FuNGI

Q06679

Protein Details

Accession

Q06679

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
6-29	LSVLKEKSRSLKIRNKPVKMTSQE	Hydrophilic
658-683	DFDVDFPINKRRKQKKRTHEGLTITD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
667-674	KRRKQKKR

Subcellular Location(s)

nucl 12.5, mito 10, cyto_nucl 7.5, golg 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR046351 UTP4 IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR001680 WD40_repeat IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0030686 C:90S preribosome GO:0005730 C:nucleolus GO:0005654 C:nucleoplasm GO:0032040 C:small-subunit processome GO:0034455 C:t-UTP complex GO:0030490 P:maturation of SSU-rRNA GO:0000462 P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0045943 P:positive regulation of transcription by RNA polymerase I
KEGG	sce:YDR324C -
Pfam	View protein in Pfam PF00400 WD40
PROSITE	View protein in PROSITE PS50082 WD_REPEATS_2 PS50294 WD_REPEATS_REGION

Amino Acid Sequences

MSSSLLSVLKEKSRSLKIRNKPVKMTSQERMIVHRCRFVDFTPATITSLAFSHKSNINKLTPSDLRLAIGRSNGNIEIWNPRNNWFQEMVIEGGKDRSIEGLCWSNVNGESLRLFSIGGSTVVTEWDLATGLPLRNYDCNSGVIWSISINDSQDKLSVGCDNGTVVLIDISGGPGVLEHDTILMRQEARVLTLAWKKDDFVIGGCSDGRIRIWSAQKNDENMGRLLHTMKVDKAKKESTLVWSVIYLPRTDQIASGDSTGSIKFWDFQFATLNQSFKAHDADVLCLTTDTDNNYVFSAGVDRKIFQFSQNTNKSQKNNRWVNSSNRLLHGNDIRAICAYQSKGADFLVSGGVEKTLVINSLTSFSNGNYRKMPTVEPYSKNVLVNKEQRLVVSWSESTVKIWTMGTDSSTEQNYKLVCKLTLKDDQNISTCSLSPDGQVLVVGRPSTTKVFHLQPVGNKLKVTKLDNDLLLRTSTKLVKFIDNSKIVICSCEDDVFIVDLESEEDEKPQEVELLEVTSTKSSIKVPYINRINHLEVDQNIAVISRGCGVVDILDLKARISKPLARLNNFITAVHINTSRKSVVVITADNKIYEFNMNLNSEAENEDSESVLTQWSKNNTDNLPKEWKTLKENCVGIFSDIENSSRLWFWGATWISRIDFDVDFPINKRRKQKKRTHEGLTITDESNFMNDEEDDEDDDIDMEISENLNVLLNQGNKIKSTDVQRNEESSGHFFFTDKYKPLLFVDLISSNELAIIERNPLTFHSKQKAFIQPKLVF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.52
2	0.59
3	0.65
4	0.69
5	0.78
6	0.84
7	0.84
8	0.82
9	0.81
10	0.81
11	0.79
12	0.77
13	0.72
14	0.7
15	0.68
16	0.61
17	0.61
18	0.59
19	0.59
20	0.56
21	0.57
22	0.49
23	0.47
24	0.49
25	0.42
26	0.45
27	0.36
28	0.36
29	0.34
30	0.33
31	0.31
32	0.28
33	0.27
34	0.18
35	0.18
36	0.18
37	0.14
38	0.14
39	0.18
40	0.23
41	0.28
42	0.33
43	0.38
44	0.4
45	0.43
46	0.44
47	0.47
48	0.45
49	0.44
50	0.42
51	0.37
52	0.33
53	0.31
54	0.32
55	0.26
56	0.27
57	0.25
58	0.21
59	0.24
60	0.23
61	0.21
62	0.2
63	0.19
64	0.24
65	0.27
66	0.32
67	0.3
68	0.33
69	0.41
70	0.41
71	0.44
72	0.37
73	0.34
74	0.29
75	0.3
76	0.28
77	0.21
78	0.2
79	0.16
80	0.15
81	0.15
82	0.13
83	0.11
84	0.12
85	0.12
86	0.12
87	0.16
88	0.2
89	0.2
90	0.21
91	0.21
92	0.21
93	0.2
94	0.22
95	0.19
96	0.15
97	0.15
98	0.15
99	0.15
100	0.13
101	0.12
102	0.09
103	0.1
104	0.09
105	0.09
106	0.08
107	0.08
108	0.08
109	0.08
110	0.08
111	0.07
112	0.06
113	0.06
114	0.06
115	0.05
116	0.07
117	0.1
118	0.11
119	0.12
120	0.13
121	0.16
122	0.19
123	0.21
124	0.24
125	0.21
126	0.22
127	0.21
