FuNGI

Q12460

Protein Details

Accession

Q12460

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
459-504	EDDDEEKKEKKEKKSKKEKKEKKEKKDKKEKKDKKEKKDKKKKSKD	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
452-504	SSKKRKLEDDDEEKKEKKEKKSKKEKKEKKEKKDKKEKKDKKEKKDKKKKSKD

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 12.833, cyto 12.5, nucl 12, mito_nucl 7.333

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045056 Nop56/Nop58 IPR012974 NOP58/56_N IPR042239 Nop_C IPR002687 Nop_dom IPR036070 Nop_dom_sf IPR012976 NOSIC
Gene Ontology	GO:0030686 C:90S preribosome GO:0031428 C:box C/D RNP complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0005654 C:nucleoplasm GO:0005634 C:nucleus GO:0032040 C:small-subunit processome GO:0003729 F:mRNA binding GO:0030515 F:snoRNA binding GO:0000494 P:box C/D RNA 3'-end processing GO:0030490 P:maturation of SSU-rRNA GO:0000154 P:rRNA modification GO:0006364 P:rRNA processing GO:0000452 P:snoRNA guided rRNA 2'-O-methylation
KEGG	sce:YLR197W -
Pfam	View protein in Pfam PF01798 Nop PF08156 NOP5NT
PROSITE	View protein in PROSITE PS51358 NOP

