Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P40040

Protein Details
Accession P40040    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
184-218PESGNNGKFKNRNKNANNRSRVSKNRRGNRSGYRRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
191-218KFKNRNKNANNRSRVSKNRRGNRSGYRR
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 14, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003034  SAP_dom  
IPR036361  SAP_dom_sf  
IPR040746  THO1_MOS11_C  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003682  F:chromatin binding  
GO:0003690  F:double-stranded DNA binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0016973  P:poly(A)+ mRNA export from nucleus  
GO:0022618  P:ribonucleoprotein complex assembly  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
KEGG sce:YER063W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02037  SAP  
PF18592  Tho1_MOS11_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50800  SAP  
Amino Acid Sequences MADYSSLTVVQLKDLLTKRNLSVGGLKNELVQRLIKDDEESKGESEVSPQEQNQEQGSEPAAIEEPASQNITEKKEVSSEPKETNEPKEENKDVQKPSDGPSATASENEQAAASTAAPALSPEEIKAKALDLLNKKLHRANKFGQDQADIDSLQRQINRVEKFGVDLNSKLAEELGLVSRKNEPESGNNGKFKNRNKNANNRSRVSKNRRGNRSGYRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.29
3 0.28
4 0.32
5 0.31
6 0.35
7 0.34
8 0.29
9 0.35
10 0.36
11 0.38
12 0.36
13 0.36
14 0.34
15 0.36
16 0.35
17 0.28
18 0.23
19 0.19
20 0.21
21 0.23
22 0.19
23 0.2
24 0.22
25 0.23
26 0.24
27 0.24
28 0.21
29 0.2
30 0.2
31 0.17
32 0.17
33 0.18
34 0.18
35 0.19
36 0.18
37 0.22
38 0.23
39 0.25
40 0.23
41 0.21
42 0.18
43 0.17
44 0.18
45 0.14
46 0.12
47 0.11
48 0.11
49 0.09
50 0.09
51 0.09
52 0.09
53 0.09
54 0.1
55 0.09
56 0.11
57 0.16
58 0.19
59 0.2
60 0.19
61 0.19
62 0.21
63 0.22
64 0.27
65 0.28
66 0.28
67 0.29
68 0.31
69 0.35
70 0.34
71 0.38
72 0.36
73 0.34
74 0.33
75 0.36
76 0.36
77 0.36
78 0.4
79 0.42
80 0.38
81 0.37
82 0.36
83 0.31
84 0.31
85 0.33
86 0.27
87 0.21
88 0.22
89 0.22
90 0.2
91 0.19
92 0.17
93 0.11
94 0.11
95 0.1
96 0.08
97 0.05
98 0.06
99 0.06
100 0.05
101 0.04
102 0.04
103 0.04
104 0.04
105 0.04
106 0.04
107 0.05
108 0.05
109 0.05
110 0.08
111 0.08
112 0.09
113 0.09
114 0.09
115 0.11
116 0.12
117 0.18
118 0.19
119 0.26
120 0.32
121 0.33
122 0.34
123 0.36
124 0.41
125 0.39
126 0.42
127 0.41
128 0.44
129 0.47
130 0.48
131 0.45
132 0.4
133 0.36
134 0.33
135 0.29
136 0.19
137 0.16
138 0.16
139 0.16
140 0.16
141 0.16
142 0.14
143 0.17
144 0.24
145 0.26
146 0.25
147 0.25
148 0.23
149 0.24
150 0.27
151 0.27
152 0.21
153 0.2
154 0.2
155 0.2
156 0.2
157 0.18
158 0.14
159 0.1
160 0.08
161 0.09
162 0.12
163 0.13
164 0.13
165 0.14
166 0.19
167 0.21
168 0.23
169 0.24
170 0.23
171 0.26
172 0.34
173 0.43
174 0.45
175 0.49
176 0.49
177 0.53
178 0.58
179 0.61
180 0.65
181 0.64
182 0.68
183 0.71
184 0.81
185 0.84
186 0.88
187 0.86
188 0.8
189 0.8
190 0.79
191 0.81
192 0.79
193 0.79
194 0.79
195 0.81
196 0.85
197 0.83
198 0.82