Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0A1TMB4

Protein Details
Accession A0A0A1TMB4    Localization Confidence High Confidence Score 24.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
125-151LTNPYGDKKGPTKRERRVRNATHCLHVHydrophilic
202-221SPKAYKRKGVGGPKKVKNEDBasic
377-396TQEKSQKKLKAKGRKGKGLFBasic
935-981SEPVPSVKRTPKAPKSTPRAKKMKAVVTPPSTATRRSTRQRQEVSYEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
203-217PKAYKRKGVGGPKKV
366-393PKKEKKATTKSTQEKSQKKLKAKGRKGK
626-631KKFKSK
803-819IRKEDEKRRKTALGKWR
942-958KRTPKAPKSTPRAKKMK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 4, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018327  BHD_2  
IPR004583  DNA_repair_Rad4  
IPR038765  Papain-like_cys_pep_sf  
IPR018325  Rad4/PNGase_transGLS-fold  
IPR018326  Rad4_beta-hairpin_dom1  
IPR018328  Rad4_beta-hairpin_dom3  
IPR042488  Rad4_BHD3_sf  
IPR036985  Transglutaminase-like_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF10403  BHD_1  
PF10404  BHD_2  
PF10405  BHD_3  
PF03835  Rad4  
Amino Acid Sequences MPPLVPRKRLHEDAQNGKTSAPSKTTVPRKATLYDDLDSTATPTSAKTVASIFNSLDDSDDSSLSSLSDEEFEDVPIAKKPKRDEESDDDDIEFEDVAAPAAPLPDAPVDGDLELTLTRDTRISLTNPYGDKKGPTKRERRVRNATHCLHVLTLLWHNAVRNSWLCDSEAQAIMLSHMPPRLWEYFDRWRRNSGLIPGESPSPKAYKRKGVGGPKKVKNEDRDWGEGAMRLEEGAVDMSHGDPLFKLMQPLMSWWKQRFRVTIPGLRKQGYMSLERLDRIVKAHAANPDDPAVFGERISNLDEFRAAALKCEGSRDIGAQLFTALLRGLGIEARMVSNLQCLGFGWSKVEEADEEAQDPKSAQSTPKKEKKATTKSTQEKSQKKLKAKGRKGKGLFSGSEESELELEHSDSDDDSVIEVKVEMKRPGGPKAAGKMMKKVDSDLVFPHYWTEVLSPVTKKYLSVDTTCNGVVATNRGLVEGFEPRGAKADKAHQMIAYVVAYSSDGSAKDVTVRYLRKQTMPGRTKGMRMPPEKLPVYNHHGKVKRYEQFDWFKAAMSGYTRGTKNLPITEIDELEDSTDLRPAQPEKKAIKEGEETLQYYKQSTEFALARHLKREEALKPGSVAVKKFKSKGKGGVVEEEDVYLRADVVNVKSAETWHKQGRAPIAGEQPLKQVPYRAATLNRKRELLEAEATTGRKVLQGLYSFDQTDWIIPDPIKDGVIPKNEYGNIDLFAEHMCPAGAVHVPFRGAVRICKKMQIDYAEAVVDFEFGHRMAVPVIQGVVIAEEYHDQLMEELQKAEAERIRKEDEKRRKTALGKWRKFMMGLRIVERIKQDYGHIEDVKVFGSSKRAPVEKTPVVHDEEMAGGFLPEGYEEEEENEVPVHKASTFFPVVAEDDDGDDDLIMEDHGHETTVEQQKVVAEEMDTTGSHEAEPESEPVPSVKRTPKAPKSTPRAKKMKAVVTPPSTATRRSTRQRQEVSYEIKDSDDEDEDL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.73
2 0.7
3 0.62
4 0.56
5 0.54
6 0.46
7 0.41
8 0.34
9 0.29
10 0.29
11 0.38
12 0.48
13 0.52
14 0.55
15 0.56
16 0.57
17 0.59
18 0.58
19 0.56
20 0.51
21 0.44
22 0.39
23 0.35
24 0.32
25 0.28
26 0.24
27 0.18
28 0.13
29 0.11
30 0.1
31 0.12
32 0.13
33 0.13
34 0.13
35 0.15
36 0.19
37 0.22
38 0.24
39 0.21
40 0.21
41 0.23
42 0.21
43 0.2
44 0.16
45 0.17
46 0.16
47 0.15
48 0.14
49 0.13
50 0.13
51 0.11
52 0.11
53 0.08
54 0.07
55 0.09
56 0.09
57 0.11
58 0.11
59 0.12
60 0.12
61 0.13
62 0.14
63 0.19
64 0.24
65 0.25
66 0.3
67 0.36
68 0.46
69 0.5
70 0.55
71 0.57
72 0.59
73 0.65
74 0.64
