Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0A1TJM3

Protein Details
Accession A0A0A1TJM3    Localization Confidence High Confidence Score 23.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
169-222NDSSKEKSHDRHHKRRHRHRSHSRERDSDRRHRRRRSRSRSPRRRRSSDDDREGBasic
231-250SRDRHSGRKRSDSRDRRRETBasic
274-312SEERPDQRRRDYDRKDRYNDDSRRPERRRYDDRRSRDGPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
174-250EKSHDRHHKRRHRHRSHSRERDSDRRHRRRRSRSRSPRRRRSSDDDREGSRHKHRDDSRDRHSGRKRSDSRDRRRET
264-271PRERARQR
282-282R
296-303RRPERRRY
306-307RR
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019339  CIR_N_dom  
IPR022209  CWC25  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF10197  Cir_N  
PF12542  CWC25  
Amino Acid Sequences MGAGDLNLKKSFHPALRRNQAAVYDEEQKALSERKRTQQRIDEIKEERAKEELQRQLEAAGGKKRVDRVDWMYQGPTDGQTGTSEETEAYLLGKRRIDNLIKGNEHKKLEKSAGAESFMALQNANSARDTAAKIRDDPLLAIKRQEQAAYEAMMNDPVRRRQLLAAMGNDSSKEKSHDRHHKRRHRHRSHSRERDSDRRHRRRRSRSRSPRRRRSSDDDREGSRHKHRDDSRDRHSGRKRSDSRDRRRETDDHKSDRQSADSPPRERARQRSISEERPDQRRRDYDRKDRYNDDSRRPERRRYDDRRSRDGPRHNGHDRNNGYNSRANDSNQEEERAKKLAAMQSAASELDDDRGKRLAAIEEQERTAREADNRARERDGERGFINGLHRQTEKLDLGARMGRNKQAYQRDDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.58
3 0.67
4 0.71
5 0.67
6 0.62
7 0.59
8 0.52
9 0.48
10 0.41
11 0.39
12 0.35
13 0.34
14 0.31
15 0.27
16 0.27
17 0.3
18 0.31
19 0.33
20 0.39
21 0.48
22 0.59
23 0.65
24 0.71
25 0.73
26 0.78
27 0.79
28 0.78
29 0.77
30 0.7
31 0.73
32 0.7
33 0.62
34 0.53
35 0.46
36 0.42
37 0.4
38 0.45
39 0.43
40 0.4
41 0.39
42 0.38
43 0.35
44 0.36
45 0.32
46 0.28
47 0.27
48 0.27
49 0.28
50 0.31
51 0.36
52 0.36
53 0.36
54 0.38
55 0.39
56 0.45
57 0.47
58 0.46
59 0.42
60 0.39
61 0.38
62 0.31
63 0.25
64 0.17
65 0.13
66 0.12
67 0.11
68 0.13
69 0.13
70 0.12
71 0.12
72 0.1
73 0.11
74 0.1
75 0.09
76 0.08
77 0.11
78 0.13
79 0.16
80 0.2
81 0.2
82 0.23
83 0.3
84 0.32
85 0.35
86 0.4
87 0.45
88 0.46
89 0.51
90 0.53
91 0.52
92 0.52
93 0.5
94 0.45
95 0.42
96 0.42
97 0.4
98 0.37
99 0.37
100 0.35
101 0.33
102 0.3
103 0.24
104 0.24
105 0.21
106 0.18
107 0.12
108 0.1
109 0.12
110 0.14
111 0.15
112 0.12
113 0.12
114 0.12
115 0.14
116 0.17
117 0.17
118 0.21
119 0.22
120 0.23
121 0.24
122 0.26
123 0.23
124 0.22
125 0.26
126 0.25
127 0.24
128 0.25
129 0.26
130 0.27
131 0.27
132 0.27
133 0.2
134 0.18
135 0.19
136 0.18
137 0.16
138 0.13
139 0.12
140 0.15
141 0.14
142 0.13
143 0.14
144 0.16
145 0.19
146 0.19
147 0.2
148 0.19
149 0.23
150 0.27
151 0.27
152 0.26
153 0.25
154 0.25
155 0.23
156 0.22
157 0.19
158 0.14
159 0.11
160 0.13
161 0.14
162 0.2
163 0.3
164 0.4
165 0.5
166 0.6
167 0.7
168 0.77
169 0.85
170 0.91
171 0.92
172 0.92
173 0.93
174 0.93
175 0.93
176 0.95
177 0.94
178 0.89
179 0.86
180 0.81
181 0.8
182 0.77
183 0.76
184 0.76
185 0.77
186 0.8
187 0.82
188 0.87
189 0.88
190 0.91
191 0.91
192 0.91
193 0.92
194 0.94
195 0.95
196 0.95
197 0.95
198 0.93
199 0.9
200 0.86
201 0.84
202 0.83
203 0.82
204 0.79
205 0.72
206 0.65
207 0.61
208 0.56
209 0.52
210 0.49
211 0.45
212 0.38
213 0.44
214 0.46
215 0.53
216 0.61
217 0.64
218 0.63
219 0.66
220 0.66
221 0.67
222 0.7
223 0.68
224 0.64
225 0.67
226 0.66
227 0.65
228 0.74
229 0.75
230 0.78
231 0.81
232 0.8
233 0.73
234 0.73
235 0.71
236 0.68
237 0.68
238 0.66
239 0.62
240 0.62
241 0.6
242 0.59
243 0.53
244 0.48
245 0.39
246 0.36
247 0.4
248 0.43
249 0.42
250 0.44
251 0.47
252 0.5
253 0.53
254 0.55
255 0.54
256 0.56
257 0.55
258 0.58
259 0.6
260 0.63
261 0.64
262 0.63
263 0.6
264 0.6
265 0.65
266 0.59
267 0.6
268 0.6
269 0.64
270 0.66
271 0.71
272 0.72
273 0.77
274 0.82
275 0.8
276 0.77
277 0.75
278 0.75
279 0.72
280 0.71
281 0.71
282 0.69
283 0.74
284 0.74
285 0.75
286 0.75
287 0.77
288 0.78
289 0.77
290 0.82
291 0.81
292 0.84
293 0.84
294 0.79
295 0.78
296 0.76
297 0.76
298 0.75
299 0.72
300 0.73
301 0.72
302 0.74
303 0.72
304 0.73
305 0.67
306 0.63
307 0.62
308 0.56
309 0.52
310 0.49
311 0.45
312 0.4
313 0.39
314 0.34
315 0.34
316 0.36
317 0.39
318 0.36
319 0.38
320 0.35
321 0.35
322 0.36
323 0.32
324 0.28
325 0.23
326 0.27
327 0.27
328 0.28
329 0.28
330 0.25
331 0.24
332 0.25
333 0.23
334 0.17
335 0.13
336 0.11
337 0.12
338 0.15
339 0.14
340 0.15
341 0.17
342 0.17
343 0.17
344 0.19
345 0.2
346 0.21
347 0.26
348 0.29
349 0.3
350 0.31
351 0.32
352 0.31
353 0.29
354 0.26
355 0.24
356 0.23
357 0.3
358 0.37
359 0.45
360 0.49
361 0.51
362 0.52
363 0.52
364 0.51
365 0.51
366 0.46
367 0.4
368 0.36
369 0.35
370 0.33
371 0.33
372 0.34
373 0.3
374 0.29
375 0.29
376 0.3
377 0.29
378 0.3
379 0.35
380 0.31
381 0.29
382 0.31
383 0.28
384 0.31
385 0.35
386 0.37
387 0.37
388 0.39
389 0.43
390 0.43
391 0.48
392 0.53
393 0.57