Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P25586

Protein Details
Accession P25586    Localization Confidence High Confidence Score 18.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
222-251RFLPMFKKRNVARKKPKKIRNVEKKVYTPFHydrophilic
267-291GEYFLSKREKQMKKLNEQKEKQMERHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
228-245KKRNVARKKPKKIRNVEK
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR041174  KH_8  
IPR004087  KH_dom  
IPR036612  KH_dom_type_1_sf  
IPR024166  rRNA_assembly_KRR1  
Gene Ontology GO:0030686  C:90S preribosome  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005654  C:nucleoplasm  
GO:0030688  C:preribosome, small subunit precursor  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000447  P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0030490  P:maturation of SSU-rRNA  
GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG sce:YCL059C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF17903  KH_8  
CDD cd22393  KH-I_KRR1_rpt1  
cd22394  KH-I_KRR1_rpt2  
Amino Acid Sequences MVSTHNRDKPWDTDDIDKWKIEEFKEEDNASGQPFAEESSFMTLFPKYRESYLKTIWNDVTRALDKHNIACVLDLVEGSMTVKTTRKTYDPAIILKARDLIKLLARSVPFPQAVKILQDDMACDVIKIGNFVTNKERFVKRRQRLVGPNGNTLKALELLTKCYILVQGNTVSAMGPFKGLKEVRRVVEDCMKNIHPIYHIKELMIKRELAKRPELANEDWSRFLPMFKKRNVARKKPKKIRNVEKKVYTPFPPAQLPRKVDLEIESGEYFLSKREKQMKKLNEQKEKQMEREIERQEERAKDFIAPEEEAYKPNQN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.53
3 0.51
4 0.46
5 0.43
6 0.41
7 0.42
8 0.36
9 0.37
10 0.33
11 0.37
12 0.43
13 0.42
14 0.38
15 0.35
16 0.36
17 0.28
18 0.25
19 0.18
20 0.12
21 0.12
22 0.12
23 0.11
24 0.1
25 0.09
26 0.14
27 0.14
28 0.14
29 0.15
30 0.16
31 0.17
32 0.2
33 0.23
34 0.19
35 0.24
36 0.3
37 0.35
38 0.4
39 0.43
40 0.49
41 0.46
42 0.5
43 0.49
44 0.46
45 0.41
46 0.36
47 0.36
48 0.3
49 0.3
50 0.27
51 0.29
52 0.28
53 0.29
54 0.31
55 0.26
56 0.24
57 0.23
58 0.2
59 0.16
60 0.14
61 0.12
62 0.08
63 0.07
64 0.06
65 0.07
66 0.06
67 0.05
68 0.07
69 0.1
70 0.11
71 0.14
72 0.17
73 0.19
74 0.23
75 0.26
76 0.32
77 0.33
78 0.34
79 0.37
80 0.36
81 0.34
82 0.31
83 0.32
84 0.26
85 0.23
86 0.21
87 0.18
88 0.2
89 0.21
90 0.22
91 0.2
92 0.2
93 0.21
94 0.21
95 0.23
96 0.2
97 0.19
98 0.19
99 0.18
100 0.18
101 0.18
102 0.17
103 0.14
104 0.15
105 0.14
106 0.14
107 0.12
108 0.13
109 0.11
110 0.1
111 0.09
112 0.08
113 0.08
114 0.08
115 0.07
116 0.09
117 0.1
118 0.12
119 0.18
120 0.19
121 0.21
122 0.26
123 0.31
124 0.3
125 0.41
126 0.5
127 0.5
128 0.58
129 0.6
130 0.63
131 0.65
132 0.7
133 0.68
134 0.61
135 0.61
136 0.53
137 0.49
138 0.41
139 0.33
140 0.25
141 0.18
142 0.15
143 0.11
144 0.1
145 0.12
146 0.12
147 0.12
148 0.12
149 0.11
150 0.12
151 0.09
152 0.1
153 0.09
154 0.09
155 0.09
156 0.09
157 0.09
158 0.07
159 0.07
160 0.07
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.11
166 0.13
167 0.15
168 0.22
169 0.26
170 0.26
171 0.31
172 0.32
173 0.29
174 0.37
175 0.36
176 0.29
177 0.3
178 0.29
179 0.26
180 0.25
181 0.23
182 0.17
183 0.21
184 0.25
185 0.27
186 0.27
187 0.25
188 0.32
189 0.32
190 0.34
191 0.31
192 0.27
193 0.24
194 0.33
195 0.38
196 0.34
197 0.37
198 0.35
199 0.35
200 0.39
201 0.4
202 0.33
203 0.36
204 0.36
205 0.34
206 0.32
207 0.3
208 0.27
209 0.23
210 0.24
211 0.23
212 0.28
213 0.34
214 0.36
215 0.44
216 0.47
217 0.58
218 0.66
219 0.7
220 0.72
221 0.76
222 0.85
223 0.86
224 0.9
225 0.91
226 0.91
227 0.92
228 0.92
229 0.91
230 0.88
231 0.86
232 0.83
233 0.79
234 0.73
235 0.65
236 0.61
237 0.53
238 0.49
239 0.48
240 0.47
241 0.49
242 0.52
243 0.52
244 0.49
245 0.49
246 0.45
247 0.4
248 0.37
249 0.32
250 0.25
251 0.25
252 0.21
253 0.18
254 0.17
255 0.16
256 0.13
257 0.14
258 0.19
259 0.17
260 0.25
261 0.36
262 0.43
263 0.52
264 0.62
265 0.68
266 0.72
267 0.81
268 0.83
269 0.84
270 0.81
271 0.82
272 0.83
273 0.79
274 0.72
275 0.71
276 0.67
277 0.62
278 0.67
279 0.62
280 0.59
281 0.56
282 0.56
283 0.54
284 0.53
285 0.51
286 0.45
287 0.41
288 0.36
289 0.35
290 0.36
291 0.34
292 0.29
293 0.27
294 0.27
295 0.27
296 0.26