Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P40971

Protein Details
Accession P40971    Localization Confidence High Confidence Score 20.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
141-179TVTDKKGNTVKRKYSRNGCSECKRRRMKCDETKPTCWQCHydrophilic
186-211CVYVLNPKNKKRRTSNAQRVKEFRKHHydrophilic
218-247DHNNARKRQHSSCKAEKKKKVRQNLSEDTTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
195-198KKRR
234-236KKK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021858  Fun_TF  
IPR036864  Zn2-C6_fun-type_DNA-bd_sf  
IPR001138  Zn2Cys6_DnaBD  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0000978  F:RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding  
GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0000976  F:transcription cis-regulatory region binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0009085  P:lysine biosynthetic process  
GO:2001196  P:positive regulation of lysine biosynthetic process via alpha-aminoadipate and saccharopine  
GO:0045944  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG sce:YDR034C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF11951  Fungal_trans_2  
PF00172  Zn_clus  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00463  ZN2_CY6_FUNGAL_1  
PS50048  ZN2_CY6_FUNGAL_2  
CDD cd00067  GAL4  
Amino Acid Sequences MFESVNLDENSPEDRELAKVLSPPGSYLSPASLDSGSSFTNSGTSTSCFEPKNNLPSLSFLNARAGSLGGIFNHKQMTSPSNSNIGGENVESTTSSNDGSNENAGHPTTSEQDQNADHPTISQADDNGHSSLTPNPAVTSTVTDKKGNTVKRKYSRNGCSECKRRRMKCDETKPTCWQCARLNRQCVYVLNPKNKKRRTSNAQRVKEFRKHSTSLDNDHNNARKRQHSSCKAEKKKKVRQNLSEDTTDPKPITDNGKNVPLDEIESLEIPNLDLTTTMNGYDVNLLMQNLNDMVNMKLHDSYLLNEELKGLDLPDLDIPELLPASNVNSSVPISFLVNNVITFNTKLSSFKLGGIHDKYLKIFYYDCLDSIAPFFQNQGNPLRDILLSFAKNEAYLLSSILATGASIAYRKSNNLEDERNYCAYLSHCLSLLGEQFKNESNVLNRIEPIILTVIMLAWDCIYSMNSQWRSHLKGVTDLFKKINAGNSSKVLNVAKCWFKVMETFASISTVFGGSLIDNNDLDAIFDPYDYQYVDSLKFLNIMTPLNEFNLLRGHKEDFDLVIKEVFKSLNTIRSTEKNYFSKEEGLFTKKLDYLLLSSQTSSEKSKDQISYFNTQKILVEIDKQLDYEFIDKSGIIPSDNQSHPRISNIHDNAIDMVTLKNGEEVAISWYDISHQTQVLSFLLIVLLKLLGMPKESSTIQQVVKKIMSFFKFLDSDSPPQNSRTCYSNFAVLIAGLNAMDEETRAIVKRYYKINGGKFQKLTEHNLNRLEKVWYGKNQNYRLEEQDVLTW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.16
3 0.18
4 0.18
5 0.17
6 0.19
7 0.22
8 0.25
9 0.24
10 0.24
11 0.25
12 0.25
13 0.23
14 0.21
15 0.2
16 0.18
17 0.18
18 0.2
19 0.16
20 0.15
21 0.15
22 0.16
23 0.14
24 0.14
25 0.14
26 0.11
27 0.13
28 0.13
29 0.13
30 0.13
31 0.15
32 0.17
33 0.2
34 0.26
35 0.25
36 0.27
37 0.34
38 0.38
39 0.44
40 0.46
41 0.45
42 0.4
43 0.42
44 0.45
45 0.41
46 0.36
47 0.3
48 0.31
49 0.29
50 0.28
51 0.25
52 0.21
53 0.16
54 0.16
55 0.16
56 0.1
57 0.16
58 0.16
59 0.18
60 0.2
61 0.2
62 0.2
63 0.22
64 0.26
65 0.27
66 0.32
67 0.32
68 0.35
69 0.36
70 0.35
71 0.33
72 0.29
73 0.24
74 0.19
75 0.18
76 0.12
77 0.12
78 0.12
79 0.11
80 0.11
81 0.11
82 0.11
83 0.11
84 0.12
85 0.12
86 0.14
87 0.16
88 0.16
89 0.16
90 0.17
91 0.16
92 0.16
93 0.15
94 0.15
95 0.16
96 0.17
97 0.19
98 0.18
99 0.2
100 0.21
101 0.23
102 0.26
103 0.23
104 0.2
105 0.18
