Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0A1TDH7

Protein Details
Accession A0A0A1TDH7    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
477-497ALVPVPKRRRHEARPVRPPSTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
470-495TRPPRKLALVPVPKRRRHEARPVRPP
Subcellular Location(s) nucl 12.5cyto_nucl 12.5, cyto 11.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024662  Trs65  
Gene Ontology GO:1990071  C:TRAPPII protein complex  
GO:0006891  P:intra-Golgi vesicle-mediated transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF12735  Trs65  
Amino Acid Sequences MAASVQPPEEPAEGATSFADQAALTYLVPADTNLTLDDAFRELVREKGSIESIETRDSLFFDESTDVLIVLEAPSMDQDALKTHLKRLIINLEAHVVNGQIQSRDAPSSELIYAGTVTDTADPYIISDSGDSSIEPDSTQKIYAVWKLPVHLIRPRMRLQRPSVIFSASAALKPVIAADTMHSTRSGYLTSGQPSSINLLESFGGDPLLQGIQPKLSALRVSRVAPVTRGQDVAARLRVLPQLQLPVHAIVHSRIRFTKPQTSPPTSTIIGQLEFDFTPDFDCEVILDEISLSTATGVVECLSDDVALKLPLSCVAHDHITLLYEIKQQKLDVAPKDNSGSLDIVVSASALVNPGVCTPRINMKWSAILDFSNPNNPTPRTPLDTGLHRSHRPAQLSLSSSQSVVTPLKSPSVTQPDALPGLEASAARAEAVIPDLGITMSFSAPTETIYTGDVFSWTVYILNRASEKSTRPPRKLALVPVPKRRRHEARPVRPPSTATRRQGEKEVADAAIDENVVHAMQKNALVEGADIISLSADTRIGPLGPGACHAVELQFLALRPGIAEMEAIRVVDIASQEHVEIQDLPVTIIEPAPA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.16
3 0.14
4 0.13
5 0.13
6 0.12
7 0.08
8 0.08
9 0.1
10 0.1
11 0.09
12 0.09
13 0.09
14 0.09
15 0.1
16 0.09
17 0.09
18 0.09
19 0.1
20 0.1
21 0.11
22 0.11
23 0.11
24 0.12
25 0.11
26 0.11
27 0.1
28 0.13
29 0.13
30 0.17
31 0.19
32 0.18
33 0.18
34 0.21
35 0.23
36 0.21
37 0.24
38 0.26
39 0.25
40 0.27
41 0.26
42 0.23
43 0.22
44 0.22
45 0.21
46 0.17
47 0.15
48 0.14
49 0.15
50 0.14
51 0.15
52 0.14
53 0.11
54 0.1
55 0.09
56 0.08
57 0.07
58 0.07
59 0.05
60 0.05
61 0.05
62 0.06
63 0.07
64 0.06
65 0.07
66 0.09
67 0.13
68 0.2
69 0.21
70 0.24
71 0.28
72 0.29
73 0.3
74 0.34
75 0.37
76 0.35
77 0.35
78 0.32
79 0.33
80 0.31
81 0.29
82 0.24
83 0.16
84 0.14
85 0.14
86 0.14
87 0.11
88 0.12
89 0.13
90 0.14
91 0.16
92 0.14
93 0.14
94 0.14
95 0.16
96 0.15
97 0.14
98 0.12
99 0.11
100 0.11
101 0.09
102 0.08
103 0.05
104 0.06
105 0.07
106 0.07
107 0.07
108 0.07
109 0.07
110 0.08
111 0.09
112 0.09
113 0.08
114 0.07
115 0.08
116 0.09
117 0.09
118 0.08
119 0.08
120 0.09
121 0.09
122 0.09
123 0.1
124 0.11
125 0.12
126 0.13
127 0.12
128 0.12
129 0.16
130 0.2
131 0.23
132 0.24
133 0.24
134 0.25
135 0.29
136 0.31
137 0.32
138 0.31
139 0.36
140 0.39
141 0.43
142 0.49
143 0.54
144 0.57
145 0.61
146 0.62
147 0.63
148 0.59
149 0.58
150 0.52
151 0.44
152 0.38
153 0.31
154 0.28
155 0.19
156 0.16
157 0.13
158 0.12
159 0.1
160 0.1
161 0.1
162 0.07
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.12
167 0.13
168 0.14
169 0.13
170 0.13
171 0.14
172 0.14
173 0.14
174 0.09
175 0.11
176 0.14
177 0.16
178 0.16
179 0.16
180 0.15
181 0.15
182 0.17
183 0.15
184 0.13
185 0.1
186 0.1
187 0.1
188 0.11
189 0.11
190 0.08
191 0.07
192 0.06
193 0.06
194 0.06
195 0.06
196 0.05
197 0.06
198 0.06
199 0.07
200 0.07
201 0.07
202 0.07
203 0.08
204 0.11
205 0.11
206 0.14
207 0.16
208 0.18
209 0.21
210 0.23
211 0.23
212 0.22
213 0.24
214 0.23
215 0.21
216 0.21
217 0.17
218 0.18
219 0.19
220 0.21
221 0.19
222 0.17
223 0.16
224 0.17
225 0.19
226 0.16
227 0.16
228 0.13
229 0.17
230 0.16
231 0.18
232 0.17
233 0.16
234 0.16
235 0.15
236 0.14
237 0.1
238 0.17
239 0.16
240 0.17
241 0.18
242 0.22
243 0.26
244 0.3
245 0.38
246 0.35
247 0.44
248 0.5
249 0.54
250 0.53
251 0.5
252 0.5
253 0.4
254 0.38
255 0.31
256 0.25
257 0.19
258 0.16
259 0.14
260 0.12
261 0.11
262 0.11
263 0.08
264 0.07
265 0.07
266 0.07
267 0.07
268 0.06
269 0.06
270 0.05
271 0.07
272 0.07
273 0.06
274 0.05
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.05
279 0.03
280 0.02
281 0.03
282 0.03
283 0.03
284 0.03
285 0.03
286 0.03
287 0.04
288 0.04
289 0.03
290 0.04
291 0.04
292 0.04
293 0.05
294 0.05
295 0.05
296 0.05
297 0.05
298 0.08
299 0.08
300 0.08
301 0.08
302 0.1
303 0.11
304 0.11
305 0.11
306 0.09
307 0.09
308 0.09
309 0.08
310 0.08
311 0.12
312 0.13
313 0.14
314 0.15
315 0.14
316 0.16
317 0.2
318 0.24
319 0.22
320 0.27
321 0.27
322 0.27
323 0.29
324 0.27
325 0.23
326 0.19
327 0.16
328 0.11
329 0.1
330 0.08
331 0.07
332 0.06
333 0.05
334 0.04
335 0.03
336 0.03
337 0.03
338 0.03
339 0.04
340 0.04
341 0.06
342 0.07
343 0.07
344 0.08
345 0.09
346 0.17
347 0.19
348 0.23
349 0.23
350 0.24
351 0.28
352 0.28
353 0.28
354 0.2
355 0.19
356 0.17
357 0.19
358 0.18
359 0.2
360 0.2
361 0.2
362 0.24
363 0.25
364 0.25
365 0.28
366 0.3
367 0.29
368 0.3
369 0.33
370 0.32
371 0.36
372 0.4
373 0.41
374 0.43
375 0.38
376 0.4
377 0.42
378 0.44
379 0.41
380 0.37
381 0.34
382 0.33
383 0.36
384 0.34
385 0.3
386 0.25
387 0.22
388 0.21
389 0.18
390 0.16
391 0.14
392 0.14
393 0.13
394 0.13
395 0.16
396 0.16
397 0.17
398 0.21
399 0.28
400 0.28
401 0.26
402 0.26
403 0.26
404 0.26
405 0.25
406 0.19
407 0.1
408 0.1
409 0.1
410 0.09
411 0.07
412 0.07
413 0.07
414 0.06
415 0.06
416 0.06
417 0.05
418 0.07
419 0.06
420 0.05
421 0.05
422 0.05
423 0.05
424 0.05
425 0.05
426 0.05
427 0.05
428 0.05
429 0.05
430 0.06
431 0.06
432 0.08
433 0.09
434 0.09
435 0.09
436 0.1
437 0.11
438 0.1
439 0.1
440 0.1
441 0.08
442 0.08
443 0.07
444 0.06
445 0.07
446 0.07
447 0.1
448 0.1
449 0.13
450 0.14
451 0.15
452 0.19
453 0.21
454 0.25
455 0.32
456 0.43
457 0.5
458 0.53
459 0.58
460 0.58
461 0.63
462 0.64
463 0.62
464 0.62
465 0.63
466 0.67
467 0.71
468 0.77
469 0.75
470 0.75
471 0.76
472 0.75
473 0.72
474 0.76
475 0.76
476 0.78
477 0.83
478 0.85
479 0.8
480 0.72
481 0.67
482 0.65
483 0.64
484 0.63
485 0.58
486 0.58
487 0.6
488 0.61
489 0.65
490 0.61
491 0.52
492 0.46
493 0.42
494 0.34
495 0.28
496 0.25
497 0.19
498 0.13
499 0.12
500 0.08
501 0.06
502 0.06
503 0.06
504 0.06
505 0.07
506 0.08
507 0.09
508 0.12
509 0.12
510 0.12
511 0.12
512 0.12
513 0.11
514 0.11
515 0.1
516 0.07
517 0.07
518 0.06
519 0.06
520 0.06
521 0.06
522 0.05
523 0.05
524 0.05
525 0.06
526 0.07
527 0.08
528 0.08
529 0.1
530 0.12
531 0.12
532 0.14
533 0.15
534 0.14
535 0.15
536 0.15
537 0.14
538 0.11
539 0.12
540 0.11
541 0.1
542 0.1
543 0.11
544 0.11
545 0.11
546 0.1
547 0.11
548 0.1
549 0.09
550 0.1
551 0.08
552 0.12
553 0.12
554 0.12
555 0.1
556 0.1
557 0.1
558 0.11
559 0.11
560 0.09
561 0.11
562 0.11
563 0.11
564 0.13
565 0.13
566 0.13
567 0.13
568 0.13
569 0.15
570 0.14
571 0.15
572 0.13
573 0.13
574 0.12