FuNGI

A0A0A1SYN5

Protein Details

Accession

A0A0A1SYN5

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
324-345	PTTGNMPPPKRQKKDKVELDGN	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 12, mito 10.5, cyto_mito 6.5, plas 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR021950 Spt20 IPR046468 Spt20-like_SEP
Gene Ontology	GO:0000124 C:SAGA complex GO:0003712 F:transcription coregulator activity
Pfam	View protein in Pfam PF12090 Spt20

Amino Acid Sequences

MSPATAVASASVATKIKRPAPPGIQTNGIISSTSSPSPSLANKKTPNSAKQPTSTPSGDRSASTSAPRPTIKIRRDTSGQNNARNSRNSAGLRTTDLDSDGLKMAGQMPYVVTDSYILKKHAGQPPSLVVHLHASHFRFDGQDGMFPYKSPMKLFLEHVRSRTIPHDLLYYFAQANVPFYDGCLIVQLHDHKSAAQTKDTARRTSPNKTVASSIHNYNPWLTPSPYVPFPKDQQHGGEAKQEPESEDGEDESGAKDGDAASATNGTATKSKTAPKAKIFTVVLHPTPESLQLDLVLKISSSKGLTESPGNVPPSTPLSLVPPTPTTGNMPPPKRQKKDKVELDGNVLYAAEGKILMATNAPLILEPTRSAEETAVLLEALSHPNHSDPPPKPNSRKRTVAEVAADEAAAAEQERYMLALDERLSSNTNSAQGTAGADGDAQTGGAAFEPRFERFKVIEDIRDQHREKKRQEKIKQQEADKRLQLQRQQQQEAQKQQELEKARREAAAREAQLRQQQQQQQQQEAHRQALAARQAAAAAAQANNAAGQNNVANMAQGHAHPGQAGVMQNVGAVGTPNAMANNMAGAAQQRFPSQMQPGQASSPIVRQGTPQNMSSPMVGSAPMQQTNSGMAGSPPRPPSAAQNPMSAPMTHSMSVRGSQQSHAAGTPRMPNATPNMAHATPINRSQMAATPRMSQASPPPNMMAQNSQMGQNMMMHNQGMSPQNAQALAAQLAAQQRQLAQQQQMVAMQNGGAGGVPNMSNMNPQQQQQMLQAMQRQFLMQQQQQAQQAQQQQAGMMAPQQQQQQQQWAQYAQQLQNMGANQLRQMTPQMQAQLQQQMARMGQLPNGAGVPGVMQRPMGAQMMNGANANMQNLAMQMQQQQQQQQQQQGQQQFVQQQQQGQPMQQMQQQQQQQQQQQQRPQTMAANQLQIQLNNHARSIYQRLLQSAALSCGGPENIPQETIDKLKATSMSQAQQALQNTINQRRAQQQQMMMQQQQQAMQGMGGMMGQQGM

