Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0A1TFU5

Protein Details
Accession A0A0A1TFU5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
277-304VEGRQKANRPPGKRRRRRKPSETPIVETBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
280-296RQKANRPPGKRRRRRKP
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 10, mito 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014144  LigD_PE_domain  
Pfam View protein in Pfam  
PF13298  LigD_N  
Amino Acid Sequences MASRKRPPDFIPNPFIKKRNLNWSLQALPATPASTNDATGSPPHAPINPDGIKPQGGRSAPASEPRPTEASTAAIESGAIIVEDHALRFSELLQKASIPHLETPDIPRLSIPDYKRLYESNAGSKHGAHFVIHQHDHPVAGTHYDLRLQINETSSVSWAIMYGVPGNPNSTRLNRNATETRIHSLWNHLIETASRETGSLLIWDTGTYQILPRRSKYAPAIDPSSQQSSQSSHHEPETQQQLLHDAFQNRKIRLQLHGTRLPEPYVLYLRLTKSEDVEGRQKANRPPGKRRRRRKPSETPIVETDLSSDDQEDGTDDDDDDDGDIVTTDQNEASESMTEVSADDRELRELEDQQVRLTNAYPGAINSIGSIHQRRWYLSMERIACGLIDRRDGRRVPWHLPKTSKETGVTSNPRASLPFYVHGRDKECSIITGRLGADILRDEGVQGFVPRMGWSAVLE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.73
2 0.73
3 0.69
4 0.7
5 0.68
6 0.7
7 0.68
8 0.65
9 0.64
10 0.67
11 0.62
12 0.55
13 0.49
14 0.39
15 0.35
16 0.3
17 0.25
18 0.18
19 0.17
20 0.2
21 0.19
22 0.19
23 0.18
24 0.18
25 0.18
26 0.19
27 0.21
28 0.17
29 0.19
30 0.2
31 0.21
32 0.23
33 0.24
34 0.32
35 0.31
36 0.31
37 0.3
38 0.31
39 0.33
40 0.31
41 0.32
42 0.3
43 0.28
44 0.29
45 0.3
46 0.33
47 0.31
48 0.37
49 0.38
50 0.35
51 0.36
52 0.38
53 0.37
54 0.33
55 0.33
56 0.26
57 0.25
58 0.21
59 0.2
60 0.17
61 0.13
62 0.12
63 0.1
64 0.09
65 0.06
66 0.05
67 0.04
68 0.04
69 0.06
70 0.06
71 0.07
72 0.07
73 0.07
74 0.08
75 0.08
76 0.09
77 0.16
78 0.17
79 0.19
80 0.19
81 0.19
82 0.2
83 0.23
84 0.24
85 0.18
86 0.19
87 0.2
88 0.21
89 0.23
90 0.26
91 0.31
92 0.29
93 0.26
94 0.24
95 0.23
96 0.26
97 0.31
98 0.28
99 0.29
100 0.32
101 0.33
102 0.35
103 0.35
104 0.35
105 0.35
106 0.37
107 0.36
108 0.36
109 0.36
110 0.35
111 0.35
112 0.32
113 0.28
114 0.26
115 0.17
116 0.18
117 0.21
118 0.27
119 0.28
120 0.26
121 0.25
122 0.25
123 0.25
124 0.22
125 0.18
126 0.11
127 0.11
128 0.12
129 0.11
130 0.11
131 0.12
132 0.13
133 0.12
134 0.13
135 0.14
136 0.15
137 0.15
138 0.16
139 0.15
140 0.15
141 0.14
142 0.13
143 0.11
144 0.09
145 0.08
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.07
150 0.08
151 0.09
152 0.09
153 0.11
154 0.11
155 0.14
156 0.16
157 0.19
158 0.22
159 0.24
160 0.31
161 0.29
162 0.35
163 0.36
164 0.35
165 0.36
166 0.34
167 0.34
168 0.28
169 0.28
170 0.22
171 0.23
172 0.24
173 0.21
174 0.19
175 0.16
176 0.16
177 0.15
178 0.18
179 0.15
180 0.12
181 0.1
182 0.1
183 0.1
184 0.1
185 0.1
186 0.07
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.06
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.06
195 0.07
196 0.1
197 0.16
198 0.18
199 0.19
200 0.23
201 0.24
202 0.28
203 0.3
204 0.34
205 0.32
206 0.33
207 0.36
208 0.32
209 0.34
210 0.32
211 0.32
212 0.25
213 0.22
214 0.19
215 0.18
216 0.19
217 0.22
218 0.23
219 0.2
220 0.21
221 0.23
222 0.23
223 0.26
224 0.29
225 0.24
226 0.21
227 0.2
228 0.22
229 0.19
230 0.2
231 0.18
232 0.15
233 0.16
234 0.24
235 0.29
236 0.27
237 0.29
238 0.3
239 0.28
240 0.3
241 0.37
242 0.36
243 0.38
244 0.43
245 0.42
246 0.42
247 0.41
248 0.38
249 0.3
250 0.23
251 0.18
252 0.16
253 0.15
254 0.13
255 0.15
256 0.15
257 0.17
258 0.19
259 0.17
260 0.16
261 0.2
262 0.2
263 0.21
264 0.26
265 0.26
266 0.27
267 0.29
268 0.33
269 0.34
270 0.42
271 0.46
272 0.46
273 0.55
274 0.63
275 0.72
276 0.77
277 0.84
278 0.85
279 0.89
280 0.93
281 0.92
282 0.93
283 0.92
284 0.93
285 0.87
286 0.8
287 0.71
288 0.65
289 0.54
290 0.42
291 0.33
292 0.24
293 0.2
294 0.15
295 0.13
296 0.09
297 0.09
298 0.09
299 0.08
300 0.07
301 0.07
302 0.07
303 0.07
304 0.07
305 0.07
306 0.07
307 0.07
308 0.06
309 0.05
310 0.05
311 0.05
312 0.04
313 0.05
314 0.05
315 0.05
316 0.05
317 0.05
318 0.06
319 0.06
320 0.07
321 0.07
322 0.07
323 0.08
324 0.08
325 0.08
326 0.07
327 0.08
328 0.07
329 0.07
330 0.09
331 0.09
332 0.1
333 0.11
334 0.12
335 0.14
336 0.15
337 0.2
338 0.24
339 0.24
340 0.23
341 0.27
342 0.26
343 0.24
344 0.23
345 0.2
346 0.15
347 0.15
348 0.14
349 0.11
350 0.13
351 0.13
352 0.12
353 0.1
354 0.1
355 0.11
356 0.15
357 0.18
358 0.17
359 0.22
360 0.24
361 0.25
362 0.27
363 0.31
364 0.31
365 0.35
366 0.42
367 0.39
368 0.37
369 0.36
370 0.33
371 0.28
372 0.25
373 0.24
374 0.18
375 0.23
376 0.26
377 0.3
378 0.37
379 0.38
380 0.4
381 0.45
382 0.49
383 0.5
384 0.57
385 0.61
386 0.62
387 0.67
388 0.68
389 0.67
390 0.66
391 0.62
392 0.54
393 0.5
394 0.49
395 0.52
396 0.53
397 0.5
398 0.49
399 0.46
400 0.44
401 0.41
402 0.38
403 0.32
404 0.3
405 0.32
406 0.31
407 0.35
408 0.4
409 0.43
410 0.44
411 0.42
412 0.39
413 0.37
414 0.34
415 0.31
416 0.3
417 0.29
418 0.25
419 0.28
420 0.27
421 0.22
422 0.22
423 0.19
424 0.17
425 0.15
426 0.16
427 0.12
428 0.12
429 0.12
430 0.12
431 0.14
432 0.13
433 0.12
434 0.12
435 0.12
436 0.13
437 0.13
438 0.14
439 0.13