106 0.19
107 0.18
108 0.18
109 0.17
110 0.13
111 0.15
112 0.17
113 0.19
114 0.17
115 0.15
116 0.14
117 0.14
118 0.17
119 0.18
120 0.17
121 0.15
122 0.15
123 0.16
124 0.18
125 0.17
126 0.19
127 0.21
128 0.26
129 0.29
130 0.3
131 0.3
132 0.36
133 0.42
134 0.46
135 0.51
136 0.53
137 0.61
138 0.68
139 0.77
140 0.79
141 0.82
142 0.82
143 0.82
144 0.8
145 0.78
146 0.8
147 0.81
148 0.81
149 0.81
150 0.82
151 0.79
152 0.82
153 0.82
154 0.83
155 0.84
156 0.86
157 0.87
158 0.84
159 0.84
160 0.84
161 0.79
162 0.76
163 0.66
164 0.61
165 0.58
166 0.6
167 0.64
168 0.64
169 0.67
170 0.61
171 0.62
172 0.59
173 0.52
174 0.48
175 0.47
176 0.46
177 0.48
178 0.56
179 0.61
180 0.69
181 0.75
182 0.77
183 0.76
184 0.79
185 0.79
186 0.82
187 0.85
188 0.85
189 0.87
190 0.85
191 0.83
192 0.81
193 0.78
194 0.73
195 0.69
196 0.65
197 0.6
198 0.56
199 0.57
200 0.54
201 0.51
202 0.54
203 0.51
204 0.45
205 0.49
206 0.53
207 0.48
208 0.49
209 0.49
210 0.47
211 0.49
212 0.56
213 0.6
214 0.63
215 0.68
216 0.73
217 0.79
218 0.83
219 0.87
220 0.87
221 0.87
222 0.87
223 0.87
224 0.87
225 0.86
226 0.85
227 0.85
228 0.84
229 0.78
230 0.7
231 0.62
232 0.55
233 0.47
234 0.39
235 0.3
236 0.21
237 0.18
238 0.18
239 0.25
240 0.25
241 0.28
242 0.28
243 0.35
244 0.35
245 0.34
246 0.32
247 0.25
248 0.22
249 0.18
250 0.16
251 0.1
252 0.1
253 0.09
254 0.08
255 0.08
256 0.06
257 0.06
258 0.05
259 0.04
260 0.04
261 0.05
262 0.06
263 0.06
264 0.06
265 0.06
266 0.06
267 0.07
268 0.07
269 0.07
270 0.06
271 0.06
272 0.06
273 0.06
274 0.06
275 0.06
276 0.06
277 0.06
278 0.05
279 0.06
280 0.06
281 0.08
282 0.08
283 0.09
284 0.09
285 0.09
286 0.1
287 0.09
288 0.1
289 0.11
290 0.13
291 0.13
292 0.12
293 0.13
294 0.11
295 0.11
296 0.1
297 0.07
298 0.06
299 0.06
300 0.07
301 0.07
302 0.08
303 0.07
304 0.07
305 0.06
306 0.06
307 0.06
308 0.05
309 0.04
310 0.04
311 0.05
312 0.06
313 0.06
314 0.06
315 0.07
316 0.08
317 0.08
318 0.08
319 0.07
320 0.07
321 0.07
322 0.08
323 0.09
324 0.09
325 0.09
326 0.09
327 0.09
328 0.09
329 0.09
330 0.09
331 0.07
332 0.07
333 0.08
334 0.09
335 0.13
336 0.13
337 0.15
338 0.18
339 0.18
340 0.23
341 0.25
342 0.25
343 0.24
344 0.24
345 0.22
346 0.2
347 0.19
348 0.15
349 0.13
350 0.11
351 0.14
352 0.13
353 0.13
354 0.13
355 0.13
356 0.12
357 0.12
358 0.12
359 0.08
360 0.08
361 0.09
362 0.09
363 0.1
364 0.12
365 0.16
366 0.17
367 0.17
368 0.17
369 0.17
370 0.15
371 0.14
372 0.14
373 0.13
374 0.12
375 0.11
376 0.12
377 0.11
378 0.11
379 0.11
380 0.09
381 0.06
382 0.06
383 0.06
384 0.05
385 0.05
386 0.05
387 0.05
388 0.05
389 0.03
390 0.03
391 0.03
392 0.03
393 0.03
394 0.04
395 0.06
396 0.07
397 0.08
398 0.1
399 0.14
400 0.17
401 0.21
402 0.24
403 0.25
404 0.27
405 0.3
406 0.28
407 0.25
408 0.21
409 0.18
410 0.16
411 0.17
412 0.15
413 0.12
414 0.11
415 0.11
416 0.11
417 0.12
418 0.13
419 0.13
420 0.12
421 0.11
422 0.12
423 0.13
424 0.15
425 0.14
426 0.13
427 0.11
428 0.16
429 0.18
430 0.17
431 0.16
432 0.16
433 0.15
434 0.13
435 0.12
436 0.08
437 0.06
438 0.06
439 0.05
440 0.05
441 0.05
442 0.05
443 0.04
444 0.03
445 0.03
446 0.03
447 0.04
448 0.04
449 0.05
450 0.07
451 0.14
452 0.18
453 0.18
454 0.21
455 0.25
456 0.29
457 0.31
458 0.32
459 0.25
460 0.28
461 0.3
462 0.34
463 0.33
464 0.3
465 0.28
466 0.26
467 0.27
468 0.22
469 0.26
470 0.22
471 0.23
472 0.23
473 0.24
474 0.25
475 0.23
476 0.25
477 0.21
478 0.17
479 0.17
480 0.2
481 0.21
482 0.2
483 0.22
484 0.19
485 0.18
486 0.2
487 0.2
488 0.18
489 0.16
490 0.17
491 0.15
492 0.16
493 0.16
494 0.13
495 0.11
496 0.08
497 0.06
498 0.06
499 0.06
500 0.05
501 0.06
502 0.08
503 0.08
504 0.08
505 0.08
506 0.08
507 0.08
508 0.08
509 0.07
510 0.07
511 0.06
512 0.06
513 0.07
514 0.07
515 0.08
516 0.08
517 0.08
518 0.08
519 0.09
520 0.1
521 0.1
522 0.11
523 0.1
524 0.12
525 0.11
526 0.11
527 0.11
528 0.11
529 0.12
530 0.13
531 0.13
532 0.12
533 0.14
534 0.12
535 0.12
536 0.17
537 0.17
538 0.16
539 0.18
540 0.2
541 0.19
542 0.2
543 0.2
544 0.15
545 0.18
546 0.18
547 0.16
548 0.16
549 0.16
550 0.15
551 0.15
552 0.14
553 0.11
554 0.14
555 0.15
556 0.2
557 0.21
558 0.23
559 0.25
560 0.31
561 0.36
562 0.37
563 0.43
564 0.4
565 0.43
566 0.44
567 0.43
568 0.44
569 0.39
570 0.38
571 0.35
572 0.35
573 0.32
574 0.29
575 0.3
576 0.25
577 0.25
578 0.21
579 0.18
580 0.16
581 0.19
582 0.22
583 0.19
584 0.17
585 0.18
586 0.19
587 0.2
588 0.2
589 0.19
590 0.18
591 0.2
592 0.26
593 0.29
594 0.29
595 0.34
596 0.36
597 0.42
598 0.42
599 0.44
600 0.39
601 0.35
602 0.33
603 0.28
604 0.27
605 0.19
606 0.2
607 0.18
608 0.2
609 0.2
610 0.2
611 0.18
612 0.16
613 0.16
614 0.14
615 0.12
616 0.1
617 0.1
618 0.1
619 0.11
620 0.14
621 0.13
622 0.12
623 0.13
624 0.16
625 0.23
626 0.25
627 0.28
628 0.27
629 0.3
630 0.3
631 0.32
632 0.31
633 0.28
634 0.36
635 0.35
636 0.38
637 0.35
638 0.35
639 0.32
640 0.3
641 0.25
642 0.16
643 0.13
644 0.09
645 0.09
646 0.08
647 0.08
648 0.07
649 0.07
650 0.07
651 0.07
652 0.09
653 0.1
654 0.1
655 0.09
656 0.09
657 0.11
658 0.13
659 0.14
660 0.13
661 0.14
662 0.14
663 0.15
664 0.17
665 0.16
666 0.14
667 0.12
668 0.09
669 0.1
670 0.09
671 0.08
672 0.06
673 0.06
674 0.05
675 0.06
676 0.07
677 0.07
678 0.09
679 0.1
680 0.11
681 0.15
682 0.16
683 0.17
684 0.21
685 0.25
686 0.28
687 0.32
688 0.33
689 0.35
690 0.37
691 0.36
692 0.35
693 0.37
694 0.35
695 0.34
696 0.32
697 0.33
698 0.32
699 0.31
700 0.34
701 0.31
702 0.34
703 0.35
704 0.39
705 0.35
706 0.37
707 0.41
708 0.38
709 0.36
710 0.36
711 0.34
712 0.35
713 0.35
714 0.38
715 0.34
716 0.31
717 0.29
718 0.23
719 0.21
720 0.15
721 0.14
722 0.07
723 0.07
724 0.06
725 0.06
726 0.05
727 0.05
728 0.05
729 0.06
730 0.08
731 0.1
732 0.12
733 0.16
734 0.22
735 0.28
736 0.34
737 0.38
738 0.45
739 0.52
740 0.59
741 0.65
742 0.66
743 0.69
744 0.64
745 0.62
746 0.62
747 0.58
748 0.58
749 0.59
750 0.6
751 0.58
752 0.64
753 0.65
754 0.58
755 0.56
756 0.5
757 0.43
758 0.42
759 0.43
760 0.43
761 0.48
762 0.53
763 0.61
764 0.65
765 0.69
766 0.68
767 0.65
768 0.63
769 0.59
770 0.54