FuNGI

P53866

Protein Details

Accession

P53866

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
6-52	SHYQGSRRRHARGSNSKKAGRGNAKGIQGRKIKKKPTPTNSWHNSSI	Hydrophilic
556-578	QSKFSKRIETKAKKRKAKEDFID	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
11-41	SRRRHARGSNSKKAGRGNAKGIQGRKIKKKP
531-538	KGKGKKKK
561-573	KRIETKAKKRKAK

Subcellular Location(s)

nucl 27

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR000467 G_patch_dom IPR036867 R3H_dom_sf IPR034082 R3H_G-patch
Gene Ontology	GO:0030686 C:90S preribosome GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005730 C:nucleolus GO:0005634 C:nucleus GO:0030687 C:preribosome, large subunit precursor GO:0030688 C:preribosome, small subunit precursor GO:0008047 F:enzyme activator activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0030490 P:maturation of SSU-rRNA GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome GO:0006364 P:rRNA processing
KEGG	sce:YNL224C -
Pfam	View protein in Pfam PF01585 G-patch
PROSITE	View protein in PROSITE PS50174 G_PATCH
CDD	cd02646 R3H_G-patch

Amino Acid Sequences

MAKRHSHYQGSRRRHARGSNSKKAGRGNAKGIQGRKIKKKPTPTNSWHNSSIPLGEGDLDDVGADFNPGRAFISPKTIEDYYFGRDAKSRSMKMGGLRPGNRYDSSTDLQAGRAAFRKRPMQFVKAKEVYDPSHNMIQKLRAKNETKNSEEIVEREADVFEEPGKMTSDVEYINNEDSENEDDDSQNSPSTDHSLSSNESKVEDGDLFFVDEEAQQSPDLTKIKRVCIEEIARPREVAIEFDPILTIGKVELSVSEGNESKEISVDVPNKGNKTYHPFAGYISNVLHGMHTSDSDNDELDYEIETENNSEPLYESSASSEVDQGFNYVGQRHNSRADNNLLPSPSPQLTEDIKCLSINGTKTFEGNNDNLPSPASEELEFGFKEEDFVINTNDIVVSNIRMGGVDNSYYLRCYRLLGDYDFHWIDQDLLTDFVVDELGLPEDRLPAYLNFIKNSLIPKIEPAEPTYSDIPISDSSDEGDSYEGDSYEDDEDMASSVVHSDIEEGLDDLIAYTLKHDTERFKTFETKSLETKGKGKKKKLLIDDALALDTETLETLQSKFSKRIETKAKKRKAKEDFIDQENRNSNDMLKKYPYGLHIQNIKDEFESFLSRNNDRLTFPPLDPHGNKTVMKIAKHYNMKSSKIGKANHTSVVVEKIKKTKWSSPNYSLIDQLMRQRPVFMRIDIRRPREEQAAFERTKTIRGKFHVKEGEIVGQNAPEIGNENIGRRMLEKLGWKSGEGLGIQGNKGISEPIFAKIKKNRSGLRHSES

