Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P25042

Protein Details
Accession P25042    Localization Confidence High Confidence Score 15.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MNPKSSTPKIPRPKNAFILFRHydrophilic
73-102LEHERKYPEYKYKPVRKSKKKQLLLKEIEQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
84-93YKPVRKSKKK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000987  F:cis-regulatory region sequence-specific DNA binding  
GO:0008301  F:DNA binding, bending  
GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0001227  F:DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0000978  F:RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding  
GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0003714  F:transcription corepressor activity  
GO:0009653  P:anatomical structure morphogenesis  
GO:0030154  P:cell differentiation  
GO:0071470  P:cellular response to osmotic stress  
GO:0000122  P:negative regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG sce:YPR065W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
CDD cd01389  HMG-box_ROX1-like  
Amino Acid Sequences MNPKSSTPKIPRPKNAFILFRQHYHRILIDEWTAQGVEIPHNSNISKIIGTKWKGLQPEDKAHWENLAEKEKLEHERKYPEYKYKPVRKSKKKQLLLKEIEQQQQQQQKEQQQQKQSQPQLQQPFNNNIVLMKRAHSLSPSSSVSSSNSYQFQLNNDLKRLPIPSVNTSNYMVSRSLSGLPLTHDKTARDLPQLSSQLNSIPYYSAPHDPSTRHHYLNVAQAQPRANSTPQLPFISSIINNSSQTPVTTTTTSTTTATSSPGKFSSSPNSSVLENNRLNSINNSNQYLPPPLLPSLQDFQLDQYQQLKQMGPTYIVKPLSHTRNNLLSTTTPTHHHIPHIPNQNIPLHQIINSSNTEVTAKTSLVSPK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.84
2 0.83
3 0.79
4 0.73
5 0.74
6 0.67
7 0.64
8 0.62
9 0.57
10 0.52
11 0.49
12 0.46
13 0.39
14 0.37
15 0.35
16 0.31
17 0.27
18 0.25
19 0.22
20 0.2
21 0.16
22 0.16
23 0.13
24 0.14
25 0.16
26 0.18
27 0.19
28 0.21
29 0.21
30 0.2
31 0.21
32 0.2
33 0.18
34 0.16
35 0.2
36 0.26
37 0.29
38 0.34
39 0.37
40 0.39
41 0.42
42 0.45
43 0.48
44 0.46
45 0.52
46 0.51
47 0.53
48 0.52
49 0.48
50 0.46
51 0.39
52 0.38
53 0.36
54 0.38
55 0.31
56 0.29
57 0.3
58 0.33
59 0.41
60 0.41
61 0.38
62 0.36
63 0.45
64 0.5
65 0.56
66 0.57
67 0.59
68 0.61
69 0.66
70 0.71
71 0.73
72 0.78
73 0.8
74 0.85
75 0.86
76 0.9
77 0.92
78 0.92
79 0.91
80 0.9
81 0.89
82 0.89
83 0.85
84 0.79
85 0.76
86 0.72
87 0.68
88 0.61
89 0.53
90 0.49
91 0.5
92 0.45
93 0.43
94 0.43
95 0.46
96 0.54
97 0.6
98 0.6
99 0.62
100 0.68
101 0.71
102 0.74
103 0.71
104 0.68
105 0.64
106 0.65
107 0.65
108 0.61
109 0.57
110 0.52
111 0.52
112 0.48
113 0.43
114 0.35
115 0.28
116 0.25
117 0.22
118 0.18
119 0.14
120 0.14
121 0.14
122 0.15
123 0.14
124 0.15
125 0.15
126 0.19
127 0.19
128 0.18
129 0.18
130 0.18
131 0.19
132 0.2
133 0.2
134 0.17
135 0.17
136 0.17
137 0.18
138 0.18
139 0.18
140 0.23
141 0.26
142 0.26
143 0.26
144 0.25
145 0.24
146 0.25
147 0.24
148 0.17
149 0.16
150 0.17
151 0.2
152 0.25
153 0.26
154 0.27
155 0.26
156 0.26
157 0.23
158 0.21
159 0.17
160 0.12
161 0.11
162 0.1
163 0.1
164 0.1
165 0.1
166 0.08
167 0.1
168 0.14
169 0.15
170 0.16
171 0.16
172 0.16
173 0.19
174 0.22
175 0.22
176 0.21
177 0.21
178 0.2
179 0.25
180 0.27
181 0.24
182 0.21
183 0.19
184 0.18
185 0.18
186 0.17
187 0.1
188 0.09
189 0.09
190 0.11
191 0.13
192 0.15
193 0.15
194 0.17
195 0.19
196 0.19
197 0.24
198 0.3
199 0.32
200 0.29
201 0.28
202 0.28
203 0.29
204 0.35
205 0.36
206 0.3
207 0.28
208 0.3
209 0.3
210 0.29
211 0.28
212 0.22
213 0.19
214 0.18
215 0.18
216 0.2
217 0.22
218 0.23
219 0.21
220 0.2
221 0.19
222 0.2
223 0.18
224 0.15
225 0.15
226 0.16
227 0.16
228 0.16
229 0.17
230 0.14
231 0.14
232 0.15
233 0.15
234 0.15
235 0.15
236 0.15
237 0.16
238 0.17
239 0.18
240 0.17
241 0.15
242 0.13
243 0.13
244 0.15
245 0.18
246 0.17
247 0.18
248 0.18
249 0.2
250 0.21
251 0.23
252 0.29
253 0.28
254 0.31
255 0.3
256 0.31
257 0.29
258 0.32
259 0.34
260 0.33
261 0.31
262 0.29
263 0.3
264 0.29
265 0.29
266 0.29
267 0.31
268 0.29
269 0.3
270 0.33
271 0.32
272 0.33
273 0.34
274 0.33
275 0.28
276 0.22
277 0.22
278 0.21
279 0.2
280 0.19
281 0.22
282 0.21
283 0.22
284 0.21
285 0.19
286 0.2
287 0.25
288 0.24
289 0.22
290 0.23
291 0.23
292 0.26
293 0.28
294 0.27
295 0.22
296 0.26
297 0.26
298 0.25
299 0.28
300 0.26
301 0.3
302 0.31
303 0.3
304 0.3
305 0.37
306 0.42
307 0.45
308 0.46
309 0.46
310 0.51
311 0.53
312 0.49
313 0.44
314 0.37
315 0.37
316 0.38
317 0.35
318 0.3
319 0.32
320 0.37
321 0.36
322 0.39
323 0.41
324 0.42
325 0.5
326 0.57
327 0.54
328 0.51
329 0.54
330 0.54
331 0.47
332 0.44
333 0.39
334 0.29
335 0.29
336 0.29
337 0.26
338 0.26
339 0.26
340 0.25
341 0.21
342 0.21
343 0.21
344 0.18
345 0.2
346 0.18
347 0.17
348 0.15