Amino Acid Sequences

MAPIEYLLFEEPTGYAVFKVKLQQDDIGSRLKEVQEQINDFGAFTKLIELVSFAPFKGAAEALENANDISEGLVSESLKAILDLNLPKASSKKKNITLAISDKNLGPSIKEEFPYVDCISNELAQDLIRGVRLHGEKLFKGLQSGDLERAQLGLGHAYSRAKVKFSVQKNDNHIIQAIALLDQLDKDINTFAMRVKEWYGWHFPELAKLVPDNYTFAKLVLFIKDKASLNDDSLHDLAALLNEDSGIAQRVIDNARISMGQDISETDMENVCVFAQRVASLADYRRQLYDYLCEKMHTVAPNLSELIGEVIGARLISHAGSLTNLSKQAASTVQILGAEKALFRALKTKGNTPKYGLIYHSGFISKASAKNKGRISRYLANKCSMASRIDNYSEEPSNVFGSVLKKQVEQRLEFYNTGKPTLKNELAIQEAMELYNKDKPAAEVEETKEKESSKKRKLEDDDEEKKEKKEKKSKKEKKEKKEKKDKKEKKDKKEKKDKKKKSKD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.1
2	0.1
3	0.13
4	0.15
5	0.17
6	0.23
7	0.27
8	0.31
9	0.33
10	0.36
11	0.38
12	0.41
13	0.4
14	0.41
15	0.36
16	0.33
17	0.34
18	0.31
19	0.31
20	0.3
21	0.35
22	0.35
23	0.38
24	0.39
25	0.4
26	0.38
27	0.33
28	0.31
29	0.24
30	0.17
31	0.14
32	0.14
33	0.1
34	0.1
35	0.1
36	0.1
37	0.11
38	0.15
39	0.15
40	0.13
41	0.14
42	0.14
43	0.14
44	0.14
45	0.13
46	0.09
47	0.12
48	0.13
49	0.13
50	0.14
51	0.14
52	0.12
53	0.11
54	0.11
55	0.08
56	0.06
57	0.05
58	0.05
59	0.05
60	0.07
61	0.07
62	0.08
63	0.08
64	0.09
65	0.08
66	0.09
67	0.09
68	0.08
69	0.13
70	0.15
71	0.18
72	0.19
73	0.19
74	0.2
75	0.25
76	0.32
77	0.37
78	0.44
79	0.5
80	0.56
81	0.64
82	0.68
83	0.67
84	0.66
85	0.65
86	0.61
87	0.54
88	0.47
89	0.4
90	0.37
91	0.34
92	0.26
93	0.19
94	0.17
95	0.2
96	0.22
97	0.22
98	0.21
99	0.2
100	0.22
101	0.26
102	0.25
103	0.22
104	0.19
105	0.2
106	0.21
107	0.21
108	0.2
109	0.14
110	0.13
111	0.1
112	0.11
113	0.1
114	0.08
115	0.08
116	0.08
117	0.08
118	0.14
119	0.16
120	0.18
121	0.21
122	0.24
123	0.23
124	0.27
125	0.29
126	0.23
127	0.23
128	0.21
129	0.22
130	0.21
131	0.23
132	0.22
133	0.2
134	0.2
135	0.19
136	0.18
137	0.14
138	0.11
139	0.1
140	0.08
141	0.07
142	0.07
143	0.09
144	0.09
145	0.1
146	0.14
147	0.15
148	0.15
149	0.16
150	0.23
151	0.3
152	0.36
153	0.45
154	0.44
155	0.5
156	0.56
157	0.6
158	0.54
159	0.46
160	0.4
161	0.3
162	0.25
163	0.19
164	0.13
165	0.08
166	0.07
167	0.06
168	0.05
169	0.05
170	0.05
171	0.05
172	0.04
173	0.05
174	0.05
175	0.05
176	0.06
177	0.07
178	0.08
179	0.11
180	0.11
181	0.12
182	0.14
183	0.17
184	0.17
185	0.21
186	0.24
187	0.22
188	0.23
189	0.24
190	0.22
191	0.23
192	0.23
193	0.19
194	0.15
195	0.14
196	0.14
197	0.13
198	0.14
199	0.12
200	0.11
201	0.13
202	0.13
203	0.12
204	0.12
205	0.11
206	0.12
207	0.14
208	0.15
209	0.13
210	0.15
211	0.19
212	0.2
213	0.19
214	0.22
215	0.18
216	0.18
217	0.2
218	0.19
219	0.18
220	0.17
221	0.16
222	0.12
223	0.11
224	0.1
225	0.07
226	0.07
227	0.04
228	0.04
229	0.04
230	0.04
231	0.03
232	0.04
233	0.04
234	0.04
235	0.04
236	0.04
237	0.06
238	0.07
239	0.09
240	0.09
241	0.08
242	0.09
243	0.09
244	0.09
245	0.09
246	0.08
247	0.06
248	0.06
249	0.07
250	0.08
251	0.08
252	0.08
253	0.07
254	0.07
255	0.07
256	0.07
257	0.06
258	0.05
259	0.05
260	0.05
261	0.05
262	0.06
263	0.05
264	0.06
265	0.07
266	0.07
267	0.08
268	0.1
269	0.13
270	0.15
271	0.16
272	0.16
273	0.16
274	0.16
275	0.15
276	0.21
277	0.21
278	0.22
279	0.21
280	0.21
281	0.21
282	0.21
283	0.24
284	0.17
285	0.16
286	0.15
287	0.16
288	0.16
289	0.16
290	0.14
291	0.11
292	0.09
293	0.08
294	0.06
295	0.05
296	0.04
297	0.04
298	0.04
299	0.04
300	0.04
301	0.03
302	0.03
303	0.03
304	0.04
305	0.04
306	0.04
307	0.05
308	0.06
309	0.07
310	0.08
311	0.09
312	0.1
313	0.1
314	0.1
315	0.11
316	0.1
317	0.11
318	0.11
319	0.11
320	0.11
321	0.12
322	0.12
323	0.11
324	0.11
325	0.09
326	0.07
327	0.08
328	0.09
329	0.08
330	0.08
331	0.14
332	0.16
333	0.23
334	0.25
335	0.33
336	0.41
337	0.47
338	0.49
339	0.46
340	0.51
341	0.47
342	0.47
343	0.4
344	0.35
345	0.31
346	0.29
347	0.26
348	0.2
349	0.17
350	0.15
351	0.16
352	0.14
353	0.18
354	0.21
355	0.3
356	0.32
357	0.39
358	0.46
359	0.51
360	0.53
361	0.53
362	0.58
363	0.56
364	0.64
365	0.66
366	0.62
367	0.57
368	0.54
369	0.49
370	0.44
371	0.37
372	0.31
373	0.25
374	0.24
375	0.25
376	0.27
377	0.27
378	0.27
379	0.29
380	0.27
381	0.24
382	0.22
383	0.2
384	0.18
385	0.17
386	0.14
387	0.12
388	0.15
389	0.18
390	0.22
391	0.22
392	0.24
393	0.29
394	0.36
395	0.4
396	0.4
397	0.39
398	0.41
399	0.45
400	0.43
401	0.4
402	0.4
403	0.35
404	0.36
405	0.37
406	0.31
407	0.32
408	0.39
409	0.39
410	0.35
411	0.36
412	0.35
413	0.34
414	0.33
415	0.28
416	0.2
417	0.18
418	0.16
419	0.15
420	0.12
421	0.11
422	0.17
423	0.17
424	0.17
425	0.17
426	0.18
427	0.22
428	0.26
429	0.27
430	0.28
431	0.32
432	0.41
433	0.42
434	0.42
435	0.39
436	0.36
437	0.41
438	0.46
439	0.53
440	0.53
441	0.6
442	0.63
443	0.71
444	0.78
445	0.79
446	0.78
447	0.78
448	0.78
449	0.76
450	0.78
451	0.7
452	0.66
453	0.65
454	0.63
455	0.64
456	0.65
457	0.69
458	0.74
459	0.83
460	0.89
461	0.92
462	0.95
463	0.95
464	0.95
465	0.96
466	0.96
467	0.96
468	0.97
469	0.96
470	0.96
471	0.97
472	0.96
473	0.96
474	0.96
475	0.95
476	0.95
477	0.96
478	0.95
479	0.95
480	0.96
481	0.96
482	0.96
483	0.97
484	0.97

Q12460

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer