Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0A1THN4

Protein Details
Accession A0A0A1THN4    Localization Confidence Low Confidence Score 8.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
390-416AGWKTNRRGNYHRKRRRWARAKQIVDSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
396-410RRGNYHRKRRRWARA
Subcellular Location(s) mito 15.5, cyto_mito 12, cyto 7.5, nucl 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MSRNVVQPNAWVVIRLPNDNIRLLEIVPNTTISLGKYGSFPTNLVIHRPYHLTYEVQEQEEGENYAKLRIVPAAELNADALVDTTAEDEAAQIDDVMEAKDGQELALADDEADIMARVDRAITDENARQTLTPDEIEELKRKGTAAGKELIEKLLLSHTAIDQKTMYSLAKYKLAKERKHMRRFTILPLDVTALAQWMLEDKDAGKILEMRQEAMALIGCWADVHFGGEPIEGLNSPHGGRWLVVDDTSGLLVAALAERMGLLHQEKEEDAVATTEAEAQAEDVEPANEDGEPAAKKAKLAPTNPKRPPRDDLEDHYAQTNTITLIHSNPQPNISLLRYFGFDASEINPPLPYHPLFTHILPISWLQLLEPEKDHTYAARPEDVPADVVAGWKTNRRGNYHRKRRRWARAKQIVDSTRAGGFTGLAIASTMDNVSILKHTLPLLAGGSPVAIYSPTIEPLAQLADCFSIPRRAAWSSTPPPGTEGKSLKELETWAGSDEFPVNPTLLVGASIQTSRARPWQVLPGRTHPFMMGRGGADGYIFTGWRAIPAEGRITARGKYQKKRTEGN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.28
3 0.28
4 0.3
5 0.33
6 0.35
7 0.35
8 0.29
9 0.28
10 0.26
11 0.28
12 0.23
13 0.23
14 0.21
15 0.21
16 0.18
17 0.18
18 0.18
19 0.13
20 0.15
21 0.13
22 0.14
23 0.14
24 0.17
25 0.2
26 0.2
27 0.2
28 0.2
29 0.25
30 0.25
31 0.28
32 0.28
33 0.27
34 0.28
35 0.31
36 0.3
37 0.28
38 0.29
39 0.26
40 0.25
41 0.32
42 0.33
43 0.32
44 0.3
45 0.27
46 0.26
47 0.26
48 0.26
49 0.17
50 0.15
51 0.14
52 0.16
53 0.16
54 0.15
55 0.14
56 0.15
57 0.15
58 0.15
59 0.17
60 0.18
61 0.17
62 0.17
63 0.16
64 0.13
65 0.12
66 0.1
67 0.08
68 0.05
69 0.05
70 0.04
71 0.05
72 0.05
73 0.05
74 0.05
75 0.05
76 0.05
77 0.06
78 0.06
79 0.05
80 0.05
81 0.06
82 0.06
83 0.07
84 0.07
85 0.06
86 0.06
87 0.08
88 0.08
89 0.07
90 0.09
91 0.08
92 0.09
93 0.1
94 0.1
95 0.08
96 0.08
97 0.08
98 0.06
99 0.06
100 0.05
101 0.04
102 0.05
103 0.05
104 0.05
105 0.05
106 0.05
107 0.08
108 0.11
109 0.12
110 0.16
111 0.19
112 0.22
113 0.23
114 0.23
115 0.2
116 0.2
117 0.21
118 0.19
119 0.16
120 0.14
121 0.15
122 0.18
123 0.2
124 0.23
125 0.22
126 0.2
127 0.2
128 0.2
129 0.22
130 0.25
131 0.26
132 0.26
133 0.3
134 0.3
135 0.32
136 0.33
137 0.29
138 0.23
139 0.19
140 0.15
141 0.12
142 0.12
143 0.09
144 0.09
145 0.1
146 0.17
147 0.17
148 0.17
149 0.15
150 0.15
151 0.16
152 0.17
153 0.15
154 0.11
155 0.15
156 0.16
157 0.23
158 0.24
159 0.28
160 0.36
161 0.44
162 0.46
163 0.52
164 0.61
165 0.65
166 0.74
167 0.74
168 0.7
169 0.7
170 0.69
171 0.67
172 0.65
173 0.56
174 0.46
175 0.42
176 0.38
177 0.29
178 0.26
179 0.18
180 0.09
181 0.07
182 0.06
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.06
188 0.06
189 0.08
190 0.09
191 0.09
192 0.09
193 0.11
194 0.12
195 0.18
196 0.17
197 0.16
198 0.15
199 0.15
200 0.15
201 0.12
202 0.12
203 0.06
204 0.06
205 0.05
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.05
212 0.05
213 0.05
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.05
218 0.06
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.06
223 0.06
224 0.07
225 0.08
226 0.08
227 0.08
228 0.08
229 0.1
230 0.09
231 0.09
232 0.08
233 0.08
234 0.08
235 0.08
236 0.06
237 0.04
238 0.03
239 0.03
240 0.03
241 0.03
242 0.02
243 0.02
244 0.02
245 0.02
246 0.02
247 0.03
248 0.04
249 0.04
250 0.06
251 0.06
252 0.07
253 0.07
254 0.08
255 0.08
256 0.07
257 0.07
258 0.06
259 0.06
260 0.05
261 0.06
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.04
266 0.04
267 0.04
268 0.04
269 0.04
270 0.04
271 0.04
272 0.04
273 0.04
274 0.05
275 0.04
276 0.04
277 0.04
278 0.06
279 0.06
280 0.07
281 0.09
282 0.09
283 0.09
284 0.13
285 0.2
286 0.23
287 0.27
288 0.38
289 0.45
290 0.55
291 0.63
292 0.68
293 0.66
294 0.64
295 0.64
296 0.6
297 0.59
298 0.53
299 0.51
300 0.5
301 0.47
302 0.43
303 0.4
304 0.33
305 0.25
306 0.21
307 0.15
308 0.08
309 0.07
310 0.07
311 0.06
312 0.08
313 0.1
314 0.14
315 0.16
316 0.16
317 0.16
318 0.17
319 0.17
320 0.18
321 0.17
322 0.14
323 0.13
324 0.13
325 0.13
326 0.13
327 0.12
328 0.1
329 0.09
330 0.09
331 0.1
332 0.13
333 0.13
334 0.12
335 0.13
336 0.12
337 0.13
338 0.16
339 0.14
340 0.13
341 0.13
342 0.17
343 0.18
344 0.18
345 0.23
346 0.2
347 0.19
348 0.17
349 0.18
350 0.15
351 0.13
352 0.13
353 0.07
354 0.11
355 0.13
356 0.13
357 0.14
358 0.15
359 0.16
360 0.17
361 0.17
362 0.14
363 0.17
364 0.19
365 0.2
366 0.21
367 0.21
368 0.21
369 0.22
370 0.22
371 0.18
372 0.14
373 0.13
374 0.09
375 0.1
376 0.09
377 0.09
378 0.1
379 0.13
380 0.17
381 0.2
382 0.24
383 0.3
384 0.4
385 0.49
386 0.6
387 0.67
388 0.74
389 0.8
390 0.86
391 0.9
392 0.92
393 0.91
394 0.9
395 0.9
396 0.9
397 0.86
398 0.8
399 0.78
400 0.7
401 0.64
402 0.55
403 0.46
404 0.36
405 0.31
406 0.26
407 0.16
408 0.13
409 0.09
410 0.09
411 0.06
412 0.05
413 0.05
414 0.05
415 0.05
416 0.05
417 0.05
418 0.04
419 0.04
420 0.05
421 0.05
422 0.06
423 0.07
424 0.07
425 0.09
426 0.09
427 0.1
428 0.1
429 0.11
430 0.11
431 0.1
432 0.1
433 0.08
434 0.08
435 0.06
436 0.06
437 0.05
438 0.04
439 0.04
440 0.07
441 0.08
442 0.09
443 0.1
444 0.1
445 0.1
446 0.11
447 0.13
448 0.1
449 0.09
450 0.09
451 0.09
452 0.09
453 0.1
454 0.12
455 0.16
456 0.17
457 0.19
458 0.22
459 0.23
460 0.26
461 0.29
462 0.37
463 0.36
464 0.43
465 0.43
466 0.39
467 0.4
468 0.41
469 0.4
470 0.38
471 0.36
472 0.32
473 0.37
474 0.38
475 0.35
476 0.33
477 0.31
478 0.26
479 0.25
480 0.22
481 0.18
482 0.18
483 0.17
484 0.16
485 0.17
486 0.14
487 0.13
488 0.13
489 0.12
490 0.1
491 0.1
492 0.1
493 0.08
494 0.08
495 0.07
496 0.07
497 0.09
498 0.09
499 0.11
500 0.13
501 0.14
502 0.17
503 0.23
504 0.26
505 0.26
506 0.3
507 0.38
508 0.44
509 0.49
510 0.52
511 0.54
512 0.57
513 0.56
514 0.54
515 0.45
516 0.4
517 0.36
518 0.34
519 0.27
520 0.21
521 0.21
522 0.21
523 0.18
524 0.15
525 0.13
526 0.11
527 0.09
528 0.09
529 0.07
530 0.09
531 0.09
532 0.12
533 0.14
534 0.14
535 0.16
536 0.19
537 0.23
538 0.24
539 0.27
540 0.29
541 0.29
542 0.29
543 0.35
544 0.42
545 0.47
546 0.54
547 0.62
548 0.67