Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0A1T5V8

Protein Details
Accession A0A0A1T5V8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
102-123PKPFHRWIRSLRRRAAHKRATGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
110-120RSLRRRAAHKR
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 14, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035899  DBL_dom_sf  
IPR000219  DH-domain  
Gene Ontology GO:0005085  F:guanyl-nucleotide exchange factor activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF00621  RhoGEF  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50010  DH_2  
Amino Acid Sequences MEDSLITSEIHPTSGHILNTGFMPFGTSSDHQPNEASETQPDITETLSDQLQNLHLQISLPDSRPSSTECSPNIIPATLADSRRNSDDTPDVMELDEDTTVPKPFHRWIRSLRRRAAHKRATGDHRRDESLFSSPNQSRQQSPSGRCKAQSSSGSSFNLLTTVRSAAVSTLSIGAAINPNTGVKPSRDASLSDENITMGHPERSASKESLSQRPQHTASRERSFQRRRILEELINTEEGYLGDLRFLMNVYITLFSSVPALSDSFRAAISHNLSQMIELHDEILGELHRAVPNSQYSATETHPPKPSPIHSQSHPHSLVTHRRCVSLDAVVDNVQIDRSDQNHQGMAVEPQVVGEVARIFGRKIKRFFVYTEYSARYEAIIQDLLTRHADLTTWSVYQRGLENLAAILDSCKNSDEASRRAMTVRDLLIKPIQRVCRYPLLFSELLKHTPEVDCPNSRMEIENSLFRLREATTEINRAADDLDMKNILQRT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.22
3 0.2
4 0.2
5 0.19
6 0.21
7 0.2
8 0.14
9 0.1
10 0.12
11 0.11
12 0.11
13 0.16
14 0.16
15 0.22
16 0.3
17 0.31
18 0.29
19 0.3
20 0.31
21 0.32
22 0.33
23 0.29
24 0.22
25 0.25
26 0.25
27 0.24
28 0.24
29 0.17
30 0.15
31 0.14
32 0.14
33 0.12
34 0.12
35 0.12
36 0.12
37 0.13
38 0.15
39 0.15
40 0.15
41 0.13
42 0.12
43 0.12
44 0.13
45 0.16
46 0.18
47 0.19
48 0.22
49 0.22
50 0.23
51 0.24
52 0.27
53 0.28
54 0.27
55 0.32
56 0.3
57 0.35
58 0.35
59 0.37
60 0.35
61 0.29
62 0.25
63 0.19
64 0.23
65 0.22
66 0.24
67 0.25
68 0.26
69 0.28
70 0.31
71 0.34
72 0.29
73 0.28
74 0.3
75 0.27
76 0.29
77 0.28
78 0.25
79 0.22
80 0.22
81 0.18
82 0.14
83 0.12
84 0.07
85 0.08
86 0.09
87 0.1
88 0.11
89 0.11
90 0.14
91 0.21
92 0.31
93 0.35
94 0.4
95 0.49
96 0.6
97 0.69
98 0.75
99 0.76
100 0.74
101 0.79
102 0.83
103 0.83
104 0.81
105 0.76
106 0.74
107 0.74
108 0.76
109 0.76
110 0.74
111 0.71
112 0.66
113 0.63
114 0.57
115 0.51
116 0.44
117 0.39
118 0.34
119 0.26
120 0.3
121 0.29
122 0.35
123 0.39
124 0.38
125 0.36
126 0.39
127 0.46
128 0.47
129 0.52
130 0.55
131 0.57
132 0.57
133 0.55
134 0.54
135 0.49
136 0.48
137 0.47
138 0.43
139 0.4
140 0.41
141 0.4
142 0.37
143 0.34
144 0.27
145 0.24
146 0.16
147 0.13
148 0.1
149 0.1
150 0.1
151 0.09
152 0.09
153 0.08
154 0.08
155 0.08
156 0.07
157 0.07
158 0.06
159 0.06
160 0.06
161 0.06
162 0.08
163 0.08
164 0.08
165 0.07
166 0.08
167 0.08
168 0.09
169 0.1
170 0.09
171 0.13
172 0.14
173 0.16
174 0.16
175 0.17
176 0.22
177 0.28
178 0.28
179 0.25
180 0.24
181 0.22
182 0.21
183 0.2
184 0.15
185 0.09
186 0.08
187 0.07
188 0.08
189 0.1
190 0.13
191 0.16
192 0.15
193 0.15
194 0.21
195 0.25
196 0.33
197 0.35
198 0.38
199 0.37
200 0.42
201 0.43
202 0.41
203 0.42
204 0.42
205 0.45
206 0.44
207 0.47
208 0.46
209 0.53
210 0.56
211 0.57
212 0.58
213 0.54
214 0.54
215 0.53
216 0.53
217 0.45
218 0.42
219 0.38
220 0.31
221 0.28
222 0.23
223 0.19
224 0.15
225 0.13
226 0.1
227 0.07
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.04
233 0.05
234 0.04
235 0.03
236 0.04
237 0.04
238 0.05
239 0.05
240 0.06
241 0.06
242 0.06
243 0.07
244 0.06
245 0.06
246 0.06
247 0.06
248 0.06
249 0.07
250 0.07
251 0.07
252 0.07
253 0.07
254 0.07
255 0.1
256 0.13
257 0.13
258 0.14
259 0.14
260 0.14
261 0.14
262 0.14
263 0.12
264 0.1
265 0.09
266 0.08
267 0.08
268 0.08
269 0.07
270 0.07
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.06
275 0.07
276 0.08
277 0.08
278 0.1
279 0.12
280 0.13
281 0.14
282 0.13
283 0.14
284 0.16
285 0.17
286 0.22
287 0.23
288 0.27
289 0.32
290 0.32
291 0.33
292 0.34
293 0.37
294 0.38
295 0.43
296 0.42
297 0.39
298 0.47
299 0.47
300 0.52
301 0.49
302 0.4
303 0.35
304 0.36
305 0.43
306 0.39
307 0.44
308 0.37
309 0.38
310 0.38
311 0.38
312 0.34
313 0.28
314 0.25
315 0.17
316 0.18
317 0.16
318 0.16
319 0.14
320 0.12
321 0.08
322 0.07
323 0.07
324 0.08
325 0.1
326 0.14
327 0.17
328 0.19
329 0.19
330 0.19
331 0.19
332 0.18
333 0.17
334 0.14
335 0.11
336 0.09
337 0.09
338 0.09
339 0.08
340 0.07
341 0.07
342 0.06
343 0.06
344 0.07
345 0.08
346 0.08
347 0.13
348 0.22
349 0.28
350 0.32
351 0.36
352 0.39
353 0.41
354 0.43
355 0.45
356 0.42
357 0.39
358 0.41
359 0.39
360 0.36
361 0.34
362 0.32
363 0.26
364 0.21
365 0.18
366 0.15
367 0.12
368 0.11
369 0.14
370 0.15
371 0.16
372 0.16
373 0.16
374 0.13
375 0.12
376 0.13
377 0.11
378 0.14
379 0.14
380 0.14
381 0.14
382 0.15
383 0.15
384 0.16
385 0.17
386 0.15
387 0.15
388 0.15
389 0.15
390 0.14
391 0.14
392 0.12
393 0.1
394 0.09
395 0.1
396 0.1
397 0.1
398 0.11
399 0.11
400 0.12
401 0.19
402 0.23
403 0.24
404 0.3
405 0.31
406 0.31
407 0.32
408 0.33
409 0.3
410 0.29
411 0.29
412 0.3
413 0.29
414 0.32
415 0.36
416 0.39
417 0.4
418 0.42
419 0.46
420 0.43
421 0.46
422 0.48
423 0.52
424 0.5
425 0.48
426 0.44
427 0.44
428 0.41
429 0.38
430 0.4
431 0.33
432 0.34
433 0.34
434 0.31
435 0.26
436 0.26
437 0.3
438 0.3
439 0.33
440 0.34
441 0.35
442 0.37
443 0.37
444 0.36
445 0.35
446 0.3
447 0.32
448 0.3
449 0.34
450 0.34
451 0.35
452 0.34
453 0.3
454 0.3
455 0.23
456 0.23
457 0.23
458 0.27
459 0.29
460 0.35
461 0.35
462 0.34
463 0.34
464 0.31
465 0.26
466 0.21
467 0.2
468 0.16
469 0.18
470 0.18
471 0.18