FuNGI

A0A0A1SYM0

Protein Details

Accession

A0A0A1SYM0

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
252-295	SKIKHQASINKKSKKQKNTYAKALDKVKRQQAKKNKPHPLNFSA	Hydrophilic
685-725	KEASGKSTSNREKARKKNIFMTMGKAKSKHKRSLVETQKVL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
261-288	NKKSKKQKNTYAKALDKVKRQQAKKNKP
664-738	AREGKPNREEHKSTQAIRKAQKEASGKSTSNREKARKKNIFMTMGKAKSKHKRSLVETQKVLRRHVDRASRGGRR

Subcellular Location(s)

nucl 22.5, mito_nucl 13, mito 2.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR016024 ARM-type_fold IPR027312 Sda1 IPR007949 SDA1_C IPR012977 SDA1_N
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0015031 P:protein transport GO:0042273 P:ribosomal large subunit biogenesis GO:0000055 P:ribosomal large subunit export from nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF08158 NUC130_3NT PF05285 SDA1

Amino Acid Sequences

MVKRKVAALEKIDADFASLQYKIRRDPKSYKDEFLKQWEQYEAQREIFLSSPNNANADSIESFHNMVDLIAHIADCYPEETQSFPEDLQNILTQHHTILHPELRDKIVGSLLLLRRKDVIDSTAVLTTLFPILVSSPSKSLRALLFGKILSDLRNSNSKAANHPLNRTVQTVLYNLVTADRASSRAIWAIKITRELWKRQIWTDAKPVDVMKETCLSDNEKVVIGGVRFFLGGDKEREELEDESSDEEVDLSKIKHQASINKKSKKQKNTYAKALDKVKRQQAKKNKPHPLNFSALHLLHDPQGFAEQLYSKHLANTKAKLALESKLLVLQLVTRLIGLHKLTVVQLYSWFIKYLTPRQQSVTSFLASLAQGTHNLVPPDVLEPLIQKIANEFISEASAAEVAAAGLNAIREICARQPLAMTDSLLQDLVQYRKSKDKGVMMAAKGLLSLYREVGAEMLKKRDRGKQATIGLNTGIMKQRKYGEEEVGEIEGLDLLAKWKDEQRRRKRAELGLPEDGSSDEDDENNEADSDEWEVASDDSSDSGGWIDVSEDEGEAPTLKKQKTDDDDEKEVDSEAAAAKKAEAEAELERISKLATTTILTPADLAKLQELRTAAAVDKVMGGNRKKSKHAEEDRHIDDGLTAENIEAPARLRKLTKEERVELAREGKPNREEHKSTQAIRKAQKEASGKSTSNREKARKKNIFMTMGKAKSKHKRSLVETQKVLRRHVDRASRGGRRSNGT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.3
2	0.24
3	0.19
4	0.17
5	0.15
6	0.17
7	0.22
8	0.26
9	0.32
10	0.41
11	0.47
12	0.52
13	0.61
14	0.68
15	0.73
16	0.74
17	0.74
18	0.73
19	0.75
20	0.73
21	0.72
22	0.7
23	0.62
24	0.6
25	0.56
26	0.5
27	0.47
28	0.48
29	0.43
30	0.36
31	0.35
32	0.32
33	0.3
34	0.29
35	0.27
36	0.22
37	0.21
38	0.25
39	0.25
40	0.26
41	0.24
42	0.23
43	0.2
44	0.22
45	0.2
46	0.16
47	0.17
48	0.17
49	0.17
50	0.16
51	0.16
52	0.12
53	0.11
54	0.1
55	0.08
56	0.08
57	0.08
58	0.08
59	0.07
60	0.07
61	0.08
62	0.08
63	0.09
64	0.08
65	0.09
66	0.1
67	0.12
68	0.14
69	0.16
70	0.17
71	0.16
72	0.18
73	0.19
74	0.18
75	0.19
76	0.2
77	0.18
78	0.18
79	0.19
80	0.16
81	0.15
82	0.18
83	0.17
84	0.16
85	0.21
86	0.24
87	0.25
88	0.27
89	0.3
90	0.28
91	0.29
92	0.27
93	0.23
94	0.2
95	0.18
96	0.16
97	0.21
98	0.24
99	0.3
100	0.29
101	0.28
102	0.29
103	0.29
104	0.3
105	0.24
106	0.22
107	0.18
108	0.19
109	0.21
110	0.19
111	0.19
112	0.17
113	0.15
114	0.13
115	0.11
116	0.09
117	0.06
118	0.06
119	0.07
120	0.1
121	0.12
122	0.12
123	0.16
124	0.18
125	0.2
126	0.2
127	0.22
128	0.2
129	0.25
130	0.25
131	0.24
132	0.25
133	0.24
134	0.24
135	0.22
136	0.22
137	0.17
138	0.18
139	0.17
140	0.17
141	0.25
142	0.26
143	0.28
144	0.32
145	0.33
146	0.35
147	0.41
148	0.46
149	0.43
150	0.46
151	0.46
152	0.46
153	0.46
154	0.43
155	0.37
156	0.3
157	0.28
158	0.25
159	0.22
160	0.17
161	0.15
162	0.13
163	0.13
164	0.11
165	0.09
166	0.1
167	0.09
168	0.1
169	0.1
170	0.11
171	0.11
172	0.15
173	0.16
174	0.15
175	0.18
176	0.21
177	0.21
178	0.24
179	0.25
180	0.29
181	0.33
182	0.36
183	0.4
184	0.42
185	0.44
186	0.42
187	0.51
188	0.46
189	0.46
190	0.5
191	0.45
192	0.39
193	0.38
194	0.36
195	0.29
196	0.3
197	0.25
198	0.18
199	0.21
200	0.21
201	0.2
202	0.22
203	0.23
204	0.2
205	0.21
206	0.2
207	0.17
208	0.16
209	0.15
210	0.15
211	0.11
212	0.11
213	0.09
214	0.08
215	0.08
216	0.08
217	0.08
218	0.09
219	0.11
220	0.13
221	0.14
222	0.15
223	0.15
224	0.16
225	0.18
226	0.16
227	0.16
228	0.14
229	0.13
230	0.14
231	0.14
232	0.13
233	0.1
234	0.09
235	0.07
236	0.06
237	0.08
238	0.07
239	0.1
240	0.14
241	0.15
242	0.19
243	0.21
244	0.3
245	0.38
246	0.48
247	0.55
248	0.59
249	0.66
250	0.72
251	0.79
252	0.8
253	0.8
254	0.8
255	0.81
256	0.81
257	0.83
258	0.82
259	0.76
260	0.72
261	0.72
262	0.67
263	0.63
264	0.62
265	0.62
266	0.6
267	0.61
268	0.64
269	0.66
270	0.72
271	0.75
272	0.79
273	0.8
274	0.8
275	0.83
276	0.81
277	0.75
278	0.69
279	0.59
280	0.52
281	0.46
282	0.38
283	0.32
284	0.25
285	0.21
286	0.18
287	0.17
288	0.14
289	0.1
290	0.11
291	0.1
292	0.09
293	0.09
294	0.08
295	0.08
296	0.12
297	0.13
298	0.12
299	0.14
300	0.18
301	0.23
302	0.25
303	0.27
304	0.27
305	0.29
306	0.29
307	0.28
308	0.26
309	0.22
310	0.2
311	0.18
312	0.15
313	0.13
314	0.13
315	0.11
316	0.09
317	0.08
318	0.07
319	0.07
320	0.06
321	0.05
322	0.06
323	0.06
324	0.09
325	0.08
326	0.07
327	0.07
328	0.08
329	0.08
330	0.08
331	0.08
332	0.06
333	0.07
334	0.08
335	0.09
336	0.09
337	0.09
338	0.09
339	0.11
340	0.13
341	0.2
342	0.28
343	0.3
344	0.31
345	0.33
346	0.37
347	0.35
348	0.37
349	0.31
350	0.22
351	0.19
352	0.18
353	0.17
354	0.13
355	0.12
356	0.08
357	0.06
358	0.06
359	0.07
360	0.08
361	0.09
362	0.09
363	0.09
364	0.08
365	0.08
366	0.09
367	0.08
368	0.07
369	0.06
370	0.06
371	0.07
372	0.09
373	0.08
374	0.07
375	0.07
376	0.09
377	0.09
378	0.09
379	0.08
380	0.07
381	0.08
382	0.08
383	0.07
384	0.05
385	0.05
386	0.04
387	0.04
388	0.03
389	0.03
390	0.03
391	0.03
392	0.02
393	0.02
394	0.02
395	0.03
396	0.03
397	0.03
398	0.03
399	0.05
400	0.06
401	0.09
402	0.09
403	0.1
404	0.1
405	0.11
406	0.13
407	0.13
408	0.12
409	0.1
410	0.11
411	0.11
412	0.1
413	0.09
414	0.08
415	0.1
416	0.11
417	0.14
418	0.15
419	0.17
420	0.25
421	0.26
422	0.29
423	0.3
424	0.33
425	0.33
426	0.37
427	0.4
428	0.33
429	0.34
430	0.31
431	0.26
432	0.21
433	0.17
434	0.11
435	0.07
436	0.08
437	0.06
438	0.07
439	0.07
440	0.07
441	0.08
442	0.08
443	0.12
444	0.13
445	0.19
446	0.21
447	0.24
448	0.28
449	0.34
450	0.41
451	0.43
452	0.47
453	0.49
454	0.54
455	0.56
456	0.54
457	0.48
458	0.39
459	0.35
460	0.29
461	0.23
462	0.22
463	0.18
464	0.17
465	0.19
466	0.23
467	0.24
468	0.29
469	0.3
470	0.29
471	0.28
472	0.29
473	0.27
474	0.23
475	0.21
476	0.15
477	0.12
478	0.07
479	0.06
480	0.04
481	0.03
482	0.04
483	0.05
484	0.05
485	0.06
486	0.12
487	0.21
488	0.31
489	0.42
490	0.52
491	0.63
492	0.69
493	0.75
494	0.78
495	0.77
496	0.78
497	0.76
498	0.72
499	0.66
500	0.61
501	0.53
502	0.45
503	0.37
504	0.28
505	0.19
506	0.14
507	0.09
508	0.08
509	0.09
510	0.1
511	0.1
512	0.09
513	0.09
514	0.07
515	0.07
516	0.07
517	0.08
518	0.07
519	0.07
520	0.07
521	0.07
522	0.07
523	0.07
524	0.07
525	0.06
526	0.06
527	0.06
528	0.06
529	0.05
530	0.06
531	0.05
532	0.05
533	0.05
534	0.05
535	0.05
536	0.06
537	0.06
538	0.06
539	0.06
540	0.06
541	0.07
542	0.07
543	0.08
544	0.11
545	0.18
546	0.18
547	0.22
548	0.24
549	0.32
550	0.38
551	0.47
552	0.51
553	0.51
554	0.56
555	0.54
556	0.52
557	0.44
558	0.38
559	0.28
560	0.19
561	0.13
562	0.1
563	0.1
564	0.09
565	0.09
566	0.09
567	0.1
568	0.1
569	0.1
570	0.08
571	0.1
572	0.11
573	0.14
574	0.15
575	0.14
576	0.14
577	0.14
578	0.13
579	0.11
580	0.1
581	0.08
582	0.09
583	0.09
584	0.11
585	0.16
586	0.16
587	0.15
588	0.15
589	0.14
590	0.15
591	0.15
592	0.14
593	0.13
594	0.15
595	0.16
596	0.18
597	0.18
598	0.17
599	0.17
600	0.18
601	0.15
602	0.15
603	0.15
604	0.12
605	0.13
606	0.13
607	0.15
608	0.2
609	0.23
610	0.3
611	0.37
612	0.41
613	0.46
614	0.53
615	0.58
616	0.62
617	0.7
618	0.71
619	0.72
620	0.76
621	0.73
622	0.67
623	0.59
624	0.48
625	0.38
626	0.28
627	0.21
628	0.13
629	0.1
630	0.07
631	0.09
632	0.09
633	0.09
634	0.08
635	0.09
636	0.15
637	0.17
638	0.2
639	0.21
640	0.26
641	0.35
642	0.45
643	0.52
644	0.55
645	0.57
646	0.61
647	0.63
648	0.61
649	0.56
650	0.53
651	0.48
652	0.46
653	0.45
654	0.46
655	0.47
656	0.52
657	0.53
658	0.55
659	0.56
660	0.55
661	0.63
662	0.63
663	0.63
664	0.65
665	0.67
666	0.67
667	0.69
668	0.7
669	0.66
670	0.61
671	0.64
672	0.62
673	0.59
674	0.58
675	0.57
676	0.51
677	0.5
678	0.58
679	0.57
680	0.59
681	0.63
682	0.66
683	0.69
684	0.78
685	0.84
686	0.84
687	0.82
688	0.82
689	0.82
690	0.81
691	0.73
692	0.71
693	0.69
694	0.66
695	0.65
696	0.6
697	0.6
698	0.62
699	0.69
700	0.7
701	0.69
702	0.71
703	0.74
704	0.8
705	0.82
706	0.81
707	0.78
708	0.77
709	0.76
710	0.71
711	0.67
712	0.65
713	0.59
714	0.56
715	0.59
716	0.6
717	0.59
718	0.65
719	0.7
720	0.7
721	0.7
722	0.72

A0A0A1SYM0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer