Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P40968

Protein Details
Accession P40968    Localization Confidence High Confidence Score 20.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
41-73SNNIHKRKSHFTKSELKRRRKTRKGDGPWGSWSHydrophilic
357-384DNRIYSFSLKPKYKRHPKKIFKGHSSAGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
46-65KRKSHFTKSELKRRRKTRKG
368-375KYKRHPKK
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020472  G-protein_beta_WD-40_rep  
IPR032847  PRPF17  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0071013  C:catalytic step 2 spliceosome  
GO:0034399  C:nuclear periphery  
GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0000350  P:generation of catalytic spliceosome for second transesterification step  
GO:0000389  P:mRNA 3'-splice site recognition  
GO:0000348  P:mRNA branch site recognition  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG sce:YDR364C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences MGLVDGYDTSSDSDLNFDEGKSVHEKKNGNLHEDTSYEPSSNNIHKRKSHFTKSELKRRRKTRKGDGPWGSWSSSDDETSQASETQKEDQDIFVHALAEDNLDSEQIEVEEVSHFYGKSEKDYQGRGYLYPPNDVDVDLREERISFRCYLPKKVIRNYPGHPEGTTALKFLPKTGHLILSGGNDHTIKIWDFYHDYECLRDFQGHNKPIKALRFTEDCQSFLSSSFDRSVKIWDTETGKVKTRLHLNSTPADVESRPTNPHEFIVGLSNSKILHYDDRVSENQGLVQTYDHHLSSILALKYFPDGSKFISSSEDKTVRIWENQINVPIKQISDTAQHSMPFLNVHPSQNYFCAQSMDNRIYSFSLKPKYKRHPKKIFKGHSSAGYGISLAFSGDGRYICSGDSKSRLFTWDWNTSRLLNNIKIPGNKPITQVDWHPQETSKVICSGAAGKIYVCD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.14
3 0.14
4 0.13
5 0.14
6 0.14
7 0.18
8 0.23
9 0.29
10 0.31
11 0.37
12 0.4
13 0.44
14 0.54
15 0.55
16 0.53
17 0.5
18 0.47
19 0.43
20 0.42
21 0.39
22 0.34
23 0.31
24 0.26
25 0.23
26 0.23
27 0.26
28 0.33
29 0.39
30 0.41
31 0.47
32 0.54
33 0.61
34 0.7
35 0.73
36 0.76
37 0.73
38 0.72
39 0.76
40 0.79
41 0.83
42 0.83
43 0.84
44 0.83
45 0.87
46 0.91
47 0.9
48 0.91
49 0.91
50 0.92
51 0.91
52 0.92
53 0.88
54 0.82
55 0.78
56 0.71
57 0.6
58 0.49
59 0.41
60 0.34
61 0.28
62 0.24
63 0.18
64 0.17
65 0.17
66 0.18
67 0.17
68 0.16
69 0.15
70 0.17
71 0.18
72 0.21
73 0.23
74 0.23
75 0.23
76 0.21
77 0.21
78 0.21
79 0.21
80 0.16
81 0.14
82 0.12
83 0.12
84 0.11
85 0.11
86 0.08
87 0.07
88 0.07
89 0.06
90 0.07
91 0.06
92 0.06
93 0.05
94 0.05
95 0.05
96 0.05
97 0.06
98 0.06
99 0.08
100 0.08
101 0.08
102 0.08
103 0.13
104 0.13
105 0.18
106 0.23
107 0.27
108 0.29
109 0.33
110 0.35
111 0.36
112 0.37
113 0.32
114 0.3
115 0.32
116 0.29
117 0.3
118 0.28
119 0.23
120 0.22
121 0.22
122 0.19
123 0.15
124 0.19
125 0.16
126 0.17
127 0.15
128 0.15
129 0.17
130 0.19
131 0.2
132 0.16
133 0.18
134 0.26
135 0.29
136 0.34
137 0.42
138 0.46
139 0.51
140 0.56
