Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q12186

Protein Details
Accession Q12186    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
101-125DAQGKRTNTREQRYRKKLEDERIKLHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 13.5, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045071  BBP-like  
IPR013041  Clathrin_app_Ig-like_sf  
IPR004087  KH_dom  
IPR004088  KH_dom_type_1  
IPR036612  KH_dom_type_1_sf  
IPR032570  SF1-HH  
IPR047086  SF1-HH_sf  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0000243  C:commitment complex  
GO:0005829  C:cytosol  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0045131  F:pre-mRNA branch point binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
GO:0048024  P:regulation of mRNA splicing, via spliceosome  
GO:0000245  P:spliceosomal complex assembly  
KEGG sce:YLR116W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00013  KH_1  
PF16275  SF1-HH  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd02395  KH-I_BBP  
Amino Acid Sequences MSFRRINSRYFENRKGSSMEEKKAKVPPNVNLSLWRKNTVESDVHRFNSLPSKISGALTREQIYSYQVMFRIQEITIKLRTNDFVPPSRKNRSPSPPPVYDAQGKRTNTREQRYRKKLEDERIKLVEIALKTIPYFVPPDDYKRPTKFQDKYYIPVDQYPDVNFVGLLLGPRGRTLRKLQEDSNCKIAIRGRGSVKEGKNASDLPPGAMNFEDPLHCLIIADSEDKIQKGIKVCQNIVIKAVTSPEGQNDLKRGQLRELAELNGTLREDNRPCPICGLKDHKRYDCPNRKIPNIQGIVCKICGQTGHFSRDCNSSSQRMSRFDRNATVNNSAPIQSNDVHYNSNTHPIQAPKRSRYDNNSTEPPLKFPASSRYAPSPSPPASHISRQAQNVTPTPPPGLTSSSFSSGVPGIAPPPLQSPPESEQPKFSLPPPPGMTTVQSSIAPPPGLSGPPGFSNNMGNDINKPTPPGLQGPPGL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.62
3 0.57
4 0.57
5 0.56
6 0.56
7 0.56
8 0.56
9 0.58
10 0.63
11 0.65
12 0.63
13 0.62
14 0.61
15 0.62
16 0.63
17 0.59
18 0.6
19 0.59
20 0.6
21 0.56
22 0.53
23 0.45
24 0.43
25 0.45
26 0.41
27 0.42
28 0.38
29 0.44
30 0.46
31 0.46
32 0.45
33 0.42
34 0.39
35 0.41
36 0.38
37 0.32
38 0.26
39 0.29
40 0.29
41 0.31
42 0.32
43 0.27
44 0.28
45 0.3
46 0.31
47 0.27
48 0.27
49 0.26
50 0.24
51 0.23
52 0.2
53 0.19
54 0.18
55 0.19
56 0.19
57 0.19
58 0.19
59 0.17
60 0.19
61 0.19
62 0.22
63 0.25
64 0.27
65 0.27
66 0.27
67 0.28
68 0.26
69 0.3
70 0.31
71 0.35
72 0.39
73 0.46
74 0.51
75 0.57
76 0.61
77 0.6
78 0.64
79 0.66
80 0.7
81 0.72
82 0.73
83 0.68
84 0.65
85 0.64
86 0.59
87 0.58
88 0.51
89 0.48
90 0.47
91 0.45
92 0.47
93 0.49
94 0.54
95 0.54
96 0.6
97 0.62
98 0.65
99 0.74
100 0.8
101 0.83
102 0.8
103 0.81
104 0.8
105 0.81
106 0.82
107 0.76
108 0.74
109 0.67
110 0.62
111 0.51
112 0.44
113 0.37
114 0.26
115 0.23
116 0.16
117 0.14
118 0.14
119 0.15
120 0.14
121 0.11
122 0.13
123 0.1
124 0.16
125 0.17
126 0.24
127 0.3
128 0.35
129 0.41
130 0.44
131 0.49
132 0.49
133 0.57
134 0.56
135 0.55
136 0.61
137 0.57
138 0.56
139 0.55
140 0.53
141 0.43
142 0.41
143 0.38
144 0.29
145 0.27
146 0.23
147 0.22
148 0.18
149 0.17
150 0.13
151 0.11
152 0.09
153 0.08
154 0.07
155 0.05
156 0.06
157 0.06
158 0.08
159 0.1
160 0.1
161 0.14
162 0.2
163 0.29
164 0.35
165 0.39
166 0.43
167 0.5
168 0.55
169 0.54
170 0.53
171 0.44
172 0.37
173 0.35
174 0.33
175 0.31
176 0.28
177 0.3
178 0.28
179 0.29
180 0.33
181 0.39
182 0.37
183 0.37
184 0.35
185 0.31
186 0.31
187 0.29
188 0.27
189 0.25
190 0.23
191 0.18
192 0.19
193 0.17
194 0.15
195 0.14
196 0.12
197 0.08
198 0.09
199 0.08
200 0.07
201 0.08
202 0.07
203 0.07
204 0.07
205 0.06
206 0.07
207 0.07
208 0.07
209 0.06
210 0.08
211 0.09
212 0.09
213 0.09
214 0.09
215 0.1
216 0.13
217 0.19
218 0.21
219 0.24
220 0.24
221 0.31
222 0.32
223 0.3
224 0.29
225 0.22
226 0.19
227 0.15
228 0.16
229 0.1
230 0.09
231 0.09
232 0.09
233 0.13
234 0.13
235 0.14
236 0.16
237 0.15
238 0.18
239 0.2
240 0.2
241 0.17
242 0.22
243 0.22
244 0.23
245 0.24
246 0.21
247 0.18
248 0.17
249 0.16
250 0.12
251 0.11
252 0.08
253 0.07
254 0.11
255 0.13
256 0.15
257 0.21
258 0.22
259 0.22
260 0.25
261 0.27
262 0.24
263 0.28
264 0.35
265 0.38
266 0.45
267 0.5
268 0.51
269 0.55
270 0.6
271 0.65
272 0.67
273 0.65
274 0.66
275 0.66
276 0.67
277 0.66
278 0.63
279 0.6
280 0.53
281 0.48
282 0.42
283 0.39
284 0.36
285 0.31
286 0.29
287 0.2
288 0.17
289 0.15
290 0.14
291 0.19
292 0.22
293 0.28
294 0.28
295 0.28
296 0.3
297 0.33
298 0.32
299 0.29
300 0.28
301 0.26
302 0.29
303 0.35
304 0.37
305 0.39
306 0.43
307 0.47
308 0.48
309 0.47
310 0.49
311 0.47
312 0.48
313 0.46
314 0.45
315 0.37
316 0.34
317 0.32
318 0.27
319 0.24
320 0.2
321 0.19
322 0.15
323 0.17
324 0.19
325 0.2
326 0.2
327 0.19
328 0.22
329 0.2
330 0.27
331 0.25
332 0.23
333 0.25
334 0.3
335 0.37
336 0.42
337 0.49
338 0.47
339 0.55
340 0.59
341 0.62
342 0.64
343 0.66
344 0.65
345 0.63
346 0.63
347 0.6
348 0.6
349 0.55
350 0.5
351 0.44
352 0.37
353 0.31
354 0.28
355 0.32
356 0.31
357 0.33
358 0.34
359 0.36
360 0.38
361 0.38
362 0.4
363 0.39
364 0.35
365 0.35
366 0.33
367 0.31
368 0.33
369 0.37
370 0.42
371 0.41
372 0.44
373 0.45
374 0.48
375 0.48
376 0.48
377 0.46
378 0.42
379 0.37
380 0.34
381 0.32
382 0.28
383 0.25
384 0.23
385 0.23
386 0.21
387 0.23
388 0.25
389 0.26
390 0.27
391 0.25
392 0.24
393 0.21
394 0.19
395 0.15
396 0.13
397 0.1
398 0.11
399 0.12
400 0.11
401 0.14
402 0.16
403 0.17
404 0.18
405 0.23
406 0.26
407 0.35
408 0.39
409 0.37
410 0.39
411 0.42
412 0.46
413 0.42
414 0.4
415 0.38
416 0.35
417 0.43
418 0.42
419 0.41
420 0.4
421 0.4
422 0.4
423 0.36
424 0.36
425 0.3
426 0.26
427 0.24
428 0.24
429 0.26
430 0.23
431 0.19
432 0.19
433 0.19
434 0.2
435 0.2
436 0.19
437 0.18
438 0.21
439 0.24
440 0.23
441 0.21
442 0.26
443 0.25
444 0.29
445 0.28
446 0.25
447 0.26
448 0.32
449 0.34
450 0.3
451 0.31
452 0.27
453 0.3
454 0.32
455 0.34
456 0.32