Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P32916

Protein Details
Accession P32916    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
177-203GSVPQSHNKNTKKKLRDTKGKKQSTGNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
187-198TKKKLRDTKGKK
Subcellular Location(s) nucl 11cyto_nucl 11, cyto 7, mito 4, vacu 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003593  AAA+_ATPase  
IPR011012  Longin-like_dom_sf  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR013822  Signal_recog_particl_SRP54_hlx  
IPR036225  SRP/SRP_N  
IPR000897  SRP54_GTPase_dom  
IPR042101  SRP54_N_sf  
IPR015284  SRX_dom  
Gene Ontology GO:0005783  C:endoplasmic reticulum  
GO:0005789  C:endoplasmic reticulum membrane  
GO:0005785  C:signal recognition particle receptor complex  
GO:0005525  F:GTP binding  
GO:0003924  F:GTPase activity  
GO:0005047  F:signal recognition particle binding  
GO:0045047  P:protein targeting to ER  
GO:0006614  P:SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane  
GO:0006617  P:SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane, signal sequence recognition  
KEGG sce:YDR292C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00448  SRP54  
PF02881  SRP54_N  
PF09201  SRX  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00300  SRP54  
CDD cd14818  longin-like  
cd17876  SRalpha_C  
Amino Acid Sequences MFDQLAVFTPQGQVLYQYNCLGKKFSEIQINSFISQLITSPVTRKESVANANTDGFDFNLLTINSEHKNSPSFNALFYLNKQPELYFVVTFAEQTLELNQETQQTLALVLKLWNSLHLSESILKNRQGQNEKNKHNYVDILQGIEDDLKKFEQYFRIKYEESIKQDHINPDNFTKNGSVPQSHNKNTKKKLRDTKGKKQSTGNVGSGRKWGRDGGMLDEMNHEDAAKLDFSSSNSHNSSQVALDSTINKDSFGDRTEGGDFLIKEIDDLLSSHKDEITSGNEAKNSGYVSTAFGFLQKHVLGNKTINESDLKSVLEKLTQQLITKNVAPEAADYLTQQVSHDLVGSKTANWTSVENTARESLTKALTQILTPGVSVDLLREIQSKRSKKDEEGKCDPYVFSIVGVNGVGKSTNLSKLAFWLLQNNFKVLIVACDTFRSGAVEQLRVHVENLAQLMDDSHVRGSKNKRGKTGNDYVELFEAGYGGSDLVTKIAKQAIKYSRDQNFDIVLMDTAGRRHNDPTLMSPLKSFADQAKPDKIIMVGEALVGTDSVQQAKNFNDAFGKGRNLDFFIISKCDTVGEMLGTMVNMVYATGIPILFVGVGQTYTDLRTLSVKWAVNTLMS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.21
3 0.23
4 0.25
5 0.29
6 0.3
7 0.32
8 0.31
9 0.27
10 0.31
11 0.34
12 0.36
13 0.41
14 0.4
15 0.43
16 0.49
17 0.51
18 0.44
19 0.39
20 0.33
21 0.24
22 0.22
23 0.18
24 0.13
25 0.13
26 0.14
27 0.17
28 0.22
29 0.27
30 0.28
31 0.29
32 0.3
33 0.35
34 0.42
35 0.44
36 0.42
37 0.39
38 0.4
39 0.39
40 0.35
41 0.28
42 0.2
43 0.16
44 0.13
45 0.1
46 0.13
47 0.13
48 0.14
49 0.14
50 0.18
51 0.19
52 0.21
53 0.22
54 0.2
55 0.24
56 0.24
57 0.26
58 0.3
59 0.29
60 0.27
61 0.28
62 0.28
63 0.27
64 0.29
65 0.36
66 0.29
67 0.3
68 0.3
69 0.28
70 0.28
71 0.31
72 0.29
73 0.19
74 0.18
75 0.18
76 0.18
77 0.18
78 0.15
79 0.11
80 0.09
81 0.09
82 0.1
83 0.11
84 0.11
85 0.12
86 0.12
87 0.14
88 0.15
89 0.14
90 0.13
91 0.11
92 0.12
93 0.12
94 0.11
95 0.09
96 0.1
97 0.11
98 0.13
99 0.12
100 0.14
101 0.15
102 0.15
103 0.15
104 0.15
105 0.17
106 0.19
107 0.24
108 0.28
109 0.3
110 0.32
111 0.38
112 0.42
113 0.48
114 0.52
115 0.56
116 0.61
117 0.67
118 0.72
119 0.74
120 0.72
121 0.65
122 0.59
123 0.54
124 0.45
125 0.41
126 0.34
127 0.27
128 0.22
129 0.21
130 0.19
131 0.18
132 0.17
133 0.1
134 0.11
135 0.11
136 0.11
137 0.13
138 0.16
139 0.22
140 0.28
141 0.32
142 0.35
143 0.4
144 0.4
145 0.42
146 0.46
147 0.45
148 0.43
149 0.43
150 0.41
151 0.39
152 0.44
153 0.47
154 0.45
155 0.41
156 0.39
157 0.38
158 0.4
159 0.36
160 0.33
161 0.28
162 0.24
163 0.25
164 0.26
165 0.24
166 0.24
167 0.34
168 0.4
169 0.45
170 0.53
171 0.56
172 0.63
173 0.69
174 0.75
175 0.74
176 0.76
177 0.81
178 0.82
179 0.85
180 0.85
181 0.87
182 0.88
183 0.86
184 0.8
185 0.75
186 0.72
187 0.69
188 0.65
189 0.58
190 0.55
191 0.49
192 0.47
193 0.47
194 0.42
195 0.34
196 0.3
197 0.26
198 0.2
199 0.23
200 0.23
201 0.2
202 0.24
203 0.23
204 0.22
205 0.23
206 0.22
207 0.18
208 0.17
209 0.13
210 0.07
211 0.07
212 0.08
213 0.07
214 0.06
215 0.06
216 0.07
217 0.09
218 0.13
219 0.14
220 0.18
221 0.19
222 0.2
223 0.21
224 0.2
225 0.2
226 0.16
227 0.15
228 0.12
229 0.11
230 0.11
231 0.11
232 0.12
233 0.14
234 0.14
235 0.13
236 0.12
237 0.13
238 0.13
239 0.13
240 0.13
241 0.11
242 0.13
243 0.13
244 0.13
245 0.12
246 0.13
247 0.11
248 0.1
249 0.11
250 0.08
251 0.08
252 0.08
253 0.08
254 0.05
255 0.06
256 0.08
257 0.09
258 0.09
259 0.1
260 0.1
261 0.1
262 0.1
263 0.12
264 0.12
265 0.14
266 0.15
267 0.15
268 0.15
269 0.16
270 0.15
271 0.15
272 0.12
273 0.09
274 0.08
275 0.07
276 0.08
277 0.09
278 0.1
279 0.08
280 0.1
281 0.1
282 0.1
283 0.12
284 0.1
285 0.11
286 0.11
287 0.13
288 0.13
289 0.14
290 0.16
291 0.16
292 0.16
293 0.16
294 0.15
295 0.15
296 0.15
297 0.14
298 0.12
299 0.1
300 0.11
301 0.1
302 0.1
303 0.1
304 0.1
305 0.13
306 0.14
307 0.14
308 0.15
309 0.17
310 0.18
311 0.19
312 0.18
313 0.14
314 0.13
315 0.13
316 0.11
317 0.11
318 0.09
319 0.08
320 0.07
321 0.09
322 0.09
323 0.09
324 0.08
325 0.07
326 0.07
327 0.06
328 0.07
329 0.07
330 0.06
331 0.09
332 0.09
333 0.09
334 0.1
335 0.1
336 0.11
337 0.11
338 0.12
339 0.11
340 0.17
341 0.19
342 0.17
343 0.18
344 0.19
345 0.18
346 0.17
347 0.17
348 0.12
349 0.12
350 0.12
351 0.11
352 0.12
353 0.13
354 0.12
355 0.12
356 0.11
357 0.1
358 0.09
359 0.09
360 0.06
361 0.06
362 0.06
363 0.05
364 0.06
365 0.06
366 0.07
367 0.1
368 0.11
369 0.18
370 0.27
371 0.32
372 0.34
373 0.42
374 0.44
375 0.47
376 0.57
377 0.58
378 0.59
379 0.62
380 0.63
381 0.56
382 0.54
383 0.48
384 0.38
385 0.31
386 0.22
387 0.15
388 0.11
389 0.09
390 0.09
391 0.09
392 0.08
393 0.06
394 0.06
395 0.06
396 0.04
397 0.06
398 0.07
399 0.1
400 0.12
401 0.12
402 0.12
403 0.15
404 0.18
405 0.18
406 0.16
407 0.21
408 0.22
409 0.28
410 0.28
411 0.27
412 0.25
413 0.23
414 0.23
415 0.16
416 0.15
417 0.11
418 0.12
419 0.11
420 0.11
421 0.12
422 0.11
423 0.12
424 0.12
425 0.1
426 0.14
427 0.16
428 0.19
429 0.19
430 0.21
431 0.23
432 0.21
433 0.21
434 0.18
435 0.16
436 0.14
437 0.14
438 0.11
439 0.09
440 0.08
441 0.08
442 0.08
443 0.08
444 0.07
445 0.08
446 0.11
447 0.12
448 0.18
449 0.25
450 0.33
451 0.43
452 0.46
453 0.53
454 0.57
455 0.63
456 0.65
457 0.68
458 0.64
459 0.59
460 0.55
461 0.49
462 0.43
463 0.37
464 0.28
465 0.18
466 0.12
467 0.07
468 0.06
469 0.05
470 0.04
471 0.04
472 0.04
473 0.04
474 0.06
475 0.06
476 0.06
477 0.08
478 0.13
479 0.15
480 0.16
481 0.25
482 0.31
483 0.36
484 0.41
485 0.48
486 0.5
487 0.53
488 0.54
489 0.47
490 0.41
491 0.36
492 0.33
493 0.25
494 0.18
495 0.13
496 0.13
497 0.11
498 0.11
499 0.14
500 0.14
501 0.15
502 0.18
503 0.21
504 0.24
505 0.25
506 0.28
507 0.34
508 0.35
509 0.34
510 0.32
511 0.31
512 0.29
513 0.27
514 0.24
515 0.2
516 0.27
517 0.32
518 0.36
519 0.41
520 0.41
521 0.41
522 0.4
523 0.35
524 0.26
525 0.22
526 0.18
527 0.11
528 0.1
529 0.1
530 0.08
531 0.08
532 0.07
533 0.06
534 0.07
535 0.08
536 0.11
537 0.13
538 0.14
539 0.17
540 0.19
541 0.26
542 0.23
543 0.24
544 0.24
545 0.24
546 0.27
547 0.29
548 0.31
549 0.27
550 0.29
551 0.29
552 0.29
553 0.28
554 0.26
555 0.24
556 0.23
557 0.24
558 0.23
559 0.21
560 0.19
561 0.18
562 0.16
563 0.15
564 0.14
565 0.11
566 0.1
567 0.1
568 0.1
569 0.09
570 0.08
571 0.07
572 0.05
573 0.05
574 0.04
575 0.04
576 0.04
577 0.05
578 0.06
579 0.06
580 0.06
581 0.06
582 0.07
583 0.06
584 0.06
585 0.06
586 0.05
587 0.06
588 0.06
589 0.08
590 0.08
591 0.1
592 0.11
593 0.11
594 0.11
595 0.14
596 0.16
597 0.2
598 0.26
599 0.28
600 0.27
601 0.31