Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0A1T549

Protein Details
Accession A0A0A1T549    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
296-315AGGAEKKPEKKQFQFTNLDDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
236-305RKKKEEEERKDKEEQEAKERAEKERVLREEREQARLEREKQREKEAAEWRRASEAGGEAPAGGAEKKPEK
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 13.5, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019258  Mediator_Med4  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF10018  Med4  
Amino Acid Sequences MDKFIDARFERLEKALTGLIDSVAKYHPSMNVADELKAADLELTRGLGKVETHQNNHLRILQLREASTALDTQIRETLTSLASTRNDIVNTQITTFPANPNYPIIYDELLSYARRISKTSMPPASTIYAAGPPAIQSELQTPIDGGRQSMTPAAATPSVAQSPAVGNTSALQAQPAAGITRLPDAMAQYLNPLSGQHFFPWPQEDKIRSGALASNQLLIEQGIDPKGFDPVLEQERKKKEEEERKDKEEQEAKERAEKERVLREEREQARLEREKQREKEAAEWRRASEAGGEAPAGGAEKKPEKKQFQFTNLDDLDDDDDDDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.25
3 0.2
4 0.19
5 0.17
6 0.16
7 0.15
8 0.15
9 0.14
10 0.13
11 0.14
12 0.14
13 0.15
14 0.17
15 0.17
16 0.19
17 0.19
18 0.24
19 0.24
20 0.24
21 0.22
22 0.2
23 0.18
24 0.17
25 0.14
26 0.09
27 0.08
28 0.09
29 0.09
30 0.09
31 0.09
32 0.09
33 0.1
34 0.1
35 0.1
36 0.15
37 0.25
38 0.3
39 0.33
40 0.41
41 0.46
42 0.47
43 0.49
44 0.47
45 0.4
46 0.37
47 0.39
48 0.36
49 0.34
50 0.32
51 0.3
52 0.27
53 0.24
54 0.22
55 0.17
56 0.13
57 0.13
58 0.13
59 0.13
60 0.15
61 0.15
62 0.14
63 0.15
64 0.15
65 0.12
66 0.13
67 0.13
68 0.14
69 0.14
70 0.16
71 0.16
72 0.17
73 0.17
74 0.16
75 0.18
76 0.19
77 0.19
78 0.19
79 0.18
80 0.17
81 0.19
82 0.2
83 0.19
84 0.19
85 0.19
86 0.18
87 0.19
88 0.19
89 0.17
90 0.17
91 0.16
92 0.13
93 0.12
94 0.11
95 0.11
96 0.11
97 0.11
98 0.1
99 0.1
100 0.13
101 0.13
102 0.15
103 0.17
104 0.24
105 0.3
106 0.38
107 0.41
108 0.38
109 0.39
110 0.39
111 0.37
112 0.29
113 0.23
114 0.16
115 0.12
116 0.11
117 0.1
118 0.08
119 0.07
120 0.07
121 0.07
122 0.06
123 0.06
124 0.08
125 0.11
126 0.12
127 0.11
128 0.11
129 0.11
130 0.13
131 0.13
132 0.11
133 0.08
134 0.08
135 0.09
136 0.09
137 0.09
138 0.06
139 0.07
140 0.08
141 0.07
142 0.07
143 0.07
144 0.07
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.06
149 0.06
150 0.07
151 0.08
152 0.06
153 0.06
154 0.07
155 0.08
156 0.08
157 0.07
158 0.06
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.04
165 0.04
166 0.05
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.06
172 0.08
173 0.08
174 0.07
175 0.07
176 0.08
177 0.08
178 0.07
179 0.07
180 0.07
181 0.09
182 0.1
183 0.1
184 0.12
185 0.13
186 0.14
187 0.19
188 0.2
189 0.21
190 0.25
191 0.26
192 0.27
193 0.3
194 0.28
195 0.23
196 0.22
197 0.21
198 0.18
199 0.21
200 0.19
201 0.17
202 0.17
203 0.17
204 0.16
205 0.13
206 0.12
207 0.07
208 0.08
209 0.08
210 0.08
211 0.08
212 0.08
213 0.1
214 0.09
215 0.08
216 0.09
217 0.13
218 0.21
219 0.27
220 0.28
221 0.35
222 0.43
223 0.46
224 0.46
225 0.47
226 0.5
227 0.55
228 0.64
229 0.66
230 0.66
231 0.69
232 0.74
233 0.69
234 0.67
235 0.64
236 0.56
237 0.54
238 0.53
239 0.49
240 0.5
241 0.5
242 0.45
243 0.45
244 0.45
245 0.43
246 0.45
247 0.49
248 0.48
249 0.49
250 0.5
251 0.54
252 0.54
253 0.54
254 0.48
255 0.44
256 0.48
257 0.52
258 0.54
259 0.53
260 0.59
261 0.63
262 0.64
263 0.7
264 0.67
265 0.62
266 0.64
267 0.65
268 0.65
269 0.63
270 0.62
271 0.55
272 0.53
273 0.5
274 0.41
275 0.34
276 0.28
277 0.21
278 0.19
279 0.17
280 0.14
281 0.14
282 0.13
283 0.11
284 0.09
285 0.08
286 0.13
287 0.22
288 0.29
289 0.38
290 0.48
291 0.56
292 0.64
293 0.74
294 0.78
295 0.78
296 0.8
297 0.73
298 0.74
299 0.65
300 0.58
301 0.47
302 0.39
303 0.33
304 0.25