Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q04930

Protein Details
Accession Q04930    Localization Confidence High Confidence Score 20.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
5-32APVNSTVRRKPHSPNKKKPKETGTAASFHydrophilic
67-97YISAKRLKPESSNRQKKKNSYKYSREENTNEHydrophilic
351-372DESLPTPDRKRKKIGHKACEILHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
12-24RRKPHSPNKKKPK
360-363KRKK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 10.5, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018837  TF_CRF1/IFH1  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0003714  F:transcription corepressor activity  
GO:0010688  P:negative regulation of ribosomal protein gene transcription by RNA polymerase II  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG sce:YDR223W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10380  CRF1  
Amino Acid Sequences MLLSAPVNSTVRRKPHSPNKKKPKETGTAASFSSSSSTVVLSSNNDGSFDALWDPSISKASDFESSYISAKRLKPESSNRQKKKNSYKYSREENTNEVEEKTSLGSSSKTEADNIFNDQLTSAGNTTYVSNKRDVNFGANSAVVLLGLPTSKSESHRQYHSPSASTTNEDEEDIGVDILVDNHIDSCETVSINNNRGITHQYPETESDVDFDEAVILTPMDGTDKGVKNPRPLEKKYSSSCFEDRTPLNLDDGHFSECNHFSTLDVSSFFHLNEHVHKIDEVELDGPDRTFSLDNVAINTRKKDIDCLYNSSREDLSNLTCSSEGPRNDSYDSDYNIDEVTYRDDESTDEDESLPTPDRKRKKIGHKACEILDSKRIGIKVPKLYVWSLSDKPFSVIDGLCTKSLYPLSDDINTPESLSSCSSSVSSRENQKGDATFDNDAMIADLLNIGGLEVEKASNGHIELIGE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.65
3 0.73
4 0.78
5 0.82
6 0.85
7 0.9
8 0.93
9 0.92
10 0.9
11 0.88
12 0.85
13 0.83
14 0.78
15 0.7
16 0.62
17 0.54
18 0.44
19 0.35
20 0.3
21 0.2
22 0.15
23 0.12
24 0.12
25 0.11
26 0.12
27 0.13
28 0.13
29 0.16
30 0.19
31 0.19
32 0.19
33 0.18
34 0.19
35 0.17
36 0.16
37 0.14
38 0.1
39 0.11
40 0.11
41 0.11
42 0.11
43 0.14
44 0.13
45 0.12
46 0.13
47 0.15
48 0.19
49 0.19
50 0.19
51 0.19
52 0.2
53 0.22
54 0.23
55 0.22
56 0.25
57 0.27
58 0.33
59 0.36
60 0.38
61 0.44
62 0.53
63 0.62
64 0.67
65 0.75
66 0.75
67 0.81
68 0.85
69 0.87
70 0.88
71 0.87
72 0.87
73 0.86
74 0.89
75 0.87
76 0.89
77 0.85
78 0.82
79 0.74
80 0.68
81 0.62
82 0.56
83 0.49
84 0.39
85 0.34
86 0.27
87 0.24
88 0.2
89 0.15
90 0.11
91 0.11
92 0.11
93 0.11
94 0.14
95 0.16
96 0.15
97 0.17
98 0.18
99 0.21
100 0.21
101 0.24
102 0.23
103 0.2
104 0.19
105 0.17
106 0.16
107 0.13
108 0.12
109 0.08
110 0.07
111 0.07
112 0.07
113 0.08
114 0.15
115 0.19
116 0.2
117 0.22
118 0.26
119 0.27
120 0.3
121 0.3
122 0.28
123 0.25
124 0.24
125 0.23
126 0.18
127 0.17
128 0.14
129 0.12
130 0.07
131 0.06
132 0.04
133 0.03
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.07
138 0.09
139 0.12
140 0.2
141 0.26
142 0.31
143 0.36
144 0.39
145 0.41
146 0.47
147 0.46
148 0.41
149 0.35
150 0.36
151 0.33
152 0.32
153 0.28
154 0.22
155 0.2
156 0.19
157 0.17
158 0.12
159 0.12
160 0.09
161 0.08
162 0.05
163 0.04
164 0.04
165 0.04
166 0.04
167 0.03
168 0.03
169 0.03
170 0.03
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.05
175 0.05
176 0.06
177 0.11
178 0.15
179 0.17
180 0.2
181 0.2
182 0.19
183 0.2
184 0.25
185 0.21
186 0.21
187 0.19
188 0.18
189 0.18
190 0.2
191 0.21
192 0.17
193 0.15
194 0.14
195 0.13
196 0.13
197 0.11
198 0.09
199 0.07
200 0.06
201 0.06
202 0.05
203 0.03
204 0.03
205 0.03
206 0.03
207 0.04
208 0.04
209 0.05
210 0.11
211 0.12
212 0.15
213 0.22
214 0.24
215 0.29
216 0.35
217 0.41
218 0.43
219 0.45
220 0.51
221 0.49
222 0.53
223 0.52
224 0.51
225 0.46
226 0.44
227 0.43
228 0.38
229 0.33
230 0.32
231 0.29
232 0.27
233 0.28
234 0.23
235 0.22
236 0.2
237 0.2
238 0.17
239 0.18
240 0.17
241 0.13
242 0.13
243 0.15
244 0.15
245 0.16
246 0.14
247 0.13
248 0.11
249 0.12
250 0.13
251 0.11
252 0.11
253 0.1
254 0.1
255 0.11
256 0.1
257 0.09
258 0.09
259 0.09
260 0.12
261 0.15
262 0.15
263 0.15
264 0.15
265 0.15
266 0.17
267 0.16
268 0.13
269 0.1
270 0.09
271 0.1
272 0.1
273 0.09
274 0.07
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.07
279 0.1
280 0.12
281 0.12
282 0.14
283 0.17
284 0.19
285 0.2
286 0.22
287 0.2
288 0.2
289 0.2
290 0.24
291 0.24
292 0.3
293 0.31
294 0.37
295 0.38
296 0.42
297 0.42
298 0.38
299 0.36
300 0.27
301 0.25
302 0.2
303 0.19
304 0.17
305 0.17
306 0.16
307 0.15
308 0.15
309 0.18
310 0.22
311 0.2
312 0.22
313 0.24
314 0.25
315 0.26
316 0.27
317 0.29
318 0.27
319 0.28
320 0.25
321 0.23
322 0.21
323 0.19
324 0.19
325 0.13
326 0.1
327 0.12
328 0.11
329 0.12
330 0.11
331 0.11
332 0.12
333 0.16
334 0.18
335 0.15
336 0.15
337 0.14
338 0.15
339 0.15
340 0.17
341 0.16
342 0.17
343 0.22
344 0.3
345 0.38
346 0.44
347 0.53
348 0.6
349 0.68
350 0.75
351 0.8
352 0.81
353 0.81
354 0.79
355 0.72
356 0.7
357 0.61
358 0.53
359 0.48
360 0.4
361 0.33
362 0.31
363 0.3
364 0.26
365 0.3
366 0.35
367 0.37
368 0.38
369 0.39
370 0.39
371 0.4
372 0.4
373 0.38
374 0.36
375 0.32
376 0.33
377 0.34
378 0.31
379 0.32
380 0.28
381 0.25
382 0.22
383 0.18
384 0.18
385 0.2
386 0.22
387 0.2
388 0.2
389 0.19
390 0.2
391 0.22
392 0.19
393 0.18
394 0.19
395 0.22
396 0.25
397 0.26
398 0.25
399 0.26
400 0.25
401 0.22
402 0.2
403 0.17
404 0.17
405 0.18
406 0.16
407 0.13
408 0.14
409 0.15
410 0.16
411 0.18
412 0.22
413 0.26
414 0.34
415 0.41
416 0.42
417 0.43
418 0.46
419 0.46
420 0.45
421 0.43
422 0.38
423 0.32
424 0.31
425 0.29
426 0.24
427 0.21
428 0.18
429 0.12
430 0.08
431 0.06
432 0.06
433 0.05
434 0.05
435 0.05
436 0.04
437 0.04
438 0.04
439 0.05
440 0.05
441 0.06
442 0.06
443 0.07
444 0.08
445 0.1
446 0.1
447 0.12