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.77
2	0.77
3	0.78
4	0.79
5	0.8
6	0.81
7	0.83
8	0.8
9	0.77
10	0.75
11	0.74
12	0.72
13	0.69
14	0.66
15	0.64
16	0.67
17	0.69
18	0.65
19	0.63
20	0.63
21	0.65
22	0.68
23	0.71
24	0.73
25	0.75
26	0.83
27	0.85
28	0.86
29	0.87
30	0.85
31	0.86
32	0.84
33	0.82
34	0.76
35	0.67
36	0.6
37	0.51
38	0.44
39	0.34
40	0.27
41	0.2
42	0.16
43	0.15
44	0.13
45	0.11
46	0.09
47	0.07
48	0.07
49	0.07
50	0.06
51	0.07
52	0.05
53	0.07
54	0.07
55	0.08
56	0.09
57	0.1
58	0.14
59	0.15
60	0.24
61	0.25
62	0.26
63	0.32
64	0.31
65	0.3
66	0.29
67	0.3
68	0.26
69	0.29
70	0.28
71	0.23
72	0.27
73	0.28
74	0.35
75	0.42
76	0.39
77	0.38
78	0.42
79	0.43
80	0.45
81	0.51
82	0.49
83	0.49
84	0.5
85	0.51
86	0.52
87	0.53
88	0.48
89	0.43
90	0.38
91	0.36
92	0.35
93	0.32
94	0.31
95	0.27
96	0.26
97	0.26
98	0.23
99	0.2
100	0.25
101	0.26
102	0.27
103	0.32
104	0.41
105	0.4
106	0.5
107	0.53
108	0.55
109	0.6
110	0.62
111	0.66
112	0.62
113	0.61
114	0.54
115	0.52
116	0.46
117	0.44
118	0.42
119	0.35
120	0.38
121	0.39
122	0.37
123	0.36
124	0.41
125	0.44
126	0.47
127	0.49
128	0.5
129	0.54
130	0.6
131	0.67
132	0.66
133	0.62
134	0.59
135	0.55
136	0.49
137	0.46
138	0.39
139	0.31
140	0.24
141	0.2
142	0.17
143	0.15
144	0.13
145	0.12
146	0.11
147	0.09
148	0.09
149	0.09
150	0.1
151	0.12
152	0.11
153	0.11
154	0.12
155	0.13
156	0.13
157	0.14
158	0.14
159	0.14
160	0.15
161	0.15
162	0.14
163	0.12
164	0.13
165	0.15
166	0.15
167	0.14
168	0.13
169	0.13
170	0.14
171	0.17
172	0.15
173	0.13
174	0.12
175	0.11
176	0.12
177	0.16
178	0.15
179	0.14
180	0.15
181	0.16
182	0.19
183	0.22
184	0.23
185	0.19
186	0.19
187	0.18
188	0.17
189	0.16
190	0.15
191	0.11
192	0.11
193	0.1
194	0.1
195	0.09
196	0.09
197	0.08
198	0.07
199	0.08
200	0.08
201	0.08
202	0.08
203	0.08
204	0.09
205	0.12
206	0.16
207	0.15
208	0.22
209	0.25
210	0.3
211	0.35
212	0.37
213	0.35
214	0.39
215	0.42
216	0.42
217	0.47
218	0.47
219	0.42
220	0.39
221	0.37
222	0.33
223	0.29
224	0.24
225	0.17
226	0.17
227	0.16
228	0.17
229	0.16
230	0.13
231	0.13
232	0.1
233	0.09
234	0.04
235	0.05
236	0.05
237	0.05
238	0.05
239	0.07
240	0.08
241	0.08
242	0.1
243	0.11
244	0.12
245	0.12
246	0.12
247	0.1
248	0.09
249	0.1
250	0.09
251	0.13
252	0.15
253	0.17
254	0.22
255	0.24
256	0.25
257	0.26
258	0.26
259	0.24
260	0.29
261	0.3
262	0.28
263	0.28
264	0.27
265	0.27
266	0.3
267	0.27
268	0.2
269	0.17
270	0.15
271	0.13
272	0.12
273	0.11
274	0.07
275	0.08
276	0.06
277	0.07
278	0.07
279	0.08
280	0.09
281	0.09
282	0.09
283	0.08
284	0.08
285	0.08
286	0.07
287	0.07
288	0.06
289	0.06
290	0.06
291	0.06
292	0.07
293	0.07
294	0.07
295	0.06
296	0.06
297	0.06
298	0.07
299	0.1
300	0.09
301	0.09
302	0.1
303	0.11
304	0.11
305	0.11
306	0.12
307	0.1
308	0.1
309	0.1
310	0.09
311	0.08
312	0.09
313	0.09
314	0.09
315	0.11
316	0.13
317	0.15
318	0.17
319	0.22
320	0.23
321	0.24
322	0.26
323	0.28
324	0.28
325	0.28
326	0.27
327	0.22
328	0.2
329	0.2
330	0.19
331	0.15
332	0.14
333	0.13
334	0.14
335	0.17
336	0.17
337	0.18
338	0.16
339	0.16
340	0.15
341	0.15
342	0.13
343	0.13
344	0.14
345	0.14
346	0.16
347	0.15
348	0.16
349	0.17
350	0.17
351	0.17
352	0.16
353	0.17
354	0.16
355	0.16
356	0.15
357	0.15
358	0.13
359	0.12
360	0.12
361	0.1
362	0.08
363	0.08
364	0.09
365	0.1
366	0.1
367	0.09
368	0.08
369	0.07
370	0.07
371	0.07
372	0.07
373	0.06
374	0.07
375	0.08
376	0.07
377	0.07
378	0.06
379	0.06
380	0.06
