Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P34078

Protein Details
Accession P34078    Localization Confidence High Confidence Score 17.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
312-339LPSIQDKSKTGKKKRKSRQKKGAMSDVSHydrophilic
429-460ADEVSKGKLSQRRNRERQEKKKLEKVTNTLSSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
319-333SKTGKKKRKSRQKKG
413-451RKLAKKDKEIERLKEAADEVSKGKLSQRRNRERQEKKKL
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005829  C:cytosol  
GO:0005770  C:late endosome  
GO:0031902  C:late endosome membrane  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0030688  C:preribosome, small subunit precursor  
GO:0071986  C:Ragulator complex  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:1904669  P:ATP export  
GO:0034599  P:cellular response to oxidative stress  
GO:0032456  P:endocytic recycling  
GO:0030490  P:maturation of SSU-rRNA  
GO:0015031  P:protein transport  
GO:0006970  P:response to osmotic stress  
GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
GO:0000056  P:ribosomal small subunit export from nucleus  
KEGG sce:YKL143W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MSKKFSSKNSQRYVVVHRPHDDPSFYDTDASAHVLVPVSNPNKTSPEADLRKKDVSSTKPKGRRAHVGEAALYGINFDDSEYDYTQHLKPIGLDPENSIFIASKGNEQKVEKKNIEDLFIEPKYRRDEIEKDDALPVFQRGMAKPEYLLHQQDTTDEIRGFKPDMNPALREVLEALEDEAYVVNDDVVVEDISKKTQLQGDNYGEEEKEDDIFAQLLGSGEAKDEDEFEDEFDEWDIDNVENFEDENYVKEMAQFDNIENLEDLENIDYQADVRRFQKDNSILEKHNSDDEFSNAGLDSVNPSEEEDVLGELPSIQDKSKTGKKKRKSRQKKGAMSDVSGFSMSSSAIARTETMTVLDDQYDQIINGYENYEEELEEDEEQNYQPFDMSAERSDFESMLDDFLDNYELESGGRKLAKKDKEIERLKEAADEVSKGKLSQRRNRERQEKKKLEKVTNTLSSLKF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.68
3 0.64
4 0.6
5 0.56
6 0.57
7 0.56
8 0.48
9 0.41
10 0.4
11 0.37
12 0.34
13 0.31
14 0.27
15 0.24
16 0.23
17 0.23
18 0.16
19 0.12
20 0.13
21 0.12
22 0.12
23 0.13
24 0.2
25 0.21
26 0.22
27 0.23
28 0.25
29 0.28
30 0.3
31 0.32
32 0.29
33 0.37
34 0.44
35 0.51
36 0.56
37 0.57
38 0.6
39 0.57
40 0.57
41 0.55
42 0.55
43 0.57
44 0.6
45 0.65
46 0.69
47 0.77
48 0.79
49 0.78
50 0.79
51 0.76
52 0.76
53 0.72
54 0.66
55 0.58
56 0.5
57 0.45
58 0.34
59 0.26
60 0.16
61 0.1
62 0.07
63 0.06
64 0.06
65 0.06
66 0.08
67 0.11
68 0.12
69 0.13
70 0.14
71 0.18
72 0.18
73 0.2
74 0.2
75 0.17
76 0.18
77 0.22
78 0.28
79 0.26
80 0.26
81 0.26
82 0.28
83 0.28
84 0.26
85 0.21
86 0.15
87 0.13
88 0.17
89 0.14
90 0.19
91 0.23
92 0.26
93 0.3
94 0.32
95 0.41
96 0.45
97 0.54
98 0.49
99 0.46
100 0.51
101 0.48
102 0.49
103 0.4
104 0.34
105 0.33
106 0.32
107 0.32
108 0.25
109 0.29
110 0.31
111 0.31
112 0.3
113 0.29
114 0.34
115 0.37
116 0.46
117 0.42
118 0.38
119 0.4
120 0.38
121 0.32
122 0.27
123 0.21
124 0.12
125 0.13
126 0.14
127 0.12
128 0.16
129 0.17
130 0.16
131 0.16
132 0.17
133 0.2
134 0.21
135 0.23
136 0.21
137 0.2
138 0.2
139 0.2
140 0.21
141 0.18
142 0.17
143 0.16
144 0.16
145 0.15
146 0.17
147 0.17
148 0.17
149 0.18
150 0.2
151 0.25
152 0.26
153 0.26
154 0.26
155 0.28
156 0.25
157 0.22
158 0.18
159 0.13
160 0.11
161 0.1
162 0.09
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.04
170 0.04
171 0.03
172 0.03
173 0.03
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.05
178 0.06
179 0.06
180 0.07
181 0.07
182 0.08
183 0.13
184 0.15
185 0.18
186 0.25
187 0.27
188 0.27
189 0.28
190 0.27
191 0.22
192 0.19
193 0.17
194 0.1
195 0.08
196 0.07
197 0.06
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.07
214 0.07
215 0.07
216 0.08
217 0.07
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.05
222 0.05
223 0.06
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.04
229 0.04
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.06
234 0.07
235 0.07
236 0.07
237 0.08
238 0.1
239 0.09
240 0.11
241 0.11
242 0.1
243 0.14
244 0.14
245 0.13
246 0.12
247 0.12
248 0.1
249 0.09
250 0.09
251 0.06
252 0.06
253 0.06
254 0.06
255 0.05
256 0.05
257 0.1
258 0.1
259 0.12
260 0.13
261 0.19
262 0.21
263 0.21
264 0.29
265 0.3
266 0.35
267 0.4
268 0.42
269 0.38
270 0.39
271 0.4
272 0.33
273 0.31
274 0.26
275 0.21
276 0.17
277 0.18
278 0.17
279 0.15
280 0.14
281 0.1
282 0.1
283 0.08
284 0.07
285 0.07
286 0.06
287 0.07
288 0.06
289 0.07
290 0.08
291 0.08
292 0.08
293 0.06
294 0.06
295 0.06
296 0.06
297 0.06
298 0.05
299 0.05
300 0.06
301 0.07
302 0.06
303 0.08
304 0.1
305 0.16
306 0.25
307 0.35
308 0.45
309 0.54
310 0.64
311 0.73
312 0.83
313 0.88
314 0.91
315 0.92
316 0.93
317 0.94
318 0.93
319 0.9
320 0.89
321 0.8
322 0.71
323 0.63
324 0.53
325 0.42
326 0.33
327 0.25
328 0.15
329 0.13
330 0.1
331 0.08
332 0.07
333 0.07
334 0.07
335 0.08
336 0.08
337 0.09
338 0.1
339 0.09
340 0.09
341 0.1
342 0.11
343 0.11
344 0.11
345 0.11
346 0.1
347 0.11
348 0.1
349 0.09
350 0.08
351 0.08
352 0.08
353 0.08
354 0.09
355 0.08
356 0.08
357 0.1
358 0.09
359 0.08
360 0.09
361 0.11
362 0.11
363 0.12
364 0.13
365 0.12
366 0.12
367 0.13
368 0.13
369 0.11
370 0.09
371 0.08
372 0.08
373 0.09
374 0.11
375 0.13
376 0.15
377 0.17
378 0.18
379 0.19
380 0.2
381 0.18
382 0.16
383 0.16
384 0.13
385 0.12
386 0.12
387 0.11
388 0.1
389 0.1
390 0.11
391 0.08
392 0.08
393 0.08
394 0.08
395 0.08
396 0.11
397 0.11
398 0.14
399 0.18
400 0.2
401 0.26
402 0.35
403 0.43
404 0.47
405 0.56
406 0.61
407 0.68
408 0.74
409 0.74
410 0.72
411 0.67
412 0.61
413 0.55
414 0.46
415 0.4
416 0.33
417 0.29
418 0.24
419 0.25
420 0.25
421 0.22
422 0.28
423 0.3
424 0.38
425 0.45
426 0.55
427 0.63
428 0.72
429 0.83
430 0.87
431 0.91
432 0.92
433 0.94
434 0.94
435 0.92
436 0.91
437 0.9
438 0.89
439 0.87
440 0.84
441 0.82
442 0.79
443 0.73