Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0A1TRW6

Protein Details
Accession A0A0A1TRW6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
82-104LIEKKKMEYERIREQRRRFELEMHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR033133  PUM-HD  
IPR033712  Pumilio_RNA-bd  
IPR001313  Pumilio_RNA-bd_rpt  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00806  PUF  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50302  PUM  
PS50303  PUM_HD  
CDD cd07920  Pumilio  
Amino Acid Sequences MDFRSQQPPRTEAPMSSLVSPPRNGGTRMGQQQPMHDIRSNLPRRFTTDSGRVPTLSSLTSPTRGPDSITDFGNNAMHKVQLIEKKKMEYERIREQRRRFELEMQKLDQQQRREAQELAQMEEEIVRLNGHQSEPTTPPEYRDTSSGFPSMFSRPNRYSTSSLTSPPGLFNRPQRSGSQITSPPSGLMQQRYGYDEPLPSRSMPGTRRNSDDEKEDAARKDSTSQRSVNAMHRYSMPATKTRVGPYESNLDQTNTARFLFGEDEPNAMPHRHTPDHTFPTLVRRDDQILSASSAALDLALSPSPKPELQTRSWASVNRHRPQQSLSSLNGSSSTQFGDLNTIGSRPASLRHSLDLKYMSDTANDSGLVSPKGSHVMTTPPKLQSSFSANDVSTTKAGNGASMMNANNHAQQHFHNHNASMGRIPASAFPPRHSRELSADTSREQNGAFPSFQSALQGNAAPFGPPMTTAPFTSSIGAPQIPNNGMNAFQNFYPGANYQVIGPNVAAPVNPAMLQSSMQQLNLNGLGSSNQFSNQNFNNFGAMPFNQGNQQRDSQARVIQNRRQVDNDAMSRYQNTTLESVRTQIYQLCKDQHGCRFLQKKLEEGKPDQVHMIWQETNPHVVELMTDPFGNYLCQKLLEYCNDDERTVLIQNASQDMVRIALNQHGTRALQKMIEYVSTPQQVSLIMEALRYRVVELIQDLNGNHVIQKCLNKLSSVDAQFIFDAVGNHSVEVGTHKHGCCVLQRCIDHASGDQKRWLVQKITQEARRLVQDPFGNYVIQYIIDLNEPTFTEPLVSMFQGCIGHLSRQKFSSNVIEKCLRCAQAPSKDLIVEEMLSPTEIENLLRDNYANYVIQTALEFATPHQKYRLVEAIRPILPQIRTTPYGRRIQAKVSAYDNRGSASSSGQVTPADNTQGQIPLRPGHARGVSSTSSIAPIAAPSVAPAGLNNQVNPSAVGGFQVGPGLPAAPGAPGAPGAIQQPPFGQRVGPNTGNGVESEEARWL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.4
3 0.38
4 0.38
5 0.37
6 0.39
7 0.39
8 0.35
9 0.34
10 0.35
11 0.35
12 0.35
13 0.37
14 0.42
15 0.48
16 0.52
17 0.53
18 0.51
19 0.53
20 0.56
21 0.53
22 0.49
23 0.44
24 0.41
25 0.4
26 0.5
27 0.55
28 0.5
29 0.52
30 0.5
31 0.53
32 0.58
33 0.56
34 0.54
35 0.54
36 0.58
37 0.58
38 0.58
39 0.52
40 0.46
41 0.43
42 0.37
43 0.29
44 0.22
45 0.21
46 0.22
47 0.24
48 0.23
49 0.24
50 0.26
51 0.25
52 0.27
53 0.27
54 0.31
55 0.31
56 0.32
57 0.31
58 0.27
59 0.29
60 0.3
61 0.25
62 0.2
63 0.18
64 0.16
65 0.15
66 0.17
67 0.22
68 0.27
69 0.33
70 0.4
71 0.43
72 0.47
73 0.52
74 0.56
75 0.59
76 0.59
77 0.61
78 0.64
79 0.7
80 0.76
81 0.79
82 0.81
83 0.82
84 0.8
85 0.8
86 0.73
87 0.73
88 0.73
89 0.75
90 0.74
91 0.67
92 0.65
93 0.64
94 0.69
95 0.64
96 0.58
97 0.56
98 0.55
99 0.57
100 0.54
101 0.49
102 0.43
103 0.44
104 0.42
105 0.36
106 0.3
107 0.25
108 0.22
109 0.21
110 0.18
111 0.12
112 0.11
113 0.08
114 0.07
115 0.1
116 0.12
117 0.12
118 0.15
119 0.16
120 0.2
121 0.23
122 0.27
123 0.3
124 0.27
