Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P25454

Protein Details
Accession P25454    Localization Confidence Low Confidence Score 7.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
355-374TTRLGFKKGKGCQRLCKVVDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 10, cyto_nucl 9.5, nucl 7, cysk 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003593  AAA+_ATPase  
IPR011941  DNA_recomb/repair_Rad51  
IPR013632  DNA_recomb/repair_Rad51_C  
IPR016467  DNA_recomb/repair_RecA-like  
IPR010995  DNA_repair_Rad51/TF_NusA_a-hlx  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR020588  RecA_ATP-bd  
IPR020587  RecA_monomer-monomer_interface  
Gene Ontology GO:0000794  C:condensed nuclear chromosome  
GO:0005759  C:mitochondrial matrix  
GO:0000228  C:nuclear chromosome  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0008094  F:ATP-dependent activity, acting on DNA  
GO:0140664  F:ATP-dependent DNA damage sensor activity  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0000150  F:DNA strand exchange activity  
GO:0003690  F:double-stranded DNA binding  
GO:0042802  F:identical protein binding  
GO:0003697  F:single-stranded DNA binding  
GO:0070192  P:chromosome organization involved in meiotic cell cycle  
GO:0000730  P:DNA recombinase assembly  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
GO:0000724  P:double-strand break repair via homologous recombination  
GO:0030491  P:heteroduplex formation  
GO:0000709  P:meiotic joint molecule formation  
GO:0043504  P:mitochondrial DNA repair  
GO:0006312  P:mitotic recombination  
GO:1990426  P:mitotic recombination-dependent replication fork processing  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
GO:0007131  P:reciprocal meiotic recombination  
GO:0042148  P:strand invasion  
GO:0000722  P:telomere maintenance via recombination  
KEGG sce:YER095W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF14520  HHH_5  
PF08423  Rad51  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50162  RECA_2  
PS50163  RECA_3  
CDD cd19513  Rad51  
Amino Acid Sequences MSQVQEQHISESQLQYGNGSLMSTVPADLSQSVVDGNGNGSSEDIEATNGSGDGGGLQEQAEAQGEMEDEAYDEAALGSFVPIEKLQVNGITMADVKKLRESGLHTAEAVAYAPRKDLLEIKGISEAKADKLLNEAARLVPMGFVTAADFHMRRSELICLTTGSKNLDTLLGGGVETGSITELFGEFRTGKSQLCHTLAVTCQIPLDIGGGEGKCLYIDTEGTFRPVRLVSIAQRFGLDPDDALNNVAYARAYNADHQLRLLDAAAQMMSESRFSLIVVDSVMALYRTDFSGRGELSARQMHLAKFMRALQRLADQFGVAVVVTNQVVAQVDGGMAFNPDPKKPIGGNIMAHSSTTRLGFKKGKGCQRLCKVVDSPCLPEAECVFAIYEDGVGDPREEDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.23
3 0.22
4 0.19
5 0.15
6 0.14
7 0.11
8 0.08
9 0.09
10 0.09
11 0.08
12 0.08
13 0.08
14 0.09
15 0.09
16 0.1
17 0.09
18 0.08
19 0.08
20 0.08
21 0.08
22 0.07
23 0.08
24 0.08
25 0.09
26 0.08
27 0.08
28 0.09
29 0.09
30 0.09
31 0.08
32 0.08
33 0.08
34 0.08
35 0.08
36 0.07
37 0.07
38 0.06
39 0.05
40 0.05
41 0.05
42 0.06
43 0.05
44 0.05
45 0.06
46 0.06
47 0.06
48 0.07
49 0.07
50 0.06
51 0.07
52 0.07
53 0.07
54 0.07
55 0.07
56 0.06
57 0.06
58 0.06
59 0.05
60 0.05
61 0.04
62 0.04
63 0.04
64 0.04
65 0.04
66 0.04
67 0.04
68 0.06
69 0.06
70 0.08
71 0.08
72 0.09
73 0.1
74 0.11
75 0.12
76 0.11
77 0.11
78 0.1
79 0.11
80 0.11
81 0.14
82 0.14
83 0.14
84 0.16
85 0.17
86 0.17
87 0.19
88 0.23
89 0.28
90 0.3
91 0.3
92 0.28
93 0.27
94 0.27
95 0.23
96 0.18
97 0.12
98 0.09
99 0.09
100 0.09
101 0.1
102 0.1
103 0.11
104 0.15
105 0.16
106 0.22
107 0.22
108 0.22
109 0.27
110 0.27
111 0.26
112 0.24
113 0.22
114 0.16
115 0.21
116 0.2
117 0.14
118 0.16
119 0.19
120 0.18
121 0.18
122 0.17
123 0.13
124 0.13
125 0.13
126 0.1
127 0.07
128 0.07
129 0.06
130 0.05
131 0.05
132 0.05
133 0.06
134 0.06
135 0.08
136 0.08
137 0.08
138 0.11
139 0.11
140 0.11
141 0.12
142 0.15
143 0.14
144 0.15
145 0.15
146 0.13
147 0.16
148 0.17
149 0.17
150 0.16
151 0.15
152 0.14
153 0.14
154 0.13
155 0.1
156 0.09
157 0.08
158 0.06
159 0.05
160 0.05
161 0.04
162 0.04
163 0.03
164 0.03
165 0.03
166 0.03
167 0.03
168 0.03
169 0.03
170 0.04
171 0.04
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.09
176 0.1
177 0.11
178 0.11
179 0.14
180 0.17
181 0.19
182 0.19
183 0.17
184 0.17
185 0.17
186 0.18
187 0.16
188 0.11
189 0.09
190 0.08
191 0.08
192 0.06
193 0.07
194 0.04
195 0.04
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.06
200 0.05
201 0.04
202 0.05
203 0.05
204 0.04
205 0.04
206 0.05
207 0.08
208 0.08
209 0.11
210 0.11
211 0.11
212 0.12
213 0.12
214 0.11
215 0.1
216 0.13
217 0.15
218 0.22
219 0.23
220 0.21
221 0.22
222 0.21
223 0.21
224 0.2
225 0.15
226 0.08
227 0.08
228 0.09
229 0.09
230 0.09
231 0.08
232 0.06
233 0.06
234 0.06
235 0.05
236 0.04
237 0.05
238 0.07
239 0.08
240 0.1
241 0.17
242 0.18
243 0.18
244 0.18
245 0.18
246 0.16
247 0.15
248 0.14
249 0.08
250 0.07
251 0.07
252 0.07
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.05
258 0.05
259 0.06
260 0.06
261 0.06
262 0.07
263 0.07
264 0.07
265 0.07
266 0.07
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.06
275 0.07
276 0.08
277 0.09
278 0.14
279 0.14
280 0.15
281 0.16
282 0.17
283 0.21
284 0.24
285 0.22
286 0.2
287 0.23
288 0.22
289 0.28
290 0.3
291 0.26
292 0.26
293 0.31
294 0.35
295 0.35
296 0.35
297 0.29
298 0.33
299 0.33
300 0.32
301 0.27
302 0.2
303 0.18
304 0.17
305 0.15
306 0.08
307 0.07
308 0.05
309 0.06
310 0.06
311 0.06
312 0.05
313 0.06
314 0.07
315 0.06
316 0.06
317 0.05
318 0.05
319 0.05
320 0.06
321 0.05
322 0.06
323 0.06
324 0.11
325 0.13
326 0.14
327 0.16
328 0.17
329 0.22
330 0.22
331 0.28
332 0.3
333 0.33
334 0.35
335 0.35
336 0.39
337 0.34
338 0.34
339 0.28
340 0.22
341 0.19
342 0.19
343 0.21
344 0.19
345 0.26
346 0.32
347 0.39
348 0.47
349 0.53
350 0.61
351 0.66
352 0.72
353 0.75
354 0.77
355 0.81
356 0.74
357 0.72
358 0.67
359 0.64
360 0.65
361 0.58
362 0.54
363 0.46
364 0.46
365 0.39
366 0.36
367 0.31
368 0.27
369 0.24
370 0.2
371 0.18
372 0.16
373 0.16
374 0.14
375 0.13
376 0.07
377 0.08
378 0.09
379 0.08
380 0.09