Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0A1TDM8

Protein Details
Accession A0A0A1TDM8    Localization Confidence Low Confidence Score 9.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-37PTDSIISKRGRRHYRVPVRSQHWQLRSHydrophilic
254-273SSTSRTPQYHWRQRQRIFLTHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 9.5, cyto_nucl 7.5, mito 6, pero 6, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019417  DUF2415  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF10313  DUF2415  
Amino Acid Sequences MAVKEDNVYYPTDSIISKRGRRHYRVPVRSQHWQLRSLISAERRHLIYFPGGTHSKQIQRLNTMTHECETLKVLNFAPRCLVADNGWLCCGSEKGDFVAMRLDEDIDGDAVGASLGLDLDTALDTRMEISREESLLSLITQGRRPNKNLNAKSMRLAKERVNCITLWFPDLRVPAGEGAYKESVAVLADNVGNVTLIGLRDFEQNDKAEPLDVINYPDFVNRALLSPDGRMLIAILDDPYLYIHVREEKPLDASSTSRTPQYHWRQRQRIFLTSQLKEDRSDSRGSFAACFSNSGALLAVGTQHGTISIFDTTLLDNPLADPLITTFKSSRPESGPGAIRDMSFCPGPFDILAWTEDRGHVGIADVRANFNMRQILDIAVEAEFDHINIFDRNTIDPRLLDSQTATRRDLLAMQANNAGSPRHGESSESFNQPLTATETVVLEALQDDRLRRDRARGGTDGGERPVPDLSWTYLSSLRPPADGDTGSRLPRRSTSVTRGVRSTSSSRAQRSALDDYLDQRERARNRQQGARDSTERLPAMRRTDPRWIDRLGETVAAMRDQRDRNQRDGQDRSDASYLNVLEILQARERATADGENEDGSLLVPLVNQVVNRWEESAMRNTLPVGTAVAIDHGVFEVPPSRDNTAGLAWSEDGRTMFVGAQDGIYEFHVNTHNRKFFPGFRLS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.24
3 0.31
4 0.36
5 0.44
6 0.54
7 0.62
8 0.68
9 0.76
10 0.79
11 0.81
12 0.85
13 0.86
14 0.86
15 0.82
16 0.85
17 0.84
18 0.82
19 0.75
20 0.7
21 0.63
22 0.57
23 0.53
24 0.46
25 0.43
26 0.41
27 0.43
28 0.41
29 0.43
30 0.41
31 0.39
32 0.37
33 0.34
34 0.32
35 0.28
36 0.26
37 0.29
38 0.29
39 0.29
40 0.33
41 0.37
42 0.39
43 0.44
44 0.49
45 0.47
46 0.52
47 0.54
48 0.53
49 0.53
50 0.52
51 0.47
52 0.42
53 0.39
54 0.32
55 0.31
56 0.29
57 0.27
58 0.23
59 0.23
60 0.24
61 0.28
62 0.28
63 0.28
64 0.27
65 0.24
66 0.24
67 0.23
68 0.23
69 0.17
70 0.24
71 0.25
72 0.24
73 0.23
74 0.21
75 0.2
76 0.19
77 0.19
78 0.13
79 0.13
80 0.13
81 0.14
82 0.2
83 0.2
84 0.19
85 0.24
86 0.21
87 0.2
88 0.2
89 0.19
90 0.13
91 0.14
92 0.14
93 0.08
94 0.08
95 0.07
96 0.06
97 0.05
98 0.05
99 0.04
100 0.03
101 0.03
102 0.03
103 0.03
104 0.03
105 0.03
106 0.03
107 0.04
108 0.04
109 0.05
110 0.05
111 0.05
112 0.07
113 0.09
114 0.09
115 0.1
116 0.12
117 0.15
118 0.15
119 0.16
120 0.14
121 0.13
122 0.12
123 0.12
124 0.12
125 0.13
126 0.15
127 0.18
128 0.24
129 0.32
130 0.37
131 0.42
132 0.48
133 0.55
134 0.63
135 0.64
136 0.69
137 0.67
138 0.64
139 0.66
140 0.64
141 0.6
142 0.53
143 0.53
144 0.49
145 0.5
146 0.54
147 0.5
148 0.43
149 0.38
150 0.37
151 0.38
152 0.32
153 0.27
154 0.22
155 0.2
156 0.21
157 0.22
158 0.2
159 0.16
160 0.16
161 0.14
162 0.15
163 0.16
164 0.12
165 0.15
166 0.15
167 0.14
168 0.13
169 0.12
170 0.11
171 0.09
172 0.09
173 0.05
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.06
179 0.05
180 0.05
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.06
186 0.07
187 0.1
188 0.11
189 0.13
190 0.16
191 0.16
192 0.17
193 0.18
194 0.17
195 0.14
196 0.14
197 0.12
198 0.11
199 0.11
200 0.13
201 0.12
202 0.13
203 0.12
204 0.13
205 0.13
206 0.11
207 0.12
208 0.09
209 0.1
210 0.1
211 0.11
212 0.11
213 0.11
214 0.12
215 0.11
216 0.1
217 0.09
218 0.08
219 0.07
220 0.06
221 0.06
222 0.05
223 0.04
224 0.04
225 0.05
226 0.05
227 0.06
228 0.05
229 0.05
230 0.07
231 0.14
232 0.15
233 0.17
234 0.18
235 0.18
236 0.21
237 0.21
238 0.21
239 0.15
240 0.15
241 0.17
242 0.19
243 0.19
244 0.19
245 0.19
246 0.21
247 0.3
248 0.4
249 0.47
250 0.54
251 0.63
252 0.69
253 0.74
254 0.81
255 0.76
256 0.7
257 0.62
258 0.61
259 0.58
260 0.5
261 0.5
262 0.44
263 0.4
264 0.35
265 0.35
266 0.3
267 0.25
268 0.27
269 0.22
270 0.21
271 0.22
272 0.21
273 0.2
274 0.17
275 0.17
276 0.13
277 0.14
278 0.11
279 0.11
280 0.1
281 0.09
282 0.08
283 0.06
284 0.06
285 0.05
286 0.05
287 0.03
288 0.04
289 0.03
290 0.03
291 0.03
292 0.04
293 0.04
294 0.05
295 0.05
296 0.05
297 0.05
298 0.06
299 0.06
300 0.07
301 0.08
302 0.06
303 0.06
304 0.06
305 0.06
306 0.06
307 0.05
308 0.04
309 0.05
310 0.08
311 0.09
312 0.1
313 0.1
314 0.13
315 0.18
316 0.19
317 0.21
318 0.21
319 0.24
320 0.24
321 0.27
322 0.29
323 0.24
324 0.26
325 0.24
326 0.21
327 0.19
328 0.18
329 0.15
330 0.11
331 0.1
332 0.1
333 0.09
334 0.09
335 0.08
336 0.08
337 0.07
338 0.07
339 0.08
340 0.07
341 0.08
342 0.08
343 0.08
344 0.08
345 0.08
346 0.07
347 0.06
348 0.06
349 0.07
350 0.07
351 0.09
352 0.09
353 0.09
354 0.09
355 0.11
356 0.11
357 0.1
358 0.12
359 0.1
360 0.11
361 0.11
362 0.12
363 0.1
364 0.1
365 0.09
366 0.06
367 0.06
368 0.06
369 0.06
370 0.05
371 0.05
372 0.05
373 0.04
374 0.06
375 0.06
376 0.06
377 0.07
378 0.08
379 0.1
380 0.12
381 0.12
382 0.12
383 0.12
384 0.14
385 0.17
386 0.16
387 0.15
388 0.14
389 0.2
390 0.25
391 0.28
392 0.26
393 0.22
394 0.22
395 0.23
396 0.23
397 0.19
398 0.2
399 0.17
400 0.18
401 0.19
402 0.18
403 0.18
404 0.17
405 0.14
406 0.08
407 0.1
408 0.11
409 0.11
410 0.11
411 0.12
412 0.14
413 0.21
414 0.26
415 0.25
416 0.24
417 0.22
418 0.22
419 0.21
420 0.2
421 0.17
422 0.13
423 0.11
424 0.11
425 0.12
426 0.11
427 0.11
428 0.1
429 0.05
430 0.05
431 0.06
432 0.07
433 0.07
434 0.08
435 0.12
436 0.17
437 0.21
438 0.22
439 0.27
440 0.33
441 0.38
442 0.42
443 0.4
444 0.38
445 0.38
446 0.42
447 0.37
448 0.32
449 0.27
450 0.22
451 0.21
452 0.19
453 0.14
454 0.11
455 0.11
456 0.12
457 0.13
458 0.14
459 0.15
460 0.18
461 0.19
462 0.21
463 0.24
464 0.22
465 0.2
466 0.2
467 0.21
468 0.2
469 0.2
470 0.18
471 0.2
472 0.23
473 0.25
474 0.28
475 0.27
476 0.26
477 0.28
478 0.33
479 0.33
480 0.35
481 0.39
482 0.47
483 0.52
484 0.52
485 0.51
486 0.47
487 0.42
488 0.4
489 0.37
490 0.32
491 0.34
492 0.38
493 0.39
494 0.4
495 0.4
496 0.39
497 0.4
498 0.39
499 0.33
500 0.29
501 0.27
502 0.27
503 0.33
504 0.32
505 0.27
506 0.24
507 0.3
508 0.33
509 0.41
510 0.48
511 0.47
512 0.51
513 0.58
514 0.62
515 0.64
516 0.66
517 0.64
518 0.58
519 0.55
520 0.53
521 0.51
522 0.45
523 0.38
524 0.36
525 0.34
526 0.37
527 0.4
528 0.42
529 0.41
530 0.5
531 0.55
532 0.55
533 0.54
534 0.5
535 0.46
536 0.43
537 0.41
538 0.32
539 0.27
540 0.22
541 0.2
542 0.19
543 0.16
544 0.16
545 0.14
546 0.2
547 0.23
548 0.31
549 0.39
550 0.42
551 0.48
552 0.56
553 0.61
554 0.63
555 0.66
556 0.62
557 0.6
558 0.56
559 0.53
560 0.46
561 0.4
562 0.32
563 0.3
564 0.26
565 0.18
566 0.18
567 0.14
568 0.13
569 0.16
570 0.17
571 0.14
572 0.16
573 0.16
574 0.18
575 0.19
576 0.18
577 0.18
578 0.19
579 0.18
580 0.19
581 0.19
582 0.17
583 0.16
584 0.15
585 0.12
586 0.09
587 0.08
588 0.06
589 0.05
590 0.05
591 0.05
592 0.07
593 0.08
594 0.08
595 0.09
596 0.14
597 0.15
598 0.16
599 0.18
600 0.17
601 0.19
602 0.23
603 0.28
604 0.27
605 0.26
606 0.25
607 0.24
608 0.24
609 0.22
610 0.19
611 0.14
612 0.1
613 0.1
614 0.1
615 0.1
616 0.1
617 0.09
618 0.08
619 0.07
620 0.07
621 0.06
622 0.07
623 0.12
624 0.13
625 0.17
626 0.2
627 0.22
628 0.23
629 0.24
630 0.26
631 0.22
632 0.23
633 0.21
634 0.19
635 0.17
636 0.17
637 0.17
638 0.16
639 0.14
640 0.13
641 0.13
642 0.13
643 0.13
644 0.12
645 0.14
646 0.12
647 0.12
648 0.12
649 0.12
650 0.12
651 0.12
652 0.13
653 0.1
654 0.14
655 0.21
656 0.24
657 0.31
658 0.4
659 0.45
660 0.45
661 0.5
662 0.52
663 0.53