75 0.59
76 0.49
77 0.43
78 0.38
79 0.3
80 0.21
81 0.12
82 0.08
83 0.07
84 0.07
85 0.07
86 0.06
87 0.06
88 0.07
89 0.07
90 0.05
91 0.07
92 0.07
93 0.08
94 0.08
95 0.09
96 0.1
97 0.1
98 0.1
99 0.08
100 0.08
101 0.08
102 0.08
103 0.08
104 0.08
105 0.08
106 0.09
107 0.1
108 0.11
109 0.15
110 0.17
111 0.22
112 0.25
113 0.31
114 0.33
115 0.35
116 0.36
117 0.34
118 0.37
119 0.4
120 0.46
121 0.51
122 0.58
123 0.65
124 0.72
125 0.81
126 0.86
127 0.87
128 0.88
129 0.88
130 0.89
131 0.89
132 0.82
133 0.77
134 0.69
135 0.6
136 0.49
137 0.39
138 0.29
139 0.22
140 0.22
141 0.18
142 0.18
143 0.17
144 0.18
145 0.19
146 0.19
147 0.2
148 0.19
149 0.22
150 0.23
151 0.23
152 0.24
153 0.23
154 0.25
155 0.24
156 0.23
157 0.18
158 0.17
159 0.16
160 0.16
161 0.16
162 0.14
163 0.12
164 0.13
165 0.12
166 0.13
167 0.18
168 0.19
169 0.2
170 0.22
171 0.28
172 0.37
173 0.47
174 0.54
175 0.52
176 0.54
177 0.54
178 0.55
179 0.53
180 0.49
181 0.48
182 0.4
183 0.4
184 0.36
185 0.38
186 0.34
187 0.31
188 0.27
189 0.24
190 0.28
191 0.35
192 0.4
193 0.45
194 0.48
195 0.55
196 0.61
197 0.68
198 0.72
199 0.74
200 0.78
201 0.76
202 0.82
203 0.8
204 0.78
205 0.74
206 0.7
207 0.68
208 0.63
209 0.6
210 0.52
211 0.47
212 0.41
213 0.37
214 0.31
215 0.23
216 0.17
217 0.13
218 0.11
219 0.09
220 0.08
221 0.06
222 0.05
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.07
227 0.07
228 0.07
229 0.06
230 0.09
231 0.11
232 0.11
233 0.12
234 0.11
235 0.13
236 0.13
237 0.17
238 0.21
239 0.24
240 0.29
241 0.32
242 0.4
243 0.43
244 0.47
245 0.48
246 0.46
247 0.51
248 0.52
249 0.56
250 0.55
251 0.58
252 0.58
253 0.55
254 0.5
255 0.41
256 0.4
257 0.35
258 0.31
259 0.25
260 0.25
261 0.25
262 0.25
263 0.25
264 0.21
265 0.18
266 0.17
267 0.17
268 0.16
269 0.17
270 0.2
271 0.23
272 0.26
273 0.26
274 0.26
275 0.26
276 0.22
277 0.21
278 0.18
279 0.17
280 0.13
281 0.13
282 0.12
283 0.11
284 0.12
285 0.14
286 0.14
287 0.11
288 0.11
289 0.11
290 0.1
291 0.1
292 0.13
293 0.11
294 0.11
295 0.12
296 0.14
297 0.14
298 0.16
299 0.16
300 0.13
301 0.14
302 0.14
303 0.15
304 0.15
305 0.14
306 0.12
307 0.12
308 0.1
309 0.09
310 0.08
311 0.06
312 0.04
313 0.04
314 0.04
315 0.04
316 0.04
317 0.04
318 0.04
319 0.05
320 0.05
321 0.06
322 0.06
323 0.06
324 0.07
325 0.08
326 0.07
327 0.07
328 0.07
329 0.11
330 0.12
331 0.12
332 0.12
333 0.12
334 0.12
335 0.12
336 0.12
337 0.08
338 0.1
339 0.12
340 0.11
341 0.11
342 0.12
343 0.12
344 0.12
345 0.12
346 0.09
347 0.09
348 0.1
349 0.15
350 0.23
351 0.32
352 0.42
353 0.5
354 0.57
355 0.59
356 0.65
357 0.71
358 0.72
359 0.71
360 0.7
361 0.71
362 0.74
363 0.75
364 0.76
365 0.75
366 0.71
367 0.7
368 0.7
369 0.67
370 0.66
371 0.7
372 0.71
373 0.72
374 0.75
375 0.79
376 0.78
377 0.8
378 0.75
379 0.72
380 0.68
381 0.61
382 0.52
383 0.46
384 0.41
385 0.32
386 0.3
387 0.25
388 0.19
389 0.14
390 0.14
391 0.1
392 0.07
393 0.07
394 0.05
395 0.05
396 0.05
397 0.05
398 0.06
399 0.05
400 0.05
401 0.05
402 0.06
403 0.05
404 0.05
405 0.05
406 0.07
407 0.1
408 0.13
409 0.13
410 0.14
411 0.19
412 0.21
413 0.25
414 0.26
415 0.25
416 0.25
417 0.28
418 0.33
419 0.34
420 0.33
421 0.35
422 0.35
423 0.37
424 0.34
425 0.32
426 0.29
427 0.26
428 0.26
429 0.21
430 0.22
431 0.18
432 0.18
433 0.17
434 0.13
435 0.12
436 0.11
437 0.1
438 0.07
439 0.09
440 0.11
441 0.11
442 0.12
443 0.14
444 0.13
445 0.13
446 0.13
447 0.17
448 0.17
449 0.18
450 0.2
451 0.19
452 0.2
453 0.2
454 0.18
455 0.13
456 0.11
457 0.09
458 0.08
459 0.09
460 0.08
461 0.09
462 0.09
463 0.09
464 0.08
465 0.09
466 0.09
467 0.09
468 0.09
469 0.1
470 0.09
471 0.13
472 0.14
473 0.13
474 0.13
475 0.19
476 0.24
477 0.26
478 0.26
479 0.23
480 0.23
481 0.22
482 0.21
483 0.14
484 0.08
485 0.05
486 0.05
487 0.05
488 0.04
489 0.05
490 0.05
491 0.05
492 0.06
493 0.06
494 0.06
495 0.08
496 0.08
497 0.1
498 0.14
499 0.16
500 0.18
501 0.24
502 0.26
503 0.26
504 0.33
505 0.38
506 0.44
507 0.47
508 0.46
509 0.46
510 0.46
511 0.46
512 0.43
513 0.44
514 0.41
515 0.39
516 0.41
517 0.38
518 0.44
519 0.42
520 0.39
521 0.35
522 0.32
523 0.37
524 0.4
525 0.39
526 0.4
527 0.43
528 0.43
529 0.47
530 0.5
531 0.48
532 0.45
533 0.45
534 0.45
535 0.47
536 0.47
537 0.45
538 0.37
539 0.32
540 0.27
541 0.25
542 0.18
543 0.14
544 0.14
545 0.11
546 0.15
547 0.15
548 0.16
549 0.17
550 0.2
551 0.21
552 0.2
553 0.2
554 0.17
555 0.19
556 0.19
557 0.18
558 0.15
559 0.12
560 0.11
561 0.1
562 0.09
563 0.07
564 0.06
565 0.07
566 0.07
567 0.07
568 0.09
569 0.12
570 0.17
571 0.2
572 0.27
573 0.29
574 0.34
575 0.38
576 0.37
577 0.37
578 0.35
579 0.34
580 0.3
581 0.29
582 0.26
583 0.23
584 0.24
585 0.21
586 0.19
587 0.17
588 0.14
589 0.13
590 0.12
591 0.14
592 0.13
593 0.13
594 0.21
595 0.26
596 0.26
597 0.3
598 0.3
599 0.27
600 0.27
601 0.32
602 0.26
603 0.27
604 0.27
605 0.23
606 0.23
607 0.24
608 0.27
609 0.24
610 0.24
611 0.24
612 0.29
613 0.31
614 0.35
615 0.39
616 0.41
617 0.44
618 0.5
619 0.51
620 0.52
621 0.51
622 0.52
623 0.48
624 0.43
625 0.39
626 0.31
627 0.23
628 0.16
629 0.14
630 0.08
631 0.06
632 0.05
633 0.06
634 0.07
635 0.08
636 0.13
637 0.13
638 0.13
639 0.13
640 0.15
641 0.2
642 0.21
643 0.26
644 0.25
645 0.29
646 0.31
647 0.34
648 0.38
649 0.36
650 0.34
651 0.33
652 0.33
653 0.34
654 0.33
655 0.31
656 0.29
657 0.26
658 0.26
659 0.22
660 0.2
661 0.17
662 0.19
663 0.21
664 0.21
665 0.28
666 0.37
667 0.46
668 0.53
669 0.53
670 0.52
671 0.5
672 0.5
673 0.45
674 0.38
675 0.33
676 0.24
677 0.24
678 0.25
679 0.25
680 0.22
681 0.19
682 0.15
683 0.12
684 0.12
685 0.11
686 0.13
687 0.15
688 0.19
689 0.21
690 0.23
691 0.22
692 0.21
693 0.22
694 0.17
695 0.16
696 0.13
697 0.13
698 0.12
699 0.12
700 0.13
701 0.13
702 0.14
703 0.13
704 0.12
705 0.14
706 0.17
707 0.23
708 0.25
709 0.23
710 0.27
711 0.28
712 0.28
713 0.27
714 0.23
715 0.18
716 0.16
717 0.15
718 0.12
719 0.11
720 0.11
721 0.09
722 0.07
723 0.06
724 0.05
725 0.05
726 0.07
727 0.08
728 0.08
729 0.09
730 0.1
731 0.11
732 0.11
733 0.12
734 0.15
735 0.14
736 0.21
737 0.26
738 0.32
739 0.33
740 0.39
741 0.4
742 0.39
743 0.43
744 0.4
745 0.37
746 0.31
747 0.31
748 0.26
749 0.24
750 0.21
751 0.15
752 0.11
753 0.08
754 0.07
755 0.06
756 0.06
757 0.07
758 0.06
759 0.07
760 0.07
761 0.08
762 0.08
763 0.07
764 0.08
765 0.07
766 0.07
767 0.06
768 0.06
769 0.05
770 0.05
771 0.05
772 0.06
773 0.07
774 0.07
775 0.07
776 0.06
777 0.06
778 0.09
779 0.11
780 0.11
781 0.11
782 0.11
783 0.12
784 0.13
785 0.16
786 0.17
787 0.19
788 0.2
789 0.25
790 0.3
791 0.36
792 0.43
793 0.5
794 0.58
795 0.64
796 0.67
797 0.68
798 0.7
799 0.69
800 0.7
801 0.71
802 0.71
803 0.68
804 0.67
805 0.66
806 0.59
807 0.56
808 0.51
809 0.5
810 0.47
811 0.43
812 0.41
813 0.43
814 0.42
815 0.43
816 0.42
817 0.36
818 0.29
819 0.27
820 0.26
821 0.25
822 0.3
823 0.34
824 0.32
825 0.29
826 0.29
827 0.28
828 0.27
829 0.22
830 0.17
831 0.11
832 0.17
833 0.19
834 0.23
835 0.29
836 0.31
837 0.33
838 0.39
839 0.47
840 0.46
841 0.46
842 0.45
843 0.43
844 0.45
845 0.43
846 0.36
847 0.28
848 0.23
849 0.21
850 0.17
851 0.13
852 0.08
853 0.07
854 0.07
855 0.06
856 0.04
857 0.05
858 0.07
859 0.08
860 0.09
861 0.11
862 0.13
863 0.13
864 0.13
865 0.13
866 0.12
867 0.12
868 0.12
869 0.11
870 0.1
871 0.12
872 0.13
873 0.19
874 0.19
875 0.18
876 0.18
877 0.19
878 0.2
879 0.2
880 0.2
881 0.13
882 0.13
883 0.13
884 0.13
885 0.11
886 0.09
887 0.08
888 0.07
889 0.07
890 0.06
891 0.05
892 0.06
893 0.07
894 0.07
895 0.07
896 0.07
897 0.07
898 0.17
899 0.25
900 0.25
901 0.24
902 0.25
903 0.26
904 0.28
905 0.28
906 0.2
907 0.12
908 0.13
909 0.14
910 0.15
911 0.13
912 0.13
913 0.13
914 0.13
915 0.12
916 0.12
917 0.11
918 0.12
919 0.14
920 0.14
921 0.13
922 0.13
923 0.14
924 0.15
925 0.19
926 0.2
927 0.25
928 0.31
929 0.36
930 0.45
931 0.56
932 0.64
933 0.7
934 0.77
935 0.8
936 0.82
937 0.88
938 0.88
939 0.88
940 0.88
941 0.82
942 0.82
943 0.81
944 0.8
945 0.77
946 0.74
947 0.73
948 0.68
949 0.66
950 0.6
951 0.59
952 0.52
953 0.48
954 0.47
955 0.46
956 0.5
957 0.58
958 0.65
959 0.68
960 0.76
961 0.81
962 0.8
963 0.78
964 0.78
965 0.76
966 0.7
967 0.63
968 0.53
969 0.45
970 0.4
971 0.34
972 0.29