Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0A1TSR3

Protein Details
Accession A0A0A1TSR3    Localization Confidence High Confidence Score 16.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
170-193EHDPEEKRRRREERPRYRNRDSDQBasic
365-384GKELFDSKSKQRQKAQDLFGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
176-189KRRRREERPRYRNR
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019416  NCBP3  
Gene Ontology GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0000340  F:RNA 7-methylguanosine cap binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF10309  NCBP3  
Amino Acid Sequences MDLDIEMGDDVHAGDLETHEPIMTTNDDILQTDEHAEDGEVAEEDEPKPNNDATTLVPNKIHIRGVDSLHTDDIKAYVKSHFGDVDKIEWIDDTSANLVFSSEPTAREAIAALSAVEIADASALPVGEVVPAKPLADKPETTLTVRFAVVSDRKERGAALRSRYYLLHPEHDPEEKRRRREERPRYRNRDSDQRSHRRRDDDDQDAFDASMYDDAPRRRSTSRDNRRNSFSRENRGKELFADRGARRNRSASPMRDDTVMGGSDDVVRNREAARSIRDRISSSNKNKELFPSKTSSSVGQLDKLERAIGSAHLRDEDMPKMAPEAGFAIKGSANQDSSVGGFSIKGTANARELFPAKLGGQSNAGKELFDSKSKQRQKAQDLFG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.06
2 0.07
3 0.09
4 0.09
5 0.09
6 0.09
7 0.09
8 0.09
9 0.12
10 0.12
11 0.12
12 0.12
13 0.14
14 0.15
15 0.16
16 0.17
17 0.14
18 0.14
19 0.14
20 0.13
21 0.11
22 0.11
23 0.1
24 0.09
25 0.09
26 0.09
27 0.07
28 0.07
29 0.08
30 0.09
31 0.1
32 0.15
33 0.15
34 0.16
35 0.19
36 0.19
37 0.19
38 0.18
39 0.19
40 0.17
41 0.27
42 0.28
43 0.28
44 0.27
45 0.3
46 0.33
47 0.34
48 0.33
49 0.23
50 0.25
51 0.27
52 0.29
53 0.31
54 0.3
55 0.29
56 0.28
57 0.28
58 0.23
59 0.19
60 0.19
61 0.18
62 0.16
63 0.15
64 0.15
65 0.18
66 0.19
67 0.2
68 0.21
69 0.19
70 0.22
71 0.22
72 0.22
73 0.21
74 0.2
75 0.18
76 0.15
77 0.15
78 0.12
79 0.11
80 0.1
81 0.09
82 0.1
83 0.1
84 0.1
85 0.09
86 0.08
87 0.08
88 0.11
89 0.11
90 0.11
91 0.13
92 0.14
93 0.13
94 0.13
95 0.13
96 0.09
97 0.08
98 0.08
99 0.06
100 0.05
101 0.05
102 0.05
103 0.04
104 0.03
105 0.03
106 0.03
107 0.03
108 0.03
109 0.03
110 0.03
111 0.03
112 0.03
113 0.04
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.07
118 0.07
119 0.07
120 0.09
121 0.1
122 0.13
123 0.16
124 0.17
125 0.18
126 0.24
127 0.26
128 0.26
129 0.27
130 0.24
131 0.22
132 0.22
133 0.19
134 0.13
135 0.16
136 0.18
137 0.2
138 0.22
139 0.22
140 0.22
141 0.22
142 0.23
143 0.21
144 0.26
145 0.27
146 0.29
147 0.31
148 0.32
149 0.33
150 0.34
151 0.31
152 0.3
153 0.28
154 0.26
155 0.23
156 0.24
157 0.25
158 0.29
159 0.29
160 0.3
161 0.39
162 0.4
163 0.45
164 0.52
165 0.57
166 0.62
167 0.71
168 0.75
169 0.76
170 0.81
171 0.87
172 0.87
173 0.87
174 0.84
175 0.77
176 0.76
177 0.7
178 0.69
179 0.68
180 0.7
181 0.7
182 0.71
183 0.71
184 0.66
185 0.65
186 0.62
187 0.59
188 0.56
189 0.51
190 0.45
191 0.41
192 0.35
193 0.31
194 0.23
195 0.16
196 0.09
197 0.07
198 0.05
199 0.06
200 0.09
201 0.11
202 0.14
203 0.15
204 0.18
205 0.19
206 0.23
207 0.33
208 0.41
209 0.51
210 0.58
211 0.64
212 0.65
213 0.71
214 0.73
215 0.7
216 0.7
217 0.65
218 0.65
219 0.67
220 0.66
221 0.64
222 0.6
223 0.53
224 0.45
225 0.43
226 0.35
227 0.29
228 0.32
229 0.27
230 0.34
231 0.38
232 0.39
233 0.36
234 0.38
235 0.37
236 0.38
237 0.45
238 0.41
239 0.44
240 0.45
241 0.44
242 0.41
243 0.39
244 0.32
245 0.26
246 0.21
247 0.14
248 0.1
249 0.09
250 0.11
251 0.12
252 0.12
253 0.11
254 0.11
255 0.12
256 0.13
257 0.14
258 0.15
259 0.17
260 0.23
261 0.28
262 0.32
263 0.35
264 0.36
265 0.36
266 0.39
267 0.45
268 0.48
269 0.51
270 0.57
271 0.57
272 0.57
273 0.56
274 0.58
275 0.58
276 0.52
277 0.47
278 0.43
279 0.4
280 0.41
281 0.42
282 0.35
283 0.31
284 0.33
285 0.3
286 0.29
287 0.3
288 0.28
289 0.28
290 0.27
291 0.23
292 0.17
293 0.16
294 0.13
295 0.15
296 0.17
297 0.17
298 0.18
299 0.18
300 0.19
301 0.2
302 0.22
303 0.2
304 0.18
305 0.17
306 0.16
307 0.17
308 0.18
309 0.16
310 0.14
311 0.15
312 0.13
313 0.13
314 0.13
315 0.13
316 0.12
317 0.14
318 0.16
319 0.16
320 0.15
321 0.15
322 0.16
323 0.14
324 0.15
325 0.14
326 0.12
327 0.09
328 0.08
329 0.08
330 0.12
331 0.12
332 0.15
333 0.16
334 0.19
335 0.23
336 0.25
337 0.25
338 0.26
339 0.27
340 0.25
341 0.24
342 0.24
343 0.2
344 0.24
345 0.26
346 0.22
347 0.27
348 0.29
349 0.3
350 0.33
351 0.32
352 0.26
353 0.25
354 0.3
355 0.27
356 0.29
357 0.33
358 0.36
359 0.47
360 0.56
361 0.64
362 0.67
363 0.73
364 0.78