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.19
2	0.26
3	0.33
4	0.39
5	0.42
6	0.49
7	0.55
8	0.63
9	0.64
10	0.62
11	0.59
12	0.54
13	0.51
14	0.44
15	0.36
16	0.27
17	0.21
18	0.21
19	0.19
20	0.19
21	0.18
22	0.17
23	0.17
24	0.21
25	0.28
26	0.34
27	0.37
28	0.46
29	0.52
30	0.57
31	0.66
32	0.7
33	0.71
34	0.71
35	0.74
36	0.71
37	0.68
38	0.68
39	0.62
40	0.61
41	0.56
42	0.49
43	0.45
44	0.43
45	0.4
46	0.35
47	0.35
48	0.32
49	0.32
50	0.33
51	0.35
52	0.34
53	0.39
54	0.4
55	0.4
56	0.45
57	0.52
58	0.55
59	0.58
60	0.58
61	0.58
62	0.62
63	0.66
64	0.66
65	0.67
66	0.67
67	0.65
68	0.7
69	0.69
70	0.71
71	0.66
72	0.61
73	0.53
74	0.54
75	0.49
76	0.45
77	0.44
78	0.4
79	0.39
80	0.37
81	0.36
82	0.28
83	0.27
84	0.24
85	0.19
86	0.19
87	0.16
88	0.13
89	0.12
90	0.11
91	0.13
92	0.13
93	0.13
94	0.11
95	0.1
96	0.12
97	0.14
98	0.13
99	0.1
100	0.11
101	0.13
102	0.17
103	0.2
104	0.2
105	0.2
106	0.25
107	0.33
108	0.38
109	0.39
110	0.36
111	0.36
112	0.41
113	0.42
114	0.39
115	0.3
116	0.24
117	0.27
118	0.27
119	0.26
120	0.25
121	0.23
122	0.24
123	0.25
124	0.24
125	0.2
126	0.19
127	0.22
128	0.18
129	0.21
130	0.21
131	0.26
132	0.25
133	0.24
134	0.28
135	0.28
136	0.29
137	0.27
138	0.3
139	0.29
140	0.32
141	0.38
142	0.43
143	0.46
144	0.48
145	0.48
146	0.47
147	0.43
148	0.42
149	0.41
150	0.38
151	0.3
152	0.28
153	0.31
154	0.26
155	0.28
156	0.26
157	0.25
158	0.19
159	0.18
160	0.19
161	0.14
162	0.16
163	0.14
164	0.14
165	0.11
166	0.12
167	0.13
168	0.11
169	0.11
170	0.11
171	0.11
172	0.1
173	0.14
174	0.18
175	0.19
176	0.21
177	0.21
178	0.19
179	0.25
180	0.31
181	0.3
182	0.28
183	0.29
184	0.33
185	0.43
186	0.47
187	0.45
188	0.41
189	0.47
190	0.5
191	0.55
192	0.57
193	0.56
194	0.54
195	0.52
196	0.52
197	0.46
198	0.47
199	0.42
200	0.38
201	0.35
202	0.34
203	0.33
204	0.32
205	0.31
206	0.27
207	0.27
208	0.25
209	0.22
210	0.23
211	0.26
212	0.3
213	0.32
214	0.32
215	0.32
216	0.35
217	0.42
218	0.42
219	0.41
220	0.38
221	0.39
222	0.39
223	0.36
224	0.4
225	0.34
226	0.33
227	0.32
228	0.3
229	0.26
230	0.25
231	0.24
232	0.17
233	0.16
234	0.14
235	0.12
236	0.12
237	0.11
238	0.09
239	0.08
240	0.07
241	0.06
242	0.06
243	0.05
244	0.06
245	0.06
246	0.06
247	0.06
248	0.07
249	0.07
250	0.08
251	0.08
252	0.08
253	0.11
254	0.12
255	0.15
256	0.17
257	0.23
258	0.3
259	0.38
260	0.44
261	0.48
262	0.52
263	0.5
264	0.54
265	0.5
266	0.44
267	0.43
268	0.41
269	0.35
270	0.31
271	0.3
272	0.23
273	0.23
274	0.24
275	0.18
276	0.13
277	0.13
278	0.12
279	0.14
280	0.13
281	0.13
282	0.1
283	0.08
284	0.09
285	0.09
286	0.09
287	0.08
288	0.09
289	0.1
290	0.11
291	0.13
292	0.14
293	0.17
294	0.18
295	0.23
296	0.24
297	0.22
298	0.21
299	0.21
300	0.23
301	0.21
302	0.18
303	0.14
304	0.16
305	0.18
306	0.19
307	0.19
308	0.16
309	0.16
310	0.16
311	0.17
312	0.17
313	0.18
314	0.27
315	0.32
316	0.35
317	0.41
318	0.52
319	0.61
320	0.64
321	0.71
322	0.72
323	0.76
324	0.83
325	0.83
326	0.81
327	0.78
328	0.72
329	0.68
330	0.58
331	0.47
332	0.37
333	0.27
334	0.18
335	0.13
336	0.11
337	0.05
338	0.04
339	0.04
340	0.05
341	0.05
342	0.05
343	0.04
344	0.05
345	0.05
346	0.05
347	0.05
348	0.04
349	0.06
350	0.06
351	0.07
352	0.07
353	0.09
354	0.11
355	0.11
356	0.12
357	0.11
358	0.11
359	0.1
360	0.1
361	0.08
362	0.06
363	0.05
364	0.05
365	0.06
366	0.07
367	0.07
368	0.07
369	0.07
370	0.08
371	0.1
372	0.12
373	0.19
374	0.2
375	0.28
376	0.36
377	0.44
378	0.52
379	0.6
380	0.67
381	0.66
382	0.72
383	0.65
384	0.67
385	0.61
386	0.56
387	0.49
388	0.41
389	0.35
390	0.27
391	0.24
392	0.15
393	0.12
394	0.07
395	0.05
396	0.04
397	0.03
398	0.03
399	0.03
400	0.03
401	0.03
402	0.04
403	0.04
404	0.04
405	0.06
406	0.07
407	0.08
408	0.09
409	0.1
410	0.11
411	0.11
412	0.12
413	0.11
414	0.13
415	0.12
416	0.12
417	0.11
418	0.1
419	0.1
420	0.09
421	0.08
422	0.05
423	0.05
424	0.05
425	0.05
426	0.04
427	0.04
428	0.03
429	0.03
430	0.03
431	0.04
432	0.04
433	0.04
434	0.07
435	0.08
436	0.1
437	0.12
438	0.13
439	0.15
440	0.15
441	0.19
442	0.22
443	0.22
444	0.24
445	0.25
446	0.28
447	0.29
448	0.36
449	0.34
450	0.37
451	0.44
452	0.49
453	0.54
454	0.6
455	0.65
456	0.68
457	0.75
458	0.77
459	0.78
460	0.8
461	0.78
462	0.74
463	0.73
464	0.67
465	0.65
466	0.55
467	0.52
468	0.46
469	0.45
470	0.44
471	0.45
472	0.47
473	0.48
474	0.49
475	0.46
476	0.51
477	0.53
478	0.55
479	0.49
480	0.44
481	0.39
482	0.37
483	0.39
484	0.35
485	0.32
486	0.31
487	0.3
488	0.29
489	0.3
490	0.29
491	0.25
492	0.27
493	0.29
494	0.24
495	0.25
496	0.25
497	0.26
498	0.3
499	0.31
500	0.28
501	0.29
502	0.34
503	0.38
504	0.45
505	0.44
506	0.43
507	0.46
508	0.46
509	0.47
510	0.43
511	0.36
512	0.29
513	0.26
514	0.23
515	0.22
516	0.22
517	0.15
518	0.13
519	0.12
520	0.12
521	0.11
522	0.11
523	0.07
524	0.05
525	0.05
526	0.04
527	0.04
528	0.04
529	0.05
530	0.05
531	0.05
532	0.04
533	0.04
534	0.05
535	0.05
536	0.06
537	0.05
538	0.05
539	0.05
540	0.05
541	0.06
542	0.05
543	0.09
544	0.08
545	0.08
546	0.08
547	0.08
548	0.08
549	0.09
550	0.1
551	0.06
552	0.06
553	0.06
554	0.06
555	0.06
556	0.05
557	0.03
558	0.03
559	0.03
560	0.03
561	0.04
562	0.04
563	0.04
564	0.04
565	0.04
566	0.04
567	0.04
568	0.04
569	0.04
570	0.04
571	0.05
572	0.06
573	0.08
574	0.09
575	0.09
576	0.11
577	0.11
578	0.14
579	0.16
580	0.18
581	0.18
582	0.2
583	0.2
584	0.19
585	0.2
586	0.18
587	0.15
588	0.14
589	0.16
590	0.14
591	0.14
592	0.15
593	0.19
594	0.24
595	0.25
596	0.24
597	0.23
598	0.24
599	0.25
600	0.23
601	0.18
602	0.13
603	0.11
604	0.1
605	0.09
606	0.12
607	0.14
608	0.15
609	0.14
610	0.14
611	0.14
612	0.15
613	0.15
614	0.1
615	0.07
616	0.07
617	0.11
618	0.12
619	0.16
620	0.17
621	0.17
622	0.18
623	0.19
624	0.25
625	0.3
626	0.37
627	0.34
628	0.36
629	0.36
630	0.37
631	0.38
632	0.3
633	0.23
634	0.17
635	0.18
636	0.15
637	0.15
638	0.15
639	0.14
640	0.15
641	0.17
642	0.18
643	0.16
644	0.16
645	0.19
646	0.18
647	0.18
648	0.18
649	0.17
650	0.15
651	0.16
652	0.2
653	0.18
654	0.18
655	0.17
656	0.18
657	0.2
658	0.24
659	0.22
660	0.2
661	0.24
662	0.23
663	0.24
664	0.23
665	0.22
666	0.19
667	0.23
668	0.23
669	0.17
670	0.18
671	0.18
672	0.22
673	0.23
674	0.24
675	0.22
676	0.23
677	0.23
678	0.25
679	0.24
680	0.2
681	0.25
682	0.29
683	0.29
684	0.27
685	0.27
686	0.27
687	0.28
688	0.29
689	0.23
690	0.17
691	0.19
692	0.18
693	0.18
694	0.18
695	0.17
696	0.16
697	0.16
698	0.15
699	0.13
700	0.13
701	0.12
702	0.11
703	0.1
704	0.13
705	0.12
706	0.13
707	0.13
708	0.13
709	0.15
710	0.14
711	0.15
712	0.12
713	0.11
714	0.11
715	0.09
716	0.09
717	0.1
718	0.12
719	0.12
720	0.12
721	0.1
722	0.11
723	0.14
724	0.18
725	0.2
726	0.2
727	0.22
728	0.22
729	0.23
730	0.25
731	0.23
732	0.2
733	0.15
734	0.13
735	0.11
736	0.09
737	0.08
738	0.06
739	0.04
740	0.04
741	0.05
742	0.05
743	0.05
744	0.06
745	0.06
746	0.09
747	0.1
748	0.17
749	0.19
750	0.2
751	0.24
752	0.24
753	0.27
754	0.26
755	0.3
756	0.25
757	0.25
758	0.29
759	0.27
760	0.26
761	0.24
762	0.22
763	0.18
764	0.21
765	0.27
766	0.23
767	0.28
768	0.31
769	0.36
770	0.4
771	0.41
772	0.37
773	0.35
774	0.4
775	0.36
776	0.33
777	0.28
778	0.24
779	0.24
780	0.23
781	0.17
782	0.13
783	0.16
784	0.17
785	0.2
786	0.24
787	0.27
788	0.32
789	0.34
790	0.41
791	0.38
792	0.39
793	0.39
794	0.37
795	0.34
796	0.33
797	0.38
798	0.31
799	0.31
800	0.29
801	0.25
802	0.27
803	0.26
804	0.24
805	0.19
806	0.17
807	0.15
808	0.18
809	0.18
810	0.16
811	0.19
812	0.19
813	0.2
814	0.23
815	0.25
816	0.22
817	0.26
818	0.28
819	0.31
820	0.3
821	0.29
822	0.27
823	0.27
824	0.26
825	0.24
826	0.23
827	0.18
828	0.18
829	0.18
830	0.17
831	0.15
832	0.15
833	0.13
834	0.1
835	0.09
836	0.09
837	0.09
838	0.1
839	0.09
840	0.09
841	0.09
842	0.11
843	0.13
844	0.13
845	0.1
846	0.09
847	0.14
848	0.16
849	0.17
850	0.16
851	0.13
852	0.13
853	0.14
854	0.15
855	0.1
856	0.08
857	0.07
858	0.08
859	0.09
860	0.08
861	0.1
862	0.14
863	0.19
864	0.24
865	0.27
866	0.33
867	0.38
868	0.46
869	0.5
870	0.53
871	0.54
872	0.55
873	0.6
874	0.59
875	0.56
876	0.49
877	0.49
878	0.46
879	0.45
880	0.46
881	0.4
882	0.41
883	0.43
884	0.48
885	0.45
886	0.41
887	0.41
888	0.37
889	0.39
890	0.36
891	0.38
892	0.36
893	0.42
894	0.47
895	0.48
896	0.53
897	0.58
898	0.61
899	0.64
900	0.68
901	0.69
902	0.72
903	0.73
904	0.71
905	0.64
906	0.6
907	0.57
908	0.51
909	0.51
910	0.46
911	0.43
912	0.39
913	0.43
914	0.42
915	0.38
916	0.37
917	0.36
918	0.4
919	0.36
920	0.36
921	0.3
922	0.28
923	0.31
924	0.36
925	0.33
926	0.3
927	0.31
928	0.33
929	0.35
930	0.35
931	0.32
932	0.27
933	0.24
934	0.2
935	0.18
936	0.16
937	0.16
938	0.16
939	0.13
940	0.13
941	0.14
942	0.14
943	0.15
944	0.16
945	0.15
946	0.18
947	0.21
948	0.22
949	0.2
950	0.19
951	0.22
952	0.24
953	0.24
954	0.28
955	0.3
956	0.31
957	0.33
958	0.35
959	0.33
960	0.36
961	0.37
962	0.34
963	0.29
964	0.32
965	0.35
966	0.41
967	0.47
968	0.43
969	0.45
970	0.5
971	0.56
972	0.58
973	0.58
974	0.56
975	0.57
976	0.64
977	0.67
978	0.62
979	0.59
980	0.56
981	0.51
982	0.47
983	0.41
984	0.34
985	0.27
986	0.23
987	0.19
988	0.14
989	0.12
990	0.1
991	0.07

A0A0A1SYN5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer