Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P48567

Protein Details
Accession P48567    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
41-73AERKQQYEKQTGKKASKRKLRKVSKVKMGHGGTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
51-67TGKKASKRKLRKVSKVK
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 14.333, cyto 10.5, mito_nucl 8.999
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR002501  PsdUridine_synth_N  
IPR014780  tRNA_psdUridine_synth_TruB  
Gene Ontology GO:0005739  C:mitochondrion  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0106029  F:tRNA pseudouridine synthase activity  
GO:1990481  P:mRNA pseudouridine synthesis  
GO:0006400  P:tRNA modification  
KEGG sce:YNL292W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01509  TruB_N  
CDD cd02867  PseudoU_synth_TruB_4  
Amino Acid Sequences MNGIFAIEKPSGITSNQFMLKLQHALTKSQVFSKEIQRATAERKQQYEKQTGKKASKRKLRKVSKVKMGHGGTLDPLASGVLVIGIGAGTKKLANYLSGTVKVYESEALFGVSTTSGDVEGEILSQNSVKHLNFDDLKTVEEKFVGQLKQTPPIYAALKMDGKPLHEYAREGKPLPRAIEPRQVTIYDLKVFSDSLKRDHDYPLLRPTTEEAVDTVKNLNANMLNDVLYFSKEYTEKHGLDSEVAKVEEPFPLSEQEEQEIQKEGDSYRAPKLHFKANVSSGTYIRSLVSDIGKSMRSSCYMVKLIRLQQQDWSLEKNNVFQLTDFTERDEKVWSKVLEKVLDEGATVDVIEELKKAEKEIPADVKECIVSSDQPGDEATAETIETANAEEHSNTLKRKIEQV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.24
3 0.27
4 0.26
5 0.25
6 0.27
7 0.29
8 0.3
9 0.28
10 0.28
11 0.26
12 0.28
13 0.33
14 0.35
15 0.34
16 0.35
17 0.38
18 0.35
19 0.38
20 0.45
21 0.47
22 0.43
23 0.44
24 0.41
25 0.42
26 0.48
27 0.5
28 0.5
29 0.47
30 0.53
31 0.57
32 0.61
33 0.64
34 0.67
35 0.68
36 0.68
37 0.73
38 0.75
39 0.78
40 0.79
41 0.81
42 0.81
43 0.83
44 0.84
45 0.85
46 0.88
47 0.88
48 0.91
49 0.92
50 0.92
51 0.92
52 0.89
53 0.83
54 0.81
55 0.72
56 0.64
57 0.54
58 0.45
59 0.36
60 0.29
61 0.24
62 0.14
63 0.12
64 0.09
65 0.07
66 0.06
67 0.04
68 0.03
69 0.03
70 0.03
71 0.02
72 0.02
73 0.03
74 0.03
75 0.03
76 0.04
77 0.04
78 0.05
79 0.07
80 0.08
81 0.09
82 0.12
83 0.16
84 0.19
85 0.21
86 0.22
87 0.21
88 0.2
89 0.19
90 0.18
91 0.15
92 0.12
93 0.11
94 0.1
95 0.1
96 0.09
97 0.09
98 0.08
99 0.06
100 0.06
101 0.05
102 0.05
103 0.05
104 0.05
105 0.05
106 0.05
107 0.05
108 0.05
109 0.05
110 0.05
111 0.05
112 0.06
113 0.06
114 0.08
115 0.11
116 0.11
117 0.13
118 0.14
119 0.19
120 0.2
121 0.21
122 0.24
123 0.21
124 0.22
125 0.21
126 0.2
127 0.15
128 0.13
129 0.13
130 0.11
131 0.16
132 0.15
133 0.15
134 0.2
135 0.21
136 0.29
137 0.29
138 0.27
139 0.22
140 0.26
141 0.26
142 0.22
143 0.21
144 0.17
145 0.19
146 0.19
147 0.22
148 0.19
149 0.2
150 0.2
151 0.21
152 0.21
153 0.19
154 0.2
155 0.21
156 0.26
157 0.27
158 0.26
159 0.28
160 0.3
161 0.33
162 0.33
163 0.33
164 0.33
165 0.34
166 0.42
167 0.4
168 0.37
169 0.35
170 0.33
171 0.29
172 0.26
173 0.25
174 0.17
175 0.16
176 0.14
177 0.13
178 0.13
179 0.13
180 0.16
181 0.15
182 0.16
183 0.2
184 0.2
185 0.21
186 0.23
187 0.27
188 0.24
189 0.26
190 0.29
191 0.27
192 0.26
193 0.25
194 0.25
195 0.22
196 0.2
197 0.17
198 0.11
199 0.12
200 0.13
201 0.13
202 0.12
203 0.1
204 0.1
205 0.1
206 0.1
207 0.09
208 0.1
209 0.1
210 0.1
211 0.09
212 0.09
213 0.1
214 0.08
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.08
219 0.09
220 0.1
221 0.16
222 0.22
223 0.22
224 0.23
225 0.25
226 0.23
227 0.24
228 0.24
229 0.19
230 0.15
231 0.14
232 0.13
233 0.11
234 0.12
235 0.11
236 0.11
237 0.1
238 0.09
239 0.11
240 0.12
241 0.14
242 0.14
243 0.15
244 0.16
245 0.16
246 0.16
247 0.16
248 0.15
249 0.13
250 0.13
251 0.12
252 0.15
253 0.16
254 0.18
255 0.21
256 0.25
257 0.26
258 0.31
259 0.34
260 0.37
261 0.4
262 0.4
263 0.41
264 0.41
265 0.43
266 0.39
267 0.38
268 0.3
269 0.28
270 0.25
271 0.21
272 0.16
273 0.13
274 0.12
275 0.12
276 0.13
277 0.12
278 0.12
279 0.14
280 0.15
281 0.15
282 0.17
283 0.16
284 0.16
285 0.19
286 0.2
287 0.24
288 0.27
289 0.27
290 0.3
291 0.34
292 0.38
293 0.42
294 0.44
295 0.38
296 0.38
297 0.43
298 0.42
299 0.38
300 0.37
301 0.33
302 0.34
303 0.35
304 0.33
305 0.32
306 0.3
307 0.28
308 0.23
309 0.23
310 0.23
311 0.28
312 0.24
313 0.24
314 0.27
315 0.27
316 0.27
317 0.3
318 0.27
319 0.25
320 0.32
321 0.3
322 0.28
323 0.33
324 0.38
325 0.35
326 0.34
327 0.33
328 0.28
329 0.27
330 0.24
331 0.2
332 0.15
333 0.11
334 0.1
335 0.08
336 0.06
337 0.07
338 0.07
339 0.06
340 0.07
341 0.12
342 0.12
343 0.14
344 0.18
345 0.22
346 0.24
347 0.32
348 0.38
349 0.37
350 0.39
351 0.37
352 0.34
353 0.31
354 0.28
355 0.23
356 0.17
357 0.15
358 0.17
359 0.23
360 0.21
361 0.21
362 0.22
363 0.21
364 0.19
365 0.18
366 0.15
367 0.1
368 0.1
369 0.09
370 0.09
371 0.08
372 0.07
373 0.07
374 0.08
375 0.08
376 0.1
377 0.1
378 0.11
379 0.17
380 0.22
381 0.24
382 0.29
383 0.34