Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P0CX58

Protein Details
Accession P0CX58    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
350-369QQGSRNSKPNYRRNPSDEKNHydrophilic
374-397YTNTTKPKVIARNPQKTNNSKSKTHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 14.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015820  TYA  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0000943  C:retrotransposon nucleocapsid  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0032197  P:retrotransposition  
KEGG sce:YAR010C  -  
sce:YPR137C-A  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01021  TYA  
Amino Acid Sequences MESQQLSQHSPISHGSACASVTSKEVHTNQDPLDVSASKTEECEKASTKANSQQTTTPASSAVPENPHHASPQTAQSHSPQNGPYPQQCMMTQNQANPSGWSFYGHPSMIPYTPYQMSPMYFPPGPQSQFPQYPSSVGTPLSTPSPESGNTFTDSSSADSDMTSTKKYVRPPPMLTSPNDFPNWVKTYIKFLQNSNLGGIIPTVNGKPVRQITDDELTFLYNTFQIFAPSQFLPTWVKDILSVDYTDIMKILSKSIEKMQSDTQEANDIVTLANLQYNGSTPADAFETKVTNIIDRLNNNGIHINNKVACQLIMRGLSGEYKFLRYTRHRHLNMTVAELFLDIHAIYEEQQGSRNSKPNYRRNPSDEKNDSRSYTNTTKPKVIARNPQKTNNSKSKTARAHNVSTSNNSPSTDNDSISKSTTEPIQLNNKHDLHLRPETY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.24
3 0.21
4 0.21
5 0.2
6 0.2
7 0.15
8 0.16
9 0.18
10 0.18
11 0.24
12 0.26
13 0.31
14 0.33
15 0.37
16 0.36
17 0.4
18 0.39
19 0.33
20 0.35
21 0.28
22 0.26
23 0.25
24 0.26
25 0.2
26 0.21
27 0.23
28 0.22
29 0.23
30 0.27
31 0.26
32 0.28
33 0.36
34 0.38
35 0.4
36 0.45
37 0.51
38 0.49
39 0.49
40 0.49
41 0.45
42 0.48
43 0.43
44 0.36
45 0.28
46 0.25
47 0.25
48 0.23
49 0.24
50 0.22
51 0.22
52 0.26
53 0.28
54 0.29
55 0.28
56 0.26
57 0.25
58 0.23
59 0.31
60 0.32
61 0.3
62 0.31
63 0.34
64 0.42
65 0.4
66 0.41
67 0.34
68 0.34
69 0.39
70 0.43
71 0.42
72 0.38
73 0.38
74 0.37
75 0.36
76 0.34
77 0.32
78 0.36
79 0.35
80 0.34
81 0.37
82 0.37
83 0.36
84 0.34
85 0.32
86 0.25
87 0.22
88 0.21
89 0.18
90 0.18
91 0.22
92 0.2
93 0.19
94 0.19
95 0.21
96 0.2
97 0.2
98 0.17
99 0.17
100 0.18
101 0.18
102 0.18
103 0.17
104 0.17
105 0.18
106 0.19
107 0.2
108 0.19
109 0.19
110 0.22
111 0.26
112 0.27
113 0.26
114 0.29
115 0.3
116 0.34
117 0.37
118 0.35
119 0.3
120 0.3
121 0.3
122 0.27
123 0.22
124 0.18
125 0.16
126 0.13
127 0.14
128 0.14
129 0.13
130 0.11
131 0.11
132 0.12
133 0.12
134 0.14
135 0.16
136 0.16
137 0.18
138 0.17
139 0.16
140 0.15
141 0.15
142 0.14
143 0.13
144 0.12
145 0.1
146 0.09
147 0.1
148 0.11
149 0.12
150 0.11
151 0.11
152 0.15
153 0.18
154 0.25
155 0.33
156 0.39
157 0.45
158 0.48
159 0.53
160 0.56
161 0.56
162 0.52
163 0.49
164 0.42
165 0.39
166 0.35
167 0.3
168 0.23
169 0.26
170 0.27
171 0.24
172 0.23
173 0.2
174 0.27
175 0.31
176 0.36
177 0.32
178 0.29
179 0.33
180 0.35
181 0.34
182 0.27
183 0.23
184 0.17
185 0.15
186 0.14
187 0.08
188 0.06
189 0.06
190 0.06
191 0.08
192 0.09
193 0.09
194 0.12
195 0.15
196 0.18
197 0.18
198 0.2
199 0.21
200 0.25
201 0.25
202 0.22
203 0.19
204 0.16
205 0.15
206 0.13
207 0.1
208 0.06
209 0.06
210 0.06
211 0.06
212 0.07
213 0.08
214 0.08
215 0.11
216 0.1
217 0.12
218 0.1
219 0.12
220 0.13
221 0.13
222 0.15
223 0.12
224 0.12
225 0.12
226 0.13
227 0.12
228 0.11
229 0.11
230 0.08
231 0.1
232 0.1
233 0.09
234 0.08
235 0.07
236 0.07
237 0.07
238 0.08
239 0.08
240 0.09
241 0.1
242 0.15
243 0.21
244 0.2
245 0.23
246 0.25
247 0.26
248 0.28
249 0.27
250 0.23
251 0.21
252 0.2
253 0.18
254 0.14
255 0.11
256 0.09
257 0.08
258 0.08
259 0.04
260 0.05
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.06
265 0.08
266 0.08
267 0.08
268 0.07
269 0.08
270 0.1
271 0.1
272 0.1
273 0.1
274 0.11
275 0.11
276 0.14
277 0.13
278 0.12
279 0.13
280 0.17
281 0.19
282 0.18
283 0.23
284 0.23
285 0.23
286 0.24
287 0.26
288 0.22
289 0.21
290 0.22
291 0.21
292 0.18
293 0.19
294 0.18
295 0.16
296 0.15
297 0.14
298 0.14
299 0.14
300 0.13
301 0.13
302 0.13
303 0.13
304 0.16
305 0.16
306 0.17
307 0.14
308 0.16
309 0.17
310 0.18
311 0.25
312 0.28
313 0.36
314 0.43
315 0.53
316 0.53
317 0.56
318 0.59
319 0.59
320 0.54
321 0.52
322 0.41
323 0.31
324 0.28
325 0.24
326 0.2
327 0.12
328 0.11
329 0.05
330 0.05
331 0.05
332 0.05
333 0.06
334 0.1
335 0.11
336 0.11
337 0.16
338 0.18
339 0.22
340 0.27
341 0.34
342 0.34
343 0.42
344 0.51
345 0.57
346 0.66
347 0.7
348 0.73
349 0.73
350 0.8
351 0.78
352 0.79
353 0.78
354 0.75
355 0.73
356 0.7
357 0.65
358 0.57
359 0.53
360 0.5
361 0.48
362 0.49
363 0.5
364 0.49
365 0.52
366 0.52
367 0.58
368 0.6
369 0.62
370 0.64
371 0.66
372 0.73
373 0.74
374 0.8
375 0.81
376 0.8
377 0.81
378 0.8
379 0.76
380 0.74
381 0.74
382 0.75
383 0.75
384 0.75
385 0.76
386 0.72
387 0.72
388 0.7
389 0.71
390 0.64
391 0.61
392 0.58
393 0.52
394 0.47
395 0.42
396 0.36
397 0.32
398 0.37
399 0.33
400 0.31
401 0.29
402 0.31
403 0.31
404 0.32
405 0.3
406 0.22
407 0.22
408 0.24
409 0.27
410 0.25
411 0.3
412 0.39
413 0.43
414 0.47
415 0.53
416 0.51
417 0.48
418 0.52
419 0.49
420 0.47