Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0A1TMA9

Protein Details
Accession A0A0A1TMA9    Localization Confidence High Confidence Score 21.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
188-213GRDNRNHNQHKDRRNSQNNNRDNRNHHydrophilic
314-342NNGPNNQKNNKNNRNKDNRNRNNNNNQGSHydrophilic
391-415GQGNENRKDKRKNQNQNQHQRRASDHydrophilic
518-549KDDSPPRRRRDSQSSERALKRQRVERWRKSGEBasic
639-660LQSLGPIKKKRKPTDSAYSRRWHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
501-546ERSKSPSSDRGGRNQAPKDDSPPRRRRDSQSSERALKRQRVERWRK
646-650KKKRK
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51257  PROKAR_LIPOPROTEIN  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MSGHASRPGQDEPRCYNCGGSGHWAVACPEPTRETPAGLSWRDGGKQKQQQGGQRNQNNGGRKAKGPIITKYAPPTPAYNGYYPPPPGYPPAPGSYSAPPGTSHQQSYPPHYGPPGTHQPPPPPPPPGANYSQPSYPPQSYHPPTQYAPPPPPPPGPPSYGPPPGHGLPPPPPPAHFGNSYNQHSQGGRDNRNHNQHKDRRNSQNNNRDNRNHGSPNNRTASFSKPAHSPPPNGNNKRSHGSPQAAKNAPKQSPSSVKASPSTLPMGIASLPPKPTNALPPKPPKSIHDVADPHRLDKNPNANASNHPNNNNNNNGPNNQKNNKNNRNKDNRNRNNNNNQGSRNNSQSQQGGQGGRNNSQSQQGGRNNSQSQQGGRNNSQSQQGGKRRDSGQGNENRKDKRKNQNQNQHQRRASDGKKVSAQSWSPSEPRVTEPSAEPATSVKEHSSPVKQPELPRPPSRDLDLDIEGNIPEEGEALEDSPEAPADAPPSAVEIETSLKRERSKSPSSDRGGRNQAPKDDSPPRRRRDSQSSERALKRQRVERWRKSGEAGEASDDEALDQAPEPGEASDDSPPRASRPVERRPSANGSERSRSAASTASSDLNSLEAELLGRPVRRQSSGSSAPKTKVDNAAPTQSALQSLGPIKKKRKPTDSAYSRRW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.51
3 0.46
4 0.41
5 0.4
6 0.35
7 0.34
8 0.29
9 0.28
10 0.28
11 0.28
12 0.26
13 0.27
14 0.27
15 0.22
16 0.23
17 0.25
18 0.26
19 0.33
20 0.32
21 0.29
22 0.28
23 0.33
24 0.37
25 0.34
26 0.34
27 0.3
28 0.33
29 0.34
30 0.39
31 0.39
32 0.42
33 0.5
34 0.55
35 0.59
36 0.62
37 0.67
38 0.71
39 0.75
40 0.75
41 0.73
42 0.71
43 0.71
44 0.71
45 0.7
46 0.68
47 0.65
48 0.58
49 0.54
50 0.53
51 0.51
52 0.52
53 0.5
54 0.48
55 0.48
56 0.48
57 0.49
58 0.5
59 0.49
60 0.44
61 0.41
62 0.39
63 0.36
64 0.41
65 0.41
66 0.37
67 0.35
68 0.36
69 0.38
70 0.37
71 0.34
72 0.28
73 0.26
74 0.28
75 0.28
76 0.3
77 0.29
78 0.31
79 0.31
80 0.3
81 0.32
82 0.31
83 0.34
84 0.3
85 0.27
86 0.25
87 0.27
88 0.32
89 0.32
90 0.31
91 0.29
92 0.36
93 0.38
94 0.45
95 0.48
96 0.43
97 0.4
98 0.4
99 0.39
100 0.33
101 0.38
102 0.4
103 0.36
104 0.4
105 0.43
106 0.48
107 0.55
108 0.6
109 0.57
110 0.5
111 0.49
112 0.49
113 0.48
114 0.46
115 0.42
116 0.43
117 0.41
118 0.4
119 0.4
