Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0A1SYQ8

Protein Details
Accession A0A0A1SYQ8    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
359-380QIAERKSKLRSAKAKSRKSMDAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
197-200KRKR
315-350GKKRKSTGDKEEPAAESPAPKKAKKAAAADNKAKPA
362-376ERKSKLRSAKAKSRK
Subcellular Location(s) cyto 19.5, cyto_nucl 13.5, nucl 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR023674  Ribosomal_L1-like  
IPR028364  Ribosomal_L1/biogenesis  
IPR016095  Ribosomal_L1_3-a/b-sand  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
Pfam View protein in Pfam  
PF00687  Ribosomal_L1  
CDD cd00403  Ribosomal_L1  
Amino Acid Sequences MSPSKAVAVVGSAELVVINPDQTIKASKALLSHIKKAAAEQTEESGKKNLLGDDDDAAETPVWLNVTTKRHITDKARLQPGKIALPHPLLSAETEQLSICLITADPQRAYKNIVDAEEFPADLRSKIGRVIDVTKLKAKFSQYEAQRKLYAEHDVFLADDRIINRLPKILGKTFYKTTQKRPIPVIFQTKAPKVDGKRKRTKTEGEVNAASPEKIAKEITKAIGSALVSLSPTANIAIRIGFANWTADQIAENVEAVSNALVEKWVPQKWRGVKSIHIKGPQTVALPIWMTDELWVDDKDVIANEDGPTTKANIGKKRKSTGDKEEPAAESPAPKKAKKAAAADNKAKPAGNDDKLDQQIAERKSKLRSAKAKSRKSMDA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.07
3 0.07
4 0.06
5 0.06
6 0.06
7 0.07
8 0.08
9 0.1
10 0.14
11 0.14
12 0.18
13 0.19
14 0.2
15 0.22
16 0.28
17 0.36
18 0.37
19 0.42
20 0.43
21 0.44
22 0.43
23 0.43
24 0.44
25 0.37
26 0.36
27 0.3
28 0.31
29 0.36
30 0.36
31 0.36
32 0.32
33 0.29
34 0.28
35 0.29
36 0.26
37 0.21
38 0.23
39 0.22
40 0.21
41 0.22
42 0.2
43 0.18
44 0.17
45 0.14
46 0.11
47 0.1
48 0.09
49 0.08
50 0.08
51 0.09
52 0.15
53 0.2
54 0.23
55 0.26
56 0.28
57 0.3
58 0.37
59 0.42
60 0.45
61 0.51
62 0.57
63 0.64
64 0.63
65 0.6
66 0.59
67 0.56
68 0.53
69 0.46
70 0.38
71 0.32
72 0.35
73 0.34
74 0.29
75 0.25
76 0.19
77 0.19
78 0.19
79 0.15
80 0.12
81 0.12
82 0.11
83 0.11
84 0.1
85 0.08
86 0.06
87 0.05
88 0.05
89 0.08
90 0.11
91 0.14
92 0.15
93 0.18
94 0.2
95 0.2
96 0.24
97 0.22
98 0.24
99 0.23
100 0.23
101 0.22
102 0.22
103 0.25
104 0.21
105 0.2
106 0.15
107 0.15
108 0.15
109 0.13
110 0.13
111 0.11
112 0.11
113 0.14
114 0.14
115 0.13
116 0.15
117 0.18
118 0.24
119 0.26
120 0.28
121 0.31
122 0.31
123 0.3
124 0.31
125 0.31
126 0.27
127 0.29
128 0.34
129 0.36
130 0.45
131 0.48
132 0.48
133 0.48
134 0.45
135 0.41
136 0.36
137 0.34
138 0.24
139 0.21
140 0.18
141 0.16
142 0.15
143 0.14
144 0.12
145 0.06
146 0.07
147 0.07
148 0.09
149 0.1
150 0.1
151 0.1
152 0.11
153 0.12
154 0.14
155 0.17
156 0.19
157 0.22
158 0.24
159 0.28
160 0.28
161 0.34
162 0.4
163 0.4
164 0.45
165 0.52
166 0.52
167 0.52
168 0.55
169 0.52
170 0.48
171 0.5
172 0.5
173 0.4
174 0.41
175 0.42
176 0.38
177 0.36
178 0.33
179 0.31
180 0.28
181 0.37
182 0.41
183 0.48
184 0.56
185 0.61
186 0.65
187 0.66
188 0.68
189 0.65
190 0.66
191 0.61
192 0.55
193 0.5
194 0.45
195 0.41
196 0.36
197 0.28
198 0.18
199 0.13
200 0.09
201 0.09
202 0.09
203 0.08
204 0.1
205 0.13
206 0.14
207 0.14
208 0.14
209 0.13
210 0.14
211 0.13
212 0.11
213 0.09
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.05
223 0.06
224 0.06
225 0.06
226 0.07
227 0.07
228 0.07
229 0.06
230 0.08
231 0.08
232 0.09
233 0.08
234 0.08
235 0.08
236 0.08
237 0.09
238 0.07
239 0.07
240 0.06
241 0.06
242 0.06
243 0.06
244 0.05
245 0.04
246 0.04
247 0.03
248 0.04
249 0.04
250 0.07
251 0.12
252 0.16
253 0.18
254 0.2
255 0.29
256 0.37
257 0.43
258 0.45
259 0.43
260 0.47
261 0.55
262 0.62
263 0.6
264 0.57
265 0.52
266 0.49
267 0.49
268 0.43
269 0.35
270 0.27
271 0.21
272 0.17
273 0.16
274 0.14
275 0.14
276 0.11
277 0.1
278 0.1
279 0.11
280 0.11
281 0.13
282 0.13
283 0.12
284 0.12
285 0.12
286 0.12
287 0.11
288 0.11
289 0.09
290 0.1
291 0.1
292 0.11
293 0.12
294 0.12
295 0.12
296 0.13
297 0.16
298 0.19
299 0.26
300 0.34
301 0.44
302 0.52
303 0.58
304 0.63
305 0.69
306 0.74
307 0.75
308 0.76
309 0.77
310 0.74
311 0.7
312 0.67
313 0.6
314 0.53
315 0.47
316 0.37
317 0.32
318 0.28
319 0.34
320 0.35
321 0.34
322 0.37
323 0.43
324 0.51
325 0.52
326 0.58
327 0.6
328 0.65
329 0.73
330 0.77
331 0.74
332 0.71
333 0.65
334 0.58
335 0.48
336 0.45
337 0.45
338 0.42
339 0.39
340 0.37
341 0.43
342 0.45
343 0.45
344 0.37
345 0.33
346 0.36
347 0.37
348 0.42
349 0.38
350 0.4
351 0.45
352 0.52
353 0.56
354 0.58
355 0.63
356 0.66
357 0.73
358 0.79
359 0.84
360 0.85