Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0A1TMA0

Protein Details
Accession A0A0A1TMA0    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
190-211LDKMEKKKGREDKKKVKKIEDDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
194-207EKKKGREDKKKVKK
Subcellular Location(s) cyto 14, nucl 6, pero 4, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR013949  Utp6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0030515  F:snoRNA binding  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
Pfam View protein in Pfam  
PF08640  U3_assoc_6  
Amino Acid Sequences MAGVAEKARFYLERSVPQLREWEEKDIFSKEEIRTLVQKRNDFEHKVLARGNTAYEWSTYAQWERSLEALRSKRCVRLKIRHLNSAHAGQGRVLGIYERAVGRHPGSSELWREYLHYTAEIKASKRWRKTMTNALRMMPTDADLWIMAGARSAKNGDMAAARGFFMRGCRFCTKECKLWIEYARSEMQWLDKMEKKKGREDKKKVKKIEDDDEIIMGDSDDDEDDNGMILPEPSAAQAKVIDKQDSKQLASNPAMDGAIPMAIFEISRKQSFFKADVAEQFYLMFMSFTEVSSHARISQHVLDALTTAFPKAAATCSCHIQAPILGVAPGTAEYPRRLQQVVPLLEKYMAETEDKAGLKRKTAAWMDEQLKWDGLDEDVRAVLEYLRKKHCGDL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.5
3 0.48
4 0.5
5 0.53
6 0.47
7 0.5
8 0.46
9 0.48
10 0.42
11 0.43
12 0.44
13 0.4
14 0.37
15 0.31
16 0.35
17 0.28
18 0.32
19 0.31
20 0.31
21 0.37
22 0.41
23 0.46
24 0.47
25 0.51
26 0.49
27 0.55
28 0.6
29 0.56
30 0.53
31 0.55
32 0.5
33 0.48
34 0.49
35 0.42
36 0.37
37 0.33
38 0.32
39 0.23
40 0.23
41 0.2
42 0.17
43 0.18
44 0.16
45 0.17
46 0.17
47 0.19
48 0.19
49 0.21
50 0.21
51 0.2
52 0.22
53 0.24
54 0.23
55 0.29
56 0.35
57 0.36
58 0.42
59 0.43
60 0.48
61 0.51
62 0.59
63 0.59
64 0.63
65 0.7
66 0.74
67 0.77
68 0.77
69 0.72
70 0.68
71 0.63
72 0.55
73 0.49
74 0.4
75 0.35
76 0.26
77 0.28
78 0.22
79 0.18
80 0.15
81 0.11
82 0.09
83 0.09
84 0.11
85 0.09
86 0.09
87 0.11
88 0.13
89 0.14
90 0.16
91 0.16
92 0.17
93 0.19
94 0.23
95 0.26
96 0.25
97 0.26
98 0.23
99 0.25
100 0.22
101 0.22
102 0.19
103 0.17
104 0.15
105 0.16
106 0.2
107 0.21
108 0.2
109 0.25
110 0.34
111 0.4
112 0.44
113 0.5
114 0.53
115 0.57
116 0.63
117 0.68
118 0.68
119 0.69
120 0.65
121 0.59
122 0.54
123 0.48
124 0.42
125 0.31
126 0.22
127 0.14
128 0.11
129 0.1
130 0.08
131 0.08
132 0.06
133 0.06
134 0.05
135 0.06
136 0.07
137 0.07
138 0.08
139 0.08
140 0.08
141 0.09
142 0.09
143 0.09
144 0.08
145 0.09
146 0.09
147 0.09
148 0.09
149 0.08
150 0.08
151 0.08
152 0.11
153 0.14
154 0.15
155 0.2
156 0.23
157 0.25
158 0.28
159 0.37
160 0.38
161 0.4
162 0.42
163 0.42
164 0.4
165 0.43
166 0.44
167 0.4
168 0.36
169 0.33
170 0.3
171 0.25
172 0.24
173 0.19
174 0.16
175 0.15
176 0.16
177 0.16
178 0.19
179 0.23
180 0.29
181 0.34
182 0.35
183 0.4
184 0.48
185 0.56
186 0.62
187 0.7
188 0.73
189 0.8
190 0.86
191 0.83
192 0.81
193 0.78
194 0.73
195 0.69
196 0.63
197 0.54
198 0.46
199 0.4
200 0.33
201 0.25
202 0.18
203 0.11
204 0.07
205 0.04
206 0.03
207 0.03
208 0.03
209 0.03
210 0.03
211 0.03
212 0.03
213 0.03
214 0.03
215 0.03
216 0.03
217 0.03
218 0.04
219 0.04
220 0.05
221 0.06
222 0.06
223 0.06
224 0.09
225 0.1
226 0.15
227 0.17
228 0.2
229 0.19
230 0.21
231 0.28
232 0.28
233 0.28
234 0.27
235 0.27
236 0.29
237 0.3
238 0.31
239 0.24
240 0.22
241 0.2
242 0.16
243 0.14
244 0.08
245 0.07
246 0.05
247 0.05
248 0.04
249 0.04
250 0.04
251 0.05
252 0.1
253 0.12
254 0.14
255 0.15
256 0.16
257 0.2
258 0.24
259 0.25
260 0.24
261 0.24
262 0.26
263 0.29
264 0.33
265 0.29
266 0.26
267 0.23
268 0.19
269 0.16
270 0.14
271 0.09
272 0.04
273 0.07
274 0.08
275 0.08
276 0.1
277 0.1
278 0.13
279 0.14
280 0.15
281 0.15
282 0.15
283 0.16
284 0.19
285 0.21
286 0.2
287 0.2
288 0.2
289 0.17
290 0.17
291 0.16
292 0.12
293 0.1
294 0.08
295 0.07
296 0.07
297 0.07
298 0.07
299 0.11
300 0.12
301 0.16
302 0.18
303 0.21
304 0.22
305 0.23
306 0.22
307 0.2
308 0.2
309 0.17
310 0.16
311 0.14
312 0.12
313 0.11
314 0.1
315 0.09
316 0.08
317 0.07
318 0.07
319 0.09
320 0.12
321 0.17
322 0.21
323 0.24
324 0.24
325 0.24
326 0.3
327 0.37
328 0.41
329 0.4
330 0.37
331 0.35
332 0.36
333 0.35
334 0.3
335 0.23
336 0.18
337 0.16
338 0.16
339 0.17
340 0.22
341 0.23
342 0.23
343 0.29
344 0.29
345 0.32
346 0.36
347 0.37
348 0.39
349 0.43
350 0.45
351 0.43
352 0.5
353 0.5
354 0.5
355 0.5
356 0.43
357 0.39
358 0.35
359 0.3
360 0.22
361 0.19
362 0.17
363 0.15
364 0.15
365 0.14
366 0.14
367 0.13
368 0.13
369 0.14
370 0.18
371 0.24
372 0.3
373 0.37
374 0.4