381	0.06
382	0.05
383	0.05
384	0.05
385	0.05
386	0.05
387	0.05
388	0.05
389	0.06
390	0.06
391	0.06
392	0.06
393	0.07
394	0.07
395	0.08
396	0.08
397	0.08
398	0.08
399	0.09
400	0.1
401	0.12
402	0.14
403	0.15
404	0.16
405	0.15
406	0.19
407	0.19
408	0.17
409	0.14
410	0.11
411	0.11
412	0.1
413	0.1
414	0.06
415	0.06
416	0.06
417	0.06
418	0.05
419	0.05
420	0.05
421	0.04
422	0.03
423	0.03
424	0.04
425	0.04
426	0.04
427	0.04
428	0.06
429	0.06
430	0.06
431	0.07
432	0.06
433	0.11
434	0.15
435	0.16
436	0.16
437	0.17
438	0.17
439	0.17
440	0.19
441	0.17
442	0.14
443	0.13
444	0.14
445	0.17
446	0.19
447	0.18
448	0.18
449	0.2
450	0.19
451	0.22
452	0.21
453	0.18
454	0.16
455	0.15
456	0.15
457	0.12
458	0.13
459	0.1
460	0.09
461	0.1
462	0.1
463	0.1
464	0.08
465	0.08
466	0.06
467	0.07
468	0.07
469	0.06
470	0.06
471	0.06
472	0.07
473	0.07
474	0.07
475	0.06
476	0.06
477	0.06
478	0.06
479	0.06
480	0.04
481	0.04
482	0.04
483	0.04
484	0.04
485	0.04
486	0.05
487	0.05
488	0.05
489	0.05
490	0.05
491	0.05
492	0.05
493	0.05
494	0.04
495	0.04
496	0.04
497	0.04
498	0.04
499	0.06
500	0.06
501	0.08
502	0.1
503	0.15
504	0.21
505	0.26
506	0.28
507	0.29
508	0.36
509	0.37
510	0.42
511	0.43
512	0.4
513	0.39
514	0.43
515	0.44
516	0.39
517	0.46
518	0.48
519	0.52
520	0.57
521	0.61
522	0.63
523	0.68
524	0.74
525	0.73
526	0.73
527	0.67
528	0.61
529	0.56
530	0.49
531	0.4
532	0.32
533	0.24
534	0.14
535	0.11
536	0.08
537	0.05
538	0.04
539	0.04
540	0.05
541	0.06
542	0.1
543	0.13
544	0.16
545	0.2
546	0.23
547	0.32
548	0.34
549	0.42
550	0.49
551	0.57
552	0.66
553	0.72
554	0.79
555	0.79
556	0.84
557	0.85
558	0.84
559	0.83
560	0.79
561	0.79
562	0.75
563	0.73
564	0.75
565	0.65
566	0.63
567	0.59
568	0.54
569	0.45
570	0.39
571	0.36
572	0.34
573	0.35
574	0.33
575	0.29
576	0.29
577	0.3
578	0.32
579	0.32
580	0.31
581	0.32
582	0.34
583	0.38
584	0.38
585	0.41
586	0.39
587	0.38
588	0.32
589	0.29
590	0.24
591	0.2
592	0.22
593	0.17
594	0.23
595	0.26
596	0.26
597	0.3
598	0.31
599	0.31
600	0.29
601	0.31
602	0.31
603	0.3
604	0.29
605	0.32
606	0.32
607	0.38
608	0.37
609	0.39
610	0.39
611	0.39
612	0.39
613	0.35
614	0.41
615	0.37
616	0.37
617	0.37
618	0.38
619	0.43
620	0.5
621	0.5
622	0.51
623	0.53
624	0.56
625	0.59
626	0.57
627	0.56
628	0.56
629	0.58
630	0.56
631	0.58
632	0.58
633	0.54
634	0.49
635	0.42
636	0.37
637	0.41
638	0.39
639	0.34
640	0.35
641	0.39
642	0.41
643	0.48
644	0.52
645	0.54
646	0.58
647	0.65
648	0.69
649	0.69
650	0.75
651	0.72
652	0.67
653	0.59
654	0.51
655	0.44
656	0.37
657	0.39
658	0.37
659	0.36
660	0.34
661	0.38
662	0.37
663	0.41
664	0.42
665	0.37
666	0.39
667	0.42
668	0.52
669	0.56
670	0.6
671	0.6
672	0.6
673	0.6
674	0.59
675	0.55
676	0.51
677	0.51
678	0.54
679	0.49
680	0.46
681	0.48
682	0.4
683	0.46
684	0.46
685	0.43
686	0.42
687	0.48
688	0.57
689	0.54
690	0.63
691	0.63
692	0.58
693	0.56
694	0.52
695	0.54
696	0.46
697	0.44
698	0.35
699	0.27
700	0.25
701	0.22
702	0.18
703	0.1
704	0.11
705	0.1
706	0.15
707	0.16
708	0.19
709	0.21
710	0.22
711	0.22
712	0.21
713	0.24
714	0.2
715	0.23
716	0.3
717	0.32
718	0.4
719	0.4
720	0.4
721	0.39
722	0.39
723	0.38
724	0.29
725	0.25
726	0.22
727	0.23
728	0.23
729	0.22
730	0.2
731	0.17
732	0.17
733	0.17
734	0.12
735	0.14
736	0.15
737	0.18
738	0.26
739	0.27
740	0.35
741	0.42
742	0.51
743	0.56
744	0.64
745	0.66
746	0.67
747	0.77

P53866

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer