Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P34909

Protein Details
Accession P34909    Localization Confidence High Confidence Score 16.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
69-88ELNGRCPACRRKYDDENVRYHydrophilic
95-127ELKMERAKLARKEKERKHREKERKENEYTNRKHBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
100-118RAKLARKEKERKHREKERK
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034261  CNOT4_RRM  
IPR039780  Mot2  
IPR039515  NOT4_mRING-HC-C4C4  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR003954  RRM_dom_euk  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0030014  C:CCR4-NOT complex  
GO:0030015  C:CCR4-NOT core complex  
GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0061630  F:ubiquitin protein ligase activity  
GO:0004842  F:ubiquitin-protein transferase activity  
GO:0031087  P:deadenylation-independent decapping of nuclear-transcribed mRNA  
GO:0000289  P:nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening  
GO:0032968  P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II  
GO:0010498  P:proteasomal protein catabolic process  
GO:0000209  P:protein polyubiquitination  
GO:0016567  P:protein ubiquitination  
KEGG sce:YER068W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF14570  zf-RING_4  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
PS50103  ZF_C3H1  
PS50089  ZF_RING_2  
CDD cd16618  mRING-HC-C4C4_CNOT4  
cd12438  RRM_CNOT4  
Amino Acid Sequences MMNPHVQENLQAIHNALSNFDTSFLSEDEEDYCPLCIEPMDITDKNFFPCPCGYQICQFCYNNIRQNPELNGRCPACRRKYDDENVRYVTLSPEELKMERAKLARKEKERKHREKERKENEYTNRKHLSGTRVIQKNLVYVVGINPPVPYEEVAPTLKSEKYFGQYGKINKIVVNRKTPHSNNTTSEHYHHHSPGYGVYITFGSKDDAARCIAQVDGTYMDGRLIKAAYGTTKYCSSYLRGLPCPNPNCMFLHEPGEEADSFNKRELHNKQQAQQQSGGTAFTRSGIHNNISTSTAGSNTNLLSENFTGTPSPAAMRAQLHHDSHTNAGTPVLTPAPVPAGSNPWGVTQSATPVTSINLSKNSSSINLPTLNDSLGHHTTPTTENTITSTTTTTNTNATSHSHGSKKKQSLAAEEYKDPYDALGNAVDFLDARLHSLSNYQKRPISIKSNIIDEETYKKYPSLFSWDKIEASKKSDNTLANKLVEILAIKPIDYTASVVQFLQSVNVGVNDNITITDNTKTPTQPIRLQTVSQQIQPPLNVSTPPPGIFGPQHKVPIQQQQMGDTSSRNSSDLLNQLINGRKIIAGN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.19
3 0.17
4 0.15
5 0.15
6 0.15
7 0.15
8 0.14
9 0.11
10 0.14
11 0.13
12 0.15
13 0.14
14 0.15
15 0.16
16 0.17
17 0.17
18 0.15
19 0.15
20 0.13
21 0.13
22 0.12
23 0.1
24 0.09
25 0.1
26 0.12
27 0.19
28 0.19
29 0.22
30 0.26
31 0.27
32 0.29
33 0.33
34 0.29
35 0.26
36 0.28
37 0.3
38 0.31
39 0.35
40 0.34
41 0.39
42 0.45
43 0.46
44 0.51
45 0.47
46 0.45
47 0.48
48 0.53
49 0.53
50 0.51
51 0.53
52 0.47
53 0.52
54 0.54
55 0.56
56 0.54
57 0.47
58 0.5
59 0.46
60 0.49
61 0.52
62 0.56
63 0.54
64 0.57
65 0.63
66 0.64
67 0.72
68 0.78
69 0.8
70 0.76
71 0.75
72 0.7
73 0.62
74 0.54
75 0.45
76 0.37
77 0.28
78 0.24
79 0.19
80 0.18
81 0.2
82 0.2
83 0.23
84 0.23
85 0.23
86 0.26
87 0.28
88 0.34
89 0.4
90 0.5
91 0.56
92 0.63
93 0.72
94 0.77
95 0.84
96 0.88
97 0.89
98 0.89
99 0.91
100 0.92
101 0.93
102 0.94
103 0.94
104 0.92
105 0.88
106 0.87
107 0.86
108 0.85
109 0.79
110 0.77
111 0.71
112 0.62
113 0.58
114 0.54
115 0.51
116 0.49
117 0.5
118 0.51
119 0.52
120 0.52
121 0.52
122 0.48
123 0.42
124 0.34
125 0.28
126 0.19
127 0.13
128 0.15
129 0.15
130 0.15
131 0.13
132 0.12
133 0.12
134 0.13
135 0.13
136 0.12
137 0.1
138 0.11
139 0.14
140 0.15
141 0.15
142 0.16
143 0.17
144 0.18
145 0.17
146 0.17
147 0.17
148 0.19
149 0.24
150 0.23
151 0.26
152 0.3
153 0.34
154 0.38
155 0.38
156 0.35
157 0.33
158 0.4
159 0.44
160 0.44
161 0.49
162 0.46
163 0.48
164 0.56
165 0.56
166 0.55
167 0.53
168 0.53
169 0.47
170 0.48
171 0.49
172 0.42
173 0.42
174 0.4
175 0.36
176 0.35
177 0.32
178 0.29
179 0.25
180 0.23
181 0.22
182 0.2
183 0.17
184 0.13
185 0.12
186 0.12
187 0.11
188 0.11
189 0.1
190 0.08
191 0.09
192 0.1
193 0.11
194 0.12
195 0.13
196 0.13
197 0.12
198 0.12
199 0.11
200 0.1
201 0.09
202 0.08
203 0.07
204 0.08
205 0.08
206 0.07
207 0.08
208 0.09
209 0.08
210 0.08
211 0.07
212 0.06
213 0.07
214 0.07
215 0.08
216 0.1
217 0.11
218 0.12
219 0.14
220 0.15
221 0.16
222 0.16
223 0.17
224 0.21
225 0.24
226 0.27
227 0.29
228 0.31
229 0.34
230 0.41
231 0.4
232 0.38
233 0.36
234 0.32
235 0.3
236 0.3
237 0.29
238 0.22
239 0.25
240 0.21
241 0.19
242 0.18
243 0.18
244 0.15
245 0.13
246 0.14
247 0.12
248 0.13
249 0.14
250 0.17
251 0.16
252 0.24
253 0.29
254 0.36
255 0.43
256 0.46
257 0.49
258 0.52
259 0.55
260 0.5
261 0.47
262 0.37
263 0.29
264 0.26
265 0.22
266 0.16
267 0.13
268 0.1
269 0.08
270 0.09
271 0.08
272 0.1
273 0.12
274 0.13
275 0.14
276 0.14
277 0.14
278 0.14
279 0.13
280 0.11
281 0.1
282 0.1
283 0.09
284 0.09
285 0.09
286 0.07
287 0.08
288 0.09
289 0.09
290 0.09
291 0.09
292 0.1
293 0.09
294 0.1
295 0.09
296 0.08
297 0.08
298 0.06
299 0.07
300 0.06
301 0.07
302 0.08
303 0.09
304 0.1
305 0.15
306 0.19
307 0.19
308 0.19
309 0.2
310 0.2
311 0.2
312 0.2
313 0.16
314 0.11
315 0.11
316 0.1
317 0.08
318 0.08
319 0.07
320 0.07
321 0.06
322 0.06
323 0.07
324 0.07
325 0.08
326 0.07
327 0.1
328 0.12
329 0.13
330 0.13
331 0.12
332 0.13
333 0.13
334 0.13
335 0.1
336 0.11
337 0.11
338 0.11
339 0.1
340 0.1
341 0.1
342 0.12
343 0.13
344 0.12
345 0.14
346 0.15
347 0.15
348 0.16
349 0.16
350 0.15
351 0.15
352 0.15
353 0.14
354 0.15
355 0.16
356 0.17
357 0.17
358 0.15
359 0.15
360 0.14
361 0.17
362 0.16
363 0.16
364 0.14
365 0.13
366 0.15
367 0.16
368 0.18
369 0.16
370 0.14
371 0.15
372 0.16
373 0.18
374 0.16
375 0.15
376 0.14
377 0.11
378 0.12
379 0.14
380 0.13
381 0.14
382 0.14
383 0.14
384 0.14
385 0.16
386 0.18
387 0.2
388 0.23
389 0.28
390 0.32
391 0.39
392 0.47
393 0.5
394 0.52
395 0.55
396 0.53
397 0.53
398 0.56
399 0.56
400 0.51
401 0.47
402 0.43
403 0.38
404 0.36
405 0.29
406 0.21
407 0.15
408 0.12
409 0.11
410 0.1
411 0.09
412 0.09
413 0.09
414 0.09
415 0.07
416 0.07
417 0.08
418 0.07
419 0.08
420 0.09
421 0.09
422 0.09
423 0.15
424 0.23
425 0.3
426 0.34
427 0.37
428 0.38
429 0.41
430 0.45
431 0.46
432 0.46
433 0.42
434 0.46
435 0.45
436 0.46
437 0.45
438 0.42
439 0.36
440 0.3
441 0.3
442 0.27
443 0.26
444 0.23
445 0.23
446 0.22
447 0.24
448 0.24
449 0.28
450 0.28
451 0.29
452 0.34
453 0.36
454 0.36
455 0.37
456 0.41
457 0.33
458 0.36
459 0.4
460 0.35
461 0.36
462 0.41
463 0.42
464 0.42
465 0.47
466 0.45
467 0.39
468 0.38
469 0.36
470 0.3
471 0.25
472 0.21
473 0.14
474 0.14
475 0.13
476 0.13
477 0.12
478 0.12
479 0.12
480 0.12
481 0.14
482 0.11
483 0.13
484 0.14
485 0.14
486 0.14
487 0.14
488 0.14
489 0.12
490 0.1
491 0.08
492 0.08
493 0.1
494 0.11
495 0.09
496 0.1
497 0.09
498 0.09
499 0.09
500 0.11
501 0.1
502 0.11
503 0.13
504 0.14
505 0.16
506 0.19
507 0.2
508 0.23
509 0.3
510 0.34
511 0.4
512 0.43
513 0.49
514 0.48
515 0.48
516 0.49
517 0.51
518 0.48
519 0.45
520 0.46
521 0.41
522 0.42
523 0.41
524 0.38
525 0.31
526 0.3
527 0.26
528 0.23
529 0.26
530 0.26
531 0.26
532 0.26
533 0.23
534 0.25
535 0.29
536 0.34
537 0.34
538 0.35
539 0.4
540 0.39
541 0.45
542 0.47
543 0.52
544 0.52
545 0.51
546 0.48
547 0.46
548 0.48
549 0.44
550 0.39
551 0.31
552 0.27
553 0.25
554 0.26
555 0.22
556 0.21
557 0.21
558 0.26
559 0.29
560 0.31
561 0.27
562 0.27
563 0.32
564 0.38
565 0.37
566 0.32
567 0.28