125 0.3
126 0.33
127 0.35
128 0.33
129 0.33
130 0.32
131 0.31
132 0.33
133 0.32
134 0.26
135 0.24
136 0.25
137 0.26
138 0.29
139 0.3
140 0.35
141 0.36
142 0.42
143 0.45
144 0.48
145 0.47
146 0.45
147 0.48
148 0.43
149 0.43
150 0.4
151 0.38
152 0.34
153 0.34
154 0.32
155 0.29
156 0.3
157 0.37
158 0.43
159 0.44
160 0.46
161 0.44
162 0.47
163 0.48
164 0.46
165 0.45
166 0.41
167 0.4
168 0.4
169 0.39
170 0.32
171 0.28
172 0.3
173 0.26
174 0.25
175 0.25
176 0.24
177 0.25
178 0.3
179 0.3
180 0.28
181 0.26
182 0.26
183 0.25
184 0.27
185 0.27
186 0.22
187 0.24
188 0.24
189 0.28
190 0.3
191 0.37
192 0.43
193 0.45
194 0.49
195 0.53
196 0.56
197 0.53
198 0.51
199 0.45
200 0.4
201 0.41
202 0.4
203 0.36
204 0.34
205 0.32
206 0.29
207 0.32
208 0.35
209 0.38
210 0.39
211 0.39
212 0.38
213 0.41
214 0.44
215 0.45
216 0.45
217 0.4
218 0.36
219 0.36
220 0.37
221 0.34
222 0.36
223 0.3
224 0.27
225 0.31
226 0.34
227 0.35
228 0.35
229 0.37
230 0.36
231 0.36
232 0.34
233 0.37
234 0.33
235 0.32
236 0.3
237 0.27
238 0.25
239 0.24
240 0.24
241 0.18
242 0.17
243 0.15
244 0.14
245 0.14
246 0.15
247 0.15
248 0.18
249 0.17
250 0.18
251 0.18
252 0.2
253 0.19
254 0.17
255 0.16
256 0.16
257 0.23
258 0.24
259 0.26
260 0.32
261 0.39
262 0.45
263 0.45
264 0.41
265 0.35
266 0.4
267 0.44
268 0.38
269 0.31
270 0.27
271 0.3
272 0.3
273 0.3
274 0.24
275 0.19
276 0.19
277 0.18
278 0.15
279 0.11
280 0.1
281 0.08
282 0.06
283 0.04
284 0.03
285 0.04
286 0.05
287 0.06
288 0.06
289 0.07
290 0.1
291 0.11
292 0.13
293 0.18
294 0.23
295 0.26
296 0.35
297 0.37
298 0.39
299 0.41
300 0.44
301 0.43
302 0.46
303 0.53
304 0.49
305 0.55
306 0.53
307 0.52
308 0.5
309 0.52
310 0.48
311 0.42
312 0.39
313 0.35
314 0.33
315 0.31
316 0.29
317 0.22
318 0.17
319 0.13
320 0.12
321 0.08
322 0.09
323 0.08
324 0.1
325 0.1
326 0.11
327 0.11
328 0.1
329 0.09
330 0.09
331 0.1
332 0.07
333 0.1
334 0.12
335 0.15
336 0.16
337 0.19
338 0.22
339 0.22
340 0.25
341 0.24
342 0.22
343 0.21
344 0.21
345 0.18
346 0.16
347 0.16
348 0.14
349 0.12
350 0.11
351 0.09
352 0.09
353 0.11
354 0.1
355 0.09
356 0.09
357 0.08
358 0.11
359 0.11
360 0.1
361 0.1
362 0.17
363 0.22
364 0.25
365 0.28
366 0.27
367 0.29
368 0.29
369 0.29
370 0.24
371 0.26
372 0.24
373 0.23
374 0.23
375 0.22
376 0.23
377 0.23
378 0.21
379 0.15
380 0.14
381 0.12
382 0.12
383 0.12
384 0.1
385 0.1
386 0.08
387 0.08
388 0.1
389 0.1
390 0.08
391 0.1
392 0.1
393 0.12
394 0.13
395 0.12
396 0.12
397 0.13
398 0.2
399 0.21
400 0.24
401 0.23
402 0.22
403 0.25
404 0.24
405 0.24
406 0.17
407 0.15
408 0.12
409 0.11
410 0.11
411 0.1
412 0.12
413 0.17
414 0.17
415 0.19
416 0.26
417 0.28
418 0.31
419 0.3
420 0.3
421 0.29
422 0.34
423 0.36
424 0.31
425 0.3
426 0.27
427 0.29
428 0.27
429 0.22
430 0.17
431 0.15
432 0.14
433 0.15
434 0.14
435 0.11
436 0.13
437 0.13
438 0.13
439 0.13
440 0.11
441 0.09
442 0.1
443 0.11
444 0.09
445 0.09
446 0.09
447 0.07
448 0.07
449 0.06
450 0.06
451 0.05
452 0.06
453 0.08
454 0.09
455 0.09
456 0.12
457 0.13
458 0.14
459 0.14
460 0.13
461 0.11
462 0.11
463 0.11
464 0.1
465 0.09
466 0.11
467 0.1
468 0.1
469 0.11
470 0.1
471 0.1
472 0.1
473 0.1
474 0.09
475 0.08
476 0.09
477 0.08
478 0.08
479 0.09
480 0.08
481 0.1
482 0.09
483 0.1
484 0.09
485 0.13
486 0.12
487 0.11
488 0.11
489 0.09
490 0.09
491 0.09
492 0.08
493 0.05
494 0.05
495 0.05
496 0.05
497 0.05
498 0.05
499 0.06
500 0.06
501 0.07
502 0.1
503 0.1
504 0.1
505 0.11
506 0.1
507 0.11
508 0.11
509 0.1
510 0.06
511 0.06
512 0.06
513 0.07
514 0.07
515 0.06
516 0.07
517 0.09
518 0.09
519 0.13
520 0.15
521 0.17
522 0.17
523 0.17
524 0.18
525 0.16
526 0.16
527 0.14
528 0.12
529 0.13
530 0.12
531 0.12
532 0.16
533 0.19
534 0.21
535 0.21
536 0.22
537 0.22
538 0.23
539 0.26
540 0.23
541 0.25
542 0.28
543 0.32
544 0.38
545 0.39
546 0.44
547 0.45
548 0.44
549 0.4
550 0.38
551 0.34
552 0.32
553 0.31
554 0.27
555 0.24
556 0.23
557 0.22
558 0.21
559 0.19
560 0.15
561 0.14
562 0.14
563 0.14
564 0.16
565 0.15
566 0.15
567 0.14
568 0.14
569 0.13
570 0.14
571 0.17
572 0.18
573 0.21
574 0.22
575 0.23
576 0.27
577 0.31
578 0.34
579 0.33
580 0.31
581 0.37
582 0.4
583 0.4
584 0.44
585 0.4
586 0.41
587 0.44
588 0.49
589 0.45
590 0.42
591 0.49
592 0.42
593 0.42
594 0.36
595 0.29
596 0.26
597 0.22
598 0.22
599 0.14
600 0.13
601 0.16
602 0.16
603 0.18
604 0.17
605 0.15
606 0.12
607 0.11
608 0.11
609 0.09
610 0.1
611 0.08
612 0.08
613 0.08
614 0.08
615 0.09
616 0.09
617 0.07
618 0.07
619 0.07
620 0.08
621 0.09
622 0.11
623 0.14
624 0.17
625 0.21
626 0.21
627 0.27
628 0.27
629 0.27
630 0.24
631 0.22
632 0.2
633 0.17
634 0.16
635 0.1
636 0.1
637 0.11
638 0.12
639 0.11
640 0.09
641 0.09
642 0.08
643 0.09
644 0.08
645 0.08
646 0.07
647 0.1
648 0.14
649 0.14
650 0.14
651 0.15
652 0.15
653 0.17
654 0.19
655 0.16
656 0.14
657 0.14
658 0.15
659 0.14
660 0.15
661 0.13
662 0.13
663 0.17
664 0.18
665 0.18
666 0.16
667 0.16
668 0.16
669 0.15
670 0.14
671 0.1
672 0.08
673 0.09
674 0.09
675 0.09
676 0.09
677 0.09
678 0.08
679 0.08
680 0.08
681 0.08
682 0.1
683 0.11
684 0.11
685 0.13
686 0.12
687 0.13
688 0.14
689 0.13
690 0.14
691 0.13
692 0.14
693 0.15
694 0.2
695 0.21
696 0.24
697 0.24
698 0.23
699 0.22
700 0.25
701 0.29
702 0.27
703 0.27
704 0.23
705 0.24
706 0.23
707 0.22
708 0.17
709 0.11
710 0.1
711 0.09
712 0.12
713 0.11
714 0.11
715 0.11
716 0.1
717 0.09
718 0.11
719 0.12
720 0.12
721 0.18
722 0.18
723 0.19
724 0.2
725 0.22
726 0.26
727 0.3
728 0.33
729 0.35
730 0.35
731 0.36
732 0.38
733 0.38
734 0.32
735 0.28
736 0.32
737 0.3
738 0.31
739 0.31
740 0.29
741 0.32
742 0.34
743 0.36
744 0.3
745 0.3
746 0.37
747 0.43
748 0.5
749 0.51
750 0.52
751 0.5
752 0.49
753 0.49
754 0.42
755 0.34
756 0.32
757 0.31
758 0.28
759 0.3
760 0.29
761 0.24
762 0.22
763 0.22
764 0.16
765 0.13
766 0.11
767 0.08
768 0.07
769 0.08
770 0.09
771 0.08
772 0.09
773 0.1
774 0.11
775 0.1
776 0.09
777 0.09
778 0.09
779 0.11
780 0.11
781 0.11
782 0.1
783 0.09
784 0.12
785 0.11
786 0.11
787 0.12
788 0.12
789 0.18
790 0.23
791 0.26
792 0.27
793 0.29
794 0.31
795 0.29
796 0.31
797 0.36
798 0.39
799 0.38
800 0.41
801 0.45
802 0.44
803 0.49
804 0.51
805 0.42
806 0.34
807 0.39
808 0.42
809 0.44
810 0.46
811 0.42
812 0.38
813 0.38
814 0.36
815 0.31
816 0.24
817 0.16
818 0.14
819 0.13
820 0.11
821 0.1
822 0.1
823 0.08
824 0.09
825 0.09
826 0.08
827 0.09
828 0.11
829 0.12
830 0.12
831 0.12
832 0.11
833 0.13
834 0.15
835 0.15
836 0.12
837 0.13
838 0.12
839 0.13
840 0.12
841 0.11
842 0.09
843 0.09
844 0.09
845 0.09
846 0.19
847 0.19
848 0.21
849 0.23
850 0.27
851 0.27
852 0.33
853 0.41
854 0.35
855 0.37
856 0.42
857 0.46
858 0.43
859 0.42
860 0.38
861 0.35
862 0.32
863 0.31
864 0.3
865 0.29
866 0.31
867 0.34
868 0.41
869 0.43
870 0.51
871 0.53
872 0.55
873 0.52
874 0.54
875 0.59
876 0.54
877 0.5
878 0.48
879 0.51
880 0.46
881 0.46
882 0.41
883 0.34
884 0.3
885 0.28
886 0.23
887 0.18
888 0.19
889 0.18
890 0.18
891 0.18
892 0.19
893 0.18
894 0.19
895 0.19
896 0.2
897 0.18
898 0.18
899 0.19
900 0.23
901 0.23
902 0.24
903 0.25
904 0.23
905 0.27
906 0.3
907 0.29
908 0.31
909 0.35
910 0.32
911 0.32
912 0.34
913 0.31
914 0.3
915 0.29
916 0.23
917 0.2
918 0.19
919 0.17
920 0.12
921 0.11
922 0.1
923 0.09
924 0.08
925 0.07
926 0.09
927 0.09
928 0.08
929 0.08
930 0.11
931 0.17
932 0.19
933 0.19
934 0.2
935 0.21
936 0.22
937 0.22
938 0.2
939 0.14
940 0.13
941 0.13
942 0.12
943 0.11
944 0.11
945 0.11
946 0.1
947 0.09
948 0.1
949 0.09
950 0.07
951 0.07
952 0.07
953 0.06
954 0.07
955 0.07
956 0.07
957 0.07
958 0.07
959 0.07
960 0.08
961 0.1
962 0.15
963 0.16
964 0.16
965 0.2
966 0.23
967 0.25
968 0.24
969 0.25
970 0.24
971 0.3
972 0.37
973 0.36
974 0.33
975 0.34
976 0.35
977 0.33
978 0.29
979 0.26
980 0.19
981 0.18