141 0.62
142 0.6
143 0.63
144 0.6
145 0.6
146 0.56
147 0.5
148 0.42
149 0.36
150 0.31
151 0.29
152 0.26
153 0.18
154 0.15
155 0.16
156 0.16
157 0.15
158 0.17
159 0.13
160 0.17
161 0.18
162 0.19
163 0.17
164 0.17
165 0.17
166 0.16
167 0.16
168 0.12
169 0.11
170 0.1
171 0.09
172 0.1
173 0.1
174 0.08
175 0.09
176 0.09
177 0.1
178 0.11
179 0.13
180 0.15
181 0.15
182 0.15
183 0.15
184 0.15
185 0.15
186 0.14
187 0.15
188 0.14
189 0.2
190 0.29
191 0.33
192 0.34
193 0.34
194 0.35
195 0.37
196 0.4
197 0.35
198 0.28
199 0.26
200 0.28
201 0.28
202 0.33
203 0.3
204 0.27
205 0.25
206 0.24
207 0.21
208 0.17
209 0.19
210 0.12
211 0.12
212 0.14
213 0.13
214 0.13
215 0.13
216 0.16
217 0.15
218 0.16
219 0.15
220 0.15
221 0.19
222 0.22
223 0.27
224 0.26
225 0.28
226 0.32
227 0.32
228 0.33
229 0.37
230 0.36
231 0.36
232 0.39
233 0.38
234 0.35
235 0.35
236 0.32
237 0.25
238 0.23
239 0.17
240 0.14
241 0.13
242 0.13
243 0.13
244 0.15
245 0.17
246 0.17
247 0.17
248 0.16
249 0.15
250 0.13
251 0.16
252 0.14
253 0.12
254 0.11
255 0.12
256 0.11
257 0.11
258 0.11
259 0.09
260 0.11
261 0.12
262 0.15
263 0.16
264 0.21
265 0.21
266 0.23
267 0.23
268 0.2
269 0.19
270 0.18
271 0.16
272 0.12
273 0.12
274 0.1
275 0.12
276 0.13
277 0.11
278 0.1
279 0.1
280 0.1
281 0.11
282 0.16
283 0.14
284 0.13
285 0.13
286 0.13
287 0.14
288 0.15
289 0.14
290 0.11
291 0.11
292 0.14
293 0.18
294 0.18
295 0.17
296 0.21
297 0.22
298 0.23
299 0.29
300 0.28
301 0.25
302 0.26
303 0.3
304 0.28
305 0.29
306 0.3
307 0.26
308 0.28
309 0.3
310 0.35
311 0.32
312 0.3
313 0.3
314 0.27
315 0.23
316 0.2
317 0.18
318 0.14
319 0.17
320 0.19
321 0.2
322 0.21
323 0.21
324 0.21
325 0.21
326 0.19
327 0.15
328 0.14
329 0.17
330 0.18
331 0.2
332 0.21
333 0.24
334 0.25
335 0.26
336 0.27
337 0.22
338 0.2
339 0.21
340 0.2
341 0.23
342 0.28
343 0.29
344 0.28
345 0.27
346 0.27
347 0.26
348 0.28
349 0.26
350 0.27
351 0.32
352 0.38
353 0.45
354 0.54
355 0.64
356 0.73
357 0.8
358 0.84
359 0.86
360 0.89
361 0.93
362 0.95
363 0.94
364 0.91
365 0.87
366 0.8
367 0.74
368 0.67
369 0.57
370 0.48
371 0.37
372 0.29
373 0.22
374 0.18
375 0.11
376 0.07
377 0.07
378 0.05
379 0.06
380 0.08
381 0.08
382 0.1
383 0.11
384 0.12
385 0.12
386 0.16
387 0.17
388 0.21
389 0.27
390 0.27
391 0.28
392 0.3
393 0.32
394 0.3
395 0.35
396 0.38
397 0.42
398 0.42
399 0.42
400 0.43
401 0.43
402 0.45
403 0.44
404 0.42
405 0.37
406 0.4
407 0.44
408 0.47
409 0.5
410 0.48
411 0.52
412 0.52
413 0.51
414 0.49
415 0.47
416 0.45
417 0.43
418 0.46
419 0.45
420 0.46
421 0.45
422 0.43
423 0.4
424 0.4
425 0.39
426 0.37
427 0.31
428 0.26
429 0.24
430 0.22
431 0.22
432 0.23
433 0.23
434 0.22
435 0.19