Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P47977

Protein Details
Accession P47977    Localization Confidence High Confidence Score 16
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
197-216GELKVKKSCKNFRTKPCVNWHydrophilic
258-280DEKRSNGRGSAKKKNLNVKVKALHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
268-270AKK
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 15.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045877  ZFP36-like  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000932  C:P-body  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0006879  P:intracellular iron ion homeostasis  
GO:0000956  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process  
KEGG sce:YLR136C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00642  zf-CCCH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MWAQLSYTRPESQKTDLTSLFSTDQEQNPLNDYQYQINIRELEEYYNKTILNEDNIQETSSEISSAVSFSPPKNTNAIQPGLLYDPQLMNPFLPSAHLNSTAPTTFKKKLEVQINPDYVPKSSQLPLTSQNLQQLSQQKPKNDASFSSEKESSAQPKVKSQVQETPKQLYKTELCESFTLKGSCPYGSKCQFAHGLGELKVKKSCKNFRTKPCVNWEKLGYCPYGRRCCFKHGDDNDIAVYVKAGTYCNVSSTSKQSDEKRSNGRGSAKKKNLNVKVKALQRMTW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.45
3 0.41
4 0.43
5 0.4
6 0.38
7 0.34
8 0.28
9 0.28
10 0.26
11 0.27
12 0.28
13 0.29
14 0.27
15 0.28
16 0.29
17 0.27
18 0.24
19 0.24
20 0.22
21 0.26
22 0.28
23 0.26
24 0.29
25 0.28
26 0.26
27 0.27
28 0.25
29 0.24
30 0.25
31 0.27
32 0.26
33 0.27
34 0.27
35 0.24
36 0.26
37 0.23
38 0.24
39 0.24
40 0.22
41 0.23
42 0.24
43 0.24
44 0.21
45 0.19
46 0.15
47 0.12
48 0.11
49 0.08
50 0.08
51 0.08
52 0.08
53 0.08
54 0.09
55 0.1
56 0.11
57 0.19
58 0.21
59 0.22
60 0.26
61 0.27
62 0.3
63 0.34
64 0.34
65 0.27
66 0.25
67 0.24
68 0.22
69 0.22
70 0.16
71 0.13
72 0.12
73 0.12
74 0.14
75 0.13
76 0.1
77 0.11
78 0.1
79 0.09
80 0.1
81 0.1
82 0.1
83 0.12
84 0.14
85 0.14
86 0.14
87 0.16
88 0.16
89 0.16
90 0.16
91 0.19
92 0.22
93 0.24
94 0.28
95 0.3
96 0.37
97 0.45
98 0.47
99 0.48
100 0.52
101 0.52
102 0.48
103 0.45
104 0.38
105 0.3
106 0.26
107 0.2
108 0.14
109 0.14
110 0.16
111 0.15
112 0.17
113 0.2
114 0.23
115 0.25
116 0.23
117 0.26
118 0.24
119 0.23
120 0.25
121 0.28
122 0.3
123 0.35
124 0.37
125 0.34
126 0.39
127 0.42
128 0.41
129 0.35
130 0.31
131 0.29
132 0.31
133 0.31
134 0.31
135 0.27
136 0.24
137 0.25
138 0.26
139 0.23
140 0.24
141 0.27
142 0.24
143 0.27
144 0.31
145 0.33
146 0.34
147 0.33
148 0.35
149 0.35
150 0.42
151 0.4
152 0.43
153 0.43
154 0.42
155 0.39
156 0.36
157 0.33
158 0.31
159 0.33
160 0.28
161 0.26
162 0.26
163 0.27
164 0.24
165 0.26
166 0.22
167 0.18
168 0.19
169 0.19
170 0.19
171 0.19
172 0.21
173 0.25
174 0.28
175 0.31
176 0.28
177 0.3
178 0.31
179 0.3
180 0.28
181 0.22
182 0.23
183 0.21
184 0.28
185 0.25
186 0.25
187 0.29
188 0.28
189 0.31
190 0.37
191 0.45
192 0.47
193 0.58
194 0.65
195 0.71
196 0.8
197 0.81
198 0.78
199 0.79
200 0.8
201 0.72
202 0.68
203 0.62
204 0.54
205 0.51
206 0.47
207 0.38
208 0.32
209 0.35
210 0.39
211 0.44
212 0.44
213 0.48
214 0.48
215 0.54
216 0.59
217 0.57
218 0.6
219 0.54
220 0.59
221 0.54
222 0.53
223 0.45
224 0.38
225 0.33
226 0.22
227 0.18
228 0.1
229 0.09
230 0.08
231 0.08
232 0.08
233 0.11
234 0.12
235 0.13
236 0.17
237 0.19
238 0.21
239 0.27
240 0.32
241 0.34
242 0.4
243 0.45
244 0.52
245 0.57
246 0.62
247 0.65
248 0.66
249 0.65
250 0.66
251 0.69
252 0.68
253 0.69
254 0.72
255 0.73
256 0.74
257 0.77
258 0.8
259 0.81
260 0.82
261 0.8
262 0.78
263 0.77
264 0.76
265 0.77