FuNGI

Q06506

Protein Details

Accession

Q06506

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-25	MSDVTQQKKRKRSKGEVNPSKPTVD	Hydrophilic
57-76	ENPADKRRRLAKQYLENLKS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
9-14	KRKRSK
207-212	RPKKLK

Subcellular Location(s)

nucl 24, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR001680 WD40_repeat IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0030686 C:90S preribosome GO:0031428 C:box C/D RNP complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0005654 C:nucleoplasm GO:0032040 C:small-subunit processome GO:0030515 F:snoRNA binding GO:0034511 F:U3 snoRNA binding GO:0000480 P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0000447 P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0000472 P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0030490 P:maturation of SSU-rRNA
KEGG	sce:YPR137W -
Pfam	View protein in Pfam PF00400 WD40
PROSITE	View protein in PROSITE PS50082 WD_REPEATS_2 PS50294 WD_REPEATS_REGION

Amino Acid Sequences

MSDVTQQKKRKRSKGEVNPSKPTVDEEITDPSSNEDEQLEVSDEEDALESEEEFEGENPADKRRRLAKQYLENLKSEANDILTDNRNAEEKDLNNLKERTIDEYNNFDAGDLDKDIIASRLKEDVAEQQGRVFRYFGDKLLISEAKQSFTRVGENNLTCISCFQPVLNKYTFEESSNGDKNKGRLFAYTVSKDLQLTKYDITDFSKRPKKLKYAKGGAKYIPTSKHEYENTTEGHYDEILTVAASPDGKYVVTGGRDRKLIVWSTESLSPVKVIPTKDRRGEVLSLAFRKNSDQLYASCADFKIRTYSINQFSQLEILYGHHDIVEDISALAMERCVTVGARDRTAMLWKIPDETRLTFRGGDEPQKLLRRWMKENAKEGEDGEVKYPDESEAPLFFCEGSIDVVSMVDDFHFITGSDNGNICLWSLAKKKPIFTERIAHGILPEPSFNDISGETDEELRKRQLQGKKLLQPFWITSLYAIPYSNVFISGSWSGSLKVWKISDNLRSFELLGELSGAKGVVTKIQVVESGKHGKEKFRILASIAKEHRLGRWIANVSGARNGIYSAVIDQTGF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.9
2	0.93
3	0.94
4	0.91
5	0.9
6	0.81
7	0.72
8	0.61
9	0.54
10	0.48
11	0.39
12	0.33
13	0.27
14	0.31
15	0.33
16	0.33
17	0.29
18	0.25
19	0.25
20	0.24
21	0.22
22	0.16
23	0.13
24	0.13
25	0.15
26	0.15
27	0.12
28	0.13
29	0.12
30	0.11
31	0.11
32	0.11
33	0.09
34	0.08
35	0.08
36	0.08
37	0.09
38	0.09
39	0.08
40	0.09
41	0.09
42	0.09
43	0.09
44	0.14
45	0.14
46	0.22
47	0.28
48	0.29
49	0.36
50	0.43
51	0.52
52	0.56
53	0.64
54	0.67
55	0.71
56	0.8
57	0.83
58	0.77
59	0.68
60	0.62
61	0.55
62	0.45
63	0.37
64	0.28
65	0.18
66	0.16
67	0.16
68	0.2
69	0.21
70	0.22
71	0.21
72	0.2
73	0.22
74	0.21
75	0.23
76	0.23
77	0.2
78	0.29
79	0.34
80	0.35
81	0.4
82	0.4
83	0.38
84	0.37
85	0.37
86	0.35
87	0.34
88	0.36
89	0.31
90	0.36
91	0.37
92	0.33
93	0.32
94	0.25
95	0.2
96	0.17
97	0.17
98	0.12
99	0.11
100	0.1
101	0.1
102	0.1
103	0.12
104	0.12
105	0.11
106	0.12
107	0.13
108	0.14
109	0.14
110	0.15
111	0.2
112	0.26
113	0.27
114	0.26
115	0.27
116	0.31
117	0.32
118	0.32
119	0.25
120	0.18
121	0.23
122	0.24
123	0.21
124	0.22
125	0.21
126	0.21
127	0.26
128	0.27
129	0.2
130	0.26
131	0.26
132	0.24
133	0.24
134	0.25
135	0.21
136	0.21
137	0.26
138	0.2
139	0.24
140	0.29
141	0.29
142	0.3
143	0.29
144	0.27
145	0.22
146	0.22
147	0.19
148	0.13
149	0.13
150	0.11
151	0.17
152	0.19
153	0.25
154	0.25
155	0.25
156	0.24
157	0.29
158	0.29
159	0.23
160	0.23
161	0.21
162	0.26
163	0.31
164	0.31
165	0.29
166	0.31
167	0.32
168	0.35
169	0.35
170	0.29
171	0.24
172	0.27
173	0.3
174	0.34
175	0.33
176	0.3
177	0.28
178	0.28
179	0.27
180	0.26
181	0.22
182	0.18
183	0.18
184	0.17
185	0.17
186	0.18
187	0.18
188	0.2
189	0.24
190	0.24
191	0.31
192	0.38
193	0.4
194	0.45
195	0.5
196	0.57
197	0.6
198	0.67
199	0.68
200	0.7
201	0.74
202	0.75
203	0.73
204	0.64
205	0.58
206	0.51
207	0.46
208	0.4
209	0.36
210	0.36
211	0.33
212	0.38
213	0.35
214	0.36
215	0.35
216	0.34
217	0.31
218	0.26
219	0.24
220	0.18
221	0.17
222	0.14
223	0.11
224	0.08
225	0.07
226	0.05
227	0.05
228	0.05
229	0.04
230	0.05
231	0.04
232	0.05
233	0.05
234	0.05
235	0.05
236	0.05
237	0.06
238	0.07
239	0.1
240	0.13
241	0.16
242	0.18
243	0.19
244	0.2
245	0.2
246	0.21
247	0.2
248	0.18
249	0.17
250	0.16
251	0.18
252	0.19
253	0.18
254	0.16
255	0.14
256	0.13
257	0.11
258	0.12
259	0.13
260	0.13
261	0.2
262	0.28
263	0.33
264	0.36
265	0.37
266	0.36
267	0.36
268	0.36
269	0.29
270	0.26
271	0.24
272	0.24
273	0.23
274	0.22
275	0.19
276	0.19
277	0.2
278	0.16
279	0.14
280	0.13
281	0.13
282	0.16
283	0.17
284	0.16
285	0.15
286	0.14
287	0.13
288	0.12
289	0.12
290	0.12
291	0.12
292	0.13
293	0.15
294	0.22
295	0.26
296	0.28
297	0.28
298	0.25
299	0.24
300	0.24
301	0.2
302	0.14
303	0.09
304	0.08
305	0.09
306	0.08
307	0.08
308	0.07
309	0.07
310	0.07
311	0.07
312	0.06
313	0.04
314	0.04
315	0.04
316	0.04
317	0.04
318	0.04
319	0.03
320	0.03
321	0.03
322	0.03
323	0.04
324	0.04
325	0.05
326	0.13
327	0.15
328	0.16
329	0.16
330	0.17
331	0.17
332	0.21
333	0.21
334	0.14
335	0.14
336	0.14
337	0.17
338	0.17
339	0.19
340	0.19
341	0.19
342	0.22
343	0.22
344	0.23
345	0.2
346	0.2
347	0.24
348	0.23
349	0.27
350	0.25
351	0.26
352	0.29
353	0.34
354	0.34
355	0.36
356	0.39
357	0.39
358	0.42
359	0.49
360	0.54
361	0.55
362	0.62
363	0.58
364	0.54
365	0.49
366	0.45
367	0.4
368	0.33
369	0.27
370	0.21
371	0.19
372	0.17
373	0.17
374	0.16
375	0.11
376	0.1
377	0.1
378	0.1
379	0.1
380	0.11
381	0.11
382	0.11
383	0.1
384	0.09
385	0.09
386	0.08
387	0.08
388	0.07
389	0.07
390	0.06
391	0.06
392	0.06
393	0.06
394	0.05
395	0.04
396	0.04
397	0.04
398	0.04
399	0.04
400	0.05
401	0.06
402	0.09
403	0.1
404	0.11
405	0.12
406	0.12
407	0.13
408	0.12
409	0.11
410	0.1
411	0.09
412	0.13
413	0.18
414	0.21
415	0.29
416	0.31
417	0.34
418	0.42
419	0.48
420	0.48
421	0.47
422	0.51
423	0.45
424	0.48
425	0.45
426	0.37
427	0.31
428	0.3
429	0.28
430	0.21
431	0.19
432	0.15
433	0.17
434	0.17
435	0.16
436	0.14
437	0.12
438	0.13
439	0.14
440	0.14
441	0.12
442	0.15
443	0.17
444	0.18
445	0.21
446	0.22
447	0.24
448	0.27
449	0.35
450	0.39
451	0.45
452	0.54
453	0.6
454	0.66
455	0.69
456	0.68
457	0.62
458	0.59
459	0.52
460	0.47
461	0.39
462	0.29
463	0.23
464	0.23
465	0.22
466	0.19
467	0.17
468	0.13
469	0.12
470	0.14
471	0.14
472	0.12
473	0.1
474	0.09
475	0.13
476	0.14
477	0.14
478	0.13
479	0.13
480	0.13
481	0.15
482	0.19
483	0.17
484	0.2
485	0.21
486	0.23
487	0.26
488	0.31
489	0.38
490	0.39
491	0.4
492	0.37
493	0.37
494	0.35
495	0.32
496	0.27
497	0.18
498	0.13
499	0.12
500	0.11
501	0.09
502	0.09
503	0.08
504	0.06
505	0.08
506	0.09
507	0.1
508	0.12
509	0.14
510	0.14
511	0.16
512	0.2
513	0.2
514	0.22
515	0.25
516	0.32
517	0.32
518	0.38
519	0.4
520	0.43
521	0.47
522	0.53
523	0.53
524	0.49
525	0.5
526	0.45
527	0.5
528	0.47
529	0.5
530	0.45
531	0.42
532	0.41
533	0.4
534	0.41
535	0.38
536	0.36
537	0.3
538	0.36
539	0.36
540	0.33
541	0.39
542	0.38
543	0.35
544	0.38
545	0.35
546	0.26
547	0.23
548	0.23
549	0.16
550	0.15
551	0.14
552	0.1
553	0.11

Q06506

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer