Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0A1TM42

Protein Details
Accession A0A0A1TM42    Localization Confidence High Confidence Score 16
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
168-189FPSTTESKPKPKPKSRNDEEEDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
142-161RPKADKPKAAVVNKPVKKAK
175-181KPKPKPK
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019194  Tscrpt_elong_fac_Eaf_N  
Pfam View protein in Pfam  
PF09816  EAF  
Amino Acid Sequences MADLIDPTVAGKYPVILGDGLLGKDANEVFTRIRYNHQPTLSSEDAPEQAKLKPSIAGKTSSYDLSYTDRGNNYAFQGARKSDDDQYVLYFDPVRKAFILDKVDSTFDMNVTRLPDNSNAEDLSHQFPHLDISSNTKSNASRPKADKPKAAVVNKPVKKAKEVAAMAFPSTTESKPKPKPKSRNDEEEDEDDDDGGLLVEYPGADNSKKTDFSPAFPTQLRFDDYMDRRESEADDADGESDDEIDMEFKLPSPVNRQEIPVAQAAEAQEEEDNDDADLEADLENELENAFEDLANSQEDTHAGGGDESEISEED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.12
3 0.1
4 0.1
5 0.13
6 0.15
7 0.14
8 0.13
9 0.12
10 0.11
11 0.14
12 0.14
13 0.12
14 0.11
15 0.13
16 0.14
17 0.18
18 0.22
19 0.21
20 0.27
21 0.35
22 0.42
23 0.47
24 0.48
25 0.48
26 0.47
27 0.54
28 0.5
29 0.41
30 0.34
31 0.3
32 0.3
33 0.28
34 0.26
35 0.19
36 0.19
37 0.24
38 0.25
39 0.23
40 0.25
41 0.26
42 0.3
43 0.31
44 0.32
45 0.28
46 0.3
47 0.31
48 0.27
49 0.25
50 0.2
51 0.19
52 0.2
53 0.21
54 0.2
55 0.22
56 0.22
57 0.23
58 0.24
59 0.24
60 0.21
61 0.23
62 0.22
63 0.19
64 0.22
65 0.22
66 0.25
67 0.25
68 0.27
69 0.26
70 0.28
71 0.28
72 0.24
73 0.24
74 0.22
75 0.2
76 0.17
77 0.16
78 0.13
79 0.18
80 0.17
81 0.18
82 0.16
83 0.18
84 0.2
85 0.24
86 0.28
87 0.23
88 0.25
89 0.24
90 0.25
91 0.23
92 0.22
93 0.16
94 0.12
95 0.12
96 0.1
97 0.11
98 0.13
99 0.13
100 0.12
101 0.14
102 0.17
103 0.19
104 0.2
105 0.2
106 0.17
107 0.17
108 0.17
109 0.17
110 0.17
111 0.14
112 0.13
113 0.11
114 0.11
115 0.13
116 0.12
117 0.12
118 0.1
119 0.16
120 0.2
121 0.21
122 0.21
123 0.21
124 0.21
125 0.24
126 0.34
127 0.3
128 0.34
129 0.37
130 0.46
131 0.54
132 0.58
133 0.57
134 0.52
135 0.57
136 0.57
137 0.56
138 0.49
139 0.47
140 0.53
141 0.51
142 0.53
143 0.48
144 0.41
145 0.4
146 0.4
147 0.36
148 0.34
149 0.32
150 0.27
151 0.27
152 0.26
153 0.24
154 0.21
155 0.17
156 0.11
157 0.12
158 0.11
159 0.13
160 0.15
161 0.24
162 0.33
163 0.42
164 0.51
165 0.59
166 0.69
167 0.75
168 0.83
169 0.81
170 0.82
171 0.77
172 0.73
173 0.66
174 0.58
175 0.51
176 0.41
177 0.35
178 0.24
179 0.19
180 0.14
181 0.1
182 0.07
183 0.04
184 0.03
185 0.03
186 0.03
187 0.03
188 0.03
189 0.04
190 0.05
191 0.06
192 0.06
193 0.1
194 0.13
195 0.14
196 0.14
197 0.23
198 0.23
199 0.26
200 0.33
201 0.33
202 0.34
203 0.34
204 0.36
205 0.29
206 0.31
207 0.3
208 0.24
209 0.23
210 0.28
211 0.29
212 0.33
213 0.33
214 0.31
215 0.29
216 0.29
217 0.29
218 0.22
219 0.21
220 0.15
221 0.14
222 0.13
223 0.13
224 0.12
225 0.1
226 0.08
227 0.06
228 0.06
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.06
235 0.06
236 0.09
237 0.11
238 0.13
239 0.2
240 0.27
241 0.31
242 0.33
243 0.35
244 0.35
245 0.37
246 0.37
247 0.33
248 0.27
249 0.22
250 0.23
251 0.21
252 0.19
253 0.16
254 0.14
255 0.11
256 0.1
257 0.12
258 0.1
259 0.1
260 0.08
261 0.09
262 0.08
263 0.07
264 0.07
265 0.06
266 0.06
267 0.05
268 0.06
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.04
274 0.05
275 0.06
276 0.06
277 0.06
278 0.07
279 0.07
280 0.09
281 0.1
282 0.09
283 0.09
284 0.09
285 0.1
286 0.11
287 0.11
288 0.1
289 0.1
290 0.09
291 0.09
292 0.1
293 0.1
294 0.08