120 0.37
121 0.37
122 0.38
123 0.35
124 0.3
125 0.32
126 0.39
127 0.41
128 0.47
129 0.47
130 0.45
131 0.44
132 0.49
133 0.51
134 0.48
135 0.49
136 0.48
137 0.48
138 0.48
139 0.51
140 0.48
141 0.47
142 0.44
143 0.43
144 0.38
145 0.4
146 0.42
147 0.47
148 0.44
149 0.41
150 0.42
151 0.38
152 0.39
153 0.34
154 0.31
155 0.28
156 0.34
157 0.37
158 0.32
159 0.32
160 0.33
161 0.36
162 0.36
163 0.35
164 0.31
165 0.33
166 0.4
167 0.44
168 0.42
169 0.39
170 0.37
171 0.34
172 0.33
173 0.34
174 0.36
175 0.38
176 0.42
177 0.48
178 0.53
179 0.64
180 0.69
181 0.67
182 0.69
183 0.71
184 0.74
185 0.77
186 0.78
187 0.79
188 0.82
189 0.85
190 0.85
191 0.86
192 0.85
193 0.83
194 0.81
195 0.74
196 0.69
197 0.65
198 0.61
199 0.57
200 0.53
201 0.54
202 0.52
203 0.56
204 0.56
205 0.5
206 0.46
207 0.42
208 0.43
209 0.42
210 0.38
211 0.33
212 0.31
213 0.34
214 0.4
215 0.41
216 0.39
217 0.39
218 0.48
219 0.56
220 0.58
221 0.61
222 0.59
223 0.6
224 0.6
225 0.54
226 0.49
227 0.46
228 0.46
229 0.45
230 0.44
231 0.49
232 0.5
233 0.5
234 0.52
235 0.52
236 0.49
237 0.46
238 0.42
239 0.38
240 0.41
241 0.41
242 0.4
243 0.35
244 0.35
245 0.34
246 0.34
247 0.3
248 0.24
249 0.23
250 0.18
251 0.16
252 0.14
253 0.12
254 0.1
255 0.11
256 0.1
257 0.1
258 0.12
259 0.12
260 0.12
261 0.13
262 0.13
263 0.22
264 0.29
265 0.31
266 0.38
267 0.47
268 0.52
269 0.55
270 0.56
271 0.48
272 0.49
273 0.49
274 0.43
275 0.41
276 0.4
277 0.39
278 0.47
279 0.45
280 0.38
281 0.37
282 0.35
283 0.29
284 0.31
285 0.37
286 0.31
287 0.34
288 0.34
289 0.32
290 0.36
291 0.41
292 0.42
293 0.36
294 0.35
295 0.37
296 0.39
297 0.42
298 0.42
299 0.36
300 0.33
301 0.32
302 0.31
303 0.32
304 0.34
305 0.38
306 0.38
307 0.45
308 0.49
309 0.58
310 0.66
311 0.71
312 0.73
313 0.75
314 0.81
315 0.83
316 0.85
317 0.86
318 0.85
319 0.86
320 0.85
321 0.84
322 0.84
323 0.82
324 0.78
325 0.71
326 0.64
327 0.57
328 0.55
329 0.49
330 0.44
331 0.38
332 0.32
333 0.3
334 0.28
335 0.26
336 0.23
337 0.24
338 0.21
339 0.2
340 0.23
341 0.23
342 0.24
343 0.26
344 0.24
345 0.21
346 0.23
347 0.23
348 0.2
349 0.27
350 0.28
351 0.31
352 0.32
353 0.36
354 0.34
355 0.34
356 0.36
357 0.29
358 0.27
359 0.3
360 0.32
361 0.32
362 0.33
363 0.36
364 0.34
365 0.34
366 0.36
367 0.29
368 0.29
369 0.33
370 0.39
371 0.4
372 0.4
373 0.43
374 0.41
375 0.47
376 0.47
377 0.41
378 0.42
379 0.45
380 0.51
381 0.52
382 0.55
383 0.54
384 0.58
385 0.62
386 0.63
387 0.65
388 0.68
389 0.74
390 0.79
391 0.84
392 0.88
393 0.91
394 0.91
395 0.89
396 0.81
397 0.71
398 0.66
399 0.64
400 0.56
401 0.55
402 0.49
403 0.43
404 0.45
405 0.45
406 0.41
407 0.37
408 0.35
409 0.28
410 0.29
411 0.29
412 0.25
413 0.25
414 0.25
415 0.22
416 0.24
417 0.25
418 0.23
419 0.21
420 0.21
421 0.25
422 0.25
423 0.23
424 0.2
425 0.16
426 0.18
427 0.17
428 0.17
429 0.13
430 0.13
431 0.15
432 0.19
433 0.24
434 0.25
435 0.29
436 0.35
437 0.37
438 0.4
439 0.49
440 0.54
441 0.56
442 0.57
443 0.59
444 0.57
445 0.56
446 0.55
447 0.46
448 0.4
449 0.37
450 0.33
451 0.27
452 0.23
453 0.2
454 0.17
455 0.15
456 0.12
457 0.08
458 0.05
459 0.05
460 0.05
461 0.05
462 0.05
463 0.05
464 0.05
465 0.05
466 0.05
467 0.05
468 0.05
469 0.05
470 0.05
471 0.05
472 0.07
473 0.07
474 0.07
475 0.07
476 0.09
477 0.09
478 0.08
479 0.08
480 0.07
481 0.11
482 0.13
483 0.16
484 0.17
485 0.2
486 0.24
487 0.28
488 0.34
489 0.38
490 0.45
491 0.5
492 0.57
493 0.63
494 0.66
495 0.71
496 0.67
497 0.68
498 0.68
499 0.66
500 0.65
501 0.61
502 0.61
503 0.57
504 0.55
505 0.54
506 0.56
507 0.6
508 0.62
509 0.67
510 0.68
511 0.71
512 0.76
513 0.77
514 0.78
515 0.78
516 0.78
517 0.79
518 0.81
519 0.8
520 0.78
521 0.77
522 0.74
523 0.71
524 0.69
525 0.67
526 0.68
527 0.71
528 0.77
529 0.8
530 0.82
531 0.8
532 0.75
533 0.7
534 0.66
535 0.61
536 0.55
537 0.46
538 0.39
539 0.34
540 0.31
541 0.27
542 0.22
543 0.15
544 0.1
545 0.09
546 0.06
547 0.06
548 0.06
549 0.06
550 0.06
551 0.07
552 0.07
553 0.08
554 0.08
555 0.1
556 0.16
557 0.17
558 0.19
559 0.22
560 0.22
561 0.23
562 0.28
563 0.29
564 0.32
565 0.4
566 0.49
567 0.56
568 0.59
569 0.6
570 0.62
571 0.67
572 0.64
573 0.64
574 0.61
575 0.58
576 0.61
577 0.59
578 0.57
579 0.5
580 0.44
581 0.36
582 0.32
583 0.27
584 0.23
585 0.24
586 0.22
587 0.21
588 0.21
589 0.19
590 0.16
591 0.14
592 0.12
593 0.1
594 0.07
595 0.08
596 0.08
597 0.11
598 0.13
599 0.14
600 0.16
601 0.22
602 0.26
603 0.29
604 0.31
605 0.33
606 0.39
607 0.48
608 0.54
609 0.55
610 0.56
611 0.56
612 0.59
613 0.58
614 0.54
615 0.52
616 0.49
617 0.5
618 0.5
619 0.54
620 0.5
621 0.48
622 0.44
623 0.36
624 0.33
625 0.25
626 0.2
627 0.18
628 0.23
629 0.3
630 0.36
631 0.44
632 0.52
633 0.58
634 0.69
635 0.74
636 0.78
637 0.78
638 0.79
639 0.82
640 0.83