128	0.21
129	0.19
130	0.16
131	0.14
132	0.11
133	0.1
134	0.1
135	0.1
136	0.1
137	0.12
138	0.12
139	0.13
140	0.13
141	0.13
142	0.12
143	0.13
144	0.14
145	0.13
146	0.12
147	0.12
148	0.11
149	0.11
150	0.11
151	0.09
152	0.07
153	0.06
154	0.05
155	0.05
156	0.05
157	0.05
158	0.04
159	0.04
160	0.03
161	0.03
162	0.05
163	0.05
164	0.05
165	0.05
166	0.06
167	0.07
168	0.07
169	0.08
170	0.09
171	0.09
172	0.09
173	0.12
174	0.11
175	0.13
176	0.14
177	0.13
178	0.18
179	0.23
180	0.25
181	0.24
182	0.25
183	0.24
184	0.24
185	0.25
186	0.2
187	0.16
188	0.17
189	0.14
190	0.15
191	0.14
192	0.13
193	0.12
194	0.11
195	0.1
196	0.09
197	0.11
198	0.16
199	0.23
200	0.29
201	0.33
202	0.41
203	0.44
204	0.45
205	0.46
206	0.43
207	0.38
208	0.33
209	0.29
210	0.21
211	0.19
212	0.18
213	0.17
214	0.16
215	0.16
216	0.18
217	0.27
218	0.31
219	0.33
220	0.37
221	0.38
222	0.38
223	0.39
224	0.39
225	0.35
226	0.36
227	0.33
228	0.28
229	0.25
230	0.25
231	0.25
232	0.22
233	0.17
234	0.12
235	0.13
236	0.14
237	0.14
238	0.13
239	0.12
240	0.13
241	0.13
242	0.13
243	0.12
244	0.11
245	0.11
246	0.1
247	0.09
248	0.07
249	0.07
250	0.08
251	0.08
252	0.13
253	0.13
254	0.14
255	0.17
256	0.17
257	0.23
258	0.23
259	0.23
260	0.18
261	0.19
262	0.19
263	0.16
264	0.18
265	0.12
266	0.13
267	0.13
268	0.15
269	0.14
270	0.14
271	0.13
272	0.1
273	0.1
274	0.09
275	0.09
276	0.09
277	0.1
278	0.1
279	0.11
280	0.11
281	0.11
282	0.1
283	0.09
284	0.11
285	0.1
286	0.12
287	0.12
288	0.13
289	0.14
290	0.17
291	0.17
292	0.16
293	0.22
294	0.22
295	0.32
296	0.37
297	0.4
298	0.43
299	0.48
300	0.51
301	0.54
302	0.58
303	0.58
304	0.61
305	0.59
306	0.61
307	0.6
308	0.62
309	0.61
310	0.6
311	0.52
312	0.45
313	0.45
314	0.38
315	0.37
316	0.33
317	0.26
318	0.23
319	0.21
320	0.2
321	0.18
322	0.17
323	0.14
324	0.13
325	0.12
326	0.1
327	0.11
328	0.11
329	0.11
330	0.11
331	0.11
332	0.08
333	0.08
334	0.06
335	0.06
336	0.06
337	0.05
338	0.05
339	0.05
340	0.05
341	0.05
342	0.04
343	0.04
344	0.04
345	0.05
346	0.05
347	0.07
348	0.07
349	0.08
350	0.08
351	0.08
352	0.16
353	0.17
354	0.19
355	0.19
356	0.21
357	0.22
358	0.23
359	0.24
360	0.2
361	0.26
362	0.31
363	0.31
364	0.33
365	0.36
366	0.37
367	0.37
368	0.35
369	0.3
370	0.3
371	0.34
372	0.33
373	0.31
374	0.3
375	0.28
376	0.28
377	0.27
378	0.21
379	0.17
380	0.14
381	0.12
382	0.14
383	0.14
384	0.12
385	0.1
386	0.1
387	0.09
388	0.09
389	0.08
390	0.08
391	0.08
392	0.08
393	0.09
394	0.09
395	0.1
396	0.11
397	0.12
398	0.1
399	0.12
400	0.12
401	0.12
402	0.13
403	0.13
404	0.13
405	0.15
406	0.16
407	0.19
408	0.27
409	0.27
410	0.29
411	0.3
412	0.31
413	0.3
414	0.3
415	0.26
416	0.19
417	0.17
418	0.15
419	0.14
420	0.12
421	0.11
422	0.1
423	0.09
424	0.08
425	0.08
426	0.07
427	0.06
428	0.07
429	0.07
430	0.06
431	0.06
432	0.08
433	0.1
434	0.1
435	0.12
436	0.15
437	0.17
438	0.2
439	0.24
440	0.24
441	0.26
442	0.33
443	0.35
444	0.32
445	0.3
446	0.28
