDQLLILPPVRDAVKEIISKESLKLQDSRKKTSENIIPSPIQTVAIKRISKNLMDPKLQIHAIAAETGSGKTMAYLIPLIDYLKRQELETPELWETLRKNVLIRSIILVPTHELVDQVYETVSKTKTLLGLNSFKWDKATSYRDLLENIKNRIDILVTTPGKLLNLFSIRMITRPDKVLSKVGFVVLDEADTLLDRSWLEETHSAIKRIPNINHLIFCSATIPQEFNKTMQRLFPTVVPIMTPRLHKLPFALDFKVINSALSPFKGSKIKALAQTLYAISNDDTEPGFEKRCIIFVNEKKNVPEIVNLLNKKFGHNAIGLTGEDTFEERSEKIMPFLSPPRPLSEVVAQSTSPPTSLKKFEIPDSNIVIGKLKNTNSNGTAPSNKSLHVLVTTDLMARGLNFKGVRNVVLYDVPKTSIDLIHRVGRTARMKQGGRVFMLTDSKTKSWAKALPKIIKKHQRLS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.36
2	0.34
3	0.35
4	0.3
5	0.32
6	0.3
7	0.25
8	0.26
9	0.27
10	0.25
11	0.2
12	0.22
13	0.25
14	0.28
15	0.31
16	0.32
17	0.38
18	0.46
19	0.5
20	0.52
21	0.54
22	0.6
23	0.62
24	0.66
25	0.64
26	0.61
27	0.58
28	0.54
29	0.46
30	0.37
31	0.36
32	0.32
33	0.3
34	0.34
35	0.41
36	0.49
37	0.58
38	0.66
39	0.68
40	0.76
41	0.82
42	0.84
43	0.86
44	0.87
45	0.89
46	0.91
47	0.93
48	0.93
49	0.94
50	0.92
51	0.9
52	0.9
53	0.85
54	0.81
55	0.74
56	0.7
57	0.61
58	0.52
59	0.43
60	0.32
61	0.27
62	0.2
63	0.18
64	0.13
65	0.13
66	0.13
67	0.13
68	0.19
69	0.19
70	0.22
71	0.21
72	0.22
73	0.25
74	0.26
75	0.26
76	0.21
77	0.24
78	0.22
79	0.22
80	0.21
81	0.2
82	0.23
83	0.29
84	0.33
85	0.37
86	0.36
87	0.34
88	0.34
89	0.31
90	0.3
91	0.26
92	0.23
93	0.14
94	0.14
95	0.16
96	0.15
97	0.14
98	0.13
99	0.14
100	0.2
101	0.22
102	0.23
103	0.25
104	0.27
105	0.28
106	0.26
107	0.29
108	0.26
109	0.26
110	0.31
111	0.36
112	0.42
113	0.47
114	0.53
115	0.5
116	0.52
117	0.52
118	0.54
119	0.53
120	0.52
121	0.51
122	0.48
123	0.45
124	0.42
125	0.41
126	0.33
127	0.27
128	0.2
129	0.18
130	0.2
131	0.26
132	0.28
133	0.26
134	0.33
135	0.35
136	0.35
137	0.4
138	0.43
139	0.42
140	0.42
141	0.43
142	0.38
143	0.39
144	0.38
145	0.3
146	0.21
147	0.17
148	0.14
149	0.14
150	0.11
151	0.07
152	0.08
153	0.08
154	0.08
155	0.07
156	0.06
157	0.05
158	0.06
159	0.06
160	0.06
161	0.06
162	0.06
163	0.06
164	0.07
165	0.08
166	0.08
167	0.09
168	0.11
169	0.15
170	0.15
171	0.15
172	0.19
173	0.22
174	0.26
175	0.26
176	0.28
177	0.24
178	0.24
179	0.24
180	0.23
181	0.21
182	0.19
183	0.21
184	0.17
185	0.18
186	0.19
187	0.24
188	0.22
189	0.21
190	0.19
191	0.19
192	0.19
193	0.18
194	0.17
195	0.13
196	0.12
197	0.12
198	0.1
199	0.08
200	0.07
201	0.08
202	0.07
203	0.06
204	0.05
205	0.05
206	0.06
207	0.09
208	0.09
209	0.09
210	0.09
211	0.1
212	0.14
213	0.15
214	0.16
215	0.18
216	0.22
217	0.22
218	0.27
219	0.27
220	0.23
221	0.23
222	0.22
223	0.19
224	0.21
225	0.25
226	0.22
227	0.24
228	0.26
229	0.25
230	0.27
231	0.28
232	0.29
233	0.29
234	0.29
235	0.27
236	0.25
237	0.25
238	0.23
239	0.19
240	0.13
241	0.11
242	0.18
243	0.17
244	0.17
245	0.18
246	0.17
247	0.17
248	0.17
249	0.14
250	0.09
251	0.1
252	0.1
253	0.1
254	0.12
255	0.12
256	0.13
257	0.16
258	0.14
259	0.14
260	0.16
261	0.17
262	0.17
263	0.19
264	0.24
265	0.21
266	0.21
267	0.2
268	0.18
269	0.16
270	0.14
271	0.14
272	0.08
273	0.07
274	0.05
275	0.05
276	0.04
277	0.04
278	0.05
279	0.03
280	0.04
281	0.04
282	0.05
283	0.05
284	0.06
285	0.07
286	0.09
287	0.11
288	0.18
289	0.2
290	0.2
291	0.21
292	0.23
293	0.27
294	0.31
295	0.3
296	0.27
297	0.31
298	0.32
299	0.31
300	0.3
301	0.25
302	0.2
303	0.19
304	0.15
305	0.1
306	0.1
307	0.09
308	0.1
309	0.09
310	0.14
311	0.14
312	0.15
313	0.2
314	0.21
315	0.22
316	0.23
317	0.25
318	0.22
319	0.23
320	0.22
321	0.19
322	0.18
323	0.18
324	0.15
325	0.13
326	0.15
327	0.17
328	0.16
329	0.15
330	0.2
331	0.2
332	0.2
333	0.21
334	0.22
335	0.25
336	0.28
337	0.26
338	0.23
339	0.23
340	0.23
341	0.26
342	0.21
343	0.15
344	0.12
345	0.13
346	0.13
347	0.13
348	0.14
349	0.11
350	0.15
351	0.19
352	0.19
353	0.22
354	0.26
355	0.29
356	0.32
357	0.35
358	0.32
359	0.28
360	0.29
361	0.25
362	0.21
363	0.16
364	0.13
365	0.1
366	0.11
367	0.1
368	0.09
369	0.09
370	0.08
371	0.11
372	0.12
373	0.13
374	0.12
375	0.16
376	0.15
377	0.17
378	0.17
379	0.18
380	0.26
381	0.31
382	0.41
383	0.43
384	0.44
385	0.43
386	0.45
387	0.43
388	0.34
389	0.31
390	0.23
391	0.25
392	0.3
393	0.31
394	0.29
395	0.33
396	0.32
397	0.31
398	0.31
399	0.26
400	0.22
401	0.22
402	0.22
403	0.17
404	0.19
405	0.17
406	0.15
407	0.13
408	0.1
409	0.09
410	0.09
411	0.09
412	0.07
413	0.09
414	0.09
415	0.1
416	0.14
417	0.14
418	0.15
419	0.17
420	0.16
421	0.2
422	0.27
423	0.3
424	0.32
425	0.33
426	0.36
427	0.36
428	0.36
429	0.35
430	0.35
431	0.34
432	0.31
433	0.31
434	0.27
435	0.25
436	0.27
437	0.23
438	0.17
439	0.15
440	0.16
441	0.2
442	0.25
443	0.27
444	0.31
445	0.34
446	0.39
447	0.46
448	0.47
449	0.47
450	0.46
451	0.45
452	0.39
453	0.37
454	0.34
455	0.25
456	0.25
457	0.25
458	0.23
459	0.28
460	0.3
461	0.34
462	0.34
463	0.38
464	0.37
465	0.37
466	0.41
467	0.37
468	0.4
469	0.37
470	0.34
471	0.32
472	0.29
473	0.26
474	0.22
475	0.2
476	0.15
477	0.15
478	0.15
479	0.14
480	0.14
481	0.12
482	0.1
483	0.1
484	0.12
485	0.11
486	0.16
487	0.16
488	0.18
489	0.24
490	0.26
491	0.27
492	0.26
493	0.27
494	0.23
495	0.28
496	0.27
497	0.24
498	0.23
499	0.24
500	0.22
501	0.22
502	0.22
503	0.2
504	0.22
505	0.24
506	0.26
507	0.32
508	0.32
509	0.33
510	0.33
511	0.38
512	0.41
513	0.43
514	0.47
515	0.49
516	0.51
517	0.56
518	0.62
519	0.59
520	0.55
521	0.5
522	0.43
523	0.39
524	0.43
525	0.38
526	0.34
527	0.35
528	0.32
529	0.37
530	0.39
531	0.37
532	0.39
533	0.44
534	0.47
535	0.5
536	0.6
537	0.63
538	0.69
539	0.75
540	0.78
541	0.82

P53166

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer