Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P47156

Protein Details
Accession P47156    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
644-671RKNNYDSIRTYKRHKKNHLSIRQWNELSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto 5, mito 1, golg 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003347  JmjC_dom  
IPR003349  JmjN  
IPR019786  Zinc_finger_PHD-type_CS  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR001965  Znf_PHD  
IPR019787  Znf_PHD-finger  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0032452  F:histone demethylase activity  
GO:0032453  F:histone H3K4 demethylase activity  
GO:0034647  F:histone H3K4me/H3K4me2/H3K4me3 demethylase activity  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0071041  P:antisense RNA transcript catabolic process  
GO:0006338  P:chromatin remodeling  
GO:1904388  P:negative regulation of ncRNA transcription associated with protein coding gene TSS/TES  
GO:0000122  P:negative regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0045944  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0000183  P:rDNA heterochromatin formation  
GO:1902275  P:regulation of chromatin organization  
GO:0060623  P:regulation of chromosome condensation  
KEGG sce:YJR119C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02373  JmjC  
PF02375  JmjN  
PF00628  PHD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51184  JMJC  
PS51183  JMJN  
PS01359  ZF_PHD_1  
PS50016  ZF_PHD_2  
CDD cd15544  PHD_BAZ1A_like  
Amino Acid Sequences MEEIPALYPTEQEFKNPIDYLSNPHIKRLGVRYGMVKVVPPNGFCPPLSIDMENFTFQPRIQNLENLDLKNRCRLFFMKQLNNFKRSVKDPSKLILREPYTIVEYSDSTHASEILKKKVYFYDVFSELIKDNRTLTDTTQSFRRKLKFRDISQLRGDISLWRTISKKFNVPIGLLKEIFEKYIASYYIFLHSLNENVHTALHADQYPKSLLSDDEDDFDLGPDSNSGSDFEEDDDDACIVCRKTNDPKRTILCDSCDKPFHIYCLSPPLERVPSGDWICNTCIVGNGYYGFTQDTHDYSLPEFQEYCKRQNSRLLPARKLSIDELEEMFWSLVTKNRRSSLTTVKYGADIHNELPGQITGFPTREFIPKNINGDELIDYLKYCDHPMNLTNLPMAHNSLLPLFKRNISGMTIPWIYIGSLFSTFCWHMEDQYTLSANYQHEGDPKVWYSIPESGCTKFNDLLNDMSPDLFIKQPDLLHQLVTLISPYDPNFKKSGIPVYKAVQKPNEYIITFPKCYHAGFNTGYNFNEAVNFTIDFWLPYGFGAITDYKLTQKACVFDMFDLMINVLDKYNKDTLLFNDAFVRQCYSSLIVFYNTELKRIRKIQAIVPRTTLLEVHTDPNDEDEEYDIFCSQCKTICSIAFVLRKNNYDSIRTYKRHKKNHLSIRQWNELSTTDSKVSILCTQDYLKSIQNLNNSDGEEPYIDDELYFTKSLKDIDSLIKQVGVKLDR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.32
3 0.31
4 0.3
5 0.28
6 0.29
7 0.33
8 0.38
9 0.45
10 0.39
11 0.43
12 0.45
13 0.41
14 0.46
15 0.45
16 0.45
17 0.4
18 0.42
19 0.43
20 0.43
21 0.45
22 0.39
23 0.35
24 0.29
25 0.33
26 0.33
27 0.3
28 0.3
29 0.32
30 0.34
31 0.31
32 0.31
33 0.27
34 0.3
35 0.32
36 0.29
37 0.26
38 0.27
39 0.3
40 0.27
41 0.24
42 0.22
43 0.19
44 0.18
45 0.26
46 0.23
47 0.27
48 0.28
49 0.33
50 0.33
51 0.4
52 0.45
53 0.39
54 0.44
55 0.43
56 0.43
57 0.47
58 0.46
59 0.38
60 0.38
61 0.4
62 0.4
63 0.45
64 0.53
65 0.53
66 0.6
67 0.7
68 0.72
69 0.73
70 0.69
71 0.63
72 0.59
73 0.54
74 0.55
75 0.53
76 0.52
77 0.51
78 0.56
79 0.61
80 0.56
81 0.56
82 0.54
83 0.48
84 0.45
85 0.44
86 0.39
87 0.33
88 0.32
89 0.29
90 0.22
91 0.19
92 0.18
93 0.19
94 0.17
95 0.15
96 0.14
97 0.15
98 0.15
99 0.21
100 0.24
101 0.29
102 0.35
103 0.34
104 0.37
105 0.4
106 0.44
107 0.39
108 0.38
109 0.37
110 0.32
111 0.33
112 0.31
113 0.29
114 0.25
115 0.26
116 0.23
117 0.18
118 0.17
119 0.17
120 0.2
121 0.19
122 0.2
123 0.26
124 0.26
125 0.27
126 0.34
127 0.38
128 0.4
129 0.45
130 0.51
131 0.51
132 0.56
133 0.65
134 0.66
135 0.66
136 0.72
137 0.71
138 0.69
139 0.65
140 0.62
141 0.52
142 0.43
143 0.39
144 0.32
145 0.29
146 0.27
147 0.23
148 0.21
149 0.22
150 0.26
151 0.33
152 0.32
153 0.37
154 0.34
155 0.39
156 0.39
157 0.39
158 0.42
159 0.39
160 0.38
161 0.32
162 0.3
163 0.28
164 0.26
165 0.24
166 0.18
167 0.14
168 0.11
169 0.14
170 0.14
171 0.12
172 0.13
173 0.13
174 0.16
175 0.16
176 0.14
177 0.13
178 0.13
179 0.14
180 0.14
181 0.15
182 0.12
183 0.12
184 0.12
185 0.11
186 0.11
187 0.1
188 0.12
189 0.12
190 0.13
191 0.14
192 0.16
193 0.17
194 0.16
195 0.15
196 0.14
197 0.12
198 0.14
199 0.17
200 0.15
201 0.16
202 0.16
203 0.16
204 0.15
205 0.15
206 0.12
207 0.08
208 0.08
209 0.06
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.07
214 0.08
215 0.08
216 0.09
217 0.1
218 0.1
219 0.1
220 0.1
221 0.09
222 0.08
223 0.07
224 0.07
225 0.09
226 0.08
227 0.09
228 0.1
229 0.14
230 0.25
231 0.35
232 0.43
233 0.44
234 0.51
235 0.54
236 0.59
237 0.59
238 0.52
239 0.47
240 0.47
241 0.45
242 0.42
243 0.4
244 0.35
245 0.35
246 0.32
247 0.3
248 0.25
249 0.23
250 0.19
251 0.25
252 0.26
253 0.22
254 0.22
255 0.23
256 0.22
257 0.22
258 0.23
259 0.17
260 0.21
261 0.23
262 0.23
263 0.2
264 0.21
265 0.21
266 0.2
267 0.18
268 0.12
269 0.12
270 0.11
271 0.11
272 0.09
273 0.1
274 0.09
275 0.09
276 0.1
277 0.08
278 0.07
279 0.08
280 0.09
281 0.09
282 0.11
283 0.12
284 0.12
285 0.12
286 0.16
287 0.15
288 0.15
289 0.14
290 0.12
291 0.21
292 0.24
293 0.28
294 0.31
295 0.33
296 0.34
297 0.43
298 0.46
299 0.47
300 0.53
301 0.54
302 0.5
303 0.51
304 0.51
305 0.43
306 0.4
307 0.31
308 0.25
309 0.2
310 0.18
311 0.16
312 0.14
313 0.13
314 0.12
315 0.1
316 0.07
317 0.07
318 0.06
319 0.09
320 0.13
321 0.17
322 0.19
323 0.23
324 0.24
325 0.27
326 0.31
327 0.37
328 0.38
329 0.38
330 0.37
331 0.34
332 0.33
333 0.32
334 0.28
335 0.2
336 0.16
337 0.13
338 0.14
339 0.14
340 0.13
341 0.12
342 0.11
343 0.09
344 0.08
345 0.09
346 0.07
347 0.08
348 0.08
349 0.09
350 0.1
351 0.13
352 0.14
353 0.15
354 0.2
355 0.22
356 0.25
357 0.24
358 0.24
359 0.2
360 0.2
361 0.19
362 0.13
363 0.11
364 0.08
365 0.07
366 0.07
367 0.08
368 0.07
369 0.07
370 0.08
371 0.08
372 0.09
373 0.11
374 0.16
375 0.16
376 0.16
377 0.15
378 0.14
379 0.15
380 0.14
381 0.14
382 0.09
383 0.08
384 0.08
385 0.09
386 0.11
387 0.1
388 0.13
389 0.13
390 0.13
391 0.15
392 0.15
393 0.15
394 0.15
395 0.15
396 0.13
397 0.16
398 0.15
399 0.13
400 0.13
401 0.12
402 0.09
403 0.09
404 0.09
405 0.06
406 0.06
407 0.07
408 0.06
409 0.09
410 0.09
411 0.09
412 0.12
413 0.11
414 0.11
415 0.13
416 0.14
417 0.12
418 0.14
419 0.14
420 0.11
421 0.12
422 0.14
423 0.13
424 0.12
425 0.12
426 0.11
427 0.13
428 0.14
429 0.15
430 0.14
431 0.14
432 0.16
433 0.15
434 0.15
435 0.15
436 0.2
437 0.2
438 0.21
439 0.22
440 0.22
441 0.24
442 0.25
443 0.25
444 0.21
445 0.22
446 0.22
447 0.21
448 0.21
449 0.2
450 0.2
451 0.17
452 0.15
453 0.13
454 0.11
455 0.1
456 0.1
457 0.09
458 0.08
459 0.1
460 0.1
461 0.13
462 0.17
463 0.16
464 0.15
465 0.14
466 0.14
467 0.12
468 0.12
469 0.09
470 0.06
471 0.06
472 0.07
473 0.08
474 0.16
475 0.17
476 0.2
477 0.21
478 0.22
479 0.24
480 0.25
481 0.34
482 0.3
483 0.33
484 0.33
485 0.36
486 0.43
487 0.44
488 0.46
489 0.41
490 0.39
491 0.38
492 0.39
493 0.4
494 0.32
495 0.31
496 0.34
497 0.35
498 0.33
499 0.31
500 0.3
501 0.26
502 0.27
503 0.28
504 0.22
505 0.22
506 0.22
507 0.26
508 0.27
509 0.27
510 0.27
511 0.26
512 0.24
513 0.19
514 0.19
515 0.14
516 0.12
517 0.12
518 0.12
519 0.11
520 0.12
521 0.12
522 0.1
523 0.1
524 0.09
525 0.08
526 0.07
527 0.08
528 0.06
529 0.06
530 0.08
531 0.08
532 0.09
533 0.1
534 0.11
535 0.12
536 0.15
537 0.15
538 0.17
539 0.19
540 0.2
541 0.21
542 0.22
543 0.22
544 0.19
545 0.21
546 0.17
547 0.15
548 0.13
549 0.12
550 0.1
551 0.09
552 0.09
553 0.08
554 0.09
555 0.09
556 0.13
557 0.16
558 0.16
559 0.17
560 0.19
561 0.2
562 0.28
563 0.27
564 0.23
565 0.25
566 0.26
567 0.26
568 0.25
569 0.26
570 0.18
571 0.18
572 0.19
573 0.17
574 0.16
575 0.16
576 0.16
577 0.15
578 0.15
579 0.15
580 0.23
581 0.2
582 0.25
583 0.27
584 0.28
585 0.34
586 0.4
587 0.43
588 0.41
589 0.44
590 0.47
591 0.53
592 0.57
593 0.51
594 0.49
595 0.46
596 0.39
597 0.37
598 0.3
599 0.21
600 0.21
601 0.2
602 0.21
603 0.2
604 0.21
605 0.2
606 0.22
607 0.22
608 0.16
609 0.15
610 0.14
611 0.13
612 0.12
613 0.13
614 0.12
615 0.1
616 0.11
617 0.12
618 0.11
619 0.14
620 0.15
621 0.18
622 0.22
623 0.24
624 0.26
625 0.27
626 0.34
627 0.37
628 0.39
629 0.42
630 0.42
631 0.44
632 0.45
633 0.48
634 0.43
635 0.41
636 0.43
637 0.45
638 0.5
639 0.52
640 0.57
641 0.62
642 0.69
643 0.75
644 0.81
645 0.83
646 0.84
647 0.91
648 0.92
649 0.91
650 0.9
651 0.88
652 0.87
653 0.76
654 0.66
655 0.58
656 0.49
657 0.45
658 0.38
659 0.33
660 0.25
661 0.25
662 0.24
663 0.22
664 0.23
665 0.22
666 0.22
667 0.19
668 0.21
669 0.23
670 0.25
671 0.27
672 0.27
673 0.27
674 0.29
675 0.33
676 0.34
677 0.4
678 0.4
679 0.41
680 0.42
681 0.38
682 0.34
683 0.3
684 0.28
685 0.21
686 0.18
687 0.18
688 0.15
689 0.14
690 0.12
691 0.13
692 0.13
693 0.16
694 0.15
695 0.13
696 0.14
697 0.16
698 0.18
699 0.19
700 0.2
701 0.2
702 0.27
703 0.32
704 0.33
705 0.32
706 0.34
707 0.32
708 0.32