447	0.28
448	0.3
449	0.3
450	0.26
451	0.27
452	0.29
453	0.3
454	0.31
455	0.27
456	0.24
457	0.22
458	0.17
459	0.14
460	0.14
461	0.16
462	0.15
463	0.18
464	0.19
465	0.22
466	0.24
467	0.28
468	0.33
469	0.31
470	0.31
471	0.28
472	0.28
473	0.24
474	0.23
475	0.18
476	0.12
477	0.12
478	0.11
479	0.11
480	0.09
481	0.1
482	0.09
483	0.09
484	0.07
485	0.06
486	0.05
487	0.06
488	0.06
489	0.06
490	0.06
491	0.07
492	0.07
493	0.08
494	0.08
495	0.08
496	0.08
497	0.07
498	0.07
499	0.07
500	0.08
501	0.07
502	0.08
503	0.08
504	0.07
505	0.07
506	0.07
507	0.08
508	0.09
509	0.12
510	0.15
511	0.21
512	0.24
513	0.33
514	0.41
515	0.41
516	0.43
517	0.44
518	0.43
519	0.37
520	0.36
521	0.29
522	0.22
523	0.25
524	0.22
525	0.17
526	0.15
527	0.13
528	0.12
529	0.1
530	0.1
531	0.05
532	0.06
533	0.05
534	0.06
535	0.06
536	0.06
537	0.06
538	0.07
539	0.06
540	0.08
541	0.08
542	0.08
543	0.13
544	0.13
545	0.14
546	0.16
547	0.21
548	0.26
549	0.36
550	0.43
551	0.42
552	0.45
553	0.45
554	0.49
555	0.45
556	0.38
557	0.32
558	0.26
559	0.24
560	0.22
561	0.23
562	0.17
563	0.18
564	0.21
565	0.18
566	0.17
567	0.17
568	0.16
569	0.16
570	0.18
571	0.2
572	0.19
573	0.23
574	0.24
575	0.23
576	0.22
577	0.18
578	0.16
579	0.15
580	0.14
581	0.11
582	0.16
583	0.17
584	0.17
585	0.18
586	0.17
587	0.16
588	0.17
589	0.15
590	0.1
591	0.1
592	0.1
593	0.09
594	0.09
595	0.09
596	0.07
597	0.09
598	0.1
599	0.1
600	0.15
601	0.19
602	0.24
603	0.26
604	0.31
605	0.33
606	0.42
607	0.44
608	0.45
609	0.49
610	0.46
611	0.49
612	0.49
613	0.5
614	0.49
615	0.53
616	0.53
617	0.51
618	0.53
619	0.48
620	0.46
621	0.42
622	0.35
623	0.28
624	0.23
625	0.2
626	0.18
627	0.18
628	0.16
629	0.15
630	0.15
631	0.14
632	0.14
633	0.12
634	0.11
635	0.11
636	0.19
637	0.19
638	0.19
639	0.21
640	0.22
641	0.21
642	0.21
643	0.22
644	0.16
645	0.15
646	0.15
647	0.18
648	0.18
649	0.19
650	0.21
651	0.29
652	0.33
653	0.39
654	0.49
655	0.55
656	0.64
657	0.74
658	0.82
659	0.84
660	0.88
661	0.92
662	0.89
663	0.87
664	0.82
665	0.77
666	0.73
667	0.65
668	0.54
669	0.46
670	0.37
671	0.29
672	0.24
673	0.19
674	0.12
675	0.1
676	0.09
677	0.1
678	0.12
679	0.13
680	0.14
681	0.13
682	0.13
683	0.11
684	0.12
685	0.1
686	0.08
687	0.07
688	0.06
689	0.06
690	0.06
691	0.06
692	0.06
693	0.06
694	0.07
695	0.07
696	0.08
697	0.12
698	0.13
699	0.17
700	0.21
701	0.23
702	0.23
703	0.25
704	0.27
705	0.27
706	0.34
707	0.4
708	0.43
709	0.49
710	0.51
711	0.52
712	0.52
713	0.5
714	0.45
715	0.4
716	0.35
717	0.3
718	0.26
719	0.23
720	0.23
721	0.27
722	0.3
723	0.28
724	0.3
725	0.29
726	0.31
727	0.33
728	0.36
729	0.3
730	0.25
731	0.27
732	0.26
733	0.26
734	0.25
735	0.23
736	0.18
737	0.18
738	0.16
739	0.12
740	0.11
741	0.11
742	0.13
743	0.15
744	0.15
745	0.15
746	0.18
747	0.25
748	0.28
749	0.36
750	0.42
751	0.44
752	0.48
753	0.56
754	0.64
755	0.64
756	0.65

Q06679

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer