Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0A1TCP0

Protein Details
Accession A0A0A1TCP0    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
262-286NSLAKVKQAKSRKARQGNKGDKSEAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
269-276QAKSRKAR
Subcellular Location(s) plas 22, E.R. 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007568  RTA1  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF04479  RTA1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51257  PROKAR_LIPOPROTEIN  
Amino Acid Sequences MADKDTSVWMYSPSFALAVIGCIVYCLLFLAITYLTLIKYRAWYFIVVVIGAAVEVAGYVCRVYSVKHQTDLPPFVMTLTFTVLAPIFVAAGNYLLISRLIPLVLPSTHHAIFGIPGRLLTPIFVTTDVLAFLIQGSGSGIASSNNWVGPNEEIGRWVLVGGLAFQFVCFGIFLCIFVRFHHLAKLYTLHDAPVGWHKVVLAVYVSSIAIMIRCVYRVCEFAEGMNGYAFRTEWLFWVWETIPMLIAIGIFCWHHPSRHLGNSLAKVKQAKSRKARQGNKGDKSEAISTPEEQV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.12
3 0.12
4 0.1
5 0.09
6 0.09
7 0.08
8 0.07
9 0.07
10 0.07
11 0.06
12 0.06
13 0.05
14 0.04
15 0.04
16 0.04
17 0.06
18 0.06
19 0.06
20 0.07
21 0.07
22 0.08
23 0.09
24 0.1
25 0.1
26 0.16
27 0.17
28 0.19
29 0.2
30 0.2
31 0.2
32 0.22
33 0.22
34 0.16
35 0.14
36 0.11
37 0.1
38 0.08
39 0.07
40 0.03
41 0.02
42 0.02
43 0.02
44 0.02
45 0.03
46 0.03
47 0.03
48 0.04
49 0.05
50 0.07
51 0.16
52 0.26
53 0.28
54 0.31
55 0.34
56 0.38
57 0.45
58 0.46
59 0.39
60 0.3
61 0.27
62 0.25
63 0.23
64 0.18
65 0.12
66 0.11
67 0.09
68 0.08
69 0.09
70 0.09
71 0.08
72 0.08
73 0.07
74 0.05
75 0.05
76 0.05
77 0.04
78 0.04
79 0.04
80 0.04
81 0.04
82 0.04
83 0.04
84 0.04
85 0.05
86 0.05
87 0.05
88 0.05
89 0.05
90 0.07
91 0.07
92 0.09
93 0.1
94 0.14
95 0.14
96 0.14
97 0.14
98 0.12
99 0.13
100 0.15
101 0.14
102 0.1
103 0.1
104 0.1
105 0.11
106 0.11
107 0.09
108 0.07
109 0.06
110 0.07
111 0.07
112 0.07
113 0.07
114 0.07
115 0.07
116 0.06
117 0.05
118 0.04
119 0.04
120 0.04
121 0.03
122 0.03
123 0.03
124 0.03
125 0.03
126 0.03
127 0.03
128 0.04
129 0.04
130 0.05
131 0.06
132 0.06
133 0.06
134 0.06
135 0.07
136 0.07
137 0.09
138 0.09
139 0.09
140 0.09
141 0.09
142 0.09
143 0.08
144 0.08
145 0.05
146 0.04
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.04
156 0.03
157 0.04
158 0.05
159 0.05
160 0.06
161 0.06
162 0.08
163 0.08
164 0.08
165 0.14
166 0.14
167 0.15
168 0.18
169 0.19
170 0.19
171 0.2
172 0.23
173 0.18
174 0.19
175 0.19
176 0.15
177 0.14
178 0.13
179 0.13
180 0.17
181 0.18
182 0.15
183 0.15
184 0.15
185 0.16
186 0.16
187 0.16
188 0.09
189 0.07
190 0.07
191 0.08
192 0.07
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.04
197 0.04
198 0.05
199 0.05
200 0.06
201 0.07
202 0.09
203 0.11
204 0.12
205 0.14
206 0.16
207 0.16
208 0.15
209 0.19
210 0.18
211 0.17
212 0.16
213 0.14
214 0.12
215 0.12
216 0.11
217 0.07
218 0.09
219 0.08
220 0.09
221 0.1
222 0.12
223 0.11
224 0.15
225 0.15
226 0.16
227 0.16
228 0.15
229 0.14
230 0.13
231 0.13
232 0.09
233 0.09
234 0.06
235 0.05
236 0.06
237 0.05
238 0.06
239 0.13
240 0.14
241 0.15
242 0.18
243 0.25
244 0.31
245 0.38
246 0.41
247 0.39
248 0.45
249 0.52
250 0.56
251 0.5
252 0.47
253 0.44
254 0.44
255 0.49
256 0.51
257 0.53
258 0.57
259 0.66
260 0.73
261 0.8
262 0.86
263 0.87
264 0.89
265 0.9
266 0.89
267 0.85
268 0.77
269 0.68
270 0.64
271 0.59
272 0.5
273 0.44
274 0.38