Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q12159

Protein Details
Accession Q12159    Localization Confidence High Confidence Score 15.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
192-216KAAMAKSQNKPKREKPAKKSLEDLDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
23-60ARVGGTRGNGPRRVGKQVGSQRRSLPNRRGPIRKNTRA
172-210KAMPQKGGNAPRPVKRGPNRKAAMAKSQNKPKREKPAKK
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 13, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR034357  Yra1/Mlo3_RRM  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000346  C:transcription export complex  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:1990119  F:RNA helicase inhibitor activity  
GO:0006406  P:mRNA export from nucleus  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
GO:0006283  P:transcription-coupled nucleotide-excision repair  
KEGG sce:YDR381W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12267  RRM_YRA1_MLO3  
Amino Acid Sequences MSANLDKSLDEIIGSNKAGSNRARVGGTRGNGPRRVGKQVGSQRRSLPNRRGPIRKNTRAPPNAVARVAKLLDTTREVKVNVEGLPRDIKQDAVREFFASQVGGVQRVLLSYNERGQSTGMANITFKNGELARRAVERFNGSPIDGGRSRLRLNLIVDPNQRPVKSLADRIKAMPQKGGNAPRPVKRGPNRKAAMAKSQNKPKREKPAKKSLEDLDKEMADYFEKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.15
3 0.16
4 0.18
5 0.22
6 0.23
7 0.27
8 0.27
9 0.29
10 0.3
11 0.29
12 0.34
13 0.36
14 0.36
15 0.37
16 0.41
17 0.45
18 0.48
19 0.5
20 0.51
21 0.49
22 0.54
23 0.49
24 0.45
25 0.48
26 0.54
27 0.62
28 0.57
29 0.56
30 0.55
31 0.63
32 0.68
33 0.67
34 0.66
35 0.65
36 0.71
37 0.75
38 0.78
39 0.74
40 0.77
41 0.79
42 0.79
43 0.77
44 0.76
45 0.78
46 0.74
47 0.72
48 0.68
49 0.65
50 0.6
51 0.54
52 0.47
53 0.37
54 0.35
55 0.31
56 0.24
57 0.17
58 0.14
59 0.14
60 0.17
61 0.19
62 0.17
63 0.19
64 0.19
65 0.19
66 0.19
67 0.19
68 0.17
69 0.17
70 0.16
71 0.15
72 0.18
73 0.18
74 0.18
75 0.16
76 0.16
77 0.16
78 0.22
79 0.22
80 0.22
81 0.22
82 0.21
83 0.21
84 0.19
85 0.17
86 0.12
87 0.09
88 0.08
89 0.08
90 0.08
91 0.07
92 0.07
93 0.06
94 0.06
95 0.07
96 0.06
97 0.07
98 0.08
99 0.12
100 0.13
101 0.13
102 0.14
103 0.13
104 0.14
105 0.12
106 0.13
107 0.1
108 0.09
109 0.09
110 0.09
111 0.1
112 0.09
113 0.08
114 0.09
115 0.09
116 0.1
117 0.12
118 0.13
119 0.14
120 0.16
121 0.17
122 0.16
123 0.18
124 0.2
125 0.18
126 0.2
127 0.19
128 0.17
129 0.18
130 0.17
131 0.2
132 0.16
133 0.19
134 0.18
135 0.2
136 0.21
137 0.22
138 0.23
139 0.21
140 0.23
141 0.28
142 0.29
143 0.33
144 0.36
145 0.36
146 0.4
147 0.41
148 0.38
149 0.33
150 0.32
151 0.33
152 0.33
153 0.4
154 0.41
155 0.43
156 0.44
157 0.44
158 0.51
159 0.47
160 0.45
161 0.41
162 0.35
163 0.35
164 0.41
165 0.47
166 0.45
167 0.5
168 0.54
169 0.55
170 0.59
171 0.57
172 0.6
173 0.62
174 0.66
175 0.63
176 0.68
177 0.65
178 0.67
179 0.71
180 0.65
181 0.67
182 0.66
183 0.68
184 0.67
185 0.75
186 0.75
187 0.74
188 0.78
189 0.76
190 0.77
191 0.8
192 0.81
193 0.8
194 0.84
195 0.86
196 0.82
197 0.8
198 0.77
199 0.76
200 0.69
201 0.64
202 0.57
203 0.49
204 0.45
